More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0676 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010644  Emin_0676  tRNA pseudouridine synthase B  100 
 
 		 235 aa  486  1e-136  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000650493 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0749  tRNA pseudouridine synthase B  44.74 
 
 		 244 aa  197  9e-50  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.844641 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2817  tRNA pseudouridine synthase B  41.59 
 
 		 241 aa  189  2.9999999999999997e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.604126  hitchhiker  0.00223059 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1559  tRNA pseudouridine synthase B  38.53 
 
 		 306 aa  174  8e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000014697  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1065  tRNA pseudouridine synthase B  41.03 
 
 		 299 aa  172  5e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.362733  normal  0.0143868 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1742  tRNA pseudouridine synthase B  39.21 
 
 		 302 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00438072  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2562  tRNA pseudouridine synthase B  40.09 
 
 		 311 aa  171  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0616361  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1059  tRNA pseudouridine synthase B  39.21 
 
 		 311 aa  170  2e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00436099  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1917  tRNA pseudouridine synthase B  39.21 
 
 		 302 aa  170  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.274314  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1764  tRNA pseudouridine synthase B  39.21 
 
 		 302 aa  170  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.701485  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0173  tRNA pseudouridine synthase B  39.21 
 
 		 321 aa  170  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.016553  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0993  tRNA pseudouridine synthase B  39.21 
 
 		 302 aa  170  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.423513  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1505  tRNA pseudouridine synthase B  39.21 
 
 		 321 aa  170  2e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0781  tRNA pseudouridine synthase B  40.08 
 
 		 293 aa  169  4e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2203  tRNA pseudouridine synthase B  38.46 
 
 		 302 aa  169  4e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.147231  normal  0.936738 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1022  tRNA pseudouridine synthase B  41.71 
 
 		 310 aa  166  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1502  tRNA pseudouridine synthase B  41.71 
 
 		 310 aa  166  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.424281  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3031  tRNA pseudouridine synthase B  42.47 
 
 		 303 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000998148  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2120  tRNA pseudouridine 55 synthase  40.17 
 
 		 299 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1424  tRNA pseudouridine synthase B  41.23 
 
 		 310 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0157045 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1727  tRNA pseudouridine synthase B  41.1 
 
 		 297 aa  163  2.0000000000000002e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1432  tRNA pseudouridine synthase B  39.92 
 
 		 322 aa  163  3e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000149867 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2818  tRNA pseudouridine synthase B  39.65 
 
 		 311 aa  162  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0130681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1727  tRNA pseudouridine synthase B  39.21 
 
 		 309 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.577271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2450  tRNA pseudouridine synthase B  38.33 
 
 		 299 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.226071  normal  0.847147 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1384  tRNA pseudouridine synthase B  40.76 
 
 		 310 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5828  tRNA pseudouridine synthase B  42.86 
 
 		 299 aa  161  6e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.786623  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1478  tRNA pseudouridine synthase B  40.76 
 
 		 310 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1753  tRNA pseudouridine synthase B  40.76 
 
 		 310 aa  161  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0346238 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1672  tRNA pseudouridine synthase B  39.45 
 
 		 292 aa  160  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000366042  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1692  tRNA pseudouridine synthase B  40 
 
 		 305 aa  160  2e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3185  tRNA pseudouridine synthase B  37.12 
 
 		 309 aa  159  3e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.991117  normal  0.361577 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4643  tRNA pseudouridine synthase B  40.76 
 
 		 322 aa  159  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0247266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0076  tRNA pseudouridine synthase B  37.5 
 
 		 359 aa  159  3e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.225671  normal  0.908993 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1031  tRNA pseudouridine synthase B  39.05 
 
 		 308 aa  159  4e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2029  tRNA pseudouridine synthase B  39.06 
 
 		 314 aa  159  4e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0245667  normal  0.0911973 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1424  tRNA pseudouridine synthase B  39.15 
 
 		 306 aa  159  4e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1634  tRNA pseudouridine synthase B  39.21 
 
 		 311 aa  158  6e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.767781  hitchhiker  0.000962415 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3327  tRNA pseudouridine synthase B  40.95 
 
 		 289 aa  158  8e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.212932  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_32966  predicted protein  41.31 
 
 		 279 aa  156  3e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3849  tRNA pseudouridine synthase B  38.33 
 
 		 371 aa  156  3e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0712752  normal  0.22473 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1291  tRNA pseudouridine synthase B  36.64 
 
 		 314 aa  155  4e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.227253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2329  tRNA pseudouridine synthase B  37.89 
 
 		 302 aa  155  4e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0208892 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2158  tRNA pseudouridine synthase B  39.19 
 
 		 299 aa  155  7e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.285493  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1054  tRNA pseudouridine synthase B  41.07 
 
 		 290 aa  154  9e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000156302  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3589  tRNA pseudouridine synthase B  39.45 
 
 		 295 aa  154  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0304508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1589  tRNA pseudouridine synthase B  38.71 
 
 		 304 aa  153  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000648729  normal  0.0689422 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3558  tRNA pseudouridine synthase B  38.84 
 
 		 327 aa  154  2e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.567602  normal  0.599891 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3188  tRNA pseudouridine synthase B  40.17 
 
 		 289 aa  152  4e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0863622  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2026  tRNA pseudouridine synthase B  36.52 
 
 		 315 aa  152  5e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12806  tRNA pseudouridine synthase B  37.1 
 
 		 298 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.107563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0479  tRNA pseudouridine synthase B  35.05 
 
 		 291 aa  152  5.9999999999999996e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1119  tRNA pseudouridine synthase B  38.21 
 
 		 318 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.717594  normal  0.307912 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1212  tRNA pseudouridine synthase B  38.68 
 
 		 318 aa  151  7e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.193622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2136  tRNA pseudouridine synthase B  38.03 
 
 		 338 aa  151  7e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0388744  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0071  tRNA pseudouridine synthase B  37.07 
 
 		 380 aa  150  1e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1862  tRNA pseudouridine synthase B  38.79 
 
 		 313 aa  150  1e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.552372  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1694  tRNA pseudouridine synthase B  39.44 
 
 		 328 aa  150  1e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00112277  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3072  tRNA pseudouridine synthase B  38.16 
 
 		 307 aa  151  1e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0823  tRNA pseudouridine synthase B  37.61 
 
 		 308 aa  151  1e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.939729  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl282  tRNA pseudouridine 5S synthase  37.32 
 
 		 286 aa  150  2e-35  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000650748  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0600  tRNA pseudouridine synthase B  36.55 
 
 		 318 aa  150  2e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04550  putative tRNA pseudouridine synthase  36.49 
 
 		 238 aa  149  3e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1225  tRNA pseudouridine synthase B  38.64 
 
 		 302 aa  149  3e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.886706  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0966  tRNA pseudouridine synthase B  38.86 
 
 		 304 aa  149  3e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000895381  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2747  tRNA pseudouridine synthase B  37.07 
 
 		 331 aa  148  8e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0741734  normal  0.187539 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3463  tRNA pseudouridine synthase B  35.48 
 
 		 318 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3960  tRNA pseudouridine synthase B  40.54 
 
 		 304 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2992  tRNA pseudouridine synthase B  35.47 
 
 		 321 aa  147  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14640  tRNA pseudouridine synthase B  40 
 
 		 295 aa  147  2.0000000000000003e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282471  normal  0.813553 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1249  tRNA pseudouridine synthase B  35.47 
 
 		 333 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0328015  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1460  tRNA pseudouridine synthase B  36.82 
 
 		 255 aa  146  2.0000000000000003e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000738183  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1186  tRNA pseudouridine synthase B  41.04 
 
 		 313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.372827 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0948  pseudouridylate synthase (pseudouridine synthase)  35.62 
 
 		 225 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.276253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0404  tRNA pseudouridine synthase B  40.28 
 
 		 240 aa  146  3e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00439158  normal  0.254846 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1438  tRNA pseudouridine synthase B  37.38 
 
 		 302 aa  146  3e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11500  tRNA pseudouridine 55 synthase  37.16 
 
 		 348 aa  145  4.0000000000000006e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0558927  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07030  tRNA pseudouridine synthase B  41.23 
 
 		 298 aa  145  4.0000000000000006e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2750  tRNA pseudouridine synthase B  36.4 
 
 		 318 aa  145  4.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1311  tRNA pseudouridine synthase B  38.57 
 
 		 249 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0354136  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3165  tRNA pseudouridine synthase B  37.29 
 
 		 309 aa  145  5e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.498601  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3606  tRNA pseudouridine synthase B  35.94 
 
 		 306 aa  145  6e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0287  tRNA pseudouridine synthase B  41.27 
 
 		 367 aa  145  6e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2009  tRNA pseudouridine synthase B  36.09 
 
 		 347 aa  145  6e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.845229  normal  0.607065 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2118  tRNA pseudouridine synthase B  36.96 
 
 		 308 aa  144  9e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.206379  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1091  tRNA pseudouridine synthase B  36.89 
 
 		 303 aa  144  1e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0150332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2078  tRNA pseudouridine synthase B  38.5 
 
 		 297 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0804076  normal  0.193911 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2706  tRNA pseudouridine synthase B  36.57 
 
 		 313 aa  144  1e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.106094 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2095  tRNA pseudouridine synthase B  38.5 
 
 		 297 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0570  tRNA pseudouridine synthase B  37.26 
 
 		 229 aa  144  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2141  tRNA pseudouridine synthase B  38.5 
 
 		 297 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.024046 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2813  tRNA pseudouridine synthase B  38.32 
 
 		 302 aa  144  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3344  tRNA pseudouridine synthase B  35.51 
 
 		 318 aa  143  2e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2510  tRNA pseudouridine synthase B  38.5 
 
 		 308 aa  144  2e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1514  tRNA pseudouridine synthase B  39.41 
 
 		 336 aa  144  2e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1046  tRNA pseudouridine synthase B  35.86 
 
 		 304 aa  143  2e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1946  tRNA pseudouridine synthase B  36.99 
 
 		 308 aa  143  2e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0313874 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0176  tRNA pseudouridine synthase B  36.87 
 
 		 312 aa  143  2e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.721931  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1336  tRNA pseudouridine synthase B  38.07 
 
 		 307 aa  142  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.1805  hitchhiker  0.00915441 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5460  tRNA pseudouridine synthase B  37.91 
 
 		 304 aa  142  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.525904  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>