More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_2321 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_2321  tRNA pseudouridine synthase B  100 
 
 		 280 aa  562  1.0000000000000001e-159  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.411496  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0735  tRNA pseudouridine synthase B  49.17 
 
 		 285 aa  226  5.0000000000000005e-58  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0988  tRNA pseudouridine synthase B  40.8 
 
 		 297 aa  181  2e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2118  tRNA pseudouridine synthase B  37.19 
 
 		 308 aa  179  7e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.206379  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2771  tRNA pseudouridine synthase B  40.61 
 
 		 307 aa  178  8e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0460  tRNA pseudouridine synthase B  36.86 
 
 		 309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1946  tRNA pseudouridine synthase B  34.15 
 
 		 308 aa  170  2e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0313874 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_853  tRNA pseudouridine synthase B  39.62 
 
 		 300 aa  170  3e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000359434  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2462  tRNA pseudouridine synthase B  35.74 
 
 		 307 aa  169  4e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0554606  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1559  tRNA pseudouridine synthase B  33.98 
 
 		 306 aa  169  6e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000014697  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1005  tRNA pseudouridine synthase B  33.7 
 
 		 307 aa  168  9e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.319279  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1694  tRNA pseudouridine synthase B  35.77 
 
 		 328 aa  168  9e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00112277  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1336  tRNA pseudouridine synthase B  34.72 
 
 		 307 aa  168  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.1805  hitchhiker  0.00915441 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0393  tRNA pseudouridine synthase B  35.16 
 
 		 293 aa  167  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0557  tRNA pseudouridine synthase B  35.16 
 
 		 293 aa  167  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.492745 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3632  tRNA pseudouridine synthase B  34.98 
 
 		 307 aa  167  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0220119  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3848  tRNA pseudouridine synthase B  34.72 
 
 		 307 aa  166  4e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1672  tRNA pseudouridine synthase B  36.33 
 
 		 292 aa  166  5e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000366042  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1158  tRNA pseudouridine synthase B  35.94 
 
 		 302 aa  166  5e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000801793  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3857  tRNA pseudouridine synthase B  34.34 
 
 		 307 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000159837  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3031  tRNA pseudouridine synthase B  40.85 
 
 		 303 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000998148  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1692  tRNA pseudouridine synthase B  41.45 
 
 		 305 aa  165  6.9999999999999995e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3908  tRNA pseudouridine synthase B  34.34 
 
 		 307 aa  165  8e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.857105  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3821  tRNA pseudouridine synthase B  34.34 
 
 		 307 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.83095e-62 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3673  tRNA pseudouridine synthase B  33.11 
 
 		 294 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0760058  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0981  tRNA pseudouridine synthase B  37.45 
 
 		 300 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.256266  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1659  tRNA pseudouridine synthase B  33.86 
 
 		 303 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0872  tRNA pseudouridine synthase B  38.76 
 
 		 300 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000436908  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1747  tRNA pseudouridine synthase B  32.62 
 
 		 304 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.108245  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07870  tRNA pseudouridine 55 synthase  38.86 
 
 		 303 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3569  tRNA pseudouridine synthase B  34.34 
 
 		 307 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0427188  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3551  tRNA pseudouridine synthase B  34.34 
 
 		 307 aa  163  3e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0701  tRNA pseudouridine synthase B  34.69 
 
 		 301 aa  163  3e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0781617  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3661  tRNA pseudouridine synthase B  34.34 
 
 		 307 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00496834  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3947  tRNA pseudouridine synthase B  34.34 
 
 		 307 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.70676  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0908  tRNA pseudouridine synthase B  31.93 
 
 		 301 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2050  tRNA pseudouridine synthase B  35.77 
 
 		 302 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3606  tRNA pseudouridine synthase B  34.62 
 
 		 306 aa  161  9e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0039  tRNA pseudouridine synthase B  35.18 
 
 		 310 aa  161  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.651075  normal  0.326168 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1937  tRNA pseudouridine synthase B  35.84 
 
 		 294 aa  160  2e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl282  tRNA pseudouridine 5S synthase  38.89 
 
 		 286 aa  159  3e-38  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000650748  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0069  tRNA pseudouridine synthase B  35.14 
 
 		 302 aa  160  3e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00601892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3058  tRNA pseudouridine synthase B  33.44 
 
 		 315 aa  159  4e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.538597  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1511  tRNA pseudouridine synthase B  38.95 
 
 		 283 aa  159  4e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1351  pseudouridine synthase  36.05 
 
 		 302 aa  159  4e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.779318  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0723  tRNA pseudouridine synthase B  33.92 
 
 		 305 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.806567  normal  0.0309098 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2450  tRNA pseudouridine synthase B  34.75 
 
 		 299 aa  159  7e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.226071  normal  0.847147 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3559  tRNA pseudouridine synthase B  34.3 
 
 		 317 aa  158  8e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000961174 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0612  tRNA pseudouridine synthase B  36.36 
 
 		 298 aa  158  8e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.259864  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0781  tRNA pseudouridine synthase B  33.22 
 
 		 305 aa  158  9e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00899616  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1655  tRNA pseudouridine synthase B  35.84 
 
 		 294 aa  158  9e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1727  tRNA pseudouridine synthase B  32.77 
 
 		 309 aa  157  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.577271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1313  pseudouridine synthase  35.03 
 
 		 298 aa  157  2e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.702604  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4575  tRNA pseudouridine synthase B  33.22 
 
 		 305 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0935427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3849  tRNA pseudouridine synthase B  34.39 
 
 		 371 aa  157  3e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0712752  normal  0.22473 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1046  tRNA pseudouridine synthase B  35.9 
 
 		 304 aa  156  4e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2921  tRNA pseudouridine synthase B  35.27 
 
 		 341 aa  156  4e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0697495  normal  0.0719894 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2695  tRNA pseudouridine synthase B  35.27 
 
 		 341 aa  156  4e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0727  tRNA pseudouridine synthase B  38.31 
 
 		 319 aa  156  4e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.414989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1742  tRNA pseudouridine synthase B  40.98 
 
 		 302 aa  155  6e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00438072  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1031  tRNA pseudouridine synthase B  37.65 
 
 		 308 aa  155  6e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1589  tRNA pseudouridine synthase B  37.01 
 
 		 304 aa  155  7e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000648729  normal  0.0689422 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2832  tRNA pseudouridine synthase B  39.8 
 
 		 318 aa  155  8e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.478015  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1091  tRNA pseudouridine synthase B  33.84 
 
 		 303 aa  155  9e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0150332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4710  tRNA pseudouridine synthase B  32.87 
 
 		 305 aa  155  9e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201435 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1059  tRNA pseudouridine synthase B  40.98 
 
 		 311 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00436099  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1764  tRNA pseudouridine synthase B  40.98 
 
 		 302 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.701485  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1917  tRNA pseudouridine synthase B  40.98 
 
 		 302 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.274314  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1505  tRNA pseudouridine synthase B  40.98 
 
 		 321 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0173  tRNA pseudouridine synthase B  40.98 
 
 		 321 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.016553  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0993  tRNA pseudouridine synthase B  40.98 
 
 		 302 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.423513  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4488  tRNA pseudouridine synthase B  32.17 
 
 		 305 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.140717  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1862  tRNA pseudouridine synthase B  34.6 
 
 		 313 aa  154  2e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.552372  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2817  tRNA pseudouridine synthase B  39.51 
 
 		 241 aa  153  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.604126  hitchhiker  0.00223059 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0159  tRNA pseudouridine synthase B  33.59 
 
 		 344 aa  154  2e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1093  tRNA pseudouridine synthase B  39.8 
 
 		 317 aa  154  2e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0247742 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1424  tRNA pseudouridine synthase B  34.25 
 
 		 310 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0157045 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1384  tRNA pseudouridine synthase B  34.25 
 
 		 310 aa  153  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5460  tRNA pseudouridine synthase B  31.47 
 
 		 304 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.525904  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0695  tRNA pseudouridine synthase B  34.54 
 
 		 298 aa  153  4e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.392139  normal  0.247417 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4643  tRNA pseudouridine synthase B  34.93 
 
 		 322 aa  152  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0247266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3387  tRNA pseudouridine synthase B  36.52 
 
 		 321 aa  152  4e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00448784 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2817  tRNA pseudouridine synthase B  35.27 
 
 		 341 aa  153  4e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.779888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1634  tRNA pseudouridine synthase B  35.32 
 
 		 311 aa  152  5e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.767781  hitchhiker  0.000962415 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1753  tRNA pseudouridine synthase B  37.14 
 
 		 310 aa  152  5e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0346238 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3725  tRNA pseudouridine synthase B  34.63 
 
 		 342 aa  152  5e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0838427 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4178  tRNA pseudouridine synthase B  31.82 
 
 		 305 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.224491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1032  tRNA pseudouridine synthase B  39.3 
 
 		 317 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.358719  hitchhiker  0.0000301922 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0071  tRNA pseudouridine synthase B  35.83 
 
 		 309 aa  152  7e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.861563  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2818  tRNA pseudouridine synthase B  35.71 
 
 		 311 aa  152  7e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0130681  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42800  tRNA pseudouridine synthase B  31.69 
 
 		 305 aa  152  8e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1331  tRNA pseudouridine synthase B  38.4 
 
 		 305 aa  151  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.284628  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1478  tRNA pseudouridine synthase B  32.65 
 
 		 310 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1357  tRNA pseudouridine synthase B  38.4 
 
 		 305 aa  151  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.531893  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0491  tRNA pseudouridine synthase B  34.54 
 
 		 323 aa  151  1e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.444271 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3473  tRNA pseudouridine synthase B  32.82 
 
 		 314 aa  151  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1642  tRNA pseudouridine synthase B  34.07 
 
 		 283 aa  151  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0749  tRNA pseudouridine synthase B  38.54 
 
 		 244 aa  151  1e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.844641 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1028  tRNA pseudouridine synthase B  39.3 
 
 		 317 aa  151  1e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000142961 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1465  tRNA pseudouridine synthase B  30 
 
 		 318 aa  150  2e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>