More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0063 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0063  tRNA pseudouridine synthase B  100 
 
 		 273 aa  558  1e-158  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0698  tRNA pseudouridine synthase B  70.7 
 
 		 273 aa  417  1e-116  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0715  tRNA pseudouridine synthase B  56.67 
 
 		 278 aa  340  1e-92  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1109  tRNA pseudouridine synthase B  57.2 
 
 		 272 aa  323  2e-87  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1245  tRNA pseudouridine synthase B  54.21 
 
 		 272 aa  297  1e-79  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.478326  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1057  tRNA pseudouridine synthase B  55.64 
 
 		 272 aa  296  3e-79  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1632  pseudouridylate synthase TruB domain protein  49.07 
 
 		 275 aa  294  1e-78  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1120  tRNA pseudouridine synthase B  53.48 
 
 		 272 aa  294  1e-78  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.855137  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0620  tRNA pseudouridine synthase B  53.48 
 
 		 272 aa  293  2e-78  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.468931  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0438  tRNA pseudouridine synthase B  50.92 
 
 		 273 aa  273  2.0000000000000002e-72  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2203  tRNA pseudouridine synthase B  39.23 
 
 		 302 aa  149  7e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.147231  normal  0.936738 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1589  tRNA pseudouridine synthase B  38.69 
 
 		 304 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000648729  normal  0.0689422 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1559  tRNA pseudouridine synthase B  32.41 
 
 		 306 aa  146  3e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000014697  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1672  tRNA pseudouridine synthase B  37.02 
 
 		 292 aa  145  6e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000366042  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0966  tRNA pseudouridine synthase B  37.19 
 
 		 304 aa  144  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000895381  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2818  tRNA pseudouridine synthase B  31.75 
 
 		 311 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0130681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3931  tRNA pseudouridine synthase B  35.14 
 
 		 299 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.486039  normal  0.358321 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2450  tRNA pseudouridine synthase B  35.64 
 
 		 299 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.226071  normal  0.847147 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2050  tRNA pseudouridine synthase B  33.19 
 
 		 302 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2227  tRNA pseudouridine synthase B  34.83 
 
 		 313 aa  139  7e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00164056  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1742  tRNA pseudouridine synthase B  32.47 
 
 		 302 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00438072  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0173  tRNA pseudouridine synthase B  32.03 
 
 		 321 aa  136  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.016553  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1505  tRNA pseudouridine synthase B  32.03 
 
 		 321 aa  136  4e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1059  tRNA pseudouridine synthase B  32.03 
 
 		 311 aa  135  5e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00436099  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1634  tRNA pseudouridine synthase B  30.97 
 
 		 311 aa  135  5e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.767781  hitchhiker  0.000962415 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1917  tRNA pseudouridine synthase B  32.03 
 
 		 302 aa  136  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.274314  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0993  tRNA pseudouridine synthase B  32.03 
 
 		 302 aa  136  5e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.423513  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1764  tRNA pseudouridine synthase B  32.03 
 
 		 302 aa  136  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.701485  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3755  tRNA pseudouridine synthase B  33.33 
 
 		 300 aa  135  8e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.366466  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3569  tRNA pseudouridine synthase B  37 
 
 		 293 aa  135  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.687406 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2562  tRNA pseudouridine synthase B  31.74 
 
 		 311 aa  133  3e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0616361  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0101  tRNA pseudouridine synthase B  39.27 
 
 		 235 aa  133  3e-30  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.374766  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0872  tRNA pseudouridine synthase B  36.52 
 
 		 300 aa  133  3e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000436908  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1591  tRNA pseudouridine synthase B  33.62 
 
 		 304 aa  132  5e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00165016  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12806  tRNA pseudouridine synthase B  33.01 
 
 		 298 aa  132  5e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.107563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1753  tRNA pseudouridine synthase B  32.17 
 
 		 310 aa  132  5e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0346238 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0781  tRNA pseudouridine synthase B  33.49 
 
 		 293 aa  132  6e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1158  tRNA pseudouridine synthase B  31.06 
 
 		 302 aa  131  9e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000801793  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_853  tRNA pseudouridine synthase B  34.43 
 
 		 300 aa  132  9e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000359434  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1424  tRNA pseudouridine synthase B  32.46 
 
 		 310 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0157045 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42800  tRNA pseudouridine synthase B  34.34 
 
 		 305 aa  131  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0084  tRNA pseudouridine synthase B  36.27 
 
 		 302 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1384  tRNA pseudouridine synthase B  32.02 
 
 		 310 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1904  tRNA pseudouridine synthase B  37.02 
 
 		 310 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000415787  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1727  tRNA pseudouridine synthase B  32.47 
 
 		 309 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.577271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0903  pseudouridylate synthase  38.14 
 
 		 299 aa  130  2.0000000000000002e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0908  tRNA pseudouridine synthase B  37.44 
 
 		 301 aa  130  3e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1128  tRNA pseudouridine synthase B  33.33 
 
 		 297 aa  130  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.925084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1045  tRNA pseudouridine synthase B  34.65 
 
 		 300 aa  129  7.000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.128429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1022  tRNA pseudouridine synthase B  32.02 
 
 		 310 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1502  tRNA pseudouridine synthase B  32.02 
 
 		 310 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.424281  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1336  tRNA pseudouridine synthase B  31.62 
 
 		 307 aa  128  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.1805  hitchhiker  0.00915441 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1438  tRNA pseudouridine synthase B  29.72 
 
 		 302 aa  127  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2462  tRNA pseudouridine synthase B  30.34 
 
 		 307 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0554606  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0981  tRNA pseudouridine synthase B  34.82 
 
 		 300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.256266  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2833  tRNA pseudouridine synthase B  39.61 
 
 		 291 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1465  tRNA pseudouridine synthase B  36.14 
 
 		 318 aa  127  3e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1478  tRNA pseudouridine synthase B  31.58 
 
 		 310 aa  126  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2078  tRNA pseudouridine synthase B  36.73 
 
 		 297 aa  126  3e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0804076  normal  0.193911 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2095  tRNA pseudouridine synthase B  36.73 
 
 		 297 aa  126  3e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2141  tRNA pseudouridine synthase B  36.73 
 
 		 297 aa  126  3e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.024046 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2029  tRNA pseudouridine synthase B  33.82 
 
 		 314 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0245667  normal  0.0911973 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3908  tRNA pseudouridine synthase B  32.05 
 
 		 307 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.857105  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3632  tRNA pseudouridine synthase B  31.62 
 
 		 307 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0220119  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4488  tRNA pseudouridine synthase B  34.85 
 
 		 305 aa  125  5e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.140717  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0069  tRNA pseudouridine synthase B  33.33 
 
 		 302 aa  125  5e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00601892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4643  tRNA pseudouridine synthase B  32.02 
 
 		 322 aa  125  6e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0247266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01762  tRNA pseudouridine synthase B  32.47 
 
 		 323 aa  125  6e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0258018  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1946  tRNA pseudouridine synthase B  35.18 
 
 		 308 aa  125  7e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0313874 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2319  tRNA pseudouridine synthase B  33.98 
 
 		 301 aa  125  8.000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.163994  hitchhiker  0.00744574 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2329  tRNA pseudouridine synthase B  33.01 
 
 		 302 aa  125  9e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0208892 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3848  tRNA pseudouridine synthase B  31.2 
 
 		 307 aa  124  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5460  tRNA pseudouridine synthase B  34.5 
 
 		 304 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.525904  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1065  tRNA pseudouridine synthase B  30.81 
 
 		 299 aa  124  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.362733  normal  0.0143868 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1862  tRNA pseudouridine synthase B  36.27 
 
 		 313 aa  125  1e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.552372  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1031  tRNA pseudouridine synthase B  30.29 
 
 		 308 aa  124  1e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3327  tRNA pseudouridine synthase B  34.38 
 
 		 289 aa  124  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.212932  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1291  tRNA pseudouridine synthase B  32.14 
 
 		 314 aa  124  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.227253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2026  tRNA pseudouridine synthase B  32.38 
 
 		 315 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07870  tRNA pseudouridine 55 synthase  36.15 
 
 		 303 aa  124  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0039  tRNA pseudouridine synthase B  35.05 
 
 		 310 aa  124  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.651075  normal  0.326168 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1046  tRNA pseudouridine synthase B  36.79 
 
 		 304 aa  124  2e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2293  tRNA pseudouridine synthase B  35.68 
 
 		 299 aa  124  2e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3048  tRNA pseudouridine synthase B  34.69 
 
 		 318 aa  124  2e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62730  tRNA pseudouridine synthase B  33.84 
 
 		 304 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1246  tRNA pseudouridine synthase B  37.5 
 
 		 244 aa  124  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.193687 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3849  tRNA pseudouridine synthase B  33.33 
 
 		 371 aa  123  3e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0712752  normal  0.22473 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1186  tRNA pseudouridine synthase B  34.17 
 
 		 313 aa  123  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.372827 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2131  tRNA pseudouridine synthase B  35.71 
 
 		 315 aa  123  3e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.222918  normal  0.419239 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1747  tRNA pseudouridine synthase B  35 
 
 		 304 aa  123  3e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.108245  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3857  tRNA pseudouridine synthase B  31.2 
 
 		 307 aa  123  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000159837  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2706  tRNA pseudouridine synthase B  37.93 
 
 		 313 aa  123  3e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.106094 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2817  tRNA pseudouridine synthase B  29.49 
 
 		 241 aa  123  3e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.604126  hitchhiker  0.00223059 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1511  tRNA pseudouridine synthase B  34.16 
 
 		 283 aa  123  3e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3551  tRNA pseudouridine synthase B  31.2 
 
 		 307 aa  123  4e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4178  tRNA pseudouridine synthase B  34.34 
 
 		 305 aa  122  5e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.224491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3821  tRNA pseudouridine synthase B  31.2 
 
 		 307 aa  122  5e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.83095e-62 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2158  tRNA pseudouridine synthase B  31.58 
 
 		 299 aa  122  5e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.285493  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1119  tRNA pseudouridine synthase B  34.65 
 
 		 318 aa  122  5e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.717594  normal  0.307912 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0827  tRNA pseudouridine synthase B  32.71 
 
 		 313 aa  122  7e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000378584 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>