More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_2833 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_2833  tRNA pseudouridine synthase B  100 
 
 		 291 aa  577  1.0000000000000001e-163  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0908  tRNA pseudouridine synthase B  39.27 
 
 		 301 aa  161  9e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3783  tRNA pseudouridine synthase B  37.9 
 
 		 308 aa  160  3e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0711171  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0927  tRNA pseudouridine synthase B  44.64 
 
 		 283 aa  158  1e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.000000000000224094  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1511  tRNA pseudouridine synthase B  42.73 
 
 		 283 aa  158  1e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2227  tRNA pseudouridine synthase B  36.77 
 
 		 313 aa  155  1e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00164056  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2609  tRNA pseudouridine synthase B  37.67 
 
 		 354 aa  150  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.225984 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4620  tRNA pseudouridine synthase B  38.6 
 
 		 335 aa  150  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.29706  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0612  tRNA pseudouridine synthase B  39.22 
 
 		 298 aa  150  3e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.259864  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1054  tRNA pseudouridine synthase B  37.05 
 
 		 290 aa  150  3e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000156302  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0816  tRNA pseudouridine synthase B  37.86 
 
 		 297 aa  149  4e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0170651  normal  0.0612098 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0728  tRNA pseudouridine synthase B  42.67 
 
 		 296 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0903  pseudouridylate synthase  40.09 
 
 		 299 aa  147  2.0000000000000003e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1212  tRNA pseudouridine synthase B  35.94 
 
 		 288 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.977984  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2293  tRNA pseudouridine synthase B  36.53 
 
 		 299 aa  146  3e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1438  tRNA pseudouridine synthase B  33.94 
 
 		 302 aa  146  4.0000000000000006e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3569  tRNA pseudouridine synthase B  35.78 
 
 		 293 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.687406 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2921  tRNA pseudouridine synthase B  36.82 
 
 		 341 aa  145  5e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0697495  normal  0.0719894 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2695  tRNA pseudouridine synthase B  34.47 
 
 		 341 aa  145  5e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1045  tRNA pseudouridine synthase B  37.9 
 
 		 300 aa  145  6e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.128429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2817  tRNA pseudouridine synthase B  36.82 
 
 		 341 aa  145  6e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.779888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2319  tRNA pseudouridine synthase B  38.05 
 
 		 301 aa  145  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.163994  hitchhiker  0.00744574 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4983  tRNA pseudouridine synthase B  37.07 
 
 		 293 aa  144  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3808  tRNA pseudouridine synthase B  37.29 
 
 		 324 aa  144  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0201981 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1692  tRNA pseudouridine synthase B  37.8 
 
 		 305 aa  144  2e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1351  pseudouridine synthase  34.01 
 
 		 302 aa  143  3e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.779318  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1046  tRNA pseudouridine synthase B  38.84 
 
 		 304 aa  143  4e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1591  tRNA pseudouridine synthase B  36.36 
 
 		 304 aa  142  6e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00165016  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3725  tRNA pseudouridine synthase B  34.18 
 
 		 342 aa  142  6e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0838427 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0361  tRNA pseudouridine synthase B  38.4 
 
 		 229 aa  142  6e-33  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.495035  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1288  tRNA pseudouridine synthase B  38.5 
 
 		 308 aa  142  7e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1589  tRNA pseudouridine synthase B  32.56 
 
 		 304 aa  142  8e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000648729  normal  0.0689422 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0441  tRNA pseudouridine synthase B  35.16 
 
 		 311 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12806  tRNA pseudouridine synthase B  32.46 
 
 		 298 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.107563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07870  tRNA pseudouridine 55 synthase  37.55 
 
 		 303 aa  141  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42800  tRNA pseudouridine synthase B  33.77 
 
 		 305 aa  140  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14640  tRNA pseudouridine synthase B  33.62 
 
 		 295 aa  140  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282471  normal  0.813553 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl282  tRNA pseudouridine 5S synthase  36.49 
 
 		 286 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000650748  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2462  tRNA pseudouridine synthase B  31.21 
 
 		 307 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0554606  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0603  tRNA pseudouridine synthase B  38.28 
 
 		 351 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0479  tRNA pseudouridine synthase B  35.29 
 
 		 291 aa  140  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3755  tRNA pseudouridine synthase B  29.75 
 
 		 300 aa  140  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.366466  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2484  tRNA pseudouridine synthase B  36.2 
 
 		 304 aa  140  3e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.468436  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0966  tRNA pseudouridine synthase B  34.96 
 
 		 304 aa  140  3e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000895381  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4575  tRNA pseudouridine synthase B  33.48 
 
 		 305 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0935427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4710  tRNA pseudouridine synthase B  33.48 
 
 		 305 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201435 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1672  tRNA pseudouridine synthase B  35.19 
 
 		 292 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000366042  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0388  hypothetical protein  36.53 
 
 		 230 aa  139  4.999999999999999e-32  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0336  tRNA pseudouridine synthase B  40.72 
 
 		 301 aa  139  6e-32  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.636591  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0229  tRNA pseudouridine synthase B  37.32 
 
 		 368 aa  139  6e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00860319  normal  0.483452 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2073  tRNA pseudouridine synthase B  35.41 
 
 		 306 aa  139  7e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.427039 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1642  tRNA pseudouridine synthase B  38.67 
 
 		 283 aa  139  7e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0287  tRNA pseudouridine synthase B  33.76 
 
 		 367 aa  139  7e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1317  tRNA pseudouridine synthase B  37.61 
 
 		 308 aa  139  7.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.583255 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0059  tRNA pseudouridine synthase B  34.55 
 
 		 366 aa  139  7.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1249  tRNA pseudouridine synthase B  34.53 
 
 		 333 aa  139  7.999999999999999e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0328015  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0723  tRNA pseudouridine synthase B  33.05 
 
 		 305 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.806567  normal  0.0309098 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1465  tRNA pseudouridine synthase B  35.37 
 
 		 318 aa  138  1e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0482  tRNA pseudouridine synthase B  37.32 
 
 		 387 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.266724  normal  0.260963 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0069  tRNA pseudouridine synthase B  36.24 
 
 		 302 aa  137  1e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00601892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0033  tRNA pseudouridine synthase B  35.91 
 
 		 412 aa  138  1e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0833  tRNA pseudouridine synthase B  35.86 
 
 		 282 aa  137  2e-31  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1659  tRNA pseudouridine synthase B  34.98 
 
 		 303 aa  137  2e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1144  tRNA pseudouridine synthase B  30.64 
 
 		 315 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.431473  normal  0.105946 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3977  tRNA pseudouridine synthase B  37.61 
 
 		 291 aa  137  2e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.505383  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3632  tRNA pseudouridine synthase B  29.77 
 
 		 307 aa  137  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0220119  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0745  tRNA pseudouridine synthase B  35.87 
 
 		 324 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.555354  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_853  tRNA pseudouridine synthase B  34.23 
 
 		 300 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000359434  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1336  tRNA pseudouridine synthase B  29.77 
 
 		 307 aa  136  4e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.1805  hitchhiker  0.00915441 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0541  tRNA pseudouridine synthase B  31.82 
 
 		 318 aa  136  4e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.578827  normal  0.242004 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1128  tRNA pseudouridine synthase B  32.26 
 
 		 297 aa  136  5e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.925084  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2167  tRNA pseudouridine synthase B  37.32 
 
 		 324 aa  136  5e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1478  tRNA pseudouridine synthase B  34.7 
 
 		 310 aa  135  5e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2079  tRNA pseudouridine synthase B  37.32 
 
 		 324 aa  136  5e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.0054544  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0438  tRNA pseudouridine synthase B  35.45 
 
 		 366 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3381  tRNA pseudouridine synthase B  31.52 
 
 		 332 aa  135  7.000000000000001e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.092575  normal  0.759632 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0026  tRNA pseudouridine synthase B  35 
 
 		 358 aa  135  8e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.148493 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0291  tRNA pseudouridine synthase B  37.98 
 
 		 363 aa  135  9e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0204129 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2992  tRNA pseudouridine synthase B  35.43 
 
 		 321 aa  134  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0039  tRNA pseudouridine synthase B  34.55 
 
 		 310 aa  134  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.651075  normal  0.326168 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0369  tRNA pseudouridine synthase B  35.62 
 
 		 247 aa  135  9.999999999999999e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0446306  normal  0.471247 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09390  tRNA pseudouridine 55 synthase  31.97 
 
 		 334 aa  135  9.999999999999999e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.86572 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0827  tRNA pseudouridine synthase B  34.84 
 
 		 313 aa  134  9.999999999999999e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000378584 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1256  tRNA pseudouridine synthase B  32.94 
 
 		 320 aa  135  9.999999999999999e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3848  tRNA pseudouridine synthase B  29.43 
 
 		 307 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0781  tRNA pseudouridine synthase B  34.25 
 
 		 305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00899616  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2029  tRNA pseudouridine synthase B  35.91 
 
 		 314 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0245667  normal  0.0911973 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62730  tRNA pseudouridine synthase B  31.76 
 
 		 304 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2801  tRNA pseudouridine synthase B  35.75 
 
 		 298 aa  134  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.404125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0872  tRNA pseudouridine synthase B  35.11 
 
 		 300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000436908  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04550  putative tRNA pseudouridine synthase  34.08 
 
 		 238 aa  134  1.9999999999999998e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0101  tRNA pseudouridine synthase B  36.36 
 
 		 235 aa  133  3e-30  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.374766  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1022  tRNA pseudouridine synthase B  33.79 
 
 		 310 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3932  tRNA pseudouridine synthase B  34.09 
 
 		 312 aa  133  3e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.138388  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1502  tRNA pseudouridine synthase B  33.79 
 
 		 310 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.424281  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3857  tRNA pseudouridine synthase B  29.1 
 
 		 307 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000159837  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1031  tRNA pseudouridine synthase B  37.18 
 
 		 308 aa  133  3.9999999999999996e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0400  tRNA pseudouridine synthase B  34.88 
 
 		 241 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00240651  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1727  tRNA pseudouridine synthase B  33.94 
 
 		 309 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.577271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0326  tRNA pseudouridine synthase B, putative  34.62 
 
 		 292 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.541699  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>