More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1511 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1511  tRNA pseudouridine synthase B  100 
 
 		 283 aa  561  1.0000000000000001e-159  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0927  tRNA pseudouridine synthase B  43.31 
 
 		 283 aa  201  9.999999999999999e-51  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.000000000000224094  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0629  tRNA pseudouridine synthase B  36.21 
 
 		 317 aa  196  5.000000000000001e-49  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2818  tRNA pseudouridine synthase B  34.48 
 
 		 311 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0130681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1634  tRNA pseudouridine synthase B  34.14 
 
 		 311 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.767781  hitchhiker  0.000962415 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0872  tRNA pseudouridine synthase B  38.18 
 
 		 300 aa  189  5.999999999999999e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000436908  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0071  tRNA pseudouridine synthase B  37.63 
 
 		 309 aa  188  7e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.861563  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1059  tRNA pseudouridine synthase B  33.79 
 
 		 311 aa  187  1e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00436099  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1917  tRNA pseudouridine synthase B  33.79 
 
 		 302 aa  187  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.274314  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0173  tRNA pseudouridine synthase B  33.79 
 
 		 321 aa  187  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.016553  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1764  tRNA pseudouridine synthase B  33.79 
 
 		 302 aa  187  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.701485  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0993  tRNA pseudouridine synthase B  33.79 
 
 		 302 aa  187  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.423513  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1505  tRNA pseudouridine synthase B  33.79 
 
 		 321 aa  187  1e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_853  tRNA pseudouridine synthase B  39.22 
 
 		 300 aa  187  2e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000359434  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1478  tRNA pseudouridine synthase B  34.6 
 
 		 310 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0071  tRNA pseudouridine synthase B  36.92 
 
 		 309 aa  187  2e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2817  tRNA pseudouridine synthase B  40.95 
 
 		 241 aa  186  3e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.604126  hitchhiker  0.00223059 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1742  tRNA pseudouridine synthase B  33.79 
 
 		 302 aa  186  3e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00438072  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2562  tRNA pseudouridine synthase B  33.79 
 
 		 311 aa  186  4e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0616361  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1022  tRNA pseudouridine synthase B  34.26 
 
 		 310 aa  186  4e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1502  tRNA pseudouridine synthase B  34.26 
 
 		 310 aa  186  4e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.424281  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0393  tRNA pseudouridine synthase B  36.1 
 
 		 293 aa  186  5e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1559  tRNA pseudouridine synthase B  39.45 
 
 		 306 aa  186  5e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000014697  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0557  tRNA pseudouridine synthase B  36.1 
 
 		 293 aa  186  5e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.492745 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1727  tRNA pseudouridine synthase B  33.33 
 
 		 309 aa  185  7e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.577271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1753  tRNA pseudouridine synthase B  33.91 
 
 		 310 aa  185  8e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0346238 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1642  tRNA pseudouridine synthase B  38.68 
 
 		 283 aa  185  9e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2203  tRNA pseudouridine synthase B  33.56 
 
 		 302 aa  184  2.0000000000000003e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.147231  normal  0.936738 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0988  tRNA pseudouridine synthase B  40.36 
 
 		 297 aa  183  3e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4643  tRNA pseudouridine synthase B  34.95 
 
 		 322 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0247266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1046  tRNA pseudouridine synthase B  38.98 
 
 		 304 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1424  tRNA pseudouridine synthase B  34.6 
 
 		 310 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0157045 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1415  tRNA pseudouridine synthase B  35.02 
 
 		 265 aa  181  1e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.334463  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1384  tRNA pseudouridine synthase B  34.26 
 
 		 310 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0908  tRNA pseudouridine synthase B  33.68 
 
 		 301 aa  178  9e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4178  tRNA pseudouridine synthase B  35.64 
 
 		 305 aa  178  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.224491  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4488  tRNA pseudouridine synthase B  35.64 
 
 		 305 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.140717  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1091  tRNA pseudouridine synthase B  35.96 
 
 		 303 aa  176  3e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0150332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2050  tRNA pseudouridine synthase B  35.58 
 
 		 302 aa  176  3e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0781  tRNA pseudouridine synthase B  34.6 
 
 		 305 aa  176  4e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00899616  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1291  tRNA pseudouridine synthase B  34.36 
 
 		 314 aa  176  6e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.227253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01762  tRNA pseudouridine synthase B  32.66 
 
 		 323 aa  174  9.999999999999999e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0258018  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0723  tRNA pseudouridine synthase B  35.29 
 
 		 305 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.806567  normal  0.0309098 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2450  tRNA pseudouridine synthase B  35.4 
 
 		 299 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.226071  normal  0.847147 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3072  tRNA pseudouridine synthase B  33.1 
 
 		 307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2029  tRNA pseudouridine synthase B  34.36 
 
 		 314 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0245667  normal  0.0911973 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4710  tRNA pseudouridine synthase B  34.6 
 
 		 305 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201435 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1005  tRNA pseudouridine synthase B  33.93 
 
 		 307 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.319279  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4575  tRNA pseudouridine synthase B  34.6 
 
 		 305 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0935427  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2227  tRNA pseudouridine synthase B  32.13 
 
 		 313 aa  172  5e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00164056  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0612  tRNA pseudouridine synthase B  35.42 
 
 		 298 aa  172  5.999999999999999e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.259864  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0981  tRNA pseudouridine synthase B  36.86 
 
 		 300 aa  171  1e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.256266  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1694  tRNA pseudouridine synthase B  38.1 
 
 		 328 aa  171  1e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00112277  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0903  pseudouridylate synthase  35.4 
 
 		 299 aa  171  2e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07870  tRNA pseudouridine 55 synthase  45.5 
 
 		 303 aa  170  2e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0727  tRNA pseudouridine synthase B  36.12 
 
 		 319 aa  169  3e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.414989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1703  tRNA pseudouridine synthase B  35.27 
 
 		 339 aa  170  3e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000149412 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3606  tRNA pseudouridine synthase B  33.69 
 
 		 306 aa  170  3e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825741  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1212  tRNA pseudouridine synthase B  33.9 
 
 		 318 aa  170  3e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.193622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0600  tRNA pseudouridine synthase B  34.6 
 
 		 318 aa  170  3e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2026  tRNA pseudouridine synthase B  33.9 
 
 		 315 aa  169  4e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0460  tRNA pseudouridine synthase B  36.05 
 
 		 309 aa  169  4e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1589  tRNA pseudouridine synthase B  33.33 
 
 		 304 aa  169  6e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000648729  normal  0.0689422 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1692  tRNA pseudouridine synthase B  38.71 
 
 		 305 aa  169  6e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1672  tRNA pseudouridine synthase B  36.55 
 
 		 292 aa  168  7e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000366042  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1212  tRNA pseudouridine synthase B  35.64 
 
 		 288 aa  167  1e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.977984  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0695  tRNA pseudouridine synthase B  33.92 
 
 		 298 aa  168  1e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.392139  normal  0.247417 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1119  tRNA pseudouridine synthase B  33.56 
 
 		 318 aa  167  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.717594  normal  0.307912 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42800  tRNA pseudouridine synthase B  33.33 
 
 		 305 aa  168  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1659  tRNA pseudouridine synthase B  35.85 
 
 		 303 aa  167  1e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1031  tRNA pseudouridine synthase B  41.98 
 
 		 308 aa  167  2e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2462  tRNA pseudouridine synthase B  35.45 
 
 		 307 aa  167  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0554606  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0929  tRNA pseudouridine synthase B  37.65 
 
 		 305 aa  167  2e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.590741  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1946  tRNA pseudouridine synthase B  32.73 
 
 		 308 aa  167  2e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0313874 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1225  tRNA pseudouridine synthase B  33.56 
 
 		 302 aa  166  2.9999999999999998e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.886706  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3558  tRNA pseudouridine synthase B  31.78 
 
 		 327 aa  166  4e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.567602  normal  0.599891 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03394  tRNA pseudouridine synthase B  33.56 
 
 		 314 aa  166  4e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0176  tRNA pseudouridine synthase B  32.75 
 
 		 312 aa  165  6.9999999999999995e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.721931  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2319  tRNA pseudouridine synthase B  32.67 
 
 		 301 aa  165  8e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.163994  hitchhiker  0.00744574 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2118  tRNA pseudouridine synthase B  32.87 
 
 		 308 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.206379  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0069  tRNA pseudouridine synthase B  33.45 
 
 		 302 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00601892  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3848  tRNA pseudouridine synthase B  35.21 
 
 		 307 aa  163  3e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3569  tRNA pseudouridine synthase B  35.56 
 
 		 307 aa  163  3e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0427188  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3387  tRNA pseudouridine synthase B  31.77 
 
 		 321 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00448784 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3857  tRNA pseudouridine synthase B  35.56 
 
 		 307 aa  162  6e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000159837  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1128  tRNA pseudouridine synthase B  33.98 
 
 		 297 aa  162  6e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.925084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3673  tRNA pseudouridine synthase B  32.2 
 
 		 294 aa  162  7e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0760058  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3821  tRNA pseudouridine synthase B  35.56 
 
 		 307 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.83095e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3661  tRNA pseudouridine synthase B  35.56 
 
 		 307 aa  161  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00496834  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3165  tRNA pseudouridine synthase B  36.47 
 
 		 309 aa  161  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.498601  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3947  tRNA pseudouridine synthase B  35.56 
 
 		 307 aa  161  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.70676  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3977  tRNA pseudouridine synthase B  32.41 
 
 		 291 aa  161  1e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.505383  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002611  tRNA pseudouridine synthase B  32.77 
 
 		 317 aa  161  1e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62730  tRNA pseudouridine synthase B  31.91 
 
 		 304 aa  161  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1158  tRNA pseudouridine synthase B  35.16 
 
 		 302 aa  161  1e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000801793  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3463  tRNA pseudouridine synthase B  31.36 
 
 		 318 aa  161  1e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2832  tRNA pseudouridine synthase B  31.08 
 
 		 318 aa  161  1e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.478015  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1598  tRNA pseudouridine synthase B  33.1 
 
 		 309 aa  160  2e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00177839  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1306  tRNA pseudouridine synthase B  35.37 
 
 		 295 aa  160  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000236822  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3551  tRNA pseudouridine synthase B  35.21 
 
 		 307 aa  160  3e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>