More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_20490 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_20490  Beta-galactosidase  100 
 
 
750 aa  1553    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000040433  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1095  Beta-galactosidase  58.42 
 
 
743 aa  893    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0951  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  42.18 
 
 
741 aa  545  1e-153  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  2.87628e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0826  glycosy hydrolase family protein  46.17 
 
 
804 aa  541  9.999999999999999e-153  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.241156  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0815  beta-galactosidase  45.78 
 
 
804 aa  539  9.999999999999999e-153  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.57434  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3487  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  40.34 
 
 
748 aa  522  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.628554 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3782  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  39.84 
 
 
747 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.148395  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4133  glycoside hydrolase family protein  41.04 
 
 
754 aa  518  1.0000000000000001e-145  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.894535  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2051  glycoside hydrolase family protein  30.6 
 
 
766 aa  296  7e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0832  glycoside hydrolase family protein  29.05 
 
 
979 aa  293  9e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0225317  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0539  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.41 
 
 
913 aa  289  1e-76  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.160142 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0684  DNA primase  27.6 
 
 
785 aa  285  2.0000000000000002e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.113069  hitchhiker  0.000000509357 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3338  glycoside hydrolase family protein  27.36 
 
 
781 aa  282  2e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0252466  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1071  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.36 
 
 
781 aa  280  5e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0819877  normal  0.0326582 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00239  beta-galactosidase  27.28 
 
 
763 aa  279  1e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1239  Carbohydrate binding family 6  26.39 
 
 
1015 aa  265  2e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000298242  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  27.07 
 
 
928 aa  265  3e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2757  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.04 
 
 
805 aa  264  4e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000135785  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0779  glycoside hydrolase family protein  25.82 
 
 
827 aa  254  6e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4074  glycoside hydrolase family protein  27.76 
 
 
806 aa  249  1e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.275726  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1810  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.07 
 
 
794 aa  247  6e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00809991  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0290  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.5 
 
 
986 aa  243  6e-63  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1667  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  31.57 
 
 
858 aa  241  4e-62  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.611357  normal  0.331093 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1474  beta-galactosidase  25.86 
 
 
1355 aa  232  2e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1016  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.41 
 
 
805 aa  229  1e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3378  glycoside hydrolase family protein  25.65 
 
 
919 aa  229  1e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.825793  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0992  glycoside hydrolase family protein  27.52 
 
 
932 aa  221  3e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0295666  normal  0.0129496 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1292  Beta-galactosidase  27.57 
 
 
862 aa  222  3e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.016367  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1941  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  24.57 
 
 
903 aa  219  1e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.615536  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3378  glycoside hydrolase family protein  26.91 
 
 
984 aa  218  4e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06388  beta-galactosidase (Eurofung)  25.66 
 
 
891 aa  217  5e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0102  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.73 
 
 
1781 aa  217  7e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.432951 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2111  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.51 
 
 
787 aa  213  1e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4083  glycoside hydrolase family protein  27.69 
 
 
832 aa  213  2e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1719  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  25.49 
 
 
922 aa  212  3e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.149509  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4197  glycoside hydrolase family protein  28.64 
 
 
803 aa  207  4e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4039  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  25.77 
 
 
811 aa  207  5e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.115808  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2520  glycoside hydrolase family protein  26.24 
 
 
925 aa  206  9e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6171  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.7 
 
 
813 aa  200  1.0000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0434587  normal  0.0455178 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3882  beta-galactosidase  26.5 
 
 
961 aa  196  2e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0857074  normal  0.216431 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0624  Beta-galactosidase  26.74 
 
 
894 aa  192  2e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0265527  normal  0.150404 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3111  glycoside hydrolase family protein  24.24 
 
 
806 aa  191  2.9999999999999997e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.634657  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2700  Beta-galactosidase  25.86 
 
 
848 aa  190  5.999999999999999e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000378241  normal  0.397467 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1177  threonine synthase  24.4 
 
 
859 aa  189  1e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0725955  hitchhiker  0.0000211988 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1355  glycoside hydrolase family protein  23.99 
 
 
873 aa  189  2e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1285  Beta-galactosidase/beta-glucuronidase-like  24.71 
 
 
824 aa  186  2.0000000000000003e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0106  Beta-galactosidase  23.45 
 
 
815 aa  184  4.0000000000000006e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2929  glycoside hydrolase family protein  30.56 
 
 
807 aa  184  7e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.113519  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3669  glycoside hydrolase family protein  25.58 
 
 
888 aa  181  4e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2734  Beta-galactosidase  24.78 
 
 
897 aa  181  4e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0857  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.05 
 
 
837 aa  181  4.999999999999999e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0590  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.27 
 
 
824 aa  176  9.999999999999999e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.429142  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0804  glycoside hydrolase family protein  28.34 
 
 
858 aa  175  2.9999999999999996e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3193  glycoside hydrolase family protein  28.15 
 
 
825 aa  171  5e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360698  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2654  Beta-galactosidase  28.08 
 
 
704 aa  170  8e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0659127  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2424  beta-galactosidase  25.36 
 
 
964 aa  165  3e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.313743  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2609  Beta-galactosidase  29.37 
 
 
738 aa  164  4.0000000000000004e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4225  glycoside hydrolase family protein  30.21 
 
 
951 aa  164  7e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.812558  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3159  glycoside hydrolase family protein  28.42 
 
 
799 aa  164  7e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3122  Beta-galactosidase  27.45 
 
 
972 aa  164  8.000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3226  glycoside hydrolase family protein  30.47 
 
 
829 aa  163  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2370  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  30.12 
 
 
1026 aa  162  2e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0768675  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4075  glycoside hydrolase family protein  24.41 
 
 
1175 aa  161  4e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.589786  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2734  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.53 
 
 
920 aa  159  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4659  glycoside hydrolase family protein  27.15 
 
 
655 aa  158  4e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.788478 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6868  Beta-galactosidase  26.96 
 
 
707 aa  158  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2082  Beta-glucuronidase  26.9 
 
 
600 aa  158  4e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.177163  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2782  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.56 
 
 
920 aa  157  7e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.396863  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2632  HflK  30.81 
 
 
607 aa  155  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000143868  normal  0.498277 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0081  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.18 
 
 
808 aa  155  2e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0579  Beta-glucuronidase  29.13 
 
 
597 aa  155  2.9999999999999998e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.588322 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1283  glycoside hydrolase family protein  30.81 
 
 
987 aa  155  2.9999999999999998e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.64034  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2419  Beta-galactosidase  26.54 
 
 
686 aa  152  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29894  normal  0.49724 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1011  Beta-galactosidase  28.5 
 
 
1019 aa  152  2e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00111283  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2935  beta-galactosidase  24.96 
 
 
604 aa  151  3e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2816  Beta-galactosidase  23.99 
 
 
1171 aa  152  3e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4208  Beta-galactosidase  28.51 
 
 
587 aa  152  3e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1013  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  31.53 
 
 
1033 aa  150  6e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.188379  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3226  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.68 
 
 
1033 aa  150  9e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.553706  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1539  beta-D-glucuronidase  29.58 
 
 
577 aa  149  2.0000000000000003e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0549709  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2842  Beta-glucuronidase  30.65 
 
 
568 aa  149  2.0000000000000003e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0277834  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0715  Beta-galactosidase  26.79 
 
 
1024 aa  148  3e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0824  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.44 
 
 
1264 aa  147  9e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000954733  decreased coverage  0.00757756 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1973  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  27.96 
 
 
1030 aa  146  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.75541  hitchhiker  0.00919107 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0534  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  28.97 
 
 
1013 aa  145  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4139  Beta-galactosidase  27.46 
 
 
1129 aa  145  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.852691 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1386  Beta-glucuronidase  30.32 
 
 
558 aa  144  8e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0490  Beta-glucuronidase  28.61 
 
 
564 aa  143  9.999999999999999e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1582  beta-D-glucuronidase  25.75 
 
 
603 aa  141  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3258  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  30.97 
 
 
1030 aa  141  4.999999999999999e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1689  Beta-glucuronidase  28.28 
 
 
563 aa  140  7e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0566843  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20590  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.47 
 
 
892 aa  140  7.999999999999999e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0624  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  30.77 
 
 
1030 aa  140  8.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02945  cryptic beta-D-galactosidase, alpha subunit  31.16 
 
 
1030 aa  139  1e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2041  Beta-glucuronidase  27.55 
 
 
601 aa  140  1e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00438067  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0665  beta-galactosidase  26.37 
 
 
1112 aa  140  1e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1666  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  30.02 
 
 
1289 aa  140  1e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.114513 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3370  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  30.88 
 
 
1030 aa  140  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02895  hypothetical protein  31.16 
 
 
1030 aa  139  1e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3543  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  31.16 
 
 
1030 aa  139  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>