More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5035 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5035  MATE efflux family protein  100 
 
 		 469 aa  904    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.88746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  32.29 
 
 		 461 aa  185  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  28.79 
 
 		 453 aa  183  6e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  29.02 
 
 		 464 aa  171  3e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  27.89 
 
 		 464 aa  164  5.0000000000000005e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  32.74 
 
 		 468 aa  164  5.0000000000000005e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  27.89 
 
 		 464 aa  163  8.000000000000001e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  29.16 
 
 		 445 aa  162  1e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  29.98 
 
 		 483 aa  161  3e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3815  MATE efflux family protein  30.77 
 
 		 467 aa  159  1e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.142559  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  27.4 
 
 		 469 aa  159  1e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  27.69 
 
 		 475 aa  157  3e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  28.13 
 
 		 450 aa  155  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  26.23 
 
 		 438 aa  153  8e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  30.75 
 
 		 486 aa  152  8.999999999999999e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0055  MATE efflux family protein  27.96 
 
 		 446 aa  152  1e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3642  multi anti extrusion protein MatE  29.37 
 
 		 496 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104533  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  28.48 
 
 		 467 aa  149  1.0000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3962  multi antimicrobial extrusion protein  29.84 
 
 		 492 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.789789  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1899  putative MATE efflux protein  24.23 
 
 		 469 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00227155  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1419  MATE efflux family protein  23.3 
 
 		 469 aa  147  3e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.703884  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1641  MATE efflux family protein  23.13 
 
 		 469 aa  147  3e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.725642  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  26.46 
 
 		 500 aa  147  4.0000000000000006e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1846  integral membrane protein, putative  24.23 
 
 		 469 aa  147  5e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563684  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1787  putative MATE efflux protein  24.23 
 
 		 469 aa  147  5e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1621  Na+ driven multidrug efflux pump  24.01 
 
 		 469 aa  145  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1591  Na+ driven multidrug efflux pump  24.01 
 
 		 469 aa  145  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742873  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1823  putative MATE efflux protein  24.01 
 
 		 469 aa  145  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2333  MATE efflux family protein  31.63 
 
 		 456 aa  145  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  26.46 
 
 		 475 aa  144  3e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  27.27 
 
 		 458 aa  144  4e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  28.92 
 
 		 459 aa  144  4e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000335028  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3565  MATE efflux family protein  30.57 
 
 		 452 aa  144  4e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3059  MATE efflux family protein  24.2 
 
 		 469 aa  142  9e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.231532  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3296  MATE efflux family protein  24.2 
 
 		 469 aa  142  9e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660304  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  26.8 
 
 		 460 aa  142  9.999999999999999e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  29.14 
 
 		 469 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  29.57 
 
 		 458 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3557  putative MATE efflux protein  23.57 
 
 		 469 aa  141  3e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  28.48 
 
 		 485 aa  140  6e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1418  MATE efflux family protein  30.12 
 
 		 462 aa  139  7e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  31.62 
 
 		 490 aa  138  2e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  27.15 
 
 		 500 aa  137  3.0000000000000003e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1159  MATE efflux family protein  24.68 
 
 		 478 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.666411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3337  MATE efflux family protein  30.34 
 
 		 470 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  28.11 
 
 		 498 aa  137  4e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  23.76 
 
 		 460 aa  136  6.0000000000000005e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  28.16 
 
 		 518 aa  136  8e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  28.16 
 
 		 458 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  25.62 
 
 		 468 aa  135  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0427  MATE efflux family protein  26.54 
 
 		 446 aa  134  3e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.744275  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  28.15 
 
 		 525 aa  134  3e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  27.38 
 
 		 538 aa  134  5e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3177  MATE efflux family protein  24.61 
 
 		 469 aa  133  6e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.186099  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0279  MATE efflux family protein  23.36 
 
 		 445 aa  132  9e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1839  MATE efflux family protein  25.26 
 
 		 480 aa  132  9e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2862  MATE efflux family protein  23.56 
 
 		 469 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.83664  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0358  multi anti extrusion protein MatE  29.29 
 
 		 452 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000377442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2766  MATE efflux family protein  25.05 
 
 		 453 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0984562  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1166  ABC transporter releated protein  25.96 
 
 		 463 aa  131  3e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.403976 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3884  MATE efflux family protein  28.69 
 
 		 521 aa  129  9.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1160  MATE efflux family protein  28.82 
 
 		 486 aa  129  2.0000000000000002e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  27.56 
 
 		 481 aa  127  6e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3129  MATE efflux family protein  29.55 
 
 		 452 aa  126  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4400  MATE efflux family protein  31.32 
 
 		 453 aa  125  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  26.7 
 
 		 454 aa  125  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1541  MATE efflux family protein  30.79 
 
 		 486 aa  125  2e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.127259  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0618  MATE efflux family protein  25.66 
 
 		 505 aa  125  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.316241  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0440  MATE efflux family protein  28.82 
 
 		 470 aa  123  7e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.589921  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2508  multi anti extrusion protein MatE  29.21 
 
 		 463 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  23.94 
 
 		 462 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2869  MATE efflux family protein  27.17 
 
 		 472 aa  122  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0768419  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  26.61 
 
 		 554 aa  122  1.9999999999999998e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1067  MATE efflux family protein  25.62 
 
 		 453 aa  121  3e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000154468  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1736  MATE efflux family protein  29.16 
 
 		 472 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.282832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4310  MATE efflux family protein  31.31 
 
 		 451 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  27.33 
 
 		 499 aa  120  6e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2173  MATE efflux family protein  27.19 
 
 		 481 aa  120  6e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.843006 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4087  MATE efflux family protein  29.82 
 
 		 447 aa  119  9e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2653  MATE efflux family protein  28.97 
 
 		 484 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2423  MATE efflux family protein  29.95 
 
 		 451 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0441886  normal  0.25868 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  25.51 
 
 		 470 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0640  MATE efflux family protein  32.77 
 
 		 454 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.690668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0316  MATE efflux family protein  24.22 
 
 		 444 aa  118  1.9999999999999998e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000262265  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3993  MATE efflux family protein  29.82 
 
 		 447 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0764  MATE family efflux pump NorM  29.95 
 
 		 451 aa  118  3e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1841  MATE efflux family protein  30.73 
 
 		 469 aa  118  3e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2347  MATE efflux family protein  26.74 
 
 		 476 aa  117  5e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03157  hypothetical protein  28.12 
 
 		 455 aa  116  6.9999999999999995e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.367645 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  27.42 
 
 		 455 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2828  MATE efflux family protein  22.5 
 
 		 463 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2514  MATE efflux family protein  22.5 
 
 		 463 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1851  MATE efflux family protein  25.05 
 
 		 475 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00783953  normal  0.201536 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  25.64 
 
 		 500 aa  115  2.0000000000000002e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  23.11 
 
 		 462 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0686  MATE efflux family protein  30.48 
 
 		 498 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.221481  normal  0.278001 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0091  MATE efflux family protein  32.11 
 
 		 454 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2439  MATE efflux family protein  26.69 
 
 		 485 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.739641  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2889  MATE efflux family protein  24.68 
 
 		 471 aa  114  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.78127  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1058  MATE efflux family protein  23.78 
 
 		 453 aa  114  3e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>