106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1283 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1283  regulatory protein TetR  100 
 
 		 205 aa  423  1e-117  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2004  regulatory protein TetR  40.41 
 
 		 216 aa  136  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.84069  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3213  transcriptional regulator, TetR family  32.02 
 
 		 195 aa  104  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000469892  normal  0.140374 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2098  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 199 aa  101  7e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0785695  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1897  transcriptional regulator, TetR family  27.6 
 
 		 200 aa  78.2  0.00000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0417503  decreased coverage  0.000000883258 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0070  transcriptional regulator, TetR family  25.87 
 
 		 202 aa  76.6  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00707412 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3202  transcriptional regulator, TetR family  28.19 
 
 		 193 aa  75.9  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2823  transcriptional regulator, TetR family  28.28 
 
 		 208 aa  74.3  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00548665  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0669  transcriptional regulator, TetR family  25.95 
 
 		 240 aa  68.6  0.00000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.922821  hitchhiker  0.000725922 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6787  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2894  transcriptional regulator, TetR family  54.72 
 
 		 218 aa  61.2  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6786  TetR family transcriptional regulator  53.7 
 
 		 199 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12460  hypothetical protein  29.44 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2260  transcriptional regulator, TetR family  25.71 
 
 		 201 aa  58.2  0.00000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0104994  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1672  transcriptional regulator, TetR family  31.78 
 
 		 184 aa  53.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4264  transcriptional regulator, TetR family  33.1 
 
 		 189 aa  52  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2806  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 193 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00749048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 206 aa  48.9  0.00005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2752  TetR family transcriptional regulator  50.85 
 
 		 193 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.208461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3277  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 275 aa  46.6  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1372  regulatory protein, TetR  33.73 
 
 		 193 aa  47  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0306025  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2779  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 185 aa  47.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.441306  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1598  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 239 aa  46.6  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.235097  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3936  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 197 aa  45.8  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0494347  normal  0.157135 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1768  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 181 aa  45.8  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0908345  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0378  TetR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 199 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.585496  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2813  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 215 aa  45.4  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2855  transcriptional regulator, TetR family  35.19 
 
 		 199 aa  45.8  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00414349  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38620  hypothetical protein  27.91 
 
 		 186 aa  45.8  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4578  TetR family transcriptional regulator  23.49 
 
 		 238 aa  45.1  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127543  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3014  TetR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 258 aa  45.1  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00422654  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0312  transcriptional regulator, TetR family  30.19 
 
 		 206 aa  45.1  0.0008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000380117  normal  0.28635 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00750  transcriptional regulator  38.46 
 
 		 197 aa  44.7  0.0009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.935342  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1807  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 218 aa  44.3  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.237257  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3920  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 227 aa  43.9  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.62554  normal  0.13671 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4464  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 278 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3902  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 278 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2904  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 213 aa  43.9  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1337  TetR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 182 aa  44.3  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.143088 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3493  TetR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 222 aa  44.3  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.50615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3625  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 278 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662049  normal  0.863638 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3796  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 275 aa  44.3  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1806  transcriptional regulator, TetR family  24.85 
 
 		 207 aa  44.7  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.382485 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2956  transcriptional regulator, TetR family  37.29 
 
 		 207 aa  44.7  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2190  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 277 aa  43.9  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.168858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2257  TetR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 202 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.92818  normal  0.36633 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3212  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 213 aa  43.9  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1244  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 206 aa  43.5  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218846 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0382  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 242 aa  43.5  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.894324  normal  0.190078 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00620  Transcriptional regulatory protein, TetR family  40 
 
 		 227 aa  43.9  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1769  transcriptional regulator, TetR family  35.19 
 
 		 198 aa  43.5  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  30.34 
 
 		 255 aa  43.5  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31770  hypothetical protein  23.27 
 
 		 198 aa  43.5  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.590627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 206 aa  43.5  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1277  transcriptional regulator, TetR family  25.69 
 
 		 211 aa  43.5  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0101868  normal  0.0726815 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3508  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 227 aa  42.7  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.343043  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0658  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 195 aa  43.1  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.609022  normal  0.929409 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3999  regulatory protein, TetR  36.11 
 
 		 258 aa  43.1  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163281  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0876  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 226 aa  43.1  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.140831 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4681  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 283 aa  42.7  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1756  transcriptional regulator, TetR family  24.14 
 
 		 205 aa  43.1  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000229906 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5928  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 215 aa  42.7  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 186 aa  43.1  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_002936  DET1436  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 125 aa  42.7  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000772402  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4326  TetR family transcriptional regulator  19.71 
 
 		 202 aa  42.7  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4936  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 211 aa  42.7  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0351  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 230 aa  42.4  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0373  TetR family transcriptional regulator  19.57 
 
 		 188 aa  42.7  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13083  DeoR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 202 aa  42.7  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2624  transcriptional regulator, TetR family  32.38 
 
 		 210 aa  42.7  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.465145  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1173  TetR family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 189 aa  42.4  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4995  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 198 aa  42.7  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0308  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 190 aa  42.4  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000556725 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 238 aa  42.4  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3173  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 245 aa  42.4  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2880  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 195 aa  42.4  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0556  TetR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 228 aa  42.4  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6209  transcriptional regulator, TetR family  32.18 
 
 		 208 aa  42.4  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28270  transcriptional regulator  35.71 
 
 		 205 aa  42.4  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.188874 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1330  putative DNA-binding transcriptional regulator  28.7 
 
 		 232 aa  42  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.745262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4551  regulatory protein TetR  25.36 
 
 		 217 aa  42  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1537  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 234 aa  42  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  30.53 
 
 		 263 aa  42  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1606  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 225 aa  41.6  0.007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.912424  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3021  regulatory protein, TetR  35.06 
 
 		 205 aa  41.6  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.84883  normal  0.636371 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3200  TetR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 224 aa  42  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.415485  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3262  TetR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 224 aa  42  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.376016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3209  TetR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 224 aa  42  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2892  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 227 aa  41.6  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0741527  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3573  transcriptional regulator, TetR family  26.89 
 
 		 196 aa  41.6  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5101  transcriptional regulator, TetR family  27.13 
 
 		 188 aa  41.6  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.375326  normal  0.313411 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0666  transcriptional regulator  36.54 
 
 		 205 aa  41.6  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36300  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 194 aa  41.6  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.564712  normal  0.0790295 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3503  TetR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 198 aa  41.6  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3363  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 244 aa  41.6  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0676561  hitchhiker  0.0000000000000226443 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6341  TetR family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 206 aa  41.6  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0497044  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1738  TetR family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 206 aa  41.6  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3073  TetR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 198 aa  41.6  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1751  TetR family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 206 aa  41.6  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  23.68 
 
 		 226 aa  41.6  0.009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>