More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0053 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0160  YD repeat protein  46.27 
 
 		 2165 aa  1513    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0053  YD repeat protein  100 
 
 		 2075 aa  4304    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.192291  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0197  Rhs family protein-like protein  22.83 
 
 		 2413 aa  261  8e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3020  hypothetical protein  26.26 
 
 		 2762 aa  171  1e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.664598  normal  0.0507807 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3249  Rhs family protein-like  24.4 
 
 		 2513 aa  167  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.139311 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0137  Integrins alpha chain  25.13 
 
 		 2497 aa  162  7e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  25.23 
 
 		 1271 aa  154  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  25.5 
 
 		 1352 aa  151  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  25.32 
 
 		 2096 aa  149  7.0000000000000006e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2031  YD repeat-containing protein  23.06 
 
 		 2402 aa  135  6e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.063176 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0198  YD repeat-containing protein  23.21 
 
 		 3333 aa  132  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00448474 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1158  YD repeat-containing protein  26.24 
 
 		 1517 aa  128  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0480723  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0201  hypothetical protein  28.17 
 
 		 722 aa  128  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1703  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  25.64 
 
 		 2094 aa  127  2e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  22.86 
 
 		 927 aa  127  3e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1124  YD repeat-containing protein  31.85 
 
 		 2401 aa  127  3e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3898  YD repeat-containing protein  31.85 
 
 		 2283 aa  126  3e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1180  YD repeat-containing protein  31.85 
 
 		 2437 aa  126  4e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.265366 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3576  YD repeat protein  24.22 
 
 		 2149 aa  125  6e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  hitchhiker  0.00854554 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  22.99 
 
 		 2035 aa  125  7e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002889  Rhs family protein  27.48 
 
 		 2416 aa  124  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  23.82 
 
 		 1840 aa  118  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07080  hypothetical protein  40.44 
 
 		 2428 aa  118  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02052  hypothetical protein  32.18 
 
 		 1854 aa  117  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1371  YD repeat-containing protein  23.13 
 
 		 1959 aa  112  7.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  23.68 
 
 		 1917 aa  111  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2165  YD repeat-containing protein  27.01 
 
 		 2448 aa  112  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5510  YD repeat-containing protein  23.39 
 
 		 1390 aa  109  6e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.162905  normal  0.931179 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  23.22 
 
 		 1600 aa  108  9e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  22.14 
 
 		 1942 aa  107  4e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3017  YD repeat-containing protein  24.86 
 
 		 1149 aa  106  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  25.36 
 
 		 3027 aa  106  6e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  24.29 
 
 		 1834 aa  105  1e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1422  YD repeat-containing protein  23.77 
 
 		 1197 aa  104  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.645858  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  24.69 
 
 		 1568 aa  104  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0317  Rhs family protein  24.82 
 
 		 924 aa  103  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.325486  normal  0.374096 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0303  YD repeat-containing protein  23.83 
 
 		 3273 aa  103  5e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20520  hypothetical protein  24.43 
 
 		 903 aa  102  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000061545  normal  0.488224 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02048  hypothetical protein  32.42 
 
 		 583 aa  100  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0129  Rhs family protein  24.78 
 
 		 1427 aa  100  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3232  YD repeat-containing protein  22.47 
 
 		 1669 aa  99.4  7e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08820  Rhs family protein  23.95 
 
 		 1485 aa  98.2  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0271193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2437  YD repeat-containing protein  23.67 
 
 		 690 aa  98.2  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1682  YD repeat-containing protein  37.68 
 
 		 474 aa  97.1  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1689  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  37.68 
 
 		 482 aa  97.1  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2167  YD repeat-containing protein  40.62 
 
 		 622 aa  96.7  5e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4802  hypothetical protein  23.18 
 
 		 2017 aa  95.9  7e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.772458  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  23.75 
 
 		 1611 aa  95.9  8e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0648  Rhs family protein  21.83 
 
 		 1446 aa  95.1  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000723582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0173  Rhs family protein  24.31 
 
 		 1381 aa  94.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8624  YD repeat protein  26.79 
 
 		 1528 aa  94.4  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.165231  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2231  FG-GAP/YD repeat-containing protein  21.22 
 
 		 1825 aa  94.7  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.685998  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3481  YD repeat-containing protein  23 
 
 		 1586 aa  94.7  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130925  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  22.75 
 
 		 1531 aa  93.6  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32830  hypothetical protein  24.2 
 
 		 889 aa  92.8  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000050197  hitchhiker  0.0000345173 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0044  hypothetical protein  28.02 
 
 		 2117 aa  92.4  8e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2323  hypothetical protein  42.48 
 
 		 554 aa  92.4  9e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0008  FG-GAP/YD repeat-containing protein  21.44 
 
 		 1806 aa  92  9e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.957829  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5681  RHS protein  23.36 
 
 		 1609 aa  92.4  9e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2855  FG-GAP/YD repeat-containing protein  21.22 
 
 		 1825 aa  92.4  9e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0248  YD repeat protein  22.53 
 
 		 1434 aa  92  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4085  RHS family protein, putative  22.69 
 
 		 1530 aa  92  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.572678  normal  0.0133781 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6085  YD repeat-containing protein  21.8 
 
 		 1410 aa  91.7  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2036  YD repeat-containing protein  23.77 
 
 		 3073 aa  91.3  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32860  Rhs family protein  25.28 
 
 		 1259 aa  90.9  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.390343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0132  YD repeat protein  24.19 
 
 		 2349 aa  90.1  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0941  YD repeat protein  23.25 
 
 		 1467 aa  90.1  4e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.125138  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2740  YD repeat-containing protein  26.39 
 
 		 1602 aa  90.1  4e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3712  YD repeat-containing protein  25.05 
 
 		 1490 aa  90.1  4e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.913964 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  22.77 
 
 		 1400 aa  89.7  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  23.41 
 
 		 2277 aa  89.4  6e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6268  YD repeat-containing protein  24.84 
 
 		 1623 aa  89.7  6e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8635  YD repeat protein  24.05 
 
 		 1489 aa  89.4  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2434  RHS protein  21.62 
 
 		 1348 aa  89.4  7e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6210  RHS protein  22.27 
 
 		 1421 aa  89  9e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0158165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2808  peptidase C39, bacteriocin processing  23.18 
 
 		 1599 aa  89  9e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4544  YD repeat protein  22.6 
 
 		 1488 aa  89  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0377133  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0766  YD repeat-containing protein  22.92 
 
 		 1466 aa  87.8  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.668703  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0160  YD repeat protein  25.19 
 
 		 2658 aa  88.2  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6684  YD repeat-containing protein  21.82 
 
 		 1149 aa  87.4  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.198743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4158  YD repeat-containing protein  22.16 
 
 		 1198 aa  87  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.529985 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1434  YD repeat-containing protein  23.9 
 
 		 1553 aa  87.4  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.16383  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3344  PAAR  21.73 
 
 		 1494 aa  86.3  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.0030504  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5023  YD repeat-containing protein  21.73 
 
 		 1494 aa  86.3  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00366927  normal  0.185239 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0606  Rhs family protein  21.41 
 
 		 2031 aa  86.3  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0622  FG-GAP/YD repeat-containing protein  21.41 
 
 		 2031 aa  86.3  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4514  YD repeat-containing protein  23.26 
 
 		 3689 aa  85.9  0.000000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40016 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2107  YD repeat protein  26.28 
 
 		 1681 aa  85.9  0.000000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0507  FG-GAP/YD repeat-containing protein  21.21 
 
 		 2032 aa  85.9  0.000000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584165  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0698  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  22.87 
 
 		 1492 aa  85.5  0.000000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0792  FG-GAP/YD repeat-containing protein  21.41 
 
 		 2031 aa  85.5  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.766885  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1171  rhsD protein  24.85 
 
 		 1543 aa  85.1  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2806  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  24.56 
 
 		 1552 aa  85.5  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2167  YD repeat-containing protein  23.2 
 
 		 2003 aa  85.5  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154621 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8640  YD repeat protein  21.97 
 
 		 1518 aa  84.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.357358  normal  0.924086 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2104  rhsD protein  23.22 
 
 		 1593 aa  84.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0967057  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0148  YD repeat protein  24.7 
 
 		 765 aa  84.7  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  23.06 
 
 		 1981 aa  84.3  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1826  Rhs family protein  24.27 
 
 		 1429 aa  84  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831768  normal  0.546607 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4951  YD repeat-containing protein  23.67 
 
 		 1495 aa  83.2  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.746977 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>