More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0521 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_0521  PA14 domain protein  100 
 
 
841 aa  1672    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.387199  hitchhiker  0.000185661 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1249  PKD domain-containing protein  45.58 
 
 
712 aa  543  1e-153  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.8229  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2965  PKD domain-containing protein  35.74 
 
 
1029 aa  281  5e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.651624  normal  0.0385802 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0779  PKD domain-containing protein  32.19 
 
 
999 aa  234  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0794  PKD domain-containing protein  32.19 
 
 
999 aa  234  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135837  normal  0.0870072 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0775  PKD domain-containing protein  32.42 
 
 
999 aa  233  2e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.482876  normal  0.807579 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  29.42 
 
 
1657 aa  201  5e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36860  glucose/sorbosone dehydrogenase  30.42 
 
 
892 aa  188  3e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.095894  normal  0.0512972 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3324  carbohydrate-binding family 6 protein  27.56 
 
 
972 aa  180  1e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  31.42 
 
 
1505 aa  178  5e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3787  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  30.12 
 
 
945 aa  172  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339008  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4878  PKD domain containing protein  26.6 
 
 
1081 aa  161  4e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846856  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  28.7 
 
 
1132 aa  155  4e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2887  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  35.48 
 
 
396 aa  149  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0670261 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2778  PA14 domain protein  48.55 
 
 
978 aa  144  5e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0316  PA14  44.93 
 
 
644 aa  144  9.999999999999999e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.914268  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12340  glucose/sorbosone dehydrogenase  26.75 
 
 
1200 aa  143  9.999999999999999e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.217847 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0158  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  32.57 
 
 
450 aa  141  4.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2489  hypothetical protein  35.47 
 
 
371 aa  138  4e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.234547 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2666  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  35.44 
 
 
388 aa  136  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000177131  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0485  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  34.71 
 
 
387 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.335617  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7275  PKD domain containing protein  25.67 
 
 
1138 aa  134  5e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000186518  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7912  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  34.73 
 
 
953 aa  134  6e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241269  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  29.55 
 
 
1444 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1591  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  33.61 
 
 
414 aa  132  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.310287  normal  0.391722 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1092  PA14 domain protein  43.66 
 
 
613 aa  131  4.0000000000000003e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12748  hypothetical protein  30.33 
 
 
461 aa  129  2.0000000000000002e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.895209  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0363  glucose sorbosone dehydrogenase  35.17 
 
 
422 aa  128  5e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.510495  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4405  HHIPL1; HHIP-like 1  32.82 
 
 
471 aa  127  9e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0608136  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6513  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  34.46 
 
 
392 aa  126  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.576185  normal  0.706231 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2680  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  45.73 
 
 
1206 aa  125  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.117789 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2448  PA14 domain protein  40 
 
 
1141 aa  125  5e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84904  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1146  hypothetical protein  46.83 
 
 
1504 aa  123  9.999999999999999e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0140  hypothetical protein  32.17 
 
 
469 aa  123  1.9999999999999998e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0959  hypothetical protein  32.37 
 
 
419 aa  122  3.9999999999999996e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0391  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  33.75 
 
 
455 aa  121  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.101157 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1286  blue (type1) copper domain-containing protein  33.15 
 
 
482 aa  121  4.9999999999999996e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.185523  normal  0.569108 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1903  Carbohydrate binding family 6  24.75 
 
 
918 aa  120  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.602156  normal  0.263579 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4030  PKD domain containing protein  24.12 
 
 
1182 aa  117  6.9999999999999995e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.775047 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2208  PKD domain containing protein  26.47 
 
 
908 aa  117  8.999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0778173  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2188  cytochrome c class I  26.5 
 
 
1151 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  41.3 
 
 
14944 aa  116  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2646  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  33.04 
 
 
367 aa  116  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0744943  normal  0.337363 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4672  PKD domain containing protein  26.58 
 
 
941 aa  115  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.612479  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0153  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  34.46 
 
 
488 aa  114  6e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1569  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  33.43 
 
 
388 aa  114  8.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0140  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  31.9 
 
 
451 aa  114  9e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.5933  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2421  blue (type1) copper domain-containing protein  31.47 
 
 
676 aa  114  1.0000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5245  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  32.9 
 
 
585 aa  113  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3440  PKD domain containing protein  25.86 
 
 
1143 aa  114  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1830  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  30.13 
 
 
442 aa  112  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922433  normal  0.747295 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2155  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  31.43 
 
 
427 aa  111  5e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00567521 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1484  PKD domain containing protein  24.87 
 
 
918 aa  110  9.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.287223 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1540  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  31.54 
 
 
403 aa  110  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1010  PKD domain-containing protein  31.92 
 
 
342 aa  108  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.740866  normal  0.234047 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4181  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  29.47 
 
 
570 aa  108  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.100139  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1991  blue (type 1) copper domain protein  29.06 
 
 
766 aa  108  5e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3278  glucose sorbosone dehydrogenase  32.7 
 
 
394 aa  108  5e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5054  PKD domain containing protein  23.71 
 
 
1135 aa  106  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4398  PKD domain containing protein  24.96 
 
 
1142 aa  104  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0061097  normal  0.588694 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  31.68 
 
 
809 aa  103  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0370  Galactose oxidase  38.17 
 
 
918 aa  102  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0335  PKD domain containing protein  25.34 
 
 
984 aa  102  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.16291  normal  0.953666 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0675  Carbohydrate binding family 6  30.47 
 
 
875 aa  100  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.783168 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3557  glucose sorbosone dehydrogenase  33.33 
 
 
374 aa  100  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194162  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8062  Quinoprotein glucose dehydrogenase  32.21 
 
 
360 aa  99.8  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3233  hypothetical protein  39.1 
 
 
4465 aa  99.4  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.226873 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4560  glucose sorbosone dehydrogenase  31.7 
 
 
381 aa  98.6  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.321101  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3428  glucose sorbosone dehydrogenase  30.06 
 
 
389 aa  98.6  4e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1937  carbohydrate-binding family 6 protein  31.45 
 
 
263 aa  98.2  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1268  PA14 domain-containing protein  37.6 
 
 
578 aa  98.6  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.29777 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2694  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  31.56 
 
 
520 aa  97.8  8e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.439378  normal  0.199707 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1687  PA14 domain-containing protein  40.19 
 
 
584 aa  95.9  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000321103 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5756  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  31.53 
 
 
460 aa  95.5  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1130  hypothetical protein  31.62 
 
 
400 aa  95.5  4e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2403  PA14 domain protein  32.39 
 
 
1172 aa  94.4  7e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5794  glucose sorbosone dehydrogenase  34.08 
 
 
388 aa  93.6  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.937217 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03856  glucan 1,4-beta-glucosidase  34.81 
 
 
904 aa  92.4  3e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2375  glucose/sorbosone dehydrogenases-like  26.51 
 
 
2172 aa  92  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.842796  normal  0.181989 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4643  OmpA/MotB domain protein  31.54 
 
 
361 aa  91.3  7e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000815983  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5332  PKD domain containing protein  24.83 
 
 
909 aa  90.5  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0649636  normal  0.493539 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0989  hypothetical protein  27.34 
 
 
475 aa  89.4  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0542  glucose sorbosone dehydrogenase  29.9 
 
 
385 aa  89.7  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1715  hypothetical protein  27.73 
 
 
394 aa  89.4  2e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.296099  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0474  glucose/sorbosone dehydrogenase  27.33 
 
 
369 aa  89  4e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0760  glucose sorbosone dehydrogenase  25.73 
 
 
387 aa  88.2  6e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0733756  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0509  glucose sorbosone dehydrogenase  33.69 
 
 
385 aa  88.2  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.760601  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1224  hypothetical protein  28.53 
 
 
398 aa  88.2  6e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.303019  normal  0.552765 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1294  glucose sorbosone dehydrogenase  28.92 
 
 
391 aa  87.8  7e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.298447  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1322  glucose sorbosone dehydrogenase  31.8 
 
 
399 aa  87.8  8e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0828348  normal  0.2304 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0538  glucose sorbosone dehydrogenase  29.64 
 
 
385 aa  87  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6298  hypothetical protein  26.76 
 
 
464 aa  86.7  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.731979 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1116  hypothetical protein  30.03 
 
 
369 aa  86.3  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0131047 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0965  glucose sorbosone dehydrogenase  30 
 
 
404 aa  86.3  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.654597  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6292  PA14 domain protein  35.21 
 
 
1314 aa  86.7  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.237878 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2732  glucose sorbosone dehydrogenase  35.27 
 
 
442 aa  85.5  0.000000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0741  blue (type 1) copper domain protein  32.21 
 
 
748 aa  84.3  0.000000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0845  glucose sorbosone dehydrogenase  32.19 
 
 
401 aa  83.6  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2824  glucose sorbosone dehydrogenase  31.93 
 
 
406 aa  83.6  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2231  putative oxidoreductase  29.96 
 
 
388 aa  82.4  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.13844  hitchhiker  0.00253224 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>