More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2625 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1865  integrase family protein  90.52 
 
 		 401 aa  743    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.94549  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31280  putative integrase  90.27 
 
 		 401 aa  741    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000488668  unclonable  4.84268e-22 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2625  phage integrase family protein  100 
 
 		 400 aa  833    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.046264 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4137  phage integrase family protein  68.75 
 
 		 400 aa  570  1e-161  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.031573  normal  0.207643 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1182  putative phage integrase  68.75 
 
 		 400 aa  570  1e-161  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.383522  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2622  integrase protein  67.75 
 
 		 400 aa  565  1e-160  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.561112  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1244  phage integrase family protein  69.23 
 
 		 399 aa  558  1e-158  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.797454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0671  phage integrase family protein  69.64 
 
 		 401 aa  559  1e-158  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.707055 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4029  integrase family protein  65.74 
 
 		 467 aa  556  1e-157  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161912  normal  0.0270341 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2959  phage integrase family protein  64.96 
 
 		 444 aa  550  1e-155  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0924112  normal  0.542634 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1236  phage integrase  67.68 
 
 		 399 aa  548  1e-155  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.449507  normal  0.10874 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3540  integrase family protein  68.5 
 
 		 399 aa  543  1e-153  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2601  integrase family protein  68 
 
 		 399 aa  541  1e-153  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.533125 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2745  integrase family protein  67.75 
 
 		 415 aa  539  9.999999999999999e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.99512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3045  phage integrase  67.75 
 
 		 415 aa  539  9.999999999999999e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.172973 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0497  integrase family protein  69.47 
 
 		 412 aa  533  1e-150  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36120  Phage integrase  64.5 
 
 		 400 aa  532  1e-150  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3747  integrase  63.87 
 
 		 399 aa  522  1e-147  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  41.16 
 
 		 411 aa  291  2e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0395  phage integrase family protein  40.85 
 
 		 397 aa  272  7e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.887583 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0807  integrase protein  65.19 
 
 		 181 aa  251  2e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3738  hypothetical protein  37.56 
 
 		 384 aa  248  1e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3091  phage integrase family protein  36.79 
 
 		 384 aa  245  9.999999999999999e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3122  phage integrase family protein  35.66 
 
 		 393 aa  231  2e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  35.03 
 
 		 388 aa  209  7e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3724  putative integrase protein  80.99 
 
 		 143 aa  205  9e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1247  putative phage related integrase  29.83 
 
 		 434 aa  166  9e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1864  integrase family protein  28.82 
 
 		 429 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0831  Phage integrase  30 
 
 		 400 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00496745  hitchhiker  0.00000971423 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2535  phage integrase  26.76 
 
 		 463 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0044  phage integrase family site specific recombinase  26.23 
 
 		 376 aa  130  6e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.374231  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1584  phage integrase family protein  26.49 
 
 		 376 aa  130  6e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3721  phage integrase family protein  26.23 
 
 		 376 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4399  integrase family protein  26.23 
 
 		 376 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.685705  normal  0.0426652 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3806  phage integrase  25.37 
 
 		 451 aa  124  4e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0304559  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  25.07 
 
 		 379 aa  122  9.999999999999999e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2964  phage integrase  28.18 
 
 		 387 aa  116  6e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7820  putative phage integrase  25.43 
 
 		 451 aa  114  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4157  integrase family protein  26.84 
 
 		 432 aa  112  8.000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.225884  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0620  integrase family protein  25.79 
 
 		 452 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2770  integrase family protein  25.49 
 
 		 452 aa  111  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.251515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1844  phage integrase family protein  28.06 
 
 		 426 aa  110  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3752  phage integrase family protein  24.81 
 
 		 422 aa  105  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.538338  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1016  integrase family protein  28.42 
 
 		 412 aa  105  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  27.38 
 
 		 404 aa  105  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0112  phage integrase family protein  28.05 
 
 		 413 aa  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.525516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  25.52 
 
 		 402 aa  101  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0366  integrase family protein  26.61 
 
 		 439 aa  97.8  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.134449 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1583  phage integrase family protein  24.75 
 
 		 451 aa  96.7  7e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0154  phage integrase family protein  22.79 
 
 		 451 aa  96.7  7e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.543339  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0045  phage integrase family site specific recombinase  24.75 
 
 		 456 aa  95.1  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.869382  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3720  phage integrase family protein  24.81 
 
 		 451 aa  95.1  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0255  phage integrase  25.36 
 
 		 430 aa  94.7  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1679  phage-related integrase  28.75 
 
 		 410 aa  93.6  5e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2486  hypothetical protein  28.11 
 
 		 413 aa  93.2  7e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4398  integrase family protein  24.81 
 
 		 451 aa  93.2  7e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0364227  hitchhiker  0.00879025 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1237  integrase family protein  25.27 
 
 		 401 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.184026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4340  phage integrase family protein  27.18 
 
 		 420 aa  91.3  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.185587  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0919  integrase family protein  27.88 
 
 		 448 aa  90.1  5e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.295922  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0805  site-specific recombinase/integrase  25.37 
 
 		 396 aa  88.2  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0116297  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1066  hypothetical protein  26.3 
 
 		 414 aa  87.8  3e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0072  hypothetical protein  26.72 
 
 		 406 aa  86.7  6e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1088  hypothetical protein  25.34 
 
 		 414 aa  85.1  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3121  phage integrase family protein  29.24 
 
 		 449 aa  85.1  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0636  integrase family protein  25.17 
 
 		 397 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00117125  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0287  site-specific recombinase, phage integrase family  24.06 
 
 		 412 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0217  phage-related integrase  26.1 
 
 		 413 aa  82  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.838235  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2751  integrase family protein  25 
 
 		 415 aa  82.8  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.606598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  26.92 
 
 		 390 aa  81.3  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0810  site-specific recombinase/integrase  24.32 
 
 		 482 aa  80.9  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0879139  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0357  integrase family protein  23.47 
 
 		 389 aa  80.1  0.00000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1170  phage integrase family protein  25.26 
 
 		 412 aa  78.2  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00333929  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2499  phage integrase family protein  29.12 
 
 		 381 aa  78.6  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.005662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0962  integrase family protein  25.48 
 
 		 371 aa  77.4  0.0000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.0000000000586623  decreased coverage  0.000000000358592 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2399  hypothetical protein  41.12 
 
 		 137 aa  77  0.0000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.229698  normal  0.0250128 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0399  phage integrase family protein  26.21 
 
 		 337 aa  76.6  0.0000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3995  phage integrase family protein  24.43 
 
 		 415 aa  75.1  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000158235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  26.79 
 
 		 367 aa  75.5  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1761  integrase family protein  25.17 
 
 		 361 aa  73.9  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3980  phage integrase family protein  26.41 
 
 		 365 aa  73.2  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.356268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1229  integrase family protein  24.08 
 
 		 402 aa  72.8  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.308607  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  25.16 
 
 		 353 aa  72.8  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1679  phage integrase family site specific recombinase  26.74 
 
 		 356 aa  72.4  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.229259  normal  0.0687632 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4708  integrase family protein  26.17 
 
 		 342 aa  72.4  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.014031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  23.78 
 
 		 363 aa  72.4  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0065  hypothetical protein  25.47 
 
 		 417 aa  71.6  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0805  integrase family protein  29.28 
 
 		 433 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00339873 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0253  integrase family protein  25.55 
 
 		 412 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003284  integrase  21.32 
 
 		 401 aa  70.9  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3823  phage-related integrase  25.82 
 
 		 403 aa  70.5  0.00000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1281  integrase family protein  24.65 
 
 		 429 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0022  shufflon-specific DNA recombinase  27.35 
 
 		 375 aa  70.1  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0970  phage integrase family protein  27.74 
 
 		 406 aa  68.9  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0829  integrase  22.29 
 
 		 388 aa  68.9  0.0000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.141939  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1337  integrase family protein  26.73 
 
 		 392 aa  68.6  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0155558  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0046  Phage integrase  26.97 
 
 		 251 aa  68.6  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380307  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6722  integrase family protein  24.28 
 
 		 413 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2612  phage integrase family protein  23.62 
 
 		 443 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0329  site-specific recombinase, phage integrase family protein  26.1 
 
 		 402 aa  67.4  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0019463  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2136  phage integrase family protein  24.38 
 
 		 389 aa  67.4  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0404563  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>