1077 genes were found for organism Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 11    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Avi_5000  CDS  NC_011988  287  1549  +  1263  replication protein A  YP_002546919  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_5001  CDS  NC_011988  1546  2628  +  1083  replication protein B  YP_002546920  normal  0.868981  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_5002  CDS  NC_011988  3579  4796  +  1218  replication initiation protein RepC  YP_002546921  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_5003  CDS  NC_011988  5079  6632  +  1554  phospholipase/phosphatidylserine synthase  YP_002546922  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_5004  CDS  NC_011988  6736  7689  -  954  hypothetical protein  YP_002546923  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_5005  CDS  NC_011988  7754  8491  +  738  hypothetical protein  YP_002546924  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_5006  CDS  NC_011988  8635  9459  -  825  hypothetical protein  YP_002546925  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_5007  CDS  NC_011988  9913  10218  +  306  hypothetical protein  YP_002546926  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_5009  CDS  NC_011988  10581  11219  +  639  exoD protein  YP_002546927  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_5010  CDS  NC_011988  11250  11717  -  468  transcriptional regulator AsnC family  YP_002546928  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_5012  CDS  NC_011988  11880  12659  +  780  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  YP_002546929  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_5014  CDS  NC_011988  12704  13474  +  771  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  YP_002546930  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_5015  CDS  NC_011988  13491  14213  +  723  ABC transporter membrane spanning protein  YP_002546931  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_5016  CDS  NC_011988  14222  14911  +  690  ABC transporter membrane spanning protein  YP_002546932  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_5017  CDS  NC_011988  14929  15834  +  906  S-methyltransferase  YP_002546933  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_5018  CDS  NC_011988  15844  16827  -  984  ABC transporter membrane spanning protein (iron (III))  YP_002546934  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_5019  CDS  NC_011988  16873  17832  -  960  ABC transporter substrate binding protein (iron)  YP_002546935  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_5021  CDS  NC_011988  17855  19009  -  1155  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (iron)  YP_002546936  normal  0.0722878  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_5022  CDS  NC_011988  19201  20637  -  1437  amidohydrolase  YP_002546937  normal  0.174731  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_5023  CDS  NC_011988  20772  21050  -  279  hypothetical protein  YP_002546938  normal  0.454124  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_5024  CDS  NC_011988  21047  22552  -  1506  glycogen synthase  YP_002546939  normal  0.671586  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_5025  CDS  NC_011988  22624  22941  -  318  hypothetical protein  YP_002546940  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_5027  CDS  NC_011988  23186  23527  +  342  hypothetical protein  YP_002546941  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_5028  CDS  NC_011988  23627  24220  -  594  hypothetical protein  YP_002546942  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_5029  CDS  NC_011988  24625  25617  +  993  hypothetical protein  YP_002546943  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_5030  CDS  NC_011988  25671  26702  -  1032  zinc-binding dehydrogenase  YP_002546944  normal  0.959168  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_5031  CDS  NC_011988  26713  27660  -  948  2-hydroxyacid dehydrogenase  YP_002546945  normal  0.356257  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_5032  CDS  NC_011988  27769  28527  +  759  gluconate 5-dehydrogenase  YP_002546946  normal  0.930013  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_5034  CDS  NC_011988  28529  29032  +  504  gluconokinase  YP_002546947  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_5035  CDS  NC_011988  29035  29919  +  885  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  YP_002546948  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_5036  CDS  NC_011988  29919  30251  +  333  hypothetical protein  YP_002546949  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_5038  CDS  NC_011988  30378  31391  +  1014  transcriptional regulator LacI family  YP_002546950  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_5039  CDS  NC_011988  31437  32531  -  1095  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  YP_002546951  normal  0.797463  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_5041  CDS  NC_011988  32570  33628  -  1059  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  YP_002546952  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_5042  CDS  NC_011988  33645  35141  -  1497  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  YP_002546953  normal  0.650295  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_5044  CDS  NC_011988  36674  37006  +  333  hypothetical protein  YP_002546954  normal  0.663378  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_5045  CDS  NC_011988  37788  38825  +  1038  hypothetical protein  YP_002546955  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_5046  CDS  NC_011988  38955  39917  +  963  ABC transporter substrate binding protein (ribose)  YP_002546956  normal  0.611947  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_5049  CDS  NC_011988  40001  41539  +  1539  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  YP_002546957  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_5050  CDS  NC_011988  41536  42576  +  1041  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  YP_002546958  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_5051  CDS  NC_011988  42573  43553  +  981  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  YP_002546959  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_5052  CDS  NC_011988  43550  44278  +  729  transcriptional regulator  YP_002546960  normal  0.259786  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_5053  CDS  NC_011988  44354  45802  -  1449  vanillin: NAD oxidoreductase  YP_002546961  normal  0.207548  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_5054  CDS  NC_011988  45882  47408  -  1527  vanillin: NAD oxidoreductase  YP_002546962  normal  0.619044  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_5055  CDS  NC_011988  47628  48527  +  900  transcriptional regulator AraC family  YP_002546963  normal  0.702992  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_5056  CDS  NC_011988  48665  49390  -  726  hypothetical protein  YP_002546964  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_5057  CDS  NC_011988  49408  51144  -  1737  dihydroxy-acid dehydratase  YP_002546965  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_5058  CDS  NC_011988  51188  52057  -  870  ABC transporter permease protein  YP_002546966  normal  0.987794  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_5059  CDS  NC_011988  52062  52877  -  816  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate/sulfonates)  YP_002546967  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_5060  CDS  NC_011988  53069  54052  -  984  ABC transporter substrate-binding protein  YP_002546968  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_5061  CDS  NC_011988  54302  55006  +  705  transcriptional regulator GntR family  YP_002546969  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_5062  CDS  NC_011988  55427  56710  +  1284  possible oxidoreductase  YP_002546970  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_5063  CDS  NC_011988  56881  57480  +  600  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  YP_002546971  normal  0.772676  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_5064  CDS  NC_011988  57596  57991  +  396  hypothetical protein  YP_002546972  normal  0.639568  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_5066  CDS  NC_011988  58678  59781  +  1104  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  YP_002546973  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_5067  CDS  NC_011988  59876  61366  +  1491  sulfate permease  YP_002546974  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_5068  CDS  NC_011988  61378  62232  +  855  Universal stress protein  YP_002546975  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_5070  CDS  NC_011988  62339  63541  +  1203  Major facilitator superfamily permease protein  YP_002546976  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_5072  CDS  NC_011988  63703  65487  -  1785  hypothetical protein  YP_002546977  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_5073  CDS  NC_011988  65889  66572  -  684  transcriptional regulator TetR family  YP_002546978  normal  0.479761  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_5074  CDS  NC_011988  66801  68207  +  1407  oxidoreductase  YP_002546979  normal  0.207548  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_5075  CDS  NC_011988  68212  68739  +  528  hypothetical protein  YP_002546980  normal  0.91947  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_5076  CDS  NC_011988  69066  70604  +  1539  major facilitator superfamily permease protein  YP_002546981  normal  0.543478  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_5077  CDS  NC_011988  70629  71237  +  609  nitrilotriacetate monooxygenase  YP_002546982  normal  0.332011  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_5079  CDS  NC_011988  71280  72179  +  900  oxidoreductase  YP_002546983  normal  0.976387  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_5080  CDS  NC_011988  72997  74346  +  1350  Carbohydrate-selective porin  YP_002546984  normal  0.66418  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_5081  CDS  NC_011988  74593  75489  +  897  hypothetical protein  YP_002546985  normal  0.149951  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_5082  CDS  NC_011988  75500  76354  +  855  2-hydroxyhepta-24-diene-1  YP_002546986  normal  0.0590578  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_5084  CDS  NC_011988  76833  77324  +  492  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  YP_002546987  normal  0.326252  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_5085  CDS  NC_011988  77346  78086  -  741  transcriptional regulator GntR family  YP_002546988  normal  0.131257  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_5086  CDS  NC_011988  78435  79988  +  1554  ABC transporter substrate binding protein (dipeptide)  YP_002546989  normal  0.243076  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_5087  CDS  NC_011988  79990  81351  +  1362  beta-glucosidase  YP_002546990  normal  0.167744  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_5088  CDS  NC_011988  81376  82317  +  942  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  YP_002546991  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_5089  CDS  NC_011988  82317  83198  +  882  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  YP_002546992  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_5090  CDS  NC_011988  83201  84412  +  1212  dihydroorotase  YP_002546993  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_5091  CDS  NC_011988  84452  84943  +  492  hypothetical protein  YP_002546994  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_5093  CDS  NC_011988  84955  85782  -  828  transcriptional regulator  YP_002546995  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_5094  CDS  NC_011988  85879  87075  +  1197  L-seryl-tRNA(ser) selenium transferase  YP_002546996  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_5096  CDS  NC_011988  87500  89038  +  1539  GGDEF family protein  YP_002546997  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_5097  CDS  NC_011988  89305  90198  +  894  hypothetical protein  YP_002546998  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_5101  CDS  NC_011988  90294  91097  +  804  Transglutaminase domain-containing protein  YP_002546999  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_5102  CDS  NC_011988  91405  92076  +  672  Permeases of the major facilitator superfamily  YP_002547000  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_5103  CDS  NC_011988  92361  92999  +  639  oxidoreductase with iron-sulfur subunit  YP_002547001  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_5106  CDS  NC_011988  92996  93946  +  951  oxidoreductase  YP_002547002  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_5107  CDS  NC_011988  93950  96148  +  2199  dehydrogenase  YP_002547003  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_5108  CDS  NC_011988  96470  98164  +  1695  two-component sensor  YP_002547004  normal  0.775404  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_5109  CDS  NC_011988  98265  99164  +  900  transcriptional regulator LysR family  YP_002547005  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_5111  CDS  NC_011988  99220  99906  -  687  hypothetical protein  YP_002547006  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_5112  CDS  NC_011988  100041  101228  -  1188  non-heme haloperoxidase  YP_002547007  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_5113  CDS  NC_011988  101290  101853  -  564  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  YP_002547008  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_5114  CDS  NC_011988  102248  102733  +  486  transcription elongation factor regulatory protein  YP_002547009  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_5115  CDS  NC_011988  102879  104240  -  1362  alpha-galactosidase  YP_002547010  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_5116  CDS  NC_011988  104266  105933  -  1668  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  YP_002547011  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_5117  CDS  NC_011988  105946  107067  -  1122  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  YP_002547012  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_5118  CDS  NC_011988  107064  108077  -  1014  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide )  YP_002547013  normal  0.296521  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_5120  CDS  NC_011988  108151  110238  -  2088  ABC transporter substrate binding protein (alpha-galactoside)  YP_002547014  normal  0.0244807  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_5121  CDS  NC_011988  110353  111825  -  1473  alpha-galactosidase  YP_002547015  normal  0.642601  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_5122  CDS  NC_011988  112016  112960  +  945  transcriptional regulator AraC family  YP_002547016  normal  0.962416  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_5123  CDS  NC_011988  113066  113461  -  396  hypothetical protein  YP_002547017  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_5124  CDS  NC_011988  113531  114028  -  498  hypothetical protein  YP_002547018  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 11    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>