214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5091 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5091  hypothetical protein  100 
 
 		 163 aa  332  1e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6667  Endoribonuclease L-PSP  80.13 
 
 		 165 aa  240  5e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0416868  normal  0.0241604 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5760  Endoribonuclease L-PSP  78.81 
 
 		 165 aa  240  7.999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.332069  normal  0.705807 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2988  endoribonuclease L-PSP  73.91 
 
 		 164 aa  235  2e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2706  Endoribonuclease L-PSP  64 
 
 		 153 aa  206  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.253512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3462  endoribonuclease L-PSP  58.39 
 
 		 159 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0120904 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6138  endoribonuclease L-PSP  55.56 
 
 		 153 aa  167  4e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6426  endoribonuclease L-PSP  55.56 
 
 		 153 aa  167  5e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.576265 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2153  endoribonuclease L-PSP, putative  46.1 
 
 		 152 aa  157  4e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1645  Endoribonuclease L-PSP  45.75 
 
 		 156 aa  150  5e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.827325 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3735  endoribonuclease L-PSP  45.7 
 
 		 170 aa  147  7e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0323381  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3793  endoribonuclease L-PSP  47.8 
 
 		 154 aa  145  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.756407 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1554  Endoribonuclease L-PSP  45.39 
 
 		 168 aa  144  7.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.30004 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3144  endoribonuclease L-PSP  52.41 
 
 		 152 aa  143  9e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.147772 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2803  endoribonuclease L-PSP  54.86 
 
 		 155 aa  142  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.117143  normal  0.432336 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2908  Endoribonuclease L-PSP  49.32 
 
 		 164 aa  141  4e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37922  predicted protein  49.32 
 
 		 185 aa  140  5e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00476754  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47655  predicted protein  49.32 
 
 		 185 aa  140  5e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00618585  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4853  Endoribonuclease L-PSP  45.64 
 
 		 154 aa  140  5e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1504  endoribonuclease L-PSP  48.32 
 
 		 155 aa  140  8e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.910903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1477  endoribonuclease L-PSP  44.74 
 
 		 174 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2531  hypothetical protein  50 
 
 		 156 aa  136  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1092  endoribonuclease L-PSP  47.3 
 
 		 151 aa  136  1e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0668  endoribonuclease L-PSP  44 
 
 		 155 aa  135  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4751  putative endoribonuclease L-PSP (protein synthesis inhibitor)  47.26 
 
 		 155 aa  135  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.708532  normal  0.751414 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6055  Endoribonuclease L-PSP  46.54 
 
 		 162 aa  135  3.0000000000000003e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.316335  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3343  Endoribonuclease L-PSP  39.74 
 
 		 152 aa  134  4e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0721684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1232  Endoribonuclease L-PSP  44.08 
 
 		 158 aa  134  5e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.118395 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7001  Endoribonuclease L-PSP  42.76 
 
 		 153 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.29749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0927  endoribonuclease L-PSP  43.33 
 
 		 152 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.553211 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1427  endoribonuclease L-PSP  48.95 
 
 		 155 aa  132  3e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.426351 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2408  endoribonuclease L-PSP  46.85 
 
 		 155 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.628638  normal  0.167618 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1204  endoribonuclease L-PSP  44.83 
 
 		 156 aa  131  3.9999999999999996e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.375276 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2027  endoribonuclease L-PSP  45.52 
 
 		 154 aa  131  5e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0633724  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3546  Endoribonuclease L-PSP  47.55 
 
 		 155 aa  130  9e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0435  endoribonuclease L-PSP  44.97 
 
 		 155 aa  129  1.0000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0713  Endoribonuclease L-PSP  47.4 
 
 		 152 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1123  endoribonuclease L-PSP  46.26 
 
 		 155 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.321047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5691  endoribonuclease L-PSP  42.95 
 
 		 152 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1027  Endoribonuclease L-PSP  42.21 
 
 		 158 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.190417  normal  0.406014 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2457  endoribonuclease L-PSP  48.3 
 
 		 153 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5081  endoribonuclease L-PSP  46.31 
 
 		 152 aa  129  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0190721 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2270  endoribonuclease L-PSP  42.28 
 
 		 152 aa  128  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.724419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1740  endoribonuclease L-PSP  42.28 
 
 		 152 aa  128  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2388  endoribonuclease L-PSP  42.28 
 
 		 152 aa  128  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.921996  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2352  endoribonuclease L-PSP  42.28 
 
 		 152 aa  128  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0200  endoribonuclease L-PSP  43.62 
 
 		 153 aa  128  3e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.151399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13709  hypothetical protein  46.53 
 
 		 151 aa  128  3e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0525391 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1346  endoribonuclease L-PSP  46.31 
 
 		 152 aa  128  4.0000000000000003e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00288796  normal  0.104373 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2373  endoribonuclease L-PSP  41.61 
 
 		 152 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2223  L-PSP family endoribonuclease  42.11 
 
 		 152 aa  127  6e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1313  L-PSP family endoribonuclease  42.11 
 
 		 164 aa  127  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.221061  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1705  Endoribonuclease L-PSP  44.3 
 
 		 156 aa  127  6e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.182301  hitchhiker  0.0000000000000067862 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2542  L-PSP family endoribonuclease  42.11 
 
 		 152 aa  127  6e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.455947  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1153  putative endoribonuclease L-PSP  42.11 
 
 		 152 aa  127  6e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1162  putative endoribonuclease L-PSP  42.11 
 
 		 152 aa  127  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2072  putative endoribonuclease L-PSP  42.11 
 
 		 152 aa  127  6e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.110705  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0708  L-PSP family endoribonuclease  42.11 
 
 		 155 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2118  endoribonuclease L-PSP  42.07 
 
 		 154 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124484  normal  0.0891562 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0950  L-PSP family endoribonuclease  41.61 
 
 		 164 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.449669  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3313  endoribonuclease L-PSP  45.27 
 
 		 155 aa  127  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2448  endoribonuclease L-PSP  47.26 
 
 		 155 aa  127  9.000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.514496  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3043  endoribonuclease L-PSP  45.45 
 
 		 155 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.574471 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1577  Endoribonuclease L-PSP  44.67 
 
 		 156 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.401191  normal  0.481334 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1944  Endoribonuclease L-PSP  44.76 
 
 		 153 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2512  endoribonuclease L-PSP  43.92 
 
 		 150 aa  124  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.796499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8908  Endoribonuclease L-PSP  46.26 
 
 		 152 aa  124  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.974502 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0894  hypothetical protein  46.05 
 
 		 152 aa  123  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.324074  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1272  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 153 aa  123  1e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.103554  hitchhiker  0.00713107 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1774  Endoribonuclease L-PSP  44.3 
 
 		 156 aa  123  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.98491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2553  endoribonuclease L-PSP  46.05 
 
 		 152 aa  123  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2348  endoribonuclease L-PSP  42.38 
 
 		 151 aa  122  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0336  endoribonuclease L-PSP  45.33 
 
 		 154 aa  122  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1212  Endoribonuclease L-PSP  41.38 
 
 		 154 aa  122  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0932  Endoribonuclease L-PSP  42.95 
 
 		 152 aa  122  3e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.315119  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2736  endoribonuclease L-PSP  47.92 
 
 		 146 aa  121  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.947  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0986  hypothetical protein  45.14 
 
 		 156 aa  121  4e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0698758  normal  0.152684 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1018  endoribonuclease L-PSP  42.95 
 
 		 152 aa  121  4e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.386479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0904  endoribonuclease L-PSP  44.08 
 
 		 151 aa  121  4e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0137  endoribonuclease L-PSP  47.18 
 
 		 155 aa  121  5e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4820  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 162 aa  120  6e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4906  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 162 aa  120  6e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.374579 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5207  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 162 aa  120  6e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000695376 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1792  endoribonuclease L-PSP  43.84 
 
 		 156 aa  120  8e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.282183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1113  Endoribonuclease L-PSP  44.83 
 
 		 155 aa  120  9e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.85817  normal  0.626067 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1122  hypothetical protein  42.57 
 
 		 154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.457332  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2319  endoribonuclease L-PSP  43.14 
 
 		 157 aa  119  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_004310  BR1165  hypothetical protein  42.57 
 
 		 154 aa  118  3.9999999999999996e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0402  endoribonuclease L-PSP  43.62 
 
 		 152 aa  118  3.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0666223 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2030  Endoribonuclease L-PSP  39.46 
 
 		 156 aa  117  7e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00146961  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3178  Endoribonuclease L-PSP  42.48 
 
 		 177 aa  117  9e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.738101 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18300  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  45.14 
 
 		 166 aa  116  9.999999999999999e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.614303  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0332  endoribonuclease L-PSP  43.04 
 
 		 163 aa  116  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0921694 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0250  endoribonuclease L-PSP  46.21 
 
 		 152 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2784  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 155 aa  116  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2506  endoribonuclease L-PSP  42.86 
 
 		 151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.101057  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1379  endoribonuclease L-PSP  38.26 
 
 		 158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0114  hypothetical protein  47.48 
 
 		 155 aa  115  3e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2111  Endoribonuclease L-PSP  42.77 
 
 		 163 aa  115  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5312  Endoribonuclease L-PSP  45.03 
 
 		 153 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.688432 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>