205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1232 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1232  Endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 158 aa  322  1e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.118395 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0668  endoribonuclease L-PSP  83.33 
 
 		 155 aa  266  5.9999999999999995e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7001  Endoribonuclease L-PSP  81.46 
 
 		 153 aa  258  3e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.29749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1027  Endoribonuclease L-PSP  77.63 
 
 		 158 aa  249  9.000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.190417  normal  0.406014 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2908  Endoribonuclease L-PSP  55.7 
 
 		 164 aa  169  1e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3462  endoribonuclease L-PSP  48.05 
 
 		 159 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0120904 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47655  predicted protein  45.21 
 
 		 185 aa  139  1.9999999999999998e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00618585  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37922  predicted protein  45.21 
 
 		 185 aa  139  1.9999999999999998e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00476754  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5091  hypothetical protein  44.08 
 
 		 163 aa  134  5e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2706  Endoribonuclease L-PSP  46.48 
 
 		 153 aa  130  6e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.253512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6138  endoribonuclease L-PSP  44.76 
 
 		 153 aa  130  6e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2988  endoribonuclease L-PSP  47.68 
 
 		 164 aa  127  5.0000000000000004e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6426  endoribonuclease L-PSP  44.06 
 
 		 153 aa  127  6e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.576265 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5760  Endoribonuclease L-PSP  45.03 
 
 		 165 aa  123  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.332069  normal  0.705807 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2803  endoribonuclease L-PSP  43.33 
 
 		 155 aa  122  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.117143  normal  0.432336 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1477  endoribonuclease L-PSP  41.18 
 
 		 174 aa  120  9e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6667  Endoribonuclease L-PSP  45.7 
 
 		 165 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0416868  normal  0.0241604 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6055  Endoribonuclease L-PSP  41.83 
 
 		 162 aa  120  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.316335  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3343  Endoribonuclease L-PSP  39.74 
 
 		 152 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0721684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0435  endoribonuclease L-PSP  42 
 
 		 155 aa  118  3.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2736  endoribonuclease L-PSP  46.71 
 
 		 146 aa  118  3.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1554  Endoribonuclease L-PSP  39.47 
 
 		 168 aa  117  3.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.30004 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2457  endoribonuclease L-PSP  39.47 
 
 		 153 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1504  endoribonuclease L-PSP  41.33 
 
 		 155 aa  114  3.9999999999999997e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.910903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1123  endoribonuclease L-PSP  38.96 
 
 		 155 aa  114  5e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.321047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2477  endoribonuclease L-PSP  40.13 
 
 		 153 aa  114  6e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.738257  normal  0.0496442 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2153  endoribonuclease L-PSP, putative  39.74 
 
 		 152 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3793  endoribonuclease L-PSP  37.33 
 
 		 154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.756407 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3105  endoribonuclease L-PSP  46.94 
 
 		 155 aa  112  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.473778  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2609  endoribonuclease L-PSP  35.57 
 
 		 152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.56142 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0402  endoribonuclease L-PSP  40.94 
 
 		 152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0666223 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2027  endoribonuclease L-PSP  38.93 
 
 		 154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0633724  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1379  endoribonuclease L-PSP  36.6 
 
 		 158 aa  112  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4853  Endoribonuclease L-PSP  36.42 
 
 		 154 aa  112  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4751  putative endoribonuclease L-PSP (protein synthesis inhibitor)  39.33 
 
 		 155 aa  112  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.708532  normal  0.751414 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1204  endoribonuclease L-PSP  38.3 
 
 		 156 aa  110  6e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.375276 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0904  endoribonuclease L-PSP  42.25 
 
 		 151 aa  110  1.0000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0841  endoribonuclease L-PSP  34.87 
 
 		 164 aa  109  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1113  Endoribonuclease L-PSP  37.09 
 
 		 155 aa  108  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.85817  normal  0.626067 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2555  hypothetical protein  37.5 
 
 		 154 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.853817 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0986  hypothetical protein  40.67 
 
 		 156 aa  108  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0698758  normal  0.152684 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3580  endoribonuclease L-PSP  40.4 
 
 		 153 aa  108  3e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.45612  normal  0.209775 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0200  endoribonuclease L-PSP  36.42 
 
 		 153 aa  108  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.151399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1577  Endoribonuclease L-PSP  40.27 
 
 		 156 aa  108  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.401191  normal  0.481334 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0250  endoribonuclease L-PSP  42.11 
 
 		 152 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2223  L-PSP family endoribonuclease  41.67 
 
 		 152 aa  107  5e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1313  L-PSP family endoribonuclease  41.67 
 
 		 164 aa  107  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.221061  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2542  L-PSP family endoribonuclease  41.67 
 
 		 152 aa  107  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.455947  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1153  putative endoribonuclease L-PSP  41.67 
 
 		 152 aa  107  5e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1162  putative endoribonuclease L-PSP  41.67 
 
 		 152 aa  107  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2072  putative endoribonuclease L-PSP  41.67 
 
 		 152 aa  107  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.110705  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0708  L-PSP family endoribonuclease  41.67 
 
 		 155 aa  107  6e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1944  Endoribonuclease L-PSP  36.42 
 
 		 153 aa  107  8.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1774  Endoribonuclease L-PSP  40.69 
 
 		 156 aa  107  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.98491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0137  endoribonuclease L-PSP  38.67 
 
 		 155 aa  106  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3735  endoribonuclease L-PSP  34.42 
 
 		 170 aa  106  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0323381  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0168  endoribonuclease L-PSP  37.41 
 
 		 153 aa  106  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2531  hypothetical protein  39.35 
 
 		 156 aa  106  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1427  endoribonuclease L-PSP  38 
 
 		 155 aa  105  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.426351 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1092  endoribonuclease L-PSP  36.91 
 
 		 151 aa  105  2e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0336  endoribonuclease L-PSP  39.73 
 
 		 154 aa  106  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4883  endoribonuclease L-PSP  38.26 
 
 		 157 aa  105  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000371063  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1645  Endoribonuclease L-PSP  33.77 
 
 		 156 aa  105  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.827325 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1346  endoribonuclease L-PSP  39.86 
 
 		 152 aa  105  3e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00288796  normal  0.104373 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2448  endoribonuclease L-PSP  39.74 
 
 		 155 aa  104  4e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.514496  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2118  endoribonuclease L-PSP  38.89 
 
 		 154 aa  103  9e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124484  normal  0.0891562 
 
 
-
 
NC_004310  BR1165  hypothetical protein  36.24 
 
 		 154 aa  103  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0950  L-PSP family endoribonuclease  39.58 
 
 		 164 aa  103  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.449669  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0713  Endoribonuclease L-PSP  39.07 
 
 		 152 aa  103  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1122  hypothetical protein  36.24 
 
 		 154 aa  103  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.457332  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13709  hypothetical protein  39.07 
 
 		 151 aa  102  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0525391 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2512  endoribonuclease L-PSP  38.78 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.796499  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0038  Endoribonuclease L-PSP  42.06 
 
 		 161 aa  102  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.491451  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3546  Endoribonuclease L-PSP  38 
 
 		 155 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0938  Endoribonuclease L-PSP  40.85 
 
 		 152 aa  101  3e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2373  endoribonuclease L-PSP  39.44 
 
 		 152 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0932  Endoribonuclease L-PSP  40.14 
 
 		 152 aa  101  4e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.315119  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0894  hypothetical protein  42 
 
 		 152 aa  101  4e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.324074  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1740  endoribonuclease L-PSP  38.73 
 
 		 152 aa  101  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2388  endoribonuclease L-PSP  38.73 
 
 		 152 aa  101  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.921996  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2352  endoribonuclease L-PSP  38.73 
 
 		 152 aa  101  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2270  endoribonuclease L-PSP  38.73 
 
 		 152 aa  101  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.724419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2553  endoribonuclease L-PSP  42 
 
 		 152 aa  101  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0927  endoribonuclease L-PSP  38.73 
 
 		 152 aa  101  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.553211 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1018  endoribonuclease L-PSP  40.14 
 
 		 152 aa  101  5e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.386479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2348  endoribonuclease L-PSP  38.1 
 
 		 151 aa  100  8e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3144  endoribonuclease L-PSP  37.58 
 
 		 152 aa  100  9e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.147772 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3313  endoribonuclease L-PSP  38 
 
 		 155 aa  100  9e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0847  Endoribonuclease L-PSP  43.9 
 
 		 156 aa  100  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00708228  normal  0.528275 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5691  endoribonuclease L-PSP  38.03 
 
 		 152 aa  99.8  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0916  Endoribonuclease L-PSP  43.9 
 
 		 156 aa  100  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.139977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1636  endoribonuclease L-PSP  36.91 
 
 		 154 aa  99  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.564581 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2408  endoribonuclease L-PSP  36.67 
 
 		 155 aa  99.4  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.628638  normal  0.167618 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1613  endoribonuclease L-PSP  36.91 
 
 		 154 aa  99  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.578745  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1212  Endoribonuclease L-PSP  36.81 
 
 		 154 aa  99.4  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2699  Endoribonuclease L-PSP  36.54 
 
 		 162 aa  99.4  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.396345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1180  Endoribonuclease L-PSP  35.92 
 
 		 153 aa  98.6  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6842  Endoribonuclease L-PSP  35.1 
 
 		 168 aa  98.6  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.173433 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3043  endoribonuclease L-PSP  36.67 
 
 		 155 aa  98.6  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.574471 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5312  Endoribonuclease L-PSP  38.41 
 
 		 153 aa  97.8  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.688432 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>