232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3144 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_3144  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 
152 aa  303  4.0000000000000004e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.147772 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1272  endoribonuclease L-PSP  66.45 
 
 
153 aa  197  3.9999999999999996e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.103554  hitchhiker  0.00713107 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3793  endoribonuclease L-PSP  60.26 
 
 
154 aa  183  9e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.756407 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3546  Endoribonuclease L-PSP  58 
 
 
155 aa  175  2e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3043  endoribonuclease L-PSP  57.33 
 
 
155 aa  174  4e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.574471 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3313  endoribonuclease L-PSP  60 
 
 
155 aa  174  5e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129795  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2408  endoribonuclease L-PSP  56.67 
 
 
155 aa  171  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.628638  normal  0.167618 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4751  putative endoribonuclease L-PSP (protein synthesis inhibitor)  58 
 
 
155 aa  171  2.9999999999999996e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.708532  normal  0.751414 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2477  endoribonuclease L-PSP  53.33 
 
 
153 aa  171  3.9999999999999995e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.738257  normal  0.0496442 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1792  endoribonuclease L-PSP  54.84 
 
 
156 aa  169  1e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.282183  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1427  endoribonuclease L-PSP  55.33 
 
 
155 aa  167  4e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.426351 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2319  endoribonuclease L-PSP  55.77 
 
 
157 aa  167  4e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1123  endoribonuclease L-PSP  53.95 
 
 
155 aa  167  5e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.321047  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2457  endoribonuclease L-PSP  55.63 
 
 
153 aa  164  4e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2531  hypothetical protein  51.66 
 
 
156 aa  162  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0435  endoribonuclease L-PSP  52.03 
 
 
155 aa  158  3e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2448  endoribonuclease L-PSP  54 
 
 
155 aa  158  3e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.514496  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6055  Endoribonuclease L-PSP  55.78 
 
 
162 aa  157  5e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.316335  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4551  Endoribonuclease L-PSP  51.92 
 
 
157 aa  157  5e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1577  Endoribonuclease L-PSP  49.67 
 
 
156 aa  156  9e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.401191  normal  0.481334 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4070  endoribonuclease L-PSP  51.28 
 
 
162 aa  155  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.256894  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2803  endoribonuclease L-PSP  54.97 
 
 
155 aa  154  3e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.117143  normal  0.432336 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0137  endoribonuclease L-PSP  52 
 
 
155 aa  154  4e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4437  Endoribonuclease L-PSP  51.28 
 
 
157 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.062411  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4853  Endoribonuclease L-PSP  51.97 
 
 
154 aa  153  7e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1774  Endoribonuclease L-PSP  49.67 
 
 
156 aa  153  9e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.98491  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2027  endoribonuclease L-PSP  50.67 
 
 
154 aa  151  2.9999999999999998e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0633724  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0894  hypothetical protein  51.01 
 
 
152 aa  150  5e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.324074  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2553  endoribonuclease L-PSP  51.01 
 
 
152 aa  150  5e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1348  Endoribonuclease L-PSP  51.3 
 
 
157 aa  150  7e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0250  endoribonuclease L-PSP  52 
 
 
152 aa  150  7e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3105  endoribonuclease L-PSP  57.72 
 
 
155 aa  149  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.473778  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7458  Endoribonuclease L-PSP  51.92 
 
 
157 aa  149  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2736  endoribonuclease L-PSP  56.08 
 
 
146 aa  149  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.947  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1165  hypothetical protein  50.67 
 
 
154 aa  148  3e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1122  hypothetical protein  50 
 
 
154 aa  146  9e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.457332  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6138  endoribonuclease L-PSP  48.03 
 
 
153 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1645  Endoribonuclease L-PSP  47.3 
 
 
156 aa  144  4.0000000000000006e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.827325 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6537  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 
157 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.21507  normal  0.550061 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0713  Endoribonuclease L-PSP  51.97 
 
 
152 aa  144  5e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1092  endoribonuclease L-PSP  49.32 
 
 
151 aa  144  6e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5091  hypothetical protein  52.41 
 
 
163 aa  143  7.0000000000000006e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6426  endoribonuclease L-PSP  47.37 
 
 
153 aa  142  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.576265 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1944  Endoribonuclease L-PSP  48.67 
 
 
153 aa  142  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3462  endoribonuclease L-PSP  52.03 
 
 
159 aa  142  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0120904 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1379  endoribonuclease L-PSP  46.31 
 
 
158 aa  141  4e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0581  endoribonuclease L-PSP  43.05 
 
 
154 aa  140  6e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0481259  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1705  Endoribonuclease L-PSP  46.36 
 
 
156 aa  138  3e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.182301  hitchhiker  0.0000000000000067862 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2988  endoribonuclease L-PSP  54.48 
 
 
164 aa  138  3e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0200  endoribonuclease L-PSP  47.37 
 
 
153 aa  137  3.9999999999999997e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.151399  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2784  endoribonuclease L-PSP  58.67 
 
 
155 aa  137  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1554  Endoribonuclease L-PSP  48.32 
 
 
168 aa  137  7e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.30004 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1113  Endoribonuclease L-PSP  49.67 
 
 
155 aa  135  1e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.85817  normal  0.626067 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2706  Endoribonuclease L-PSP  47.62 
 
 
153 aa  136  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.253512  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6667  Endoribonuclease L-PSP  54.48 
 
 
165 aa  136  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0416868  normal  0.0241604 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37922  predicted protein  46.41 
 
 
185 aa  135  2e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00476754  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47655  predicted protein  46.41 
 
 
185 aa  135  2e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00618585  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1204  endoribonuclease L-PSP  45.27 
 
 
156 aa  135  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.375276 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5760  Endoribonuclease L-PSP  53.79 
 
 
165 aa  134  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.332069  normal  0.705807 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13709  hypothetical protein  50.68 
 
 
151 aa  135  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0525391 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3343  Endoribonuclease L-PSP  44.97 
 
 
152 aa  134  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0721684  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2030  Endoribonuclease L-PSP  45.27 
 
 
156 aa  133  9e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00146961  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0927  endoribonuclease L-PSP  44.37 
 
 
152 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.553211 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3178  Endoribonuclease L-PSP  47.83 
 
 
177 aa  131  3e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.738101 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2373  endoribonuclease L-PSP  44.37 
 
 
152 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2270  endoribonuclease L-PSP  43.71 
 
 
152 aa  130  5e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.724419  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2111  Endoribonuclease L-PSP  49.32 
 
 
163 aa  130  5e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1740  endoribonuclease L-PSP  43.71 
 
 
152 aa  130  5e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2388  endoribonuclease L-PSP  43.71 
 
 
152 aa  130  5e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.921996  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2352  endoribonuclease L-PSP  43.71 
 
 
152 aa  130  5e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2609  endoribonuclease L-PSP  45.33 
 
 
152 aa  130  6e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.56142 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5691  endoribonuclease L-PSP  44.37 
 
 
152 aa  130  6e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3735  endoribonuclease L-PSP  43.24 
 
 
170 aa  130  6e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0323381  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3580  endoribonuclease L-PSP  46.62 
 
 
153 aa  130  7.999999999999999e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.45612  normal  0.209775 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5081  endoribonuclease L-PSP  44.67 
 
 
152 aa  130  9e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0190721 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1062  Endoribonuclease L-PSP  50 
 
 
151 aa  130  9e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0950  L-PSP family endoribonuclease  43.05 
 
 
164 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.449669  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2153  endoribonuclease L-PSP, putative  43.54 
 
 
152 aa  128  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1313  L-PSP family endoribonuclease  43.05 
 
 
164 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.221061  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2223  L-PSP family endoribonuclease  43.05 
 
 
152 aa  127  6e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0708  L-PSP family endoribonuclease  43.05 
 
 
155 aa  127  6e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2542  L-PSP family endoribonuclease  43.05 
 
 
152 aa  127  6e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.455947  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1153  putative endoribonuclease L-PSP  43.05 
 
 
152 aa  127  6e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1162  putative endoribonuclease L-PSP  43.05 
 
 
152 aa  127  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2072  putative endoribonuclease L-PSP  43.05 
 
 
152 aa  127  6e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.110705  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8908  Endoribonuclease L-PSP  50 
 
 
152 aa  126  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.974502 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1504  endoribonuclease L-PSP  47.33 
 
 
155 aa  126  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.910903  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3039  Endoribonuclease L-PSP  49.68 
 
 
157 aa  125  2.0000000000000002e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4820  endoribonuclease L-PSP  55.15 
 
 
162 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4906  endoribonuclease L-PSP  55.15 
 
 
162 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.374579 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5207  endoribonuclease L-PSP  55.15 
 
 
162 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000695376 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1346  endoribonuclease L-PSP  41.33 
 
 
152 aa  123  8.000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00288796  normal  0.104373 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1018  endoribonuclease L-PSP  42.95 
 
 
152 aa  122  1e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.386479  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0932  Endoribonuclease L-PSP  42.28 
 
 
152 aa  122  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.315119  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2555  hypothetical protein  45.03 
 
 
154 aa  122  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.853817 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2118  endoribonuclease L-PSP  42.67 
 
 
154 aa  121  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124484  normal  0.0891562 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0168  endoribonuclease L-PSP  47.95 
 
 
153 aa  121  3e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0904  endoribonuclease L-PSP  43.71 
 
 
151 aa  120  4e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0986  hypothetical protein  44.3 
 
 
156 aa  120  6e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0698758  normal  0.152684 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0434  Endoribonuclease L-PSP  49.67 
 
 
155 aa  120  6e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.51654 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>