202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2111 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2111  Endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 163 aa  332  1e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6055  Endoribonuclease L-PSP  48.15 
 
 		 162 aa  150  5.9999999999999996e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.316335  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2457  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 153 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2803  endoribonuclease L-PSP  49.02 
 
 		 155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.117143  normal  0.432336 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2319  endoribonuclease L-PSP  52.98 
 
 		 157 aa  143  9e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1272  endoribonuclease L-PSP  50.68 
 
 		 153 aa  141  3e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.103554  hitchhiker  0.00713107 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1504  endoribonuclease L-PSP  51.03 
 
 		 155 aa  141  5e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.910903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2531  hypothetical protein  46.62 
 
 		 156 aa  139  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3043  endoribonuclease L-PSP  48.99 
 
 		 155 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.574471 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2408  endoribonuclease L-PSP  47.65 
 
 		 155 aa  137  6e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.628638  normal  0.167618 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4751  putative endoribonuclease L-PSP (protein synthesis inhibitor)  47.06 
 
 		 155 aa  137  6e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.708532  normal  0.751414 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6537  endoribonuclease L-PSP  49.33 
 
 		 157 aa  136  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.21507  normal  0.550061 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6138  endoribonuclease L-PSP  48.65 
 
 		 153 aa  136  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3546  Endoribonuclease L-PSP  48.32 
 
 		 155 aa  136  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3343  Endoribonuclease L-PSP  46.26 
 
 		 152 aa  135  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0721684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6426  endoribonuclease L-PSP  48.65 
 
 		 153 aa  135  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.576265 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3580  endoribonuclease L-PSP  47.3 
 
 		 153 aa  134  4e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.45612  normal  0.209775 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1792  endoribonuclease L-PSP  46 
 
 		 156 aa  133  8e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.282183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2448  endoribonuclease L-PSP  47.71 
 
 		 155 aa  133  9.999999999999999e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.514496  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4551  Endoribonuclease L-PSP  48.34 
 
 		 157 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0200  endoribonuclease L-PSP  50.34 
 
 		 153 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.151399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3313  endoribonuclease L-PSP  47.4 
 
 		 155 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7458  Endoribonuclease L-PSP  48.37 
 
 		 157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4070  endoribonuclease L-PSP  47.68 
 
 		 162 aa  132  3e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.256894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1092  endoribonuclease L-PSP  43.62 
 
 		 151 aa  131  3.9999999999999996e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1123  endoribonuclease L-PSP  44.59 
 
 		 155 aa  131  3.9999999999999996e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.321047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3144  endoribonuclease L-PSP  49.32 
 
 		 152 aa  130  6e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.147772 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3793  endoribonuclease L-PSP  45.33 
 
 		 154 aa  130  6e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.756407 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4437  Endoribonuclease L-PSP  47.68 
 
 		 157 aa  130  7.999999999999999e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.062411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2477  endoribonuclease L-PSP  43.24 
 
 		 153 aa  128  4.0000000000000003e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.738257  normal  0.0496442 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1427  endoribonuclease L-PSP  46.31 
 
 		 155 aa  127  6e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.426351 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1062  Endoribonuclease L-PSP  51.33 
 
 		 151 aa  126  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1577  Endoribonuclease L-PSP  42.57 
 
 		 156 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.401191  normal  0.481334 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4853  Endoribonuclease L-PSP  47.3 
 
 		 154 aa  125  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1774  Endoribonuclease L-PSP  42.95 
 
 		 156 aa  125  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.98491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1944  Endoribonuclease L-PSP  47.65 
 
 		 153 aa  125  3e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13709  hypothetical protein  47.68 
 
 		 151 aa  124  6e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0525391 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0894  hypothetical protein  48.03 
 
 		 152 aa  122  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.324074  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2553  endoribonuclease L-PSP  48.03 
 
 		 152 aa  122  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2706  Endoribonuclease L-PSP  46.94 
 
 		 153 aa  122  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.253512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2027  endoribonuclease L-PSP  43.62 
 
 		 154 aa  120  8e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0633724  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0250  endoribonuclease L-PSP  48.3 
 
 		 152 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1369  endoribonuclease L-PSP  49.66 
 
 		 153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.324136 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0435  endoribonuclease L-PSP  40.82 
 
 		 155 aa  118  3.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8908  Endoribonuclease L-PSP  48.98 
 
 		 152 aa  118  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.974502 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0713  Endoribonuclease L-PSP  45.27 
 
 		 152 aa  118  3.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1348  Endoribonuclease L-PSP  45.33 
 
 		 157 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1645  Endoribonuclease L-PSP  39.46 
 
 		 156 aa  117  6e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.827325 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2030  Endoribonuclease L-PSP  43.97 
 
 		 156 aa  117  6e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00146961  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0137  endoribonuclease L-PSP  43.54 
 
 		 155 aa  117  7.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1122  hypothetical protein  43.54 
 
 		 154 aa  116  1.9999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.457332  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0986  hypothetical protein  44.97 
 
 		 156 aa  115  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0698758  normal  0.152684 
 
 
-
 
NC_004310  BR1165  hypothetical protein  43.54 
 
 		 154 aa  115  3e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5091  hypothetical protein  42.77 
 
 		 163 aa  115  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2555  hypothetical protein  44.97 
 
 		 154 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.853817 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1252  endoribonuclease L-PSP  48.67 
 
 		 156 aa  114  5e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.476616  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2609  endoribonuclease L-PSP  47.3 
 
 		 152 aa  114  6.9999999999999995e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.56142 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1379  endoribonuclease L-PSP  42.57 
 
 		 158 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3462  endoribonuclease L-PSP  43.84 
 
 		 159 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0120904 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0336  endoribonuclease L-PSP  46.94 
 
 		 154 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1705  Endoribonuclease L-PSP  44.9 
 
 		 156 aa  113  1.0000000000000001e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.182301  hitchhiker  0.0000000000000067862 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1554  Endoribonuclease L-PSP  42.18 
 
 		 168 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.30004 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0581  endoribonuclease L-PSP  38.51 
 
 		 154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0481259  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3039  Endoribonuclease L-PSP  47.02 
 
 		 157 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5181  endoribonuclease L-PSP  40.94 
 
 		 154 aa  110  9e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0841  endoribonuclease L-PSP  40.74 
 
 		 164 aa  109  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0114  hypothetical protein  44.97 
 
 		 155 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1113  Endoribonuclease L-PSP  41.22 
 
 		 155 aa  109  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.85817  normal  0.626067 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4789  endoribonuclease L-PSP  48.53 
 
 		 153 aa  109  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0118265 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47655  predicted protein  43.75 
 
 		 185 aa  108  4.0000000000000004e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00618585  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37922  predicted protein  43.75 
 
 		 185 aa  108  4.0000000000000004e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00476754  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2736  endoribonuclease L-PSP  45.89 
 
 		 146 aa  108  4.0000000000000004e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0168  endoribonuclease L-PSP  40.41 
 
 		 153 aa  106  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2153  endoribonuclease L-PSP, putative  37.41 
 
 		 152 aa  105  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0499  Endoribonuclease L-PSP  45.91 
 
 		 162 aa  105  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.389355  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3006  endoribonuclease L-PSP  45.95 
 
 		 154 aa  106  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.236246 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5437  endoribonuclease L-PSP  49.25 
 
 		 152 aa  106  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491285 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3178  Endoribonuclease L-PSP  41.29 
 
 		 177 aa  105  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.738101 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4348  endoribonuclease L-PSP  47.1 
 
 		 153 aa  106  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.917733 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1212  Endoribonuclease L-PSP  41.5 
 
 		 154 aa  105  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4820  endoribonuclease L-PSP  46.27 
 
 		 162 aa  105  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4906  endoribonuclease L-PSP  46.27 
 
 		 162 aa  105  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.374579 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5207  endoribonuclease L-PSP  46.27 
 
 		 162 aa  105  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000695376 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0932  Endoribonuclease L-PSP  39.86 
 
 		 152 aa  105  4e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.315119  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0904  endoribonuclease L-PSP  44.22 
 
 		 151 aa  104  4e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1018  endoribonuclease L-PSP  39.86 
 
 		 152 aa  104  5e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.386479  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18300  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  43.98 
 
 		 166 aa  103  8e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.614303  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0465  hypothetical protein  46.36 
 
 		 152 aa  103  9e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.346493 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1636  endoribonuclease L-PSP  41.5 
 
 		 154 aa  103  9e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.564581 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4282  endoribonuclease L-PSP  44.59 
 
 		 154 aa  103  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.667627  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5312  Endoribonuclease L-PSP  46.26 
 
 		 153 aa  103  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.688432 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1613  endoribonuclease L-PSP  41.5 
 
 		 154 aa  103  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.578745  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1346  endoribonuclease L-PSP  39.19 
 
 		 152 aa  103  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00288796  normal  0.104373 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4883  endoribonuclease L-PSP  41.5 
 
 		 157 aa  102  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000371063  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0927  endoribonuclease L-PSP  39.86 
 
 		 152 aa  102  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.553211 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1204  endoribonuclease L-PSP  39.46 
 
 		 156 aa  102  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.375276 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0332  endoribonuclease L-PSP  44.17 
 
 		 163 aa  102  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0921694 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2373  endoribonuclease L-PSP  39.86 
 
 		 152 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2270  endoribonuclease L-PSP  39.86 
 
 		 152 aa  102  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.724419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2388  endoribonuclease L-PSP  39.86 
 
 		 152 aa  102  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.921996  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>