202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5181 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5181  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 154 aa  306  8e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2457  endoribonuclease L-PSP  53.29 
 
 		 153 aa  157  4e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1123  endoribonuclease L-PSP  50.34 
 
 		 155 aa  136  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.321047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0581  endoribonuclease L-PSP  46.26 
 
 		 154 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0481259  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2531  hypothetical protein  45.64 
 
 		 156 aa  129  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1504  endoribonuclease L-PSP  46.62 
 
 		 155 aa  126  9.000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.910903  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6055  Endoribonuclease L-PSP  42.86 
 
 		 162 aa  125  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.316335  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2027  endoribonuclease L-PSP  46.26 
 
 		 154 aa  125  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0633724  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1165  hypothetical protein  44.9 
 
 		 154 aa  123  1e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1113  Endoribonuclease L-PSP  48.3 
 
 		 155 aa  122  1e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.85817  normal  0.626067 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1645  Endoribonuclease L-PSP  41.22 
 
 		 156 aa  122  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.827325 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1122  hypothetical protein  44.22 
 
 		 154 aa  121  3e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.457332  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1577  Endoribonuclease L-PSP  44 
 
 		 156 aa  121  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.401191  normal  0.481334 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2111  Endoribonuclease L-PSP  40.94 
 
 		 163 aa  120  8e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0168  endoribonuclease L-PSP  45.39 
 
 		 153 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3144  endoribonuclease L-PSP  45.95 
 
 		 152 aa  118  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.147772 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1774  Endoribonuclease L-PSP  44.22 
 
 		 156 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.98491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1944  Endoribonuclease L-PSP  45.58 
 
 		 153 aa  117  3.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4751  putative endoribonuclease L-PSP (protein synthesis inhibitor)  43.79 
 
 		 155 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.708532  normal  0.751414 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4853  Endoribonuclease L-PSP  46.15 
 
 		 154 aa  117  7.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1272  endoribonuclease L-PSP  43.05 
 
 		 153 aa  116  9.999999999999999e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.103554  hitchhiker  0.00713107 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1092  endoribonuclease L-PSP  40.14 
 
 		 151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2030  Endoribonuclease L-PSP  41.55 
 
 		 156 aa  114  3e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00146961  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2408  endoribonuclease L-PSP  45.21 
 
 		 155 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.628638  normal  0.167618 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1252  endoribonuclease L-PSP  49.64 
 
 		 156 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.476616  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1792  endoribonuclease L-PSP  44 
 
 		 156 aa  113  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.282183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2448  endoribonuclease L-PSP  45.33 
 
 		 155 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.514496  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1346  endoribonuclease L-PSP  41.5 
 
 		 152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00288796  normal  0.104373 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3043  endoribonuclease L-PSP  43.62 
 
 		 155 aa  111  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.574471 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1379  endoribonuclease L-PSP  44.76 
 
 		 158 aa  111  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0200  endoribonuclease L-PSP  45.45 
 
 		 153 aa  111  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.151399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25430  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  45.1 
 
 		 157 aa  111  4.0000000000000004e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2803  endoribonuclease L-PSP  42.86 
 
 		 155 aa  110  7.000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.117143  normal  0.432336 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0121  peptidase C26  41.22 
 
 		 407 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.808568 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2477  endoribonuclease L-PSP  40.65 
 
 		 153 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.738257  normal  0.0496442 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2555  hypothetical protein  41.89 
 
 		 154 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.853817 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6537  endoribonuclease L-PSP  42.11 
 
 		 157 aa  108  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.21507  normal  0.550061 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2319  endoribonuclease L-PSP  41.83 
 
 		 157 aa  108  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3546  Endoribonuclease L-PSP  43.15 
 
 		 155 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0228  Endoribonuclease L-PSP  45.33 
 
 		 152 aa  108  3e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0932  Endoribonuclease L-PSP  39.46 
 
 		 152 aa  107  4.0000000000000004e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.315119  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1018  endoribonuclease L-PSP  39.46 
 
 		 152 aa  108  4.0000000000000004e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.386479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3343  Endoribonuclease L-PSP  40.14 
 
 		 152 aa  107  5e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0721684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0435  endoribonuclease L-PSP  40.14 
 
 		 155 aa  107  6e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13709  hypothetical protein  42.86 
 
 		 151 aa  107  7.000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0525391 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1427  endoribonuclease L-PSP  44.3 
 
 		 155 aa  105  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.426351 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4551  Endoribonuclease L-PSP  42.48 
 
 		 157 aa  105  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0402  endoribonuclease L-PSP  40.14 
 
 		 152 aa  105  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0666223 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4070  endoribonuclease L-PSP  42.48 
 
 		 162 aa  105  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.256894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2784  endoribonuclease L-PSP  42.11 
 
 		 155 aa  105  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7458  Endoribonuclease L-PSP  40.79 
 
 		 157 aa  104  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0137  endoribonuclease L-PSP  41.5 
 
 		 155 aa  104  5e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3793  endoribonuclease L-PSP  39.16 
 
 		 154 aa  104  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.756407 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0713  Endoribonuclease L-PSP  42.66 
 
 		 152 aa  104  5e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1062  Endoribonuclease L-PSP  44.37 
 
 		 151 aa  103  7e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3313  endoribonuclease L-PSP  42.67 
 
 		 155 aa  103  8e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0332  endoribonuclease L-PSP  47.18 
 
 		 163 aa  103  8e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0921694 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4437  Endoribonuclease L-PSP  42.48 
 
 		 157 aa  103  8e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.062411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0250  endoribonuclease L-PSP  44.81 
 
 		 152 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2111  endoribonuclease L-PSP  46.62 
 
 		 141 aa  102  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.459106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0894  hypothetical protein  42.11 
 
 		 152 aa  101  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.324074  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2553  endoribonuclease L-PSP  42.11 
 
 		 152 aa  101  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2450  peptidase C26  40.82 
 
 		 409 aa  101  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3006  endoribonuclease L-PSP  40.79 
 
 		 154 aa  100  5e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.236246 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2609  endoribonuclease L-PSP  41.89 
 
 		 152 aa  100  5e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.56142 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1369  endoribonuclease L-PSP  45.52 
 
 		 153 aa  101  5e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.324136 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1259  Endoribonuclease L-PSP  45.71 
 
 		 149 aa  100  8e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0123792 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3178  Endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 177 aa  100  8e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.738101 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1180  Endoribonuclease L-PSP  42.65 
 
 		 153 aa  100  9e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8908  Endoribonuclease L-PSP  43.45 
 
 		 152 aa  99.8  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.974502 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1258  endoribonuclease L-PSP  39.07 
 
 		 156 aa  99  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1470  endoribonuclease L-PSP  45.1 
 
 		 157 aa  99  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3934  Endoribonuclease L-PSP  42.28 
 
 		 156 aa  98.2  3e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0814  hypothetical protein  43.05 
 
 		 170 aa  98.2  4e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.565462  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5081  endoribonuclease L-PSP  37.41 
 
 		 152 aa  97.4  6e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0190721 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1348  Endoribonuclease L-PSP  42.57 
 
 		 157 aa  97.1  8e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4348  endoribonuclease L-PSP  42.03 
 
 		 153 aa  97.1  8e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.917733 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0465  hypothetical protein  42.86 
 
 		 152 aa  97.1  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.346493 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4789  endoribonuclease L-PSP  41.43 
 
 		 153 aa  96.3  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0118265 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53740  hypothetical protein  43.55 
 
 		 144 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00018421  hitchhiker  0.00710422 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5091  hypothetical protein  40.54 
 
 		 163 aa  95.9  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6138  endoribonuclease L-PSP  39.73 
 
 		 153 aa  95.9  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6426  endoribonuclease L-PSP  39.73 
 
 		 153 aa  95.5  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.576265 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4704  hypothetical protein  43.55 
 
 		 144 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.723705  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4282  endoribonuclease L-PSP  42.76 
 
 		 154 aa  94.7  4e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.667627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3105  endoribonuclease L-PSP  41.56 
 
 		 155 aa  94.7  4e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.473778  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2706  Endoribonuclease L-PSP  36.84 
 
 		 153 aa  94.7  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.253512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0434  Endoribonuclease L-PSP  43.33 
 
 		 155 aa  94  7e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.51654 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3580  endoribonuclease L-PSP  38.3 
 
 		 153 aa  93.6  8e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.45612  normal  0.209775 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2736  endoribonuclease L-PSP  40.67 
 
 		 146 aa  93.6  9e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.947  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0986  hypothetical protein  38.03 
 
 		 156 aa  93.2  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0698758  normal  0.152684 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0515  Endoribonuclease L-PSP  47.5 
 
 		 157 aa  93.2  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1204  endoribonuclease L-PSP  37.24 
 
 		 156 aa  93.2  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.375276 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3462  endoribonuclease L-PSP  41.1 
 
 		 159 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0120904 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18300  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  44.59 
 
 		 166 aa  92  3e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.614303  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2118  endoribonuclease L-PSP  38.36 
 
 		 154 aa  91.3  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124484  normal  0.0891562 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3039  Endoribonuclease L-PSP  40.67 
 
 		 157 aa  91.3  4e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1498  Endoribonuclease L-PSP  39.19 
 
 		 160 aa  90.9  5e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0960  hypothetical protein  39.61 
 
 		 162 aa  90.9  5e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.304597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0336  endoribonuclease L-PSP  43.48 
 
 		 154 aa  91.3  5e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>