275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1470 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_1470  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 157 aa  303  7e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3343  Endoribonuclease L-PSP  55.92 
 
 		 152 aa  188  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0721684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1944  Endoribonuclease L-PSP  57.62 
 
 		 153 aa  169  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1645  Endoribonuclease L-PSP  46.67 
 
 		 156 aa  167  4e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.827325 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2030  Endoribonuclease L-PSP  48.65 
 
 		 156 aa  159  1e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00146961  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13709  hypothetical protein  49.01 
 
 		 151 aa  152  2e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0525391 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4348  endoribonuclease L-PSP  57.35 
 
 		 153 aa  151  4e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.917733 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4853  Endoribonuclease L-PSP  49.66 
 
 		 154 aa  150  5.9999999999999996e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0713  Endoribonuclease L-PSP  53.06 
 
 		 152 aa  150  8.999999999999999e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0200  endoribonuclease L-PSP  50.34 
 
 		 153 aa  150  8.999999999999999e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.151399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5207  endoribonuclease L-PSP  52.86 
 
 		 162 aa  147  7e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000695376 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8908  Endoribonuclease L-PSP  53.38 
 
 		 152 aa  147  7e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.974502 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4820  endoribonuclease L-PSP  52.86 
 
 		 162 aa  147  7e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4906  endoribonuclease L-PSP  52.86 
 
 		 162 aa  147  7e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.374579 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1122  hypothetical protein  48 
 
 		 154 aa  145  3e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.457332  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1165  hypothetical protein  48 
 
 		 154 aa  144  5e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2027  endoribonuclease L-PSP  47.33 
 
 		 154 aa  143  8.000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0633724  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4789  endoribonuclease L-PSP  56.06 
 
 		 153 aa  143  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0118265 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1369  endoribonuclease L-PSP  51.37 
 
 		 153 aa  139  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.324136 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0465  hypothetical protein  51.97 
 
 		 152 aa  140  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.346493 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0241  Endoribonuclease L-PSP  52.94 
 
 		 152 aa  139  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.206377  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0434  Endoribonuclease L-PSP  51.01 
 
 		 155 aa  138  3.9999999999999997e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.51654 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1504  endoribonuclease L-PSP  48.67 
 
 		 155 aa  137  4.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.910903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1999  endoribonuclease L-PSP  55.48 
 
 		 161 aa  137  4.999999999999999e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1092  endoribonuclease L-PSP  41.33 
 
 		 151 aa  137  7.999999999999999e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3793  endoribonuclease L-PSP  44.97 
 
 		 154 aa  137  7.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.756407 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2531  hypothetical protein  44.37 
 
 		 156 aa  136  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5437  endoribonuclease L-PSP  53.28 
 
 		 152 aa  136  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491285 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3039  Endoribonuclease L-PSP  46.1 
 
 		 157 aa  135  2e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0228  Endoribonuclease L-PSP  48.03 
 
 		 152 aa  135  2e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1705  Endoribonuclease L-PSP  46.71 
 
 		 156 aa  135  3.0000000000000003e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.182301  hitchhiker  0.0000000000000067862 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0499  Endoribonuclease L-PSP  49.69 
 
 		 162 aa  135  3.0000000000000003e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.389355  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3178  Endoribonuclease L-PSP  43.75 
 
 		 177 aa  134  5e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.738101 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0332  endoribonuclease L-PSP  51.37 
 
 		 163 aa  134  7.000000000000001e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0921694 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0114  hypothetical protein  52.17 
 
 		 155 aa  134  7.000000000000001e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3580  endoribonuclease L-PSP  45.39 
 
 		 153 aa  132  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.45612  normal  0.209775 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4282  endoribonuclease L-PSP  52.7 
 
 		 154 aa  133  9.999999999999999e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.667627  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2153  endoribonuclease L-PSP, putative  40.67 
 
 		 152 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4751  putative endoribonuclease L-PSP (protein synthesis inhibitor)  45.39 
 
 		 155 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.708532  normal  0.751414 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5091  hypothetical protein  40.94 
 
 		 163 aa  132  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0515  Endoribonuclease L-PSP  54.97 
 
 		 157 aa  131  3.9999999999999996e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1613  endoribonuclease L-PSP  43.42 
 
 		 154 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.578745  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5312  Endoribonuclease L-PSP  49.66 
 
 		 153 aa  130  6.999999999999999e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.688432 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1636  endoribonuclease L-PSP  42.76 
 
 		 154 aa  130  9e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.564581 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4437  Endoribonuclease L-PSP  47.3 
 
 		 157 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.062411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1180  Endoribonuclease L-PSP  48.23 
 
 		 153 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2457  endoribonuclease L-PSP  47.26 
 
 		 153 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0336  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3735  endoribonuclease L-PSP  39.6 
 
 		 170 aa  128  3e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0323381  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4070  endoribonuclease L-PSP  46.62 
 
 		 162 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.256894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1577  Endoribonuclease L-PSP  42.76 
 
 		 156 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.401191  normal  0.481334 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18300  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  47.02 
 
 		 166 aa  127  5.0000000000000004e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.614303  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3934  Endoribonuclease L-PSP  42.86 
 
 		 156 aa  127  6e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1252  endoribonuclease L-PSP  48.25 
 
 		 156 aa  127  6e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.476616  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0927  endoribonuclease L-PSP  40.67 
 
 		 152 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.553211 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4551  Endoribonuclease L-PSP  46.62 
 
 		 157 aa  127  8.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5125  endoribonuclease L-PSP  42.86 
 
 		 154 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4883  endoribonuclease L-PSP  43.71 
 
 		 157 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000371063  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25430  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  47.1 
 
 		 157 aa  126  1.0000000000000001e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1113  Endoribonuclease L-PSP  45.07 
 
 		 155 aa  126  1.0000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.85817  normal  0.626067 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1774  Endoribonuclease L-PSP  43.42 
 
 		 156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.98491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2408  endoribonuclease L-PSP  45.83 
 
 		 155 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.628638  normal  0.167618 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1123  endoribonuclease L-PSP  44 
 
 		 155 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.321047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0581  endoribonuclease L-PSP  40.67 
 
 		 154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0481259  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6537  endoribonuclease L-PSP  47.59 
 
 		 157 aa  125  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.21507  normal  0.550061 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5691  endoribonuclease L-PSP  40.67 
 
 		 152 aa  125  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1379  endoribonuclease L-PSP  41.18 
 
 		 158 aa  125  3e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2373  endoribonuclease L-PSP  40.67 
 
 		 152 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6055  Endoribonuclease L-PSP  41.5 
 
 		 162 aa  124  5e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.316335  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36190  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  49.67 
 
 		 151 aa  124  5e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1740  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 152 aa  124  6e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2388  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 152 aa  124  6e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.921996  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2352  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 152 aa  124  6e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1530  endoribonuclease L-PSP  39.87 
 
 		 160 aa  124  6e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2270  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 152 aa  124  6e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.724419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2319  endoribonuclease L-PSP  45.81 
 
 		 157 aa  123  8.000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2448  endoribonuclease L-PSP  46.21 
 
 		 155 aa  123  8.000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.514496  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0814  hypothetical protein  42.86 
 
 		 170 aa  122  1e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.565462  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2736  endoribonuclease L-PSP  47.02 
 
 		 146 aa  123  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3546  Endoribonuclease L-PSP  45.14 
 
 		 155 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1427  endoribonuclease L-PSP  45.14 
 
 		 155 aa  121  3e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.426351 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2706  Endoribonuclease L-PSP  37.25 
 
 		 153 aa  121  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.253512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7458  Endoribonuclease L-PSP  47.59 
 
 		 157 aa  122  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3313  endoribonuclease L-PSP  44.37 
 
 		 155 aa  121  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3105  endoribonuclease L-PSP  51.33 
 
 		 155 aa  121  5e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.473778  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0168  endoribonuclease L-PSP  45.89 
 
 		 153 aa  120  5e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1792  endoribonuclease L-PSP  41.45 
 
 		 156 aa  120  6e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.282183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2118  endoribonuclease L-PSP  41.06 
 
 		 154 aa  120  6e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124484  normal  0.0891562 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6426  endoribonuclease L-PSP  42.18 
 
 		 153 aa  120  6e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.576265 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1062  Endoribonuclease L-PSP  46.62 
 
 		 151 aa  120  6e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1212  Endoribonuclease L-PSP  40.4 
 
 		 154 aa  120  7e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3043  endoribonuclease L-PSP  44.44 
 
 		 155 aa  120  7e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.574471 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0950  L-PSP family endoribonuclease  38 
 
 		 164 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.449669  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3144  endoribonuclease L-PSP  41.45 
 
 		 152 aa  120  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.147772 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1204  endoribonuclease L-PSP  38.67 
 
 		 156 aa  120  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.375276 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2204  Endoribonuclease L-PSP  50.33 
 
 		 153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0449477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0435  endoribonuclease L-PSP  38.82 
 
 		 155 aa  119  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5081  endoribonuclease L-PSP  42.76 
 
 		 152 aa  119  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0190721 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0137  endoribonuclease L-PSP  44.76 
 
 		 155 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1313  L-PSP family endoribonuclease  38.67 
 
 		 164 aa  118  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.221061  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>