203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0228 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0228  Endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 152 aa  293  5e-79  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2030  Endoribonuclease L-PSP  53.52 
 
 		 156 aa  154  6e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00146961  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1645  Endoribonuclease L-PSP  45.58 
 
 		 156 aa  142  1e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.827325 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1944  Endoribonuclease L-PSP  49.67 
 
 		 153 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3343  Endoribonuclease L-PSP  41.45 
 
 		 152 aa  128  3e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0721684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1122  hypothetical protein  44.22 
 
 		 154 aa  125  3e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.457332  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1165  hypothetical protein  44.22 
 
 		 154 aa  124  4.0000000000000003e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4853  Endoribonuclease L-PSP  46.67 
 
 		 154 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0713  Endoribonuclease L-PSP  46.94 
 
 		 152 aa  123  8.000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1252  endoribonuclease L-PSP  48.3 
 
 		 156 aa  121  3e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.476616  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6055  Endoribonuclease L-PSP  44.22 
 
 		 162 aa  119  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.316335  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1092  endoribonuclease L-PSP  39.04 
 
 		 151 aa  118  1.9999999999999998e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0200  endoribonuclease L-PSP  43.92 
 
 		 153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.151399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0332  endoribonuclease L-PSP  49.32 
 
 		 163 aa  119  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0921694 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2457  endoribonuclease L-PSP  44.08 
 
 		 153 aa  118  3e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3793  endoribonuclease L-PSP  42.47 
 
 		 154 aa  118  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.756407 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1470  endoribonuclease L-PSP  48.03 
 
 		 157 aa  118  3e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13709  hypothetical protein  45.1 
 
 		 151 aa  117  6e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0525391 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2803  endoribonuclease L-PSP  43.54 
 
 		 155 aa  117  7.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.117143  normal  0.432336 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47655  predicted protein  42.86 
 
 		 185 aa  116  9.999999999999999e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00618585  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37922  predicted protein  42.86 
 
 		 185 aa  116  9.999999999999999e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00476754  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0465  hypothetical protein  46.45 
 
 		 152 aa  116  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.346493 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25430  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  47.71 
 
 		 157 aa  116  9.999999999999999e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3580  endoribonuclease L-PSP  39.46 
 
 		 153 aa  114  3e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.45612  normal  0.209775 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2531  hypothetical protein  43.54 
 
 		 156 aa  114  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3144  endoribonuclease L-PSP  45.27 
 
 		 152 aa  114  5e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.147772 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1792  endoribonuclease L-PSP  43.62 
 
 		 156 aa  114  6e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.282183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2027  endoribonuclease L-PSP  43.15 
 
 		 154 aa  114  6.9999999999999995e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0633724  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2153  endoribonuclease L-PSP, putative  39.86 
 
 		 152 aa  113  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4282  endoribonuclease L-PSP  46.26 
 
 		 154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.667627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1705  Endoribonuclease L-PSP  42.18 
 
 		 156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.182301  hitchhiker  0.0000000000000067862 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2908  Endoribonuclease L-PSP  44.97 
 
 		 164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4348  endoribonuclease L-PSP  46.72 
 
 		 153 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.917733 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3105  endoribonuclease L-PSP  47.62 
 
 		 155 aa  112  3e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.473778  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2111  endoribonuclease L-PSP  45.04 
 
 		 141 aa  111  3e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.459106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4704  hypothetical protein  46.1 
 
 		 144 aa  111  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.723705  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1180  Endoribonuclease L-PSP  43.26 
 
 		 153 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1427  endoribonuclease L-PSP  45.77 
 
 		 155 aa  110  5e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.426351 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0435  endoribonuclease L-PSP  41.22 
 
 		 155 aa  110  6e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1113  Endoribonuclease L-PSP  43.15 
 
 		 155 aa  110  6e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.85817  normal  0.626067 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1123  endoribonuclease L-PSP  43.54 
 
 		 155 aa  110  8.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.321047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36190  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  47.97 
 
 		 151 aa  109  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53740  hypothetical protein  45.39 
 
 		 144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00018421  hitchhiker  0.00710422 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0581  endoribonuclease L-PSP  37.41 
 
 		 154 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0481259  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0434  Endoribonuclease L-PSP  45.58 
 
 		 155 aa  108  2.0000000000000002e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.51654 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0137  endoribonuclease L-PSP  43.24 
 
 		 155 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1379  endoribonuclease L-PSP  39.73 
 
 		 158 aa  108  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18300  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  45.58 
 
 		 166 aa  108  3e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.614303  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2736  endoribonuclease L-PSP  44.67 
 
 		 146 aa  108  4.0000000000000004e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4789  endoribonuclease L-PSP  46.81 
 
 		 153 aa  107  5e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0118265 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1554  Endoribonuclease L-PSP  36.49 
 
 		 168 aa  107  6e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.30004 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6537  endoribonuclease L-PSP  46.54 
 
 		 157 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.21507  normal  0.550061 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4751  putative endoribonuclease L-PSP (protein synthesis inhibitor)  41.96 
 
 		 155 aa  107  7.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.708532  normal  0.751414 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3546  Endoribonuclease L-PSP  42.86 
 
 		 155 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0168  endoribonuclease L-PSP  42.57 
 
 		 153 aa  106  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0814  hypothetical protein  44.06 
 
 		 170 aa  104  4e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.565462  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2319  endoribonuclease L-PSP  42.68 
 
 		 157 aa  104  5e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7458  Endoribonuclease L-PSP  45.91 
 
 		 157 aa  104  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2408  endoribonuclease L-PSP  41.5 
 
 		 155 aa  103  6e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.628638  normal  0.167618 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5760  Endoribonuclease L-PSP  41.22 
 
 		 165 aa  103  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.332069  normal  0.705807 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2706  Endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 153 aa  103  6e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.253512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2784  endoribonuclease L-PSP  46.75 
 
 		 155 aa  103  7e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0114  hypothetical protein  45.26 
 
 		 155 aa  103  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1577  Endoribonuclease L-PSP  39.19 
 
 		 156 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.401191  normal  0.481334 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1774  Endoribonuclease L-PSP  40.14 
 
 		 156 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.98491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3039  Endoribonuclease L-PSP  43.04 
 
 		 157 aa  102  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1801  hypothetical protein  44.6 
 
 		 168 aa  102  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0113627  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6667  Endoribonuclease L-PSP  40.54 
 
 		 165 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0416868  normal  0.0241604 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0950  L-PSP family endoribonuclease  42.57 
 
 		 164 aa  101  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.449669  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1613  endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 154 aa  101  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.578745  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0241  Endoribonuclease L-PSP  44.08 
 
 		 152 aa  101  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.206377  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5312  Endoribonuclease L-PSP  46.36 
 
 		 153 aa  101  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.688432 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1369  endoribonuclease L-PSP  43.71 
 
 		 153 aa  101  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.324136 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3735  endoribonuclease L-PSP  38.26 
 
 		 170 aa  101  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0323381  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1272  endoribonuclease L-PSP  41.18 
 
 		 153 aa  101  4e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.103554  hitchhiker  0.00713107 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3934  Endoribonuclease L-PSP  42.38 
 
 		 156 aa  100  6e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3043  endoribonuclease L-PSP  40.14 
 
 		 155 aa  100  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.574471 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1636  endoribonuclease L-PSP  36.84 
 
 		 154 aa  100  8e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.564581 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2518  Endoribonuclease L-PSP  47.92 
 
 		 151 aa  99.8  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0151498  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3313  endoribonuclease L-PSP  42.18 
 
 		 155 aa  99.4  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2448  endoribonuclease L-PSP  41.22 
 
 		 155 aa  99.4  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.514496  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2988  endoribonuclease L-PSP  39.19 
 
 		 164 aa  100  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04880  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  43.75 
 
 		 159 aa  98.6  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.826759 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0250  endoribonuclease L-PSP  42.21 
 
 		 152 aa  99  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5125  endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 154 aa  98.2  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1498  Endoribonuclease L-PSP  42.75 
 
 		 160 aa  98.6  3e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0607  Endoribonuclease L-PSP  44.16 
 
 		 155 aa  98.6  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.322518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0927  endoribonuclease L-PSP  39.46 
 
 		 152 aa  97.8  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.553211 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4883  endoribonuclease L-PSP  39.86 
 
 		 157 aa  97.4  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000371063  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4820  endoribonuclease L-PSP  42.03 
 
 		 162 aa  97.4  6e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4906  endoribonuclease L-PSP  42.03 
 
 		 162 aa  97.4  6e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.374579 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3178  Endoribonuclease L-PSP  41.45 
 
 		 177 aa  97.4  6e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.738101 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5207  endoribonuclease L-PSP  42.03 
 
 		 162 aa  97.4  6e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000695376 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2118  endoribonuclease L-PSP  40.94 
 
 		 154 aa  97.1  7e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124484  normal  0.0891562 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3462  endoribonuclease L-PSP  40.82 
 
 		 159 aa  97.1  8e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0120904 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1313  L-PSP family endoribonuclease  42.25 
 
 		 164 aa  97.1  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.221061  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2223  L-PSP family endoribonuclease  42.25 
 
 		 152 aa  97.1  9e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5691  endoribonuclease L-PSP  39.46 
 
 		 152 aa  96.7  9e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1530  endoribonuclease L-PSP  35.06 
 
 		 160 aa  96.7  9e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1162  putative endoribonuclease L-PSP  42.25 
 
 		 152 aa  97.1  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>