279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1801 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1801  hypothetical protein  100 
 
 		 168 aa  338  2e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0113627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2665  endoribonuclease L-PSP  53.46 
 
 		 158 aa  161  5.0000000000000005e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0119908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5806  endoribonuclease L-PSP  50.33 
 
 		 156 aa  134  5e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.295199 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0287  endoribonuclease L-PSP  44.59 
 
 		 162 aa  130  1.0000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2788  Endoribonuclease L-PSP  44.87 
 
 		 163 aa  125  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4643  endoribonuclease L-PSP  42.86 
 
 		 163 aa  124  5e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.183681  normal  0.137047 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1645  Endoribonuclease L-PSP  41.61 
 
 		 156 aa  123  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.827325 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7448  endoribonuclease L-PSP  44.65 
 
 		 162 aa  122  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5025  endoribonuclease L-PSP  38.67 
 
 		 177 aa  122  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4704  hypothetical protein  48.06 
 
 		 144 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.723705  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4853  Endoribonuclease L-PSP  42.55 
 
 		 154 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5670  endoribonuclease L-PSP  42.48 
 
 		 162 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6034  endoribonuclease L-PSP  42.48 
 
 		 162 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6524  endoribonuclease L-PSP  42.48 
 
 		 162 aa  115  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.372376 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0200  endoribonuclease L-PSP  42.55 
 
 		 153 aa  114  7.999999999999999e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.151399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53740  hypothetical protein  45.74 
 
 		 144 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00018421  hitchhiker  0.00710422 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1379  endoribonuclease L-PSP  42.11 
 
 		 158 aa  110  9e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1123  endoribonuclease L-PSP  39.44 
 
 		 155 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.321047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2531  hypothetical protein  37.5 
 
 		 156 aa  108  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1577  Endoribonuclease L-PSP  35.26 
 
 		 156 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.401191  normal  0.481334 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2784  endoribonuclease L-PSP  41.6 
 
 		 155 aa  106  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6055  Endoribonuclease L-PSP  36.11 
 
 		 162 aa  106  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.316335  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3006  endoribonuclease L-PSP  43.75 
 
 		 154 aa  105  4e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.236246 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0121  peptidase C26  38.61 
 
 		 407 aa  103  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.808568 
 
 
-
 
NC_004310  BR1165  hypothetical protein  37.5 
 
 		 154 aa  103  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2027  endoribonuclease L-PSP  38.82 
 
 		 154 aa  103  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0633724  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2457  endoribonuclease L-PSP  37.24 
 
 		 153 aa  103  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0435  endoribonuclease L-PSP  37.41 
 
 		 155 aa  103  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1944  Endoribonuclease L-PSP  36.73 
 
 		 153 aa  103  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2030  Endoribonuclease L-PSP  39.58 
 
 		 156 aa  103  1e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00146961  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2111  endoribonuclease L-PSP  41.54 
 
 		 141 aa  102  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.459106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1122  hypothetical protein  37.5 
 
 		 154 aa  103  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.457332  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0228  Endoribonuclease L-PSP  44.6 
 
 		 152 aa  102  3e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2988  endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 164 aa  101  4e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3105  endoribonuclease L-PSP  39.61 
 
 		 155 aa  101  5e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.473778  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1092  endoribonuclease L-PSP  35.62 
 
 		 151 aa  101  5e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1113  Endoribonuclease L-PSP  41.94 
 
 		 155 aa  101  6e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.85817  normal  0.626067 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1774  Endoribonuclease L-PSP  33.97 
 
 		 156 aa  100  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.98491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1498  Endoribonuclease L-PSP  38.76 
 
 		 160 aa  99.8  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1470  endoribonuclease L-PSP  39.31 
 
 		 157 aa  100  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26250  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  42.86 
 
 		 167 aa  100  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.738846  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5760  Endoribonuclease L-PSP  38 
 
 		 165 aa  99.8  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.332069  normal  0.705807 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3343  Endoribonuclease L-PSP  35.86 
 
 		 152 aa  99.4  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0721684  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6667  Endoribonuclease L-PSP  38 
 
 		 165 aa  99.8  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0416868  normal  0.0241604 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1427  endoribonuclease L-PSP  41.3 
 
 		 155 aa  99  3e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.426351 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0241  Endoribonuclease L-PSP  40.85 
 
 		 152 aa  98.6  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.206377  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0960  hypothetical protein  37.93 
 
 		 162 aa  98.2  5e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.304597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0581  endoribonuclease L-PSP  34.27 
 
 		 154 aa  97.4  9e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0481259  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3793  endoribonuclease L-PSP  36.54 
 
 		 154 aa  96.7  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.756407 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3735  endoribonuclease L-PSP  34.9 
 
 		 170 aa  96.3  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0323381  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13709  hypothetical protein  36.11 
 
 		 151 aa  96.7  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0525391 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2706  Endoribonuclease L-PSP  36.81 
 
 		 153 aa  96.3  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.253512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0168  endoribonuclease L-PSP  36.5 
 
 		 153 aa  95.5  3e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3546  Endoribonuclease L-PSP  39.13 
 
 		 155 aa  95.5  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4348  endoribonuclease L-PSP  38.57 
 
 		 153 aa  94.7  5e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.917733 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5091  hypothetical protein  33.33 
 
 		 163 aa  94.4  7e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0336  endoribonuclease L-PSP  38.98 
 
 		 154 aa  94  9e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1008  Endoribonuclease L-PSP  40.15 
 
 		 162 aa  93.2  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2448  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 155 aa  94  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.514496  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4751  putative endoribonuclease L-PSP (protein synthesis inhibitor)  38.57 
 
 		 155 aa  94  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.708532  normal  0.751414 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4883  endoribonuclease L-PSP  37.67 
 
 		 157 aa  93.2  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000371063  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1258  endoribonuclease L-PSP  38.31 
 
 		 156 aa  92.4  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2408  endoribonuclease L-PSP  38.41 
 
 		 155 aa  92  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.628638  normal  0.167618 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4789  endoribonuclease L-PSP  37.86 
 
 		 153 aa  92  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0118265 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2153  endoribonuclease L-PSP, putative  35.42 
 
 		 152 aa  91.7  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1554  Endoribonuclease L-PSP  34.01 
 
 		 168 aa  91.3  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.30004 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0814  hypothetical protein  34.69 
 
 		 170 aa  91.3  5e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.565462  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3333  hypothetical protein  35.9 
 
 		 154 aa  91.7  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.440014  normal  0.330579 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3043  endoribonuclease L-PSP  38.41 
 
 		 155 aa  91.3  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.574471 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5312  Endoribonuclease L-PSP  40.85 
 
 		 153 aa  91.3  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.688432 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8908  Endoribonuclease L-PSP  38.78 
 
 		 152 aa  91.3  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.974502 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0402  endoribonuclease L-PSP  39.53 
 
 		 152 aa  90.9  7e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0666223 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1180  Endoribonuclease L-PSP  38.28 
 
 		 153 aa  90.5  9e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1252  endoribonuclease L-PSP  37.86 
 
 		 156 aa  90.5  9e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.476616  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3313  endoribonuclease L-PSP  38.1 
 
 		 155 aa  90.5  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1705  Endoribonuclease L-PSP  37.42 
 
 		 156 aa  90.5  1e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.182301  hitchhiker  0.0000000000000067862 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1259  Endoribonuclease L-PSP  42.75 
 
 		 149 aa  90.1  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0123792 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5207  endoribonuclease L-PSP  33.58 
 
 		 162 aa  89.7  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000695376 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0927  endoribonuclease L-PSP  35.57 
 
 		 152 aa  89.7  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.553211 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36190  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  42.74 
 
 		 151 aa  89.7  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4820  endoribonuclease L-PSP  33.58 
 
 		 162 aa  89.7  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4906  endoribonuclease L-PSP  33.58 
 
 		 162 aa  89.7  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.374579 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1369  endoribonuclease L-PSP  35.21 
 
 		 153 aa  88.6  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.324136 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1792  endoribonuclease L-PSP  35.66 
 
 		 156 aa  89  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.282183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0465  hypothetical protein  41.13 
 
 		 152 aa  89  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.346493 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1272  endoribonuclease L-PSP  33.81 
 
 		 153 aa  89  3e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.103554  hitchhiker  0.00713107 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0515  Endoribonuclease L-PSP  38.33 
 
 		 157 aa  89  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5081  endoribonuclease L-PSP  33.57 
 
 		 152 aa  88.2  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0190721 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2477  endoribonuclease L-PSP  34.78 
 
 		 153 aa  88.2  5e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.738257  normal  0.0496442 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3178  Endoribonuclease L-PSP  36.71 
 
 		 177 aa  88.2  6e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.738101 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3144  endoribonuclease L-PSP  34.04 
 
 		 152 aa  87.8  6e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.147772 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1530  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 160 aa  87.4  9e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2542  L-PSP family endoribonuclease  35.1 
 
 		 152 aa  87  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.455947  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2072  putative endoribonuclease L-PSP  35.1 
 
 		 152 aa  87  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.110705  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2223  L-PSP family endoribonuclease  35.1 
 
 		 152 aa  87  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1313  L-PSP family endoribonuclease  35.1 
 
 		 164 aa  86.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.221061  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0916  Endoribonuclease L-PSP  34.19 
 
 		 156 aa  87  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.139977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1212  Endoribonuclease L-PSP  36.18 
 
 		 154 aa  87  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25430  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  35.67 
 
 		 157 aa  86.7  1e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1346  endoribonuclease L-PSP  37.21 
 
 		 152 aa  86.7  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00288796  normal  0.104373 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>