205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4643 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4643  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 163 aa  336  9.999999999999999e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.183681  normal  0.137047 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5806  endoribonuclease L-PSP  53.55 
 
 		 156 aa  172  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.295199 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2665  endoribonuclease L-PSP  50.33 
 
 		 158 aa  159  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0119908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0287  endoribonuclease L-PSP  46.75 
 
 		 162 aa  152  1e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7448  endoribonuclease L-PSP  44.08 
 
 		 162 aa  136  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2788  Endoribonuclease L-PSP  44 
 
 		 163 aa  134  4e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5670  endoribonuclease L-PSP  44.74 
 
 		 162 aa  134  5e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6034  endoribonuclease L-PSP  44.74 
 
 		 162 aa  134  5e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6524  endoribonuclease L-PSP  44.08 
 
 		 162 aa  131  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.372376 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4704  hypothetical protein  45.86 
 
 		 144 aa  125  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.723705  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1801  hypothetical protein  42.86 
 
 		 168 aa  124  5e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0113627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5025  endoribonuclease L-PSP  38.06 
 
 		 177 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53740  hypothetical protein  45.11 
 
 		 144 aa  120  7e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00018421  hitchhiker  0.00710422 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2111  endoribonuclease L-PSP  46.27 
 
 		 141 aa  120  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.459106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1645  Endoribonuclease L-PSP  38.46 
 
 		 156 aa  117  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.827325 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2027  endoribonuclease L-PSP  39.74 
 
 		 154 aa  114  6e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0633724  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1122  hypothetical protein  41.13 
 
 		 154 aa  114  6e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.457332  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1165  hypothetical protein  41.13 
 
 		 154 aa  113  8.999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3343  Endoribonuclease L-PSP  39.53 
 
 		 152 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0721684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1944  Endoribonuclease L-PSP  38.93 
 
 		 153 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6055  Endoribonuclease L-PSP  44.09 
 
 		 162 aa  110  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.316335  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1379  endoribonuclease L-PSP  37.09 
 
 		 158 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4751  putative endoribonuclease L-PSP (protein synthesis inhibitor)  44.88 
 
 		 155 aa  108  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.708532  normal  0.751414 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1705  Endoribonuclease L-PSP  43.08 
 
 		 156 aa  107  6e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.182301  hitchhiker  0.0000000000000067862 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1123  endoribonuclease L-PSP  41.73 
 
 		 155 aa  104  7e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.321047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3546  Endoribonuclease L-PSP  44 
 
 		 155 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3793  endoribonuclease L-PSP  43.08 
 
 		 154 aa  102  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.756407 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3735  endoribonuclease L-PSP  41.41 
 
 		 170 aa  101  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0323381  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3105  endoribonuclease L-PSP  41.32 
 
 		 155 aa  101  4e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.473778  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0435  endoribonuclease L-PSP  39.39 
 
 		 155 aa  100  6e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4853  Endoribonuclease L-PSP  35.71 
 
 		 154 aa  100  7e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0200  endoribonuclease L-PSP  39.53 
 
 		 153 aa  100  8e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.151399  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2030  Endoribonuclease L-PSP  35.37 
 
 		 156 aa  100  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00146961  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2448  endoribonuclease L-PSP  41.6 
 
 		 155 aa  99  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.514496  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5091  hypothetical protein  36.15 
 
 		 163 aa  99  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1427  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 155 aa  98.6  3e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.426351 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3043  endoribonuclease L-PSP  40.8 
 
 		 155 aa  98.2  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.574471 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2408  endoribonuclease L-PSP  40.8 
 
 		 155 aa  97.8  6e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.628638  normal  0.167618 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1470  endoribonuclease L-PSP  36.8 
 
 		 157 aa  97.4  7e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3313  endoribonuclease L-PSP  40.16 
 
 		 155 aa  97.1  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1577  Endoribonuclease L-PSP  38.58 
 
 		 156 aa  96.7  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.401191  normal  0.481334 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2531  hypothetical protein  36.84 
 
 		 156 aa  96.7  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1092  endoribonuclease L-PSP  36.17 
 
 		 151 aa  96.3  2e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2111  Endoribonuclease L-PSP  40.62 
 
 		 163 aa  95.9  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0336  endoribonuclease L-PSP  39.32 
 
 		 154 aa  96.3  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2784  endoribonuclease L-PSP  43.8 
 
 		 155 aa  96.3  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1774  Endoribonuclease L-PSP  37.8 
 
 		 156 aa  95.5  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.98491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1749  endoribonuclease L-PSP  36.43 
 
 		 151 aa  95.5  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.470188  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1636  endoribonuclease L-PSP  32.91 
 
 		 154 aa  95.5  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.564581 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1554  Endoribonuclease L-PSP  35.61 
 
 		 168 aa  95.1  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.30004 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0228  Endoribonuclease L-PSP  34.78 
 
 		 152 aa  94.7  5e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3006  endoribonuclease L-PSP  39.68 
 
 		 154 aa  94.7  5e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.236246 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3580  endoribonuclease L-PSP  37.8 
 
 		 153 aa  94.7  5e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.45612  normal  0.209775 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0581  endoribonuclease L-PSP  35.71 
 
 		 154 aa  94  8e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0481259  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0960  hypothetical protein  40.6 
 
 		 162 aa  93.2  1e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.304597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1252  endoribonuclease L-PSP  34.72 
 
 		 156 aa  93.2  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.476616  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1613  endoribonuclease L-PSP  32.28 
 
 		 154 aa  93.6  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.578745  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1498  Endoribonuclease L-PSP  34.85 
 
 		 160 aa  93.6  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1530  endoribonuclease L-PSP  34.46 
 
 		 160 aa  93.6  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3144  endoribonuclease L-PSP  37.21 
 
 		 152 aa  93.6  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.147772 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1062  Endoribonuclease L-PSP  43.75 
 
 		 151 aa  92.8  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0168  endoribonuclease L-PSP  39.2 
 
 		 153 aa  92.8  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1792  endoribonuclease L-PSP  37.98 
 
 		 156 aa  91.7  4e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.282183  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2153  endoribonuclease L-PSP, putative  31.3 
 
 		 152 aa  91.3  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5312  Endoribonuclease L-PSP  38.76 
 
 		 153 aa  91.3  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.688432 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1180  Endoribonuclease L-PSP  33.85 
 
 		 153 aa  91.3  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4883  endoribonuclease L-PSP  34.59 
 
 		 157 aa  90.9  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000371063  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8908  Endoribonuclease L-PSP  38.71 
 
 		 152 aa  90.5  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.974502 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0332  endoribonuclease L-PSP  37.06 
 
 		 163 aa  90.1  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0921694 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3178  Endoribonuclease L-PSP  35.29 
 
 		 177 aa  90.1  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.738101 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1404  Endoribonuclease L-PSP  39.26 
 
 		 161 aa  90.1  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4070  endoribonuclease L-PSP  39.06 
 
 		 162 aa  90.1  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.256894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4437  Endoribonuclease L-PSP  39.06 
 
 		 157 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.062411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4551  Endoribonuclease L-PSP  39.06 
 
 		 157 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2457  endoribonuclease L-PSP  35.38 
 
 		 153 aa  89.4  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2270  endoribonuclease L-PSP  36.67 
 
 		 152 aa  89.4  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.724419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3162  endoribonuclease L-PSP  32.64 
 
 		 155 aa  89.7  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.567156  normal  0.207214 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1740  endoribonuclease L-PSP  36.67 
 
 		 152 aa  89.4  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0927  endoribonuclease L-PSP  36.67 
 
 		 152 aa  89.7  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.553211 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2388  endoribonuclease L-PSP  36.67 
 
 		 152 aa  89.4  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.921996  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7458  Endoribonuclease L-PSP  38.46 
 
 		 157 aa  89  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2352  endoribonuclease L-PSP  36.67 
 
 		 152 aa  89.4  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18300  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  39.68 
 
 		 166 aa  89.4  2e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.614303  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0713  Endoribonuclease L-PSP  34.03 
 
 		 152 aa  89.4  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2706  Endoribonuclease L-PSP  33.59 
 
 		 153 aa  89.4  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.253512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4348  endoribonuclease L-PSP  39.5 
 
 		 153 aa  89.7  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.917733 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0841  endoribonuclease L-PSP  35.92 
 
 		 164 aa  89  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2373  endoribonuclease L-PSP  36.67 
 
 		 152 aa  89  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1504  endoribonuclease L-PSP  37.59 
 
 		 155 aa  89  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.910903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2319  endoribonuclease L-PSP  39.23 
 
 		 157 aa  89  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5081  endoribonuclease L-PSP  31.47 
 
 		 152 aa  88.2  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0190721 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1258  endoribonuclease L-PSP  40.15 
 
 		 156 aa  88.2  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5691  endoribonuclease L-PSP  35.83 
 
 		 152 aa  88.2  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13709  hypothetical protein  36.72 
 
 		 151 aa  87.8  5e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0525391 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4789  endoribonuclease L-PSP  38.66 
 
 		 153 aa  87.4  7e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0118265 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0950  L-PSP family endoribonuclease  31.25 
 
 		 164 aa  86.7  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.449669  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2506  endoribonuclease L-PSP  33.9 
 
 		 151 aa  87  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.101057  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1212  Endoribonuclease L-PSP  32.64 
 
 		 154 aa  86.7  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1204  endoribonuclease L-PSP  30.56 
 
 		 156 aa  86.3  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.375276 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3462  endoribonuclease L-PSP  34.88 
 
 		 159 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0120904 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>