224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2665 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2665  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 158 aa  317  3.9999999999999996e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0119908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5806  endoribonuclease L-PSP  62.67 
 
 		 156 aa  190  7e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.295199 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0287  endoribonuclease L-PSP  59.87 
 
 		 162 aa  186  8e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2788  Endoribonuclease L-PSP  60.69 
 
 		 163 aa  182  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7448  endoribonuclease L-PSP  54.97 
 
 		 162 aa  167  5e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4643  endoribonuclease L-PSP  50.33 
 
 		 163 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.183681  normal  0.137047 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1801  hypothetical protein  53.46 
 
 		 168 aa  161  3e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0113627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5670  endoribonuclease L-PSP  52.98 
 
 		 162 aa  160  9e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6034  endoribonuclease L-PSP  52.98 
 
 		 162 aa  160  9e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6524  endoribonuclease L-PSP  51.66 
 
 		 162 aa  155  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.372376 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5025  endoribonuclease L-PSP  43.42 
 
 		 177 aa  138  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4704  hypothetical protein  49.62 
 
 		 144 aa  123  9e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.723705  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53740  hypothetical protein  48.87 
 
 		 144 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00018421  hitchhiker  0.00710422 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2027  endoribonuclease L-PSP  41.56 
 
 		 154 aa  116  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0633724  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2111  endoribonuclease L-PSP  46.15 
 
 		 141 aa  115  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.459106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1944  Endoribonuclease L-PSP  47.62 
 
 		 153 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1165  hypothetical protein  41.56 
 
 		 154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4853  Endoribonuclease L-PSP  44.37 
 
 		 154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1122  hypothetical protein  40.91 
 
 		 154 aa  111  4.0000000000000004e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.457332  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0581  endoribonuclease L-PSP  43.65 
 
 		 154 aa  111  5e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0481259  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1645  Endoribonuclease L-PSP  42.06 
 
 		 156 aa  108  3e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.827325 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3343  Endoribonuclease L-PSP  40.8 
 
 		 152 aa  107  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0721684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2531  hypothetical protein  38.71 
 
 		 156 aa  107  6e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1379  endoribonuclease L-PSP  38.31 
 
 		 158 aa  106  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0200  endoribonuclease L-PSP  46.03 
 
 		 153 aa  105  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.151399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1577  Endoribonuclease L-PSP  41.73 
 
 		 156 aa  104  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.401191  normal  0.481334 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1774  Endoribonuclease L-PSP  42.52 
 
 		 156 aa  104  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.98491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1123  endoribonuclease L-PSP  44.09 
 
 		 155 aa  103  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.321047  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2030  Endoribonuclease L-PSP  42.28 
 
 		 156 aa  102  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00146961  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3793  endoribonuclease L-PSP  39.68 
 
 		 154 aa  102  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.756407 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1498  Endoribonuclease L-PSP  38.17 
 
 		 160 aa  100  9e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3105  endoribonuclease L-PSP  41.46 
 
 		 155 aa  100  9e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.473778  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3735  endoribonuclease L-PSP  40.16 
 
 		 170 aa  100  9e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0323381  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1092  endoribonuclease L-PSP  37.8 
 
 		 151 aa  99.8  1e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0336  endoribonuclease L-PSP  41.53 
 
 		 154 aa  98.6  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0435  endoribonuclease L-PSP  40.94 
 
 		 155 aa  98.2  4e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1470  endoribonuclease L-PSP  41.32 
 
 		 157 aa  97.8  5e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4348  endoribonuclease L-PSP  42.54 
 
 		 153 aa  97.8  5e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.917733 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6055  Endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 162 aa  97.4  7e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.316335  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8908  Endoribonuclease L-PSP  44.35 
 
 		 152 aa  97.1  9e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.974502 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3546  Endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 155 aa  95.9  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0960  hypothetical protein  41.09 
 
 		 162 aa  95.5  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.304597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26250  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  44.07 
 
 		 167 aa  95.9  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.738846  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5312  Endoribonuclease L-PSP  42.06 
 
 		 153 aa  95.5  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.688432 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3144  endoribonuclease L-PSP  39.52 
 
 		 152 aa  95.1  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.147772 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0332  endoribonuclease L-PSP  41.41 
 
 		 163 aa  94.4  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0921694 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1285  Endoribonuclease L-PSP  43.18 
 
 		 156 aa  94.7  5e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.770765 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0434  Endoribonuclease L-PSP  43.65 
 
 		 155 aa  94.4  6e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.51654 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3178  Endoribonuclease L-PSP  41.91 
 
 		 177 aa  94.4  6e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.738101 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4789  endoribonuclease L-PSP  41.79 
 
 		 153 aa  94.4  6e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0118265 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2477  endoribonuclease L-PSP  41.6 
 
 		 153 aa  94  7e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.738257  normal  0.0496442 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0121  peptidase C26  34.48 
 
 		 407 aa  94  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.808568 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1427  endoribonuclease L-PSP  38.58 
 
 		 155 aa  93.2  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.426351 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3006  endoribonuclease L-PSP  45.16 
 
 		 154 aa  92.8  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.236246 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0168  endoribonuclease L-PSP  38.4 
 
 		 153 aa  93.2  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1008  Endoribonuclease L-PSP  40.77 
 
 		 162 aa  92.8  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1180  Endoribonuclease L-PSP  39.52 
 
 		 153 aa  92.4  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0814  hypothetical protein  35.76 
 
 		 170 aa  92.4  2e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.565462  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3891  putative endoribonuclease L-PSP  41.22 
 
 		 152 aa  92.4  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1613  endoribonuclease L-PSP  38.73 
 
 		 154 aa  92.4  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.578745  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1530  endoribonuclease L-PSP  36.43 
 
 		 160 aa  92.8  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2518  Endoribonuclease L-PSP  45.24 
 
 		 151 aa  92.8  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0151498  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0114  hypothetical protein  40.28 
 
 		 155 aa  92  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0228  Endoribonuclease L-PSP  42.74 
 
 		 152 aa  91.7  3e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1252  endoribonuclease L-PSP  37.14 
 
 		 156 aa  92  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.476616  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4751  putative endoribonuclease L-PSP (protein synthesis inhibitor)  36.8 
 
 		 155 aa  92  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.708532  normal  0.751414 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1636  endoribonuclease L-PSP  38.73 
 
 		 154 aa  92  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.564581 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2706  Endoribonuclease L-PSP  37.21 
 
 		 153 aa  91.7  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.253512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4883  endoribonuclease L-PSP  40.62 
 
 		 157 aa  91.3  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000371063  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2784  endoribonuclease L-PSP  39.83 
 
 		 155 aa  90.9  6e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2408  endoribonuclease L-PSP  36.8 
 
 		 155 aa  90.9  7e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.628638  normal  0.167618 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13709  hypothetical protein  38.76 
 
 		 151 aa  90.9  7e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0525391 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0241  Endoribonuclease L-PSP  41.53 
 
 		 152 aa  90.5  7e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.206377  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2223  L-PSP family endoribonuclease  39.68 
 
 		 152 aa  90.1  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5125  endoribonuclease L-PSP  37.32 
 
 		 154 aa  89.7  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1313  L-PSP family endoribonuclease  39.68 
 
 		 164 aa  90.1  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.221061  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3043  endoribonuclease L-PSP  37.6 
 
 		 155 aa  90.1  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.574471 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0708  L-PSP family endoribonuclease  39.68 
 
 		 155 aa  90.1  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2542  L-PSP family endoribonuclease  39.68 
 
 		 152 aa  90.1  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.455947  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1153  putative endoribonuclease L-PSP  39.68 
 
 		 152 aa  90.1  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1162  putative endoribonuclease L-PSP  39.68 
 
 		 152 aa  90.1  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2072  putative endoribonuclease L-PSP  39.68 
 
 		 152 aa  90.1  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.110705  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2153  endoribonuclease L-PSP, putative  33.07 
 
 		 152 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0465  hypothetical protein  41.55 
 
 		 152 aa  89.4  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.346493 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5536  endoribonuclease L-PSP  37.01 
 
 		 156 aa  89.4  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.044824 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3162  endoribonuclease L-PSP  38.1 
 
 		 155 aa  88.6  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.567156  normal  0.207214 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2448  endoribonuclease L-PSP  37.01 
 
 		 155 aa  88.6  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.514496  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1554  Endoribonuclease L-PSP  34.65 
 
 		 168 aa  88.6  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.30004 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6667  Endoribonuclease L-PSP  35.94 
 
 		 165 aa  88.6  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0416868  normal  0.0241604 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6842  Endoribonuclease L-PSP  35.11 
 
 		 168 aa  88.2  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.173433 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18300  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  40.97 
 
 		 166 aa  88.2  4e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.614303  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3934  Endoribonuclease L-PSP  39.84 
 
 		 156 aa  88.2  4e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3039  Endoribonuclease L-PSP  41.09 
 
 		 157 aa  88.2  4e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5760  Endoribonuclease L-PSP  34.97 
 
 		 165 aa  87.8  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.332069  normal  0.705807 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3313  endoribonuclease L-PSP  35.66 
 
 		 155 aa  87.8  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3397  endoribonuclease L-PSP  41.41 
 
 		 189 aa  87.4  6e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1404  Endoribonuclease L-PSP  38.46 
 
 		 161 aa  87.4  7e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1272  endoribonuclease L-PSP  35.71 
 
 		 153 aa  87  8e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.103554  hitchhiker  0.00713107 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0950  L-PSP family endoribonuclease  38.1 
 
 		 164 aa  87  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.449669  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0841  endoribonuclease L-PSP  34.53 
 
 		 164 aa  86.7  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>