281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1123 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1123  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 155 aa  308  2e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.321047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1577  Endoribonuclease L-PSP  78.71 
 
 		 156 aa  253  5e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.401191  normal  0.481334 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1774  Endoribonuclease L-PSP  78.06 
 
 		 156 aa  249  8.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.98491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2531  hypothetical protein  75.97 
 
 		 156 aa  242  1.9999999999999999e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2027  endoribonuclease L-PSP  63.87 
 
 		 154 aa  199  8e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0633724  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1165  hypothetical protein  61.94 
 
 		 154 aa  187  4e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1122  hypothetical protein  61.94 
 
 		 154 aa  187  4e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.457332  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1379  endoribonuclease L-PSP  57.42 
 
 		 158 aa  180  6e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2457  endoribonuclease L-PSP  53.64 
 
 		 153 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6055  Endoribonuclease L-PSP  58.67 
 
 		 162 aa  172  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.316335  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1272  endoribonuclease L-PSP  57.42 
 
 		 153 aa  171  5e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.103554  hitchhiker  0.00713107 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0137  endoribonuclease L-PSP  54.55 
 
 		 155 aa  168  3e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3144  endoribonuclease L-PSP  53.95 
 
 		 152 aa  167  5e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.147772 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0435  endoribonuclease L-PSP  52.6 
 
 		 155 aa  166  8e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3793  endoribonuclease L-PSP  51.95 
 
 		 154 aa  166  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.756407 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2477  endoribonuclease L-PSP  52.67 
 
 		 153 aa  165  2e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.738257  normal  0.0496442 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2803  endoribonuclease L-PSP  54.19 
 
 		 155 aa  165  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.117143  normal  0.432336 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1092  endoribonuclease L-PSP  52 
 
 		 151 aa  158  2e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4853  Endoribonuclease L-PSP  52 
 
 		 154 aa  156  8e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0581  endoribonuclease L-PSP  52.29 
 
 		 154 aa  156  9e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0481259  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0200  endoribonuclease L-PSP  53.9 
 
 		 153 aa  156  1e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.151399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3546  Endoribonuclease L-PSP  50.64 
 
 		 155 aa  153  6e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1113  Endoribonuclease L-PSP  50.67 
 
 		 155 aa  153  8e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.85817  normal  0.626067 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0250  endoribonuclease L-PSP  55.33 
 
 		 152 aa  152  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1645  Endoribonuclease L-PSP  48.99 
 
 		 156 aa  150  4e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.827325 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3313  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 155 aa  150  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1792  endoribonuclease L-PSP  53.25 
 
 		 156 aa  150  5.9999999999999996e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.282183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0168  endoribonuclease L-PSP  50.34 
 
 		 153 aa  149  1e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2408  endoribonuclease L-PSP  48.72 
 
 		 155 aa  149  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.628638  normal  0.167618 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3043  endoribonuclease L-PSP  48.08 
 
 		 155 aa  149  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.574471 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0894  hypothetical protein  54 
 
 		 152 aa  149  2e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.324074  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3178  Endoribonuclease L-PSP  50.62 
 
 		 177 aa  149  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.738101 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2553  endoribonuclease L-PSP  54 
 
 		 152 aa  149  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4751  putative endoribonuclease L-PSP (protein synthesis inhibitor)  47.74 
 
 		 155 aa  148  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.708532  normal  0.751414 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1427  endoribonuclease L-PSP  49.36 
 
 		 155 aa  147  7e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.426351 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2448  endoribonuclease L-PSP  49.68 
 
 		 155 aa  146  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.514496  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1944  Endoribonuclease L-PSP  49.67 
 
 		 153 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13709  hypothetical protein  48.7 
 
 		 151 aa  144  5e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0525391 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2030  Endoribonuclease L-PSP  48.05 
 
 		 156 aa  143  8.000000000000001e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00146961  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3343  Endoribonuclease L-PSP  47.65 
 
 		 152 aa  140  7e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0721684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1348  Endoribonuclease L-PSP  51.92 
 
 		 157 aa  140  9e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8908  Endoribonuclease L-PSP  51.68 
 
 		 152 aa  139  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.974502 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2609  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 152 aa  138  3e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.56142 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3105  endoribonuclease L-PSP  52.6 
 
 		 155 aa  137  3.9999999999999997e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.473778  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0114  hypothetical protein  56.12 
 
 		 155 aa  137  7.999999999999999e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3039  Endoribonuclease L-PSP  52.29 
 
 		 157 aa  137  7.999999999999999e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3462  endoribonuclease L-PSP  48.67 
 
 		 159 aa  136  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0120904 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25430  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  50 
 
 		 157 aa  135  2e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2784  endoribonuclease L-PSP  52.67 
 
 		 155 aa  135  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5312  Endoribonuclease L-PSP  51.32 
 
 		 153 aa  135  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.688432 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2736  endoribonuclease L-PSP  52.32 
 
 		 146 aa  135  3.0000000000000003e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1346  endoribonuclease L-PSP  45.03 
 
 		 152 aa  134  4e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00288796  normal  0.104373 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0713  Endoribonuclease L-PSP  46.94 
 
 		 152 aa  134  4e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1204  endoribonuclease L-PSP  45.58 
 
 		 156 aa  134  5e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.375276 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0465  hypothetical protein  54.55 
 
 		 152 aa  134  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.346493 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1062  Endoribonuclease L-PSP  52.03 
 
 		 151 aa  133  7.000000000000001e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4551  Endoribonuclease L-PSP  45.81 
 
 		 157 aa  133  9e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4348  endoribonuclease L-PSP  52.55 
 
 		 153 aa  133  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.917733 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2319  endoribonuclease L-PSP  46.79 
 
 		 157 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0434  Endoribonuclease L-PSP  49.67 
 
 		 155 aa  132  9.999999999999999e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.51654 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0986  hypothetical protein  44.81 
 
 		 156 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0698758  normal  0.152684 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4070  endoribonuclease L-PSP  45.81 
 
 		 162 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.256894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1369  endoribonuclease L-PSP  50.32 
 
 		 153 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.324136 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1504  endoribonuclease L-PSP  45.7 
 
 		 155 aa  132  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.910903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1018  endoribonuclease L-PSP  43.92 
 
 		 152 aa  131  3e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.386479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2111  Endoribonuclease L-PSP  44.59 
 
 		 163 aa  131  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0932  Endoribonuclease L-PSP  43.92 
 
 		 152 aa  131  3e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.315119  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2555  hypothetical protein  45.75 
 
 		 154 aa  131  3e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.853817 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4437  Endoribonuclease L-PSP  45.81 
 
 		 157 aa  131  3e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.062411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5081  endoribonuclease L-PSP  44.59 
 
 		 152 aa  131  3.9999999999999996e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0190721 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1258  endoribonuclease L-PSP  48.7 
 
 		 156 aa  130  5e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4820  endoribonuclease L-PSP  51.09 
 
 		 162 aa  130  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5207  endoribonuclease L-PSP  51.09 
 
 		 162 aa  130  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000695376 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4906  endoribonuclease L-PSP  51.09 
 
 		 162 aa  130  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.374579 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0950  L-PSP family endoribonuclease  47.06 
 
 		 164 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.449669  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4789  endoribonuclease L-PSP  50.36 
 
 		 153 aa  129  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0118265 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5091  hypothetical protein  46.26 
 
 		 163 aa  129  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0402  endoribonuclease L-PSP  44.59 
 
 		 152 aa  128  3e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0666223 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3006  endoribonuclease L-PSP  50.99 
 
 		 154 aa  127  5.0000000000000004e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.236246 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0927  endoribonuclease L-PSP  45.75 
 
 		 152 aa  127  6e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.553211 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2153  endoribonuclease L-PSP, putative  44.3 
 
 		 152 aa  127  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1313  L-PSP family endoribonuclease  46.41 
 
 		 164 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.221061  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0708  L-PSP family endoribonuclease  46.41 
 
 		 155 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2118  endoribonuclease L-PSP  46.05 
 
 		 154 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124484  normal  0.0891562 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2072  putative endoribonuclease L-PSP  46.41 
 
 		 152 aa  126  9.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.110705  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2223  L-PSP family endoribonuclease  46.41 
 
 		 152 aa  126  9.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3580  endoribonuclease L-PSP  44.97 
 
 		 153 aa  126  9.000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.45612  normal  0.209775 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1162  putative endoribonuclease L-PSP  46.41 
 
 		 152 aa  126  9.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2542  L-PSP family endoribonuclease  46.41 
 
 		 152 aa  126  9.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.455947  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1153  putative endoribonuclease L-PSP  46.41 
 
 		 152 aa  126  9.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3735  endoribonuclease L-PSP  43.62 
 
 		 170 aa  125  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0323381  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1554  Endoribonuclease L-PSP  41.72 
 
 		 168 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.30004 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2373  endoribonuclease L-PSP  45.75 
 
 		 152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2270  endoribonuclease L-PSP  45.75 
 
 		 152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.724419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1740  endoribonuclease L-PSP  45.75 
 
 		 152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2388  endoribonuclease L-PSP  45.75 
 
 		 152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.921996  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2352  endoribonuclease L-PSP  45.75 
 
 		 152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1212  Endoribonuclease L-PSP  46.94 
 
 		 154 aa  124  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6537  endoribonuclease L-PSP  43.95 
 
 		 157 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.21507  normal  0.550061 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7458  Endoribonuclease L-PSP  45.57 
 
 		 157 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>