226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1272 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1272  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 
153 aa  301  3.0000000000000004e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.103554  hitchhiker  0.00713107 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2477  endoribonuclease L-PSP  64 
 
 
153 aa  201  2e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.738257  normal  0.0496442 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3144  endoribonuclease L-PSP  66.45 
 
 
152 aa  197  3.9999999999999996e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.147772 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2457  endoribonuclease L-PSP  64.71 
 
 
153 aa  190  7e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2803  endoribonuclease L-PSP  62 
 
 
155 aa  182  1.0000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.117143  normal  0.432336 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0435  endoribonuclease L-PSP  55.7 
 
 
155 aa  176  8e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0894  hypothetical protein  61.74 
 
 
152 aa  175  2e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.324074  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2553  endoribonuclease L-PSP  61.74 
 
 
152 aa  175  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1123  endoribonuclease L-PSP  57.42 
 
 
155 aa  171  3.9999999999999995e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.321047  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0137  endoribonuclease L-PSP  59.06 
 
 
155 aa  171  5e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3793  endoribonuclease L-PSP  59.87 
 
 
154 aa  170  6.999999999999999e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.756407 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0250  endoribonuclease L-PSP  60 
 
 
152 aa  170  6.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2319  endoribonuclease L-PSP  58.86 
 
 
157 aa  168  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6055  Endoribonuclease L-PSP  59.33 
 
 
162 aa  168  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.316335  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1577  Endoribonuclease L-PSP  56.95 
 
 
156 aa  168  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.401191  normal  0.481334 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1774  Endoribonuclease L-PSP  56.29 
 
 
156 aa  166  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.98491  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2531  hypothetical protein  54.67 
 
 
156 aa  166  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4751  putative endoribonuclease L-PSP (protein synthesis inhibitor)  56.95 
 
 
155 aa  164  5e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.708532  normal  0.751414 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1427  endoribonuclease L-PSP  55.92 
 
 
155 aa  162  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.426351 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1792  endoribonuclease L-PSP  54.49 
 
 
156 aa  160  5.0000000000000005e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.282183  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3313  endoribonuclease L-PSP  57.24 
 
 
155 aa  160  6e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129795  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4551  Endoribonuclease L-PSP  53.8 
 
 
157 aa  160  6e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2027  endoribonuclease L-PSP  55.63 
 
 
154 aa  158  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0633724  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2408  endoribonuclease L-PSP  55.26 
 
 
155 aa  158  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.628638  normal  0.167618 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4070  endoribonuclease L-PSP  52.53 
 
 
162 aa  157  5e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.256894  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3546  Endoribonuclease L-PSP  55.26 
 
 
155 aa  157  7e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3043  endoribonuclease L-PSP  53.95 
 
 
155 aa  155  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.574471 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2448  endoribonuclease L-PSP  54.97 
 
 
155 aa  155  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.514496  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4437  Endoribonuclease L-PSP  52.53 
 
 
157 aa  155  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.062411  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1165  hypothetical protein  55.63 
 
 
154 aa  154  5.0000000000000005e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2736  endoribonuclease L-PSP  58.94 
 
 
146 aa  154  5.0000000000000005e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.947  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1122  hypothetical protein  54.97 
 
 
154 aa  152  2e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.457332  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1113  Endoribonuclease L-PSP  55.84 
 
 
155 aa  149  8.999999999999999e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.85817  normal  0.626067 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6537  endoribonuclease L-PSP  50.64 
 
 
157 aa  148  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.21507  normal  0.550061 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2784  endoribonuclease L-PSP  61.33 
 
 
155 aa  148  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1379  endoribonuclease L-PSP  49.67 
 
 
158 aa  147  6e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4853  Endoribonuclease L-PSP  52.6 
 
 
154 aa  145  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7458  Endoribonuclease L-PSP  51.59 
 
 
157 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0200  endoribonuclease L-PSP  52.94 
 
 
153 aa  143  9e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.151399  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1944  Endoribonuclease L-PSP  50 
 
 
153 aa  141  3e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2111  Endoribonuclease L-PSP  50.68 
 
 
163 aa  141  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1348  Endoribonuclease L-PSP  50.32 
 
 
157 aa  141  4e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3105  endoribonuclease L-PSP  55.03 
 
 
155 aa  137  4.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.473778  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3462  endoribonuclease L-PSP  53.06 
 
 
159 aa  137  7e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0120904 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1204  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 
156 aa  137  7e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.375276 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0168  endoribonuclease L-PSP  52.7 
 
 
153 aa  137  7e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0986  hypothetical protein  50.67 
 
 
156 aa  136  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0698758  normal  0.152684 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1645  Endoribonuclease L-PSP  46.31 
 
 
156 aa  135  2e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.827325 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5081  endoribonuclease L-PSP  45.7 
 
 
152 aa  132  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0190721 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0581  endoribonuclease L-PSP  42.11 
 
 
154 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0481259  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2555  hypothetical protein  50 
 
 
154 aa  130  5e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.853817 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13709  hypothetical protein  49.67 
 
 
151 aa  130  7.999999999999999e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0525391 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1092  endoribonuclease L-PSP  45.7 
 
 
151 aa  130  7.999999999999999e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0114  hypothetical protein  56.83 
 
 
155 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3006  endoribonuclease L-PSP  52.35 
 
 
154 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.236246 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1346  endoribonuclease L-PSP  46.41 
 
 
152 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00288796  normal  0.104373 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1018  endoribonuclease L-PSP  45.1 
 
 
152 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.386479  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0932  Endoribonuclease L-PSP  44.44 
 
 
152 aa  128  3e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.315119  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6426  endoribonuclease L-PSP  46.1 
 
 
153 aa  128  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.576265 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6138  endoribonuclease L-PSP  45.45 
 
 
153 aa  128  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0402  endoribonuclease L-PSP  46.36 
 
 
152 aa  128  3e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0666223 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1504  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 
155 aa  127  8.000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.910903  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2609  endoribonuclease L-PSP  49.67 
 
 
152 aa  126  1.0000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.56142 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3178  Endoribonuclease L-PSP  46.39 
 
 
177 aa  125  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.738101 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1554  Endoribonuclease L-PSP  44.44 
 
 
168 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.30004 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0927  endoribonuclease L-PSP  45.75 
 
 
152 aa  124  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.553211 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2373  endoribonuclease L-PSP  46.41 
 
 
152 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1740  endoribonuclease L-PSP  45.75 
 
 
152 aa  124  5e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2388  endoribonuclease L-PSP  45.75 
 
 
152 aa  124  5e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.921996  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2352  endoribonuclease L-PSP  45.75 
 
 
152 aa  124  5e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2270  endoribonuclease L-PSP  45.75 
 
 
152 aa  124  5e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.724419  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5691  endoribonuclease L-PSP  45.75 
 
 
152 aa  124  6e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0950  L-PSP family endoribonuclease  45.1 
 
 
164 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.449669  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0713  Endoribonuclease L-PSP  46.1 
 
 
152 aa  123  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2348  endoribonuclease L-PSP  48.03 
 
 
151 aa  123  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5091  hypothetical protein  50 
 
 
163 aa  123  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3039  Endoribonuclease L-PSP  50 
 
 
157 aa  122  1e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4348  endoribonuclease L-PSP  50.35 
 
 
153 aa  122  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.917733 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2223  L-PSP family endoribonuclease  45.1 
 
 
152 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1313  L-PSP family endoribonuclease  45.1 
 
 
164 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.221061  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47655  predicted protein  47.02 
 
 
185 aa  122  2e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00618585  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37922  predicted protein  47.02 
 
 
185 aa  122  2e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00476754  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2542  L-PSP family endoribonuclease  45.1 
 
 
152 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.455947  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1153  putative endoribonuclease L-PSP  45.1 
 
 
152 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1162  putative endoribonuclease L-PSP  45.1 
 
 
152 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2072  putative endoribonuclease L-PSP  45.1 
 
 
152 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.110705  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1062  Endoribonuclease L-PSP  46.2 
 
 
151 aa  121  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0708  L-PSP family endoribonuclease  45.1 
 
 
155 aa  122  3e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3162  endoribonuclease L-PSP  46.94 
 
 
155 aa  120  7e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.567156  normal  0.207214 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3343  Endoribonuclease L-PSP  42.28 
 
 
152 aa  120  7e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0721684  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3735  endoribonuclease L-PSP  42.28 
 
 
170 aa  120  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0323381  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2988  endoribonuclease L-PSP  51.39 
 
 
164 aa  120  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0916  Endoribonuclease L-PSP  48.98 
 
 
156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.139977  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2118  endoribonuclease L-PSP  45.7 
 
 
154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124484  normal  0.0891562 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0847  Endoribonuclease L-PSP  48.98 
 
 
156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00708228  normal  0.528275 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2512  endoribonuclease L-PSP  46.71 
 
 
150 aa  118  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.796499  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1212  Endoribonuclease L-PSP  45.21 
 
 
154 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3580  endoribonuclease L-PSP  45.33 
 
 
153 aa  117  3.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.45612  normal  0.209775 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0434  Endoribonuclease L-PSP  50 
 
 
155 aa  117  4.9999999999999996e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.51654 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0904  endoribonuclease L-PSP  48.03 
 
 
151 aa  117  4.9999999999999996e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>