213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1348 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1348  Endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 157 aa  311  2.9999999999999996e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1792  endoribonuclease L-PSP  65.81 
 
 		 156 aa  216  7.999999999999999e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.282183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4551  Endoribonuclease L-PSP  66.24 
 
 		 157 aa  211  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4070  endoribonuclease L-PSP  64.97 
 
 		 162 aa  208  2e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.256894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2319  endoribonuclease L-PSP  68.39 
 
 		 157 aa  207  6e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4437  Endoribonuclease L-PSP  64.97 
 
 		 157 aa  206  9e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.062411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6537  endoribonuclease L-PSP  61.29 
 
 		 157 aa  187  5e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.21507  normal  0.550061 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7458  Endoribonuclease L-PSP  60 
 
 		 157 aa  185  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2408  endoribonuclease L-PSP  60 
 
 		 155 aa  180  6e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.628638  normal  0.167618 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3546  Endoribonuclease L-PSP  59.33 
 
 		 155 aa  178  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3043  endoribonuclease L-PSP  58 
 
 		 155 aa  177  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.574471 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3793  endoribonuclease L-PSP  56.86 
 
 		 154 aa  172  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.756407 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4751  putative endoribonuclease L-PSP (protein synthesis inhibitor)  56.29 
 
 		 155 aa  170  7.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.708532  normal  0.751414 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2448  endoribonuclease L-PSP  56.67 
 
 		 155 aa  169  1e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.514496  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1113  Endoribonuclease L-PSP  56.13 
 
 		 155 aa  168  3e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.85817  normal  0.626067 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1427  endoribonuclease L-PSP  56 
 
 		 155 aa  167  7e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.426351 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3313  endoribonuclease L-PSP  54.97 
 
 		 155 aa  165  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2531  hypothetical protein  56.05 
 
 		 156 aa  163  9e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3144  endoribonuclease L-PSP  51.3 
 
 		 152 aa  163  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.147772 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2803  endoribonuclease L-PSP  54.84 
 
 		 155 aa  161  3e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.117143  normal  0.432336 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6055  Endoribonuclease L-PSP  53.29 
 
 		 162 aa  152  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.316335  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1123  endoribonuclease L-PSP  51.92 
 
 		 155 aa  152  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.321047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1272  endoribonuclease L-PSP  50.97 
 
 		 153 aa  151  2.9999999999999998e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.103554  hitchhiker  0.00713107 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1379  endoribonuclease L-PSP  52.63 
 
 		 158 aa  150  5e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2457  endoribonuclease L-PSP  53.02 
 
 		 153 aa  148  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2027  endoribonuclease L-PSP  49.68 
 
 		 154 aa  148  3e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0633724  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1165  hypothetical protein  51.59 
 
 		 154 aa  148  4e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1122  hypothetical protein  51.59 
 
 		 154 aa  148  4e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.457332  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1577  Endoribonuclease L-PSP  52.53 
 
 		 156 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.401191  normal  0.481334 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0894  hypothetical protein  53.95 
 
 		 152 aa  142  2e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.324074  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2553  endoribonuclease L-PSP  53.95 
 
 		 152 aa  142  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0137  endoribonuclease L-PSP  50.65 
 
 		 155 aa  141  4e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1774  Endoribonuclease L-PSP  50.66 
 
 		 156 aa  140  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.98491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4853  Endoribonuclease L-PSP  48.72 
 
 		 154 aa  140  9e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0435  endoribonuclease L-PSP  47.06 
 
 		 155 aa  139  1.9999999999999998e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0713  Endoribonuclease L-PSP  53.25 
 
 		 152 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2030  Endoribonuclease L-PSP  46.85 
 
 		 156 aa  139  1.9999999999999998e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00146961  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1645  Endoribonuclease L-PSP  44.37 
 
 		 156 aa  138  3e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.827325 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0250  endoribonuclease L-PSP  52.63 
 
 		 152 aa  137  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0168  endoribonuclease L-PSP  54.67 
 
 		 153 aa  137  4.999999999999999e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3178  Endoribonuclease L-PSP  47.85 
 
 		 177 aa  135  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.738101 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0200  endoribonuclease L-PSP  48.05 
 
 		 153 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.151399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3343  Endoribonuclease L-PSP  45.7 
 
 		 152 aa  134  7.000000000000001e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0721684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3039  Endoribonuclease L-PSP  49.38 
 
 		 157 aa  132  9.999999999999999e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2477  endoribonuclease L-PSP  44.74 
 
 		 153 aa  132  9.999999999999999e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.738257  normal  0.0496442 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2736  endoribonuclease L-PSP  53.29 
 
 		 146 aa  132  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13709  hypothetical protein  49.33 
 
 		 151 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0525391 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1092  endoribonuclease L-PSP  43.79 
 
 		 151 aa  132  3e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0581  endoribonuclease L-PSP  42.86 
 
 		 154 aa  131  3e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0481259  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3105  endoribonuclease L-PSP  51.92 
 
 		 155 aa  131  3.9999999999999996e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.473778  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2153  endoribonuclease L-PSP, putative  42.11 
 
 		 152 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3580  endoribonuclease L-PSP  46.41 
 
 		 153 aa  129  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.45612  normal  0.209775 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1705  Endoribonuclease L-PSP  42.21 
 
 		 156 aa  126  1.0000000000000001e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.182301  hitchhiker  0.0000000000000067862 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3462  endoribonuclease L-PSP  47.37 
 
 		 159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0120904 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2111  Endoribonuclease L-PSP  45.33 
 
 		 163 aa  124  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5091  hypothetical protein  44.52 
 
 		 163 aa  124  7e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1944  Endoribonuclease L-PSP  45.39 
 
 		 153 aa  123  9e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0465  hypothetical protein  52.67 
 
 		 152 aa  123  9e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.346493 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1369  endoribonuclease L-PSP  50.33 
 
 		 153 aa  123  9e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.324136 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6667  Endoribonuclease L-PSP  49.32 
 
 		 165 aa  122  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0416868  normal  0.0241604 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4348  endoribonuclease L-PSP  50.34 
 
 		 153 aa  122  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.917733 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3735  endoribonuclease L-PSP  41.45 
 
 		 170 aa  122  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0323381  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5760  Endoribonuclease L-PSP  48.63 
 
 		 165 aa  121  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.332069  normal  0.705807 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8908  Endoribonuclease L-PSP  48.05 
 
 		 152 aa  121  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.974502 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1504  endoribonuclease L-PSP  45.45 
 
 		 155 aa  119  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.910903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0241  Endoribonuclease L-PSP  52.9 
 
 		 152 aa  119  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.206377  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4789  endoribonuclease L-PSP  48.97 
 
 		 153 aa  118  3.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0118265 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3397  endoribonuclease L-PSP  46.63 
 
 		 189 aa  117  6e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5691  endoribonuclease L-PSP  42.21 
 
 		 152 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5312  Endoribonuclease L-PSP  48.05 
 
 		 153 aa  116  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.688432 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0434  Endoribonuclease L-PSP  46.15 
 
 		 155 aa  115  1.9999999999999998e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.51654 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2270  endoribonuclease L-PSP  41.56 
 
 		 152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.724419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7184  Endoribonuclease L-PSP  44.17 
 
 		 161 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2373  endoribonuclease L-PSP  41.56 
 
 		 152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2988  endoribonuclease L-PSP  45.89 
 
 		 164 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1740  endoribonuclease L-PSP  41.56 
 
 		 152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2388  endoribonuclease L-PSP  41.56 
 
 		 152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.921996  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2352  endoribonuclease L-PSP  41.56 
 
 		 152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0927  endoribonuclease L-PSP  40.91 
 
 		 152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.553211 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6138  endoribonuclease L-PSP  41.56 
 
 		 153 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6426  endoribonuclease L-PSP  41.56 
 
 		 153 aa  114  5e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.576265 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4883  endoribonuclease L-PSP  41.5 
 
 		 157 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000371063  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18300  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  48.97 
 
 		 166 aa  113  1.0000000000000001e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.614303  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2706  Endoribonuclease L-PSP  41.1 
 
 		 153 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.253512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1613  endoribonuclease L-PSP  42.66 
 
 		 154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.578745  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1252  endoribonuclease L-PSP  45.45 
 
 		 156 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.476616  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1636  endoribonuclease L-PSP  41.96 
 
 		 154 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.564581 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1212  Endoribonuclease L-PSP  41.22 
 
 		 154 aa  111  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2348  endoribonuclease L-PSP  42.95 
 
 		 151 aa  110  6e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2784  endoribonuclease L-PSP  49.35 
 
 		 155 aa  110  6e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1554  Endoribonuclease L-PSP  40.67 
 
 		 168 aa  110  8.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.30004 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0228  Endoribonuclease L-PSP  41.89 
 
 		 152 aa  110  9e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5437  endoribonuclease L-PSP  48.28 
 
 		 152 aa  110  9e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491285 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1258  endoribonuclease L-PSP  45.03 
 
 		 156 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4820  endoribonuclease L-PSP  46.04 
 
 		 162 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4906  endoribonuclease L-PSP  46.04 
 
 		 162 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.374579 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5207  endoribonuclease L-PSP  46.04 
 
 		 162 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000695376 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2118  endoribonuclease L-PSP  40.26 
 
 		 154 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124484  normal  0.0891562 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0114  hypothetical protein  47.52 
 
 		 155 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0950  L-PSP family endoribonuclease  40.26 
 
 		 164 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.449669  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>