263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2477 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2477  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 153 aa  304  3e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.738257  normal  0.0496442 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1272  endoribonuclease L-PSP  64 
 
 		 153 aa  201  2e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.103554  hitchhiker  0.00713107 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0250  endoribonuclease L-PSP  70.39 
 
 		 152 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0137  endoribonuclease L-PSP  66.23 
 
 		 155 aa  198  1.9999999999999998e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0435  endoribonuclease L-PSP  66.23 
 
 		 155 aa  196  7e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0894  hypothetical protein  67.11 
 
 		 152 aa  193  6e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.324074  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2553  endoribonuclease L-PSP  67.11 
 
 		 152 aa  193  6e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2457  endoribonuclease L-PSP  58.55 
 
 		 153 aa  181  3e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2803  endoribonuclease L-PSP  57.72 
 
 		 155 aa  176  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.117143  normal  0.432336 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3793  endoribonuclease L-PSP  59.33 
 
 		 154 aa  172  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.756407 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3144  endoribonuclease L-PSP  53.33 
 
 		 152 aa  171  3.9999999999999995e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.147772 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1577  Endoribonuclease L-PSP  52.67 
 
 		 156 aa  167  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.401191  normal  0.481334 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2736  endoribonuclease L-PSP  60.26 
 
 		 146 aa  167  5e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.947  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1774  Endoribonuclease L-PSP  54.3 
 
 		 156 aa  166  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.98491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1123  endoribonuclease L-PSP  52.67 
 
 		 155 aa  165  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.321047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2027  endoribonuclease L-PSP  55.63 
 
 		 154 aa  164  2.9999999999999998e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0633724  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4751  putative endoribonuclease L-PSP (protein synthesis inhibitor)  54.9 
 
 		 155 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.708532  normal  0.751414 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2531  hypothetical protein  50.33 
 
 		 156 aa  162  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6055  Endoribonuclease L-PSP  51.68 
 
 		 162 aa  157  4e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.316335  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2408  endoribonuclease L-PSP  53.64 
 
 		 155 aa  156  1e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.628638  normal  0.167618 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2448  endoribonuclease L-PSP  55.92 
 
 		 155 aa  156  1e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.514496  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3546  Endoribonuclease L-PSP  53.64 
 
 		 155 aa  156  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3043  endoribonuclease L-PSP  53.64 
 
 		 155 aa  155  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.574471 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3313  endoribonuclease L-PSP  53.95 
 
 		 155 aa  153  8e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1427  endoribonuclease L-PSP  53.64 
 
 		 155 aa  152  2e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.426351 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3105  endoribonuclease L-PSP  56.67 
 
 		 155 aa  151  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.473778  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1113  Endoribonuclease L-PSP  51.68 
 
 		 155 aa  147  5e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.85817  normal  0.626067 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1122  hypothetical protein  49.67 
 
 		 154 aa  147  7e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.457332  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1165  hypothetical protein  49.67 
 
 		 154 aa  147  8e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2784  endoribonuclease L-PSP  53.59 
 
 		 155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2373  endoribonuclease L-PSP  52.74 
 
 		 152 aa  144  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1346  endoribonuclease L-PSP  47.68 
 
 		 152 aa  145  3e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00288796  normal  0.104373 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0927  endoribonuclease L-PSP  52.05 
 
 		 152 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.553211 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2270  endoribonuclease L-PSP  52.05 
 
 		 152 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.724419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1740  endoribonuclease L-PSP  52.05 
 
 		 152 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2388  endoribonuclease L-PSP  52.05 
 
 		 152 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.921996  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2352  endoribonuclease L-PSP  52.05 
 
 		 152 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2319  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 157 aa  144  6e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4551  Endoribonuclease L-PSP  48.7 
 
 		 157 aa  143  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1204  endoribonuclease L-PSP  48.3 
 
 		 156 aa  143  7.0000000000000006e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.375276 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1092  endoribonuclease L-PSP  47.33 
 
 		 151 aa  143  9e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0932  Endoribonuclease L-PSP  46.36 
 
 		 152 aa  143  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.315119  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1379  endoribonuclease L-PSP  48.34 
 
 		 158 aa  142  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5691  endoribonuclease L-PSP  50.68 
 
 		 152 aa  141  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1018  endoribonuclease L-PSP  45.7 
 
 		 152 aa  141  3e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.386479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0402  endoribonuclease L-PSP  46.36 
 
 		 152 aa  141  3e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0666223 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1792  endoribonuclease L-PSP  47.06 
 
 		 156 aa  141  4e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.282183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4070  endoribonuclease L-PSP  47.4 
 
 		 162 aa  140  7e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.256894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5081  endoribonuclease L-PSP  45.03 
 
 		 152 aa  139  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0190721 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4437  Endoribonuclease L-PSP  47.4 
 
 		 157 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.062411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3343  Endoribonuclease L-PSP  49.67 
 
 		 152 aa  138  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0721684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0168  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 153 aa  138  3e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3162  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 155 aa  138  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.567156  normal  0.207214 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1645  Endoribonuclease L-PSP  46.67 
 
 		 156 aa  137  3.9999999999999997e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.827325 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1212  Endoribonuclease L-PSP  48.3 
 
 		 154 aa  137  7e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0986  hypothetical protein  46.31 
 
 		 156 aa  136  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0698758  normal  0.152684 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0950  L-PSP family endoribonuclease  48.63 
 
 		 164 aa  136  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.449669  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1313  L-PSP family endoribonuclease  48.63 
 
 		 164 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.221061  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2609  endoribonuclease L-PSP  48.03 
 
 		 152 aa  135  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.56142 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3006  endoribonuclease L-PSP  51.32 
 
 		 154 aa  135  2e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.236246 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1153  putative endoribonuclease L-PSP  48.63 
 
 		 152 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1162  putative endoribonuclease L-PSP  48.63 
 
 		 152 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2223  L-PSP family endoribonuclease  48.63 
 
 		 152 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2072  putative endoribonuclease L-PSP  48.63 
 
 		 152 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.110705  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2542  L-PSP family endoribonuclease  48.63 
 
 		 152 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.455947  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0708  L-PSP family endoribonuclease  48.63 
 
 		 155 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2555  hypothetical protein  46.05 
 
 		 154 aa  134  4e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.853817 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4853  Endoribonuclease L-PSP  49.66 
 
 		 154 aa  133  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3462  endoribonuclease L-PSP  49.32 
 
 		 159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0120904 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1554  Endoribonuclease L-PSP  46.71 
 
 		 168 aa  131  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.30004 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2118  endoribonuclease L-PSP  46.94 
 
 		 154 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124484  normal  0.0891562 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2153  endoribonuclease L-PSP, putative  47.65 
 
 		 152 aa  130  6e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13709  hypothetical protein  48.03 
 
 		 151 aa  129  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0525391 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0200  endoribonuclease L-PSP  49.33 
 
 		 153 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.151399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6426  endoribonuclease L-PSP  42.86 
 
 		 153 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.576265 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1504  endoribonuclease L-PSP  46.62 
 
 		 155 aa  129  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.910903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6537  endoribonuclease L-PSP  45.03 
 
 		 157 aa  128  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.21507  normal  0.550061 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2111  Endoribonuclease L-PSP  43.24 
 
 		 163 aa  128  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0581  endoribonuclease L-PSP  43.71 
 
 		 154 aa  128  3e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0481259  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6138  endoribonuclease L-PSP  42.18 
 
 		 153 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37922  predicted protein  47.22 
 
 		 185 aa  126  9.000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00476754  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47655  predicted protein  47.22 
 
 		 185 aa  126  9.000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00618585  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1258  endoribonuclease L-PSP  51.97 
 
 		 156 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7458  Endoribonuclease L-PSP  44.37 
 
 		 157 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2706  Endoribonuclease L-PSP  42.48 
 
 		 153 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.253512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2506  endoribonuclease L-PSP  48.03 
 
 		 151 aa  124  6e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.101057  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1944  Endoribonuclease L-PSP  42.21 
 
 		 153 aa  122  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1705  Endoribonuclease L-PSP  44.37 
 
 		 156 aa  122  1e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.182301  hitchhiker  0.0000000000000067862 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1259  Endoribonuclease L-PSP  50.97 
 
 		 149 aa  123  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0123792 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0847  Endoribonuclease L-PSP  46.94 
 
 		 156 aa  121  4e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00708228  normal  0.528275 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0916  Endoribonuclease L-PSP  46.94 
 
 		 156 aa  121  4e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.139977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8908  Endoribonuclease L-PSP  51.01 
 
 		 152 aa  120  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.974502 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3333  hypothetical protein  47.26 
 
 		 154 aa  120  8e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.440014  normal  0.330579 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3178  Endoribonuclease L-PSP  44.85 
 
 		 177 aa  120  9.999999999999999e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.738101 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2348  endoribonuclease L-PSP  44.37 
 
 		 151 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1348  Endoribonuclease L-PSP  44.74 
 
 		 157 aa  118  3e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2512  endoribonuclease L-PSP  45.03 
 
 		 150 aa  118  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.796499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3580  endoribonuclease L-PSP  41.83 
 
 		 153 aa  117  4.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.45612  normal  0.209775 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0668  endoribonuclease L-PSP  41.22 
 
 		 155 aa  116  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2030  Endoribonuclease L-PSP  40.43 
 
 		 156 aa  116  9.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00146961  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>