222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3546 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3546  Endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 155 aa  308  2e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3043  endoribonuclease L-PSP  91.61 
 
 		 155 aa  287  4e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.574471 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2408  endoribonuclease L-PSP  91.61 
 
 		 155 aa  284  4e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.628638  normal  0.167618 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1427  endoribonuclease L-PSP  81.94 
 
 		 155 aa  266  1e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.426351 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2448  endoribonuclease L-PSP  83.12 
 
 		 155 aa  263  7e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.514496  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3313  endoribonuclease L-PSP  80 
 
 		 155 aa  257  5.0000000000000005e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4751  putative endoribonuclease L-PSP (protein synthesis inhibitor)  76.62 
 
 		 155 aa  242  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.708532  normal  0.751414 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3793  endoribonuclease L-PSP  64.94 
 
 		 154 aa  195  2.0000000000000003e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.756407 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4437  Endoribonuclease L-PSP  61.69 
 
 		 157 aa  186  9e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.062411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4551  Endoribonuclease L-PSP  61.04 
 
 		 157 aa  185  2e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4070  endoribonuclease L-PSP  61.04 
 
 		 162 aa  184  3e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.256894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2319  endoribonuclease L-PSP  62.75 
 
 		 157 aa  183  9e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1792  endoribonuclease L-PSP  61.84 
 
 		 156 aa  180  6e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.282183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3144  endoribonuclease L-PSP  58 
 
 		 152 aa  175  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.147772 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1113  Endoribonuclease L-PSP  62 
 
 		 155 aa  176  2e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.85817  normal  0.626067 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2027  endoribonuclease L-PSP  55.48 
 
 		 154 aa  173  6e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0633724  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7458  Endoribonuclease L-PSP  59.24 
 
 		 157 aa  169  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0435  endoribonuclease L-PSP  53.55 
 
 		 155 aa  166  2e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6537  endoribonuclease L-PSP  60 
 
 		 157 aa  165  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.21507  normal  0.550061 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1348  Endoribonuclease L-PSP  58.55 
 
 		 157 aa  163  6.9999999999999995e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2457  endoribonuclease L-PSP  58.39 
 
 		 153 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1122  hypothetical protein  53.55 
 
 		 154 aa  161  3e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.457332  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1165  hypothetical protein  53.55 
 
 		 154 aa  160  5.0000000000000005e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0168  endoribonuclease L-PSP  60.4 
 
 		 153 aa  160  5.0000000000000005e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1379  endoribonuclease L-PSP  50.32 
 
 		 158 aa  160  6e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1944  Endoribonuclease L-PSP  57.33 
 
 		 153 aa  157  4e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1272  endoribonuclease L-PSP  55.26 
 
 		 153 aa  157  7e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.103554  hitchhiker  0.00713107 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6055  Endoribonuclease L-PSP  56.38 
 
 		 162 aa  156  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.316335  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2477  endoribonuclease L-PSP  53.64 
 
 		 153 aa  156  1e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.738257  normal  0.0496442 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2736  endoribonuclease L-PSP  57.62 
 
 		 146 aa  155  2e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0137  endoribonuclease L-PSP  55.48 
 
 		 155 aa  155  3e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2803  endoribonuclease L-PSP  53.85 
 
 		 155 aa  154  6e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.117143  normal  0.432336 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1123  endoribonuclease L-PSP  50.64 
 
 		 155 aa  153  6e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.321047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1577  Endoribonuclease L-PSP  50.64 
 
 		 156 aa  153  9e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.401191  normal  0.481334 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3105  endoribonuclease L-PSP  60.39 
 
 		 155 aa  151  2.9999999999999998e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.473778  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2531  hypothetical protein  48.39 
 
 		 156 aa  148  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1774  Endoribonuclease L-PSP  49.36 
 
 		 156 aa  147  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.98491  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2153  endoribonuclease L-PSP, putative  49.66 
 
 		 152 aa  147  6e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1092  endoribonuclease L-PSP  47.33 
 
 		 151 aa  147  8e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1705  Endoribonuclease L-PSP  48.67 
 
 		 156 aa  145  2.0000000000000003e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.182301  hitchhiker  0.0000000000000067862 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0250  endoribonuclease L-PSP  55.63 
 
 		 152 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0894  hypothetical protein  55.63 
 
 		 152 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.324074  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2553  endoribonuclease L-PSP  55.63 
 
 		 152 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4853  Endoribonuclease L-PSP  49.33 
 
 		 154 aa  141  4e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13709  hypothetical protein  53.06 
 
 		 151 aa  139  9.999999999999999e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0525391 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3343  Endoribonuclease L-PSP  44.97 
 
 		 152 aa  137  4.999999999999999e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0721684  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0200  endoribonuclease L-PSP  48.99 
 
 		 153 aa  137  7.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.151399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0581  endoribonuclease L-PSP  46 
 
 		 154 aa  136  8.999999999999999e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0481259  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2111  Endoribonuclease L-PSP  48.32 
 
 		 163 aa  136  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1554  Endoribonuclease L-PSP  47.68 
 
 		 168 aa  135  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.30004 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2784  endoribonuclease L-PSP  59.5 
 
 		 155 aa  134  4e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1645  Endoribonuclease L-PSP  43.62 
 
 		 156 aa  133  9.999999999999999e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.827325 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3462  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 159 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0120904 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2030  Endoribonuclease L-PSP  43.24 
 
 		 156 aa  132  1.9999999999999998e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00146961  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3735  endoribonuclease L-PSP  44.97 
 
 		 170 aa  132  1.9999999999999998e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0323381  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1504  endoribonuclease L-PSP  49.32 
 
 		 155 aa  132  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.910903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0927  endoribonuclease L-PSP  49.01 
 
 		 152 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.553211 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2706  Endoribonuclease L-PSP  44.22 
 
 		 153 aa  130  5e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.253512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2609  endoribonuclease L-PSP  50.33 
 
 		 152 aa  130  5e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.56142 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5691  endoribonuclease L-PSP  49.01 
 
 		 152 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5091  hypothetical protein  47.55 
 
 		 163 aa  130  7.999999999999999e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1740  endoribonuclease L-PSP  48.34 
 
 		 152 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2388  endoribonuclease L-PSP  48.34 
 
 		 152 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.921996  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2373  endoribonuclease L-PSP  49.01 
 
 		 152 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2352  endoribonuclease L-PSP  48.34 
 
 		 152 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2270  endoribonuclease L-PSP  48.34 
 
 		 152 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.724419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8908  Endoribonuclease L-PSP  52.35 
 
 		 152 aa  127  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.974502 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3178  Endoribonuclease L-PSP  45.57 
 
 		 177 aa  127  5.0000000000000004e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.738101 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6426  endoribonuclease L-PSP  44.3 
 
 		 153 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.576265 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6138  endoribonuclease L-PSP  43.62 
 
 		 153 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2988  endoribonuclease L-PSP  48.61 
 
 		 164 aa  126  9.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5760  Endoribonuclease L-PSP  49.66 
 
 		 165 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.332069  normal  0.705807 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2555  hypothetical protein  48.7 
 
 		 154 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.853817 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3580  endoribonuclease L-PSP  44.3 
 
 		 153 aa  126  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.45612  normal  0.209775 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1346  endoribonuclease L-PSP  46.71 
 
 		 152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00288796  normal  0.104373 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0121  peptidase C26  45.52 
 
 		 407 aa  125  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.808568 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0950  L-PSP family endoribonuclease  47.02 
 
 		 164 aa  124  6e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.449669  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0713  Endoribonuclease L-PSP  47.62 
 
 		 152 aa  124  6e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1258  endoribonuclease L-PSP  50.97 
 
 		 156 aa  124  7e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6667  Endoribonuclease L-PSP  48.28 
 
 		 165 aa  123  7e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0416868  normal  0.0241604 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0434  Endoribonuclease L-PSP  48.37 
 
 		 155 aa  124  7e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.51654 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1313  L-PSP family endoribonuclease  47.02 
 
 		 164 aa  123  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.221061  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1212  Endoribonuclease L-PSP  45.03 
 
 		 154 aa  122  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0708  L-PSP family endoribonuclease  47.02 
 
 		 155 aa  122  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2223  L-PSP family endoribonuclease  47.02 
 
 		 152 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2542  L-PSP family endoribonuclease  47.02 
 
 		 152 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.455947  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1153  putative endoribonuclease L-PSP  47.02 
 
 		 152 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1162  putative endoribonuclease L-PSP  47.02 
 
 		 152 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2072  putative endoribonuclease L-PSP  47.02 
 
 		 152 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.110705  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0932  Endoribonuclease L-PSP  44.74 
 
 		 152 aa  121  3e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.315119  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1018  endoribonuclease L-PSP  44.74 
 
 		 152 aa  121  3e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.386479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1204  endoribonuclease L-PSP  43.79 
 
 		 156 aa  120  5e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.375276 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0986  hypothetical protein  46.05 
 
 		 156 aa  120  9e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0698758  normal  0.152684 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2118  endoribonuclease L-PSP  46 
 
 		 154 aa  120  9e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124484  normal  0.0891562 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3162  endoribonuclease L-PSP  48.67 
 
 		 155 aa  119  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.567156  normal  0.207214 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0402  endoribonuclease L-PSP  45.39 
 
 		 152 aa  119  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0666223 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3333  hypothetical protein  45.33 
 
 		 154 aa  118  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.440014  normal  0.330579 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5312  Endoribonuclease L-PSP  49.66 
 
 		 153 aa  117  4.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.688432 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1369  endoribonuclease L-PSP  47.1 
 
 		 153 aa  117  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.324136 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3039  Endoribonuclease L-PSP  46.1 
 
 		 157 aa  117  7.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>