213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1554 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1554  Endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 168 aa  332  2e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.30004 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3793  endoribonuclease L-PSP  50.65 
 
 		 154 aa  155  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.756407 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2153  endoribonuclease L-PSP, putative  48.99 
 
 		 152 aa  155  3e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3735  endoribonuclease L-PSP  49.66 
 
 		 170 aa  155  3e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0323381  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1645  Endoribonuclease L-PSP  49.35 
 
 		 156 aa  150  7e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.827325 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2803  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 155 aa  144  8.000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.117143  normal  0.432336 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5091  hypothetical protein  45.39 
 
 		 163 aa  144  8.000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4853  Endoribonuclease L-PSP  47.97 
 
 		 154 aa  142  3e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4751  putative endoribonuclease L-PSP (protein synthesis inhibitor)  49.03 
 
 		 155 aa  141  4e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.708532  normal  0.751414 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1944  Endoribonuclease L-PSP  46.62 
 
 		 153 aa  140  8e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2988  endoribonuclease L-PSP  49.66 
 
 		 164 aa  140  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2706  Endoribonuclease L-PSP  43.71 
 
 		 153 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.253512  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2908  Endoribonuclease L-PSP  44.94 
 
 		 164 aa  139  1.9999999999999998e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3462  endoribonuclease L-PSP  44.81 
 
 		 159 aa  139  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0120904 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0435  endoribonuclease L-PSP  45.75 
 
 		 155 aa  138  3.9999999999999997e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0137  endoribonuclease L-PSP  48.34 
 
 		 155 aa  138  4.999999999999999e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2118  endoribonuclease L-PSP  49.35 
 
 		 154 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124484  normal  0.0891562 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3144  endoribonuclease L-PSP  48.32 
 
 		 152 aa  137  8.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.147772 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2512  endoribonuclease L-PSP  49.66 
 
 		 150 aa  136  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.796499  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0986  hypothetical protein  46.36 
 
 		 156 aa  135  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0698758  normal  0.152684 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0950  L-PSP family endoribonuclease  50 
 
 		 164 aa  135  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.449669  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6055  Endoribonuclease L-PSP  40.76 
 
 		 162 aa  135  3.0000000000000003e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.316335  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3546  Endoribonuclease L-PSP  47.68 
 
 		 155 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6667  Endoribonuclease L-PSP  47.3 
 
 		 165 aa  134  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0416868  normal  0.0241604 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1212  Endoribonuclease L-PSP  49.68 
 
 		 154 aa  135  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5760  Endoribonuclease L-PSP  48.28 
 
 		 165 aa  135  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.332069  normal  0.705807 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0200  endoribonuclease L-PSP  46.62 
 
 		 153 aa  134  7.000000000000001e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.151399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2609  endoribonuclease L-PSP  48.34 
 
 		 152 aa  133  9e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.56142 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2348  endoribonuclease L-PSP  48.99 
 
 		 151 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1504  endoribonuclease L-PSP  46.41 
 
 		 155 aa  132  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.910903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47655  predicted protein  45.7 
 
 		 185 aa  132  1.9999999999999998e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00618585  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2457  endoribonuclease L-PSP  46 
 
 		 153 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37922  predicted protein  45.7 
 
 		 185 aa  132  1.9999999999999998e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00476754  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3333  hypothetical protein  46.71 
 
 		 154 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.440014  normal  0.330579 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1092  endoribonuclease L-PSP  47.3 
 
 		 151 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1313  L-PSP family endoribonuclease  49.34 
 
 		 164 aa  132  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.221061  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0938  Endoribonuclease L-PSP  44.37 
 
 		 152 aa  132  3e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2736  endoribonuclease L-PSP  48.67 
 
 		 146 aa  132  3e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.947  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2223  L-PSP family endoribonuclease  49.34 
 
 		 152 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2477  endoribonuclease L-PSP  46.71 
 
 		 153 aa  131  3.9999999999999996e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.738257  normal  0.0496442 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0708  L-PSP family endoribonuclease  49.34 
 
 		 155 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2542  L-PSP family endoribonuclease  49.34 
 
 		 152 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.455947  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1153  putative endoribonuclease L-PSP  49.34 
 
 		 152 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1162  putative endoribonuclease L-PSP  49.34 
 
 		 152 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2072  putative endoribonuclease L-PSP  49.34 
 
 		 152 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.110705  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0927  endoribonuclease L-PSP  48.68 
 
 		 152 aa  130  6e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.553211 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1180  Endoribonuclease L-PSP  44.59 
 
 		 153 aa  131  6e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2408  endoribonuclease L-PSP  47.68 
 
 		 155 aa  130  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.628638  normal  0.167618 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1477  endoribonuclease L-PSP  40.36 
 
 		 174 aa  130  7.999999999999999e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0713  Endoribonuclease L-PSP  48.98 
 
 		 152 aa  130  7.999999999999999e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3408  Endoribonuclease L-PSP  49.01 
 
 		 152 aa  130  9e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3043  endoribonuclease L-PSP  47.68 
 
 		 155 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.574471 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3343  Endoribonuclease L-PSP  44.97 
 
 		 152 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0721684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1204  endoribonuclease L-PSP  46.75 
 
 		 156 aa  129  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.375276 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1427  endoribonuclease L-PSP  46 
 
 		 155 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.426351 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0894  hypothetical protein  48.05 
 
 		 152 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.324074  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3162  endoribonuclease L-PSP  46.45 
 
 		 155 aa  129  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.567156  normal  0.207214 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2553  endoribonuclease L-PSP  48.05 
 
 		 152 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2373  endoribonuclease L-PSP  48.68 
 
 		 152 aa  128  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0904  endoribonuclease L-PSP  46.31 
 
 		 151 aa  128  3e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0916  Endoribonuclease L-PSP  45.7 
 
 		 156 aa  128  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.139977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3313  endoribonuclease L-PSP  44.67 
 
 		 155 aa  128  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0847  Endoribonuclease L-PSP  45.7 
 
 		 156 aa  128  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00708228  normal  0.528275 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2270  endoribonuclease L-PSP  48.03 
 
 		 152 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.724419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1740  endoribonuclease L-PSP  48.03 
 
 		 152 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2388  endoribonuclease L-PSP  48.03 
 
 		 152 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.921996  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2352  endoribonuclease L-PSP  48.03 
 
 		 152 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5691  endoribonuclease L-PSP  47.37 
 
 		 152 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2506  endoribonuclease L-PSP  44.67 
 
 		 151 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.101057  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2448  endoribonuclease L-PSP  46.67 
 
 		 155 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.514496  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1272  endoribonuclease L-PSP  44.44 
 
 		 153 aa  125  2.0000000000000002e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.103554  hitchhiker  0.00713107 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1123  endoribonuclease L-PSP  41.72 
 
 		 155 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.321047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2027  endoribonuclease L-PSP  43.62 
 
 		 154 aa  125  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0633724  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0250  endoribonuclease L-PSP  47.02 
 
 		 152 aa  125  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6138  endoribonuclease L-PSP  40.82 
 
 		 153 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13709  hypothetical protein  45.27 
 
 		 151 aa  124  7e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0525391 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1705  Endoribonuclease L-PSP  42 
 
 		 156 aa  123  1e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.182301  hitchhiker  0.0000000000000067862 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1379  endoribonuclease L-PSP  41.61 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6426  endoribonuclease L-PSP  40.14 
 
 		 153 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.576265 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1577  Endoribonuclease L-PSP  41.06 
 
 		 156 aa  120  9e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.401191  normal  0.481334 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2531  hypothetical protein  41.33 
 
 		 156 aa  120  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3105  endoribonuclease L-PSP  42.67 
 
 		 155 aa  119  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.473778  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1346  endoribonuclease L-PSP  44 
 
 		 152 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00288796  normal  0.104373 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0932  Endoribonuclease L-PSP  46 
 
 		 152 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.315119  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8908  Endoribonuclease L-PSP  50.68 
 
 		 152 aa  119  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.974502 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1018  endoribonuclease L-PSP  46 
 
 		 152 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.386479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3178  Endoribonuclease L-PSP  42.68 
 
 		 177 aa  119  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.738101 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0668  endoribonuclease L-PSP  41.61 
 
 		 155 aa  119  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2784  endoribonuclease L-PSP  43.71 
 
 		 155 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7184  Endoribonuclease L-PSP  42.14 
 
 		 161 aa  118  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1232  Endoribonuclease L-PSP  39.47 
 
 		 158 aa  117  4.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.118395 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3580  endoribonuclease L-PSP  40.27 
 
 		 153 aa  116  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.45612  normal  0.209775 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0402  endoribonuclease L-PSP  43.05 
 
 		 152 aa  116  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0666223 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0114  hypothetical protein  51.11 
 
 		 155 aa  115  3e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2319  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 157 aa  115  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1062  Endoribonuclease L-PSP  44 
 
 		 151 aa  115  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0581  endoribonuclease L-PSP  39.87 
 
 		 154 aa  115  3e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0481259  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2555  hypothetical protein  43.05 
 
 		 154 aa  115  3e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.853817 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0434  Endoribonuclease L-PSP  46.31 
 
 		 155 aa  115  3.9999999999999997e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.51654 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1252  endoribonuclease L-PSP  44.67 
 
 		 156 aa  114  6e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.476616  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>