213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2908 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2908  Endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 164 aa  330  4e-90  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1027  Endoribonuclease L-PSP  57.24 
 
 		 158 aa  171  3.9999999999999995e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.190417  normal  0.406014 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1232  Endoribonuclease L-PSP  55.7 
 
 		 158 aa  169  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.118395 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0668  endoribonuclease L-PSP  56.08 
 
 		 155 aa  168  3e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7001  Endoribonuclease L-PSP  53.9 
 
 		 153 aa  162  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.29749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5091  hypothetical protein  49.32 
 
 		 163 aa  141  4e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2706  Endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 153 aa  140  6e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.253512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1554  Endoribonuclease L-PSP  44.94 
 
 		 168 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.30004 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3462  endoribonuclease L-PSP  48.41 
 
 		 159 aa  137  6e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0120904 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5760  Endoribonuclease L-PSP  52.35 
 
 		 165 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.332069  normal  0.705807 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6667  Endoribonuclease L-PSP  53.02 
 
 		 165 aa  133  9e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0416868  normal  0.0241604 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37922  predicted protein  44.22 
 
 		 185 aa  132  9.999999999999999e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00476754  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47655  predicted protein  44.22 
 
 		 185 aa  132  9.999999999999999e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00618585  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2988  endoribonuclease L-PSP  48.5 
 
 		 164 aa  128  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3735  endoribonuclease L-PSP  42.31 
 
 		 170 aa  128  4.0000000000000003e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0323381  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2153  endoribonuclease L-PSP, putative  45.51 
 
 		 152 aa  127  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6138  endoribonuclease L-PSP  44 
 
 		 153 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6426  endoribonuclease L-PSP  44.83 
 
 		 153 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.576265 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1504  endoribonuclease L-PSP  43.87 
 
 		 155 aa  122  3e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.910903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2803  endoribonuclease L-PSP  45.27 
 
 		 155 aa  120  7e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.117143  normal  0.432336 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6055  Endoribonuclease L-PSP  44.59 
 
 		 162 aa  119  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.316335  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3343  Endoribonuclease L-PSP  42 
 
 		 152 aa  117  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0721684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1645  Endoribonuclease L-PSP  42.47 
 
 		 156 aa  116  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.827325 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2457  endoribonuclease L-PSP  46.98 
 
 		 153 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0435  endoribonuclease L-PSP  39.61 
 
 		 155 aa  115  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2736  endoribonuclease L-PSP  47.97 
 
 		 146 aa  116  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1092  endoribonuclease L-PSP  43.33 
 
 		 151 aa  115  3e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4853  Endoribonuclease L-PSP  44.44 
 
 		 154 aa  115  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0200  endoribonuclease L-PSP  46.21 
 
 		 153 aa  114  5e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.151399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2609  endoribonuclease L-PSP  39.86 
 
 		 152 aa  113  8.999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.56142 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0137  endoribonuclease L-PSP  41.18 
 
 		 155 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2477  endoribonuclease L-PSP  42.95 
 
 		 153 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.738257  normal  0.0496442 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0228  Endoribonuclease L-PSP  44.97 
 
 		 152 aa  112  3e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4751  putative endoribonuclease L-PSP (protein synthesis inhibitor)  40.94 
 
 		 155 aa  112  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.708532  normal  0.751414 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3105  endoribonuclease L-PSP  44.37 
 
 		 155 aa  111  5e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.473778  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0894  hypothetical protein  44.74 
 
 		 152 aa  110  9e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.324074  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2553  endoribonuclease L-PSP  44.74 
 
 		 152 aa  110  9e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2030  Endoribonuclease L-PSP  42.58 
 
 		 156 aa  110  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00146961  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1113  Endoribonuclease L-PSP  43.14 
 
 		 155 aa  109  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.85817  normal  0.626067 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7184  Endoribonuclease L-PSP  42.86 
 
 		 161 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3144  endoribonuclease L-PSP  42.95 
 
 		 152 aa  108  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.147772 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1477  endoribonuclease L-PSP  41.33 
 
 		 174 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0250  endoribonuclease L-PSP  44.08 
 
 		 152 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0713  Endoribonuclease L-PSP  44.3 
 
 		 152 aa  108  4.0000000000000004e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1123  endoribonuclease L-PSP  43.05 
 
 		 155 aa  107  6e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.321047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0950  L-PSP family endoribonuclease  37.42 
 
 		 164 aa  106  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.449669  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3793  endoribonuclease L-PSP  36.91 
 
 		 154 aa  105  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.756407 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1944  Endoribonuclease L-PSP  41.1 
 
 		 153 aa  105  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1792  endoribonuclease L-PSP  39.22 
 
 		 156 aa  105  4e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.282183  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0038  Endoribonuclease L-PSP  45.24 
 
 		 161 aa  104  5e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.491451  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0168  endoribonuclease L-PSP  42.86 
 
 		 153 aa  104  6e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1313  L-PSP family endoribonuclease  36.42 
 
 		 164 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.221061  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2408  endoribonuclease L-PSP  38.93 
 
 		 155 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.628638  normal  0.167618 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2531  hypothetical protein  42.28 
 
 		 156 aa  103  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0581  endoribonuclease L-PSP  38.82 
 
 		 154 aa  103  1e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0481259  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0986  hypothetical protein  38.12 
 
 		 156 aa  103  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0698758  normal  0.152684 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2223  L-PSP family endoribonuclease  37.58 
 
 		 152 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3546  Endoribonuclease L-PSP  38.93 
 
 		 155 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1204  endoribonuclease L-PSP  36.18 
 
 		 156 aa  102  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.375276 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0708  L-PSP family endoribonuclease  37.58 
 
 		 155 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2542  L-PSP family endoribonuclease  37.58 
 
 		 152 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.455947  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1153  putative endoribonuclease L-PSP  37.58 
 
 		 152 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1162  putative endoribonuclease L-PSP  37.58 
 
 		 152 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2072  putative endoribonuclease L-PSP  37.58 
 
 		 152 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.110705  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2027  endoribonuclease L-PSP  40.94 
 
 		 154 aa  102  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0633724  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1427  endoribonuclease L-PSP  38.26 
 
 		 155 aa  102  3e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.426351 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2118  endoribonuclease L-PSP  37.58 
 
 		 154 aa  101  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124484  normal  0.0891562 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1272  endoribonuclease L-PSP  43.05 
 
 		 153 aa  101  5e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.103554  hitchhiker  0.00713107 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1212  Endoribonuclease L-PSP  36.91 
 
 		 154 aa  101  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0927  endoribonuclease L-PSP  36.73 
 
 		 152 aa  100  6e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.553211 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0402  endoribonuclease L-PSP  41.38 
 
 		 152 aa  100  8e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0666223 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1122  hypothetical protein  40.94 
 
 		 154 aa  100  8e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.457332  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1165  hypothetical protein  40.94 
 
 		 154 aa  100  9e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3313  endoribonuclease L-PSP  38.93 
 
 		 155 aa  100  9e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2270  endoribonuclease L-PSP  36.05 
 
 		 152 aa  99.4  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.724419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2373  endoribonuclease L-PSP  36.05 
 
 		 152 aa  99  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1740  endoribonuclease L-PSP  36.05 
 
 		 152 aa  99.4  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2388  endoribonuclease L-PSP  36.05 
 
 		 152 aa  99.4  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.921996  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2352  endoribonuclease L-PSP  36.05 
 
 		 152 aa  99.4  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3039  Endoribonuclease L-PSP  43.87 
 
 		 157 aa  99.8  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0904  endoribonuclease L-PSP  38.93 
 
 		 151 aa  99.8  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5691  endoribonuclease L-PSP  35.37 
 
 		 152 aa  98.6  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3043  endoribonuclease L-PSP  37.58 
 
 		 155 aa  98.6  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.574471 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1705  Endoribonuclease L-PSP  39.46 
 
 		 156 aa  98.2  4e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.182301  hitchhiker  0.0000000000000067862 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3444  endoribonuclease L-PSP  36.84 
 
 		 163 aa  98.2  4e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.603041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0938  Endoribonuclease L-PSP  38 
 
 		 152 aa  98.2  4e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2555  hypothetical protein  39.19 
 
 		 154 aa  97.8  5e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.853817 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1062  Endoribonuclease L-PSP  45.7 
 
 		 151 aa  98.2  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1346  endoribonuclease L-PSP  37.84 
 
 		 152 aa  96.3  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00288796  normal  0.104373 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2788  Endoribonuclease L-PSP  40.13 
 
 		 163 aa  96.3  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0932  Endoribonuclease L-PSP  37.93 
 
 		 152 aa  95.9  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.315119  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2784  endoribonuclease L-PSP  42.11 
 
 		 155 aa  95.5  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3178  Endoribonuclease L-PSP  39.13 
 
 		 177 aa  95.5  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.738101 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1379  endoribonuclease L-PSP  38.26 
 
 		 158 aa  95.5  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1018  endoribonuclease L-PSP  37.93 
 
 		 152 aa  95.5  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.386479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3162  endoribonuclease L-PSP  37.25 
 
 		 155 aa  94.7  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.567156  normal  0.207214 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3333  hypothetical protein  37.33 
 
 		 154 aa  94  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.440014  normal  0.330579 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0465  hypothetical protein  45.52 
 
 		 152 aa  93.2  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.346493 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6842  Endoribonuclease L-PSP  35.71 
 
 		 168 aa  93.2  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.173433 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5536  endoribonuclease L-PSP  36.73 
 
 		 156 aa  93.2  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.044824 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>