194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3444 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_3444  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 163 aa  327  4e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.603041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7184  Endoribonuclease L-PSP  46.3 
 
 		 161 aa  149  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0038  Endoribonuclease L-PSP  53.5 
 
 		 161 aa  146  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.491451  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2609  endoribonuclease L-PSP  47.02 
 
 		 152 aa  117  4.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.56142 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47655  predicted protein  43.9 
 
 		 185 aa  114  8.999999999999998e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00618585  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37922  predicted protein  43.9 
 
 		 185 aa  114  8.999999999999998e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00476754  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2555  hypothetical protein  45.39 
 
 		 154 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.853817 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0904  endoribonuclease L-PSP  40.65 
 
 		 151 aa  104  4e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4853  Endoribonuclease L-PSP  41.14 
 
 		 154 aa  104  5e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1272  endoribonuclease L-PSP  40.38 
 
 		 153 aa  103  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.103554  hitchhiker  0.00713107 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1554  Endoribonuclease L-PSP  41.4 
 
 		 168 aa  103  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.30004 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2118  endoribonuclease L-PSP  39.19 
 
 		 154 aa  103  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124484  normal  0.0891562 
 
 
-
 
NC_004310  BR1165  hypothetical protein  39.49 
 
 		 154 aa  102  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1212  Endoribonuclease L-PSP  39.87 
 
 		 154 aa  102  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1122  hypothetical protein  39.49 
 
 		 154 aa  102  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.457332  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2348  endoribonuclease L-PSP  45.6 
 
 		 151 aa  101  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6426  endoribonuclease L-PSP  42.31 
 
 		 153 aa  101  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.576265 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0927  endoribonuclease L-PSP  38.31 
 
 		 152 aa  101  6e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.553211 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3462  endoribonuclease L-PSP  40.25 
 
 		 159 aa  101  6e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0120904 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5691  endoribonuclease L-PSP  38.31 
 
 		 152 aa  100  8e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2373  endoribonuclease L-PSP  38.31 
 
 		 152 aa  100  8e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1740  endoribonuclease L-PSP  38.31 
 
 		 152 aa  100  9e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2388  endoribonuclease L-PSP  38.31 
 
 		 152 aa  100  9e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.921996  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2352  endoribonuclease L-PSP  38.31 
 
 		 152 aa  100  9e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2270  endoribonuclease L-PSP  38.31 
 
 		 152 aa  100  9e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.724419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3333  hypothetical protein  39.19 
 
 		 154 aa  99.8  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.440014  normal  0.330579 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1113  Endoribonuclease L-PSP  40.91 
 
 		 155 aa  99.8  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.85817  normal  0.626067 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0950  L-PSP family endoribonuclease  37.01 
 
 		 164 aa  98.6  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.449669  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2512  endoribonuclease L-PSP  46.67 
 
 		 150 aa  98.2  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.796499  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2908  Endoribonuclease L-PSP  36.84 
 
 		 164 aa  98.2  4e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0200  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 153 aa  98.2  4e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.151399  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3408  Endoribonuclease L-PSP  42.86 
 
 		 152 aa  97.8  5e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1792  endoribonuclease L-PSP  41.4 
 
 		 156 aa  97.8  6e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.282183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1313  L-PSP family endoribonuclease  36.36 
 
 		 164 aa  97.4  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.221061  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0708  L-PSP family endoribonuclease  36.36 
 
 		 155 aa  97.4  7e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2223  L-PSP family endoribonuclease  36.36 
 
 		 152 aa  97.4  8e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0938  Endoribonuclease L-PSP  39.61 
 
 		 152 aa  97.4  8e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2542  L-PSP family endoribonuclease  36.36 
 
 		 152 aa  97.4  8e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.455947  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1153  putative endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 152 aa  97.4  8e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1162  putative endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 152 aa  97.4  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2072  putative endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 152 aa  97.4  8e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.110705  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4751  putative endoribonuclease L-PSP (protein synthesis inhibitor)  38.36 
 
 		 155 aa  97.1  9e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.708532  normal  0.751414 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0986  hypothetical protein  42.11 
 
 		 156 aa  96.7  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0698758  normal  0.152684 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6138  endoribonuclease L-PSP  41.03 
 
 		 153 aa  97.1  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2457  endoribonuclease L-PSP  40.79 
 
 		 153 aa  95.5  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2027  endoribonuclease L-PSP  38.85 
 
 		 154 aa  95.5  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0633724  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3793  endoribonuclease L-PSP  39.38 
 
 		 154 aa  94.7  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.756407 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0916  Endoribonuclease L-PSP  44.63 
 
 		 156 aa  94.7  5e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.139977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1204  endoribonuclease L-PSP  38.61 
 
 		 156 aa  94.7  5e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.375276 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0847  Endoribonuclease L-PSP  44.63 
 
 		 156 aa  94.7  5e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00708228  normal  0.528275 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3735  endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 170 aa  94.4  6e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0323381  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2531  hypothetical protein  39.35 
 
 		 156 aa  93.2  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0713  Endoribonuclease L-PSP  42.24 
 
 		 152 aa  93.6  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2319  endoribonuclease L-PSP  38.46 
 
 		 157 aa  92  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1018  endoribonuclease L-PSP  39.33 
 
 		 152 aa  92  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.386479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1027  Endoribonuclease L-PSP  33.99 
 
 		 158 aa  92  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.190417  normal  0.406014 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0932  Endoribonuclease L-PSP  38.67 
 
 		 152 aa  91.3  5e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.315119  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3144  endoribonuclease L-PSP  37.74 
 
 		 152 aa  91.3  5e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.147772 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2706  Endoribonuclease L-PSP  37.66 
 
 		 153 aa  90.5  8e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.253512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0228  Endoribonuclease L-PSP  41.29 
 
 		 152 aa  90.5  8e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0435  endoribonuclease L-PSP  38.71 
 
 		 155 aa  90.1  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2803  endoribonuclease L-PSP  38.16 
 
 		 155 aa  89.7  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.117143  normal  0.432336 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3343  Endoribonuclease L-PSP  36.54 
 
 		 152 aa  89.4  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0721684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1645  Endoribonuclease L-PSP  32.08 
 
 		 156 aa  89  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.827325 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3043  endoribonuclease L-PSP  38.41 
 
 		 155 aa  88.6  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.574471 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2153  endoribonuclease L-PSP, putative  34.42 
 
 		 152 aa  87.8  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4282  endoribonuclease L-PSP  44.65 
 
 		 154 aa  87.8  5e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.667627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3546  Endoribonuclease L-PSP  37.75 
 
 		 155 aa  87.8  6e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3162  endoribonuclease L-PSP  38.76 
 
 		 155 aa  87.8  6e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.567156  normal  0.207214 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6537  endoribonuclease L-PSP  37.89 
 
 		 157 aa  87.8  6e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.21507  normal  0.550061 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5081  endoribonuclease L-PSP  38.06 
 
 		 152 aa  87.4  7e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0190721 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2408  endoribonuclease L-PSP  38.41 
 
 		 155 aa  87.4  7e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.628638  normal  0.167618 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1427  endoribonuclease L-PSP  40.13 
 
 		 155 aa  87.4  8e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.426351 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2477  endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 153 aa  87.4  8e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.738257  normal  0.0496442 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4070  endoribonuclease L-PSP  36.31 
 
 		 162 aa  87  9e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.256894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4551  Endoribonuclease L-PSP  36.94 
 
 		 157 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2506  endoribonuclease L-PSP  41.18 
 
 		 151 aa  87  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.101057  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1346  endoribonuclease L-PSP  38 
 
 		 152 aa  86.7  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00288796  normal  0.104373 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8908  Endoribonuclease L-PSP  39.38 
 
 		 152 aa  86.3  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.974502 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4437  Endoribonuclease L-PSP  36.31 
 
 		 157 aa  86.3  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.062411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0137  endoribonuclease L-PSP  39.47 
 
 		 155 aa  86.3  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3313  endoribonuclease L-PSP  38.56 
 
 		 155 aa  85.5  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1379  endoribonuclease L-PSP  36.77 
 
 		 158 aa  85.5  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0402  endoribonuclease L-PSP  37.18 
 
 		 152 aa  85.5  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0666223 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1123  endoribonuclease L-PSP  35.95 
 
 		 155 aa  85.1  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.321047  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2030  Endoribonuclease L-PSP  34.62 
 
 		 156 aa  85.1  4e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00146961  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1944  Endoribonuclease L-PSP  36.67 
 
 		 153 aa  84.7  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0894  hypothetical protein  40.26 
 
 		 152 aa  84.7  5e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.324074  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1477  endoribonuclease L-PSP  31.45 
 
 		 174 aa  84.7  5e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2553  endoribonuclease L-PSP  40.26 
 
 		 152 aa  84.7  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1232  Endoribonuclease L-PSP  33.55 
 
 		 158 aa  84.3  7e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.118395 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7458  Endoribonuclease L-PSP  35.67 
 
 		 157 aa  84  8e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1180  Endoribonuclease L-PSP  40.38 
 
 		 153 aa  84  8e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1774  Endoribonuclease L-PSP  39.33 
 
 		 156 aa  83.6  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.98491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2448  endoribonuclease L-PSP  38.96 
 
 		 155 aa  82.4  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.514496  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5760  Endoribonuclease L-PSP  35.22 
 
 		 165 aa  82  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.332069  normal  0.705807 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0668  endoribonuclease L-PSP  32.45 
 
 		 155 aa  82.4  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6667  Endoribonuclease L-PSP  35.44 
 
 		 165 aa  82  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0416868  normal  0.0241604 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1577  Endoribonuclease L-PSP  36.67 
 
 		 156 aa  81.6  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.401191  normal  0.481334 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5091  hypothetical protein  34.19 
 
 		 163 aa  80.9  0.000000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>