196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_7184 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_7184  Endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 161 aa  324  3e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0038  Endoribonuclease L-PSP  63.35 
 
 		 161 aa  190  8e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.491451  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3444  endoribonuclease L-PSP  46.3 
 
 		 163 aa  149  2e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.603041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1554  Endoribonuclease L-PSP  42.14 
 
 		 168 aa  118  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.30004 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3735  endoribonuclease L-PSP  42.68 
 
 		 170 aa  116  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0323381  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2319  endoribonuclease L-PSP  49.38 
 
 		 157 aa  115  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3793  endoribonuclease L-PSP  43.95 
 
 		 154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.756407 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47655  predicted protein  40.88 
 
 		 185 aa  112  3e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00618585  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37922  predicted protein  40.88 
 
 		 185 aa  112  3e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00476754  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2803  endoribonuclease L-PSP  44.38 
 
 		 155 aa  112  3e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.117143  normal  0.432336 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2706  Endoribonuclease L-PSP  44.44 
 
 		 153 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.253512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1792  endoribonuclease L-PSP  44.44 
 
 		 156 aa  110  1.0000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.282183  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2908  Endoribonuclease L-PSP  42.86 
 
 		 164 aa  109  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3462  endoribonuclease L-PSP  43.79 
 
 		 159 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0120904 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6667  Endoribonuclease L-PSP  44.44 
 
 		 165 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0416868  normal  0.0241604 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1272  endoribonuclease L-PSP  40.99 
 
 		 153 aa  108  4.0000000000000004e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.103554  hitchhiker  0.00713107 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4551  Endoribonuclease L-PSP  44.79 
 
 		 157 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1427  endoribonuclease L-PSP  43.95 
 
 		 155 aa  107  9.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.426351 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4751  putative endoribonuclease L-PSP (protein synthesis inhibitor)  42.77 
 
 		 155 aa  106  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.708532  normal  0.751414 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1645  Endoribonuclease L-PSP  39.24 
 
 		 156 aa  105  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.827325 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6055  Endoribonuclease L-PSP  42.95 
 
 		 162 aa  105  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.316335  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4070  endoribonuclease L-PSP  43.56 
 
 		 162 aa  104  4e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.256894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2448  endoribonuclease L-PSP  43.95 
 
 		 155 aa  104  5e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.514496  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3313  endoribonuclease L-PSP  43.31 
 
 		 155 aa  104  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4853  Endoribonuclease L-PSP  43.4 
 
 		 154 aa  103  8e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3546  Endoribonuclease L-PSP  44.94 
 
 		 155 aa  103  8e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5760  Endoribonuclease L-PSP  42.31 
 
 		 165 aa  103  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.332069  normal  0.705807 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3105  endoribonuclease L-PSP  43.87 
 
 		 155 aa  103  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.473778  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4437  Endoribonuclease L-PSP  43.56 
 
 		 157 aa  103  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.062411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13709  hypothetical protein  44.87 
 
 		 151 aa  103  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0525391 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1348  Endoribonuclease L-PSP  44.17 
 
 		 157 aa  102  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2408  endoribonuclease L-PSP  42.68 
 
 		 155 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.628638  normal  0.167618 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3144  endoribonuclease L-PSP  38.75 
 
 		 152 aa  102  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.147772 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0581  endoribonuclease L-PSP  38.12 
 
 		 154 aa  102  2e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0481259  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3043  endoribonuclease L-PSP  42.04 
 
 		 155 aa  101  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.574471 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2555  hypothetical protein  43.87 
 
 		 154 aa  100  6e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.853817 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2988  endoribonuclease L-PSP  41.03 
 
 		 164 aa  99.8  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0927  endoribonuclease L-PSP  39.38 
 
 		 152 aa  99  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.553211 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5091  hypothetical protein  40.52 
 
 		 163 aa  99.4  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6426  endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 153 aa  99  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.576265 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2027  endoribonuclease L-PSP  41.4 
 
 		 154 aa  99.8  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0633724  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0336  endoribonuclease L-PSP  40.38 
 
 		 154 aa  98.6  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1165  hypothetical protein  41.4 
 
 		 154 aa  98.6  4e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2457  endoribonuclease L-PSP  44.81 
 
 		 153 aa  98.2  4e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2609  endoribonuclease L-PSP  40.52 
 
 		 152 aa  98.6  4e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.56142 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1122  hypothetical protein  41.4 
 
 		 154 aa  98.2  4e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.457332  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1027  Endoribonuclease L-PSP  37.97 
 
 		 158 aa  97.8  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.190417  normal  0.406014 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1232  Endoribonuclease L-PSP  36.94 
 
 		 158 aa  97.8  6e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.118395 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6138  endoribonuclease L-PSP  36.88 
 
 		 153 aa  97.4  6e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0200  endoribonuclease L-PSP  40.99 
 
 		 153 aa  97.4  8e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.151399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5691  endoribonuclease L-PSP  39.1 
 
 		 152 aa  96.7  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2477  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 153 aa  97.1  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.738257  normal  0.0496442 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1740  endoribonuclease L-PSP  39.1 
 
 		 152 aa  96.7  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2388  endoribonuclease L-PSP  39.1 
 
 		 152 aa  96.7  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.921996  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2352  endoribonuclease L-PSP  39.1 
 
 		 152 aa  96.7  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3178  Endoribonuclease L-PSP  38.6 
 
 		 177 aa  96.7  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.738101 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2270  endoribonuclease L-PSP  39.1 
 
 		 152 aa  96.7  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.724419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2373  endoribonuclease L-PSP  39.1 
 
 		 152 aa  96.7  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1504  endoribonuclease L-PSP  44.3 
 
 		 155 aa  96.7  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.910903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0950  L-PSP family endoribonuclease  39.74 
 
 		 164 aa  95.9  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.449669  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3408  Endoribonuclease L-PSP  38 
 
 		 152 aa  95.5  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1204  endoribonuclease L-PSP  41.03 
 
 		 156 aa  96.3  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.375276 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0904  endoribonuclease L-PSP  40.13 
 
 		 151 aa  95.5  3e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2153  endoribonuclease L-PSP, putative  36.08 
 
 		 152 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2348  endoribonuclease L-PSP  41.27 
 
 		 151 aa  94.7  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0713  Endoribonuclease L-PSP  43.12 
 
 		 152 aa  94.7  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0708  L-PSP family endoribonuclease  39.1 
 
 		 155 aa  94.4  5e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2030  Endoribonuclease L-PSP  39.86 
 
 		 156 aa  94.7  5e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00146961  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2223  L-PSP family endoribonuclease  39.1 
 
 		 152 aa  94.4  6e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1313  L-PSP family endoribonuclease  39.1 
 
 		 164 aa  94.4  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.221061  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1212  Endoribonuclease L-PSP  39.1 
 
 		 154 aa  94.4  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2542  L-PSP family endoribonuclease  39.1 
 
 		 152 aa  94.4  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.455947  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1153  putative endoribonuclease L-PSP  39.1 
 
 		 152 aa  94.4  6e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1162  putative endoribonuclease L-PSP  39.1 
 
 		 152 aa  94.4  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2072  putative endoribonuclease L-PSP  39.1 
 
 		 152 aa  94.4  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.110705  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6537  endoribonuclease L-PSP  42.31 
 
 		 157 aa  94  8e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.21507  normal  0.550061 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0938  Endoribonuclease L-PSP  42.15 
 
 		 152 aa  92.8  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3333  hypothetical protein  38.67 
 
 		 154 aa  92  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.440014  normal  0.330579 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7458  Endoribonuclease L-PSP  41.67 
 
 		 157 aa  92  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7001  Endoribonuclease L-PSP  34.19 
 
 		 153 aa  92  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.29749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2506  endoribonuclease L-PSP  38.99 
 
 		 151 aa  91.7  4e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.101057  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3343  Endoribonuclease L-PSP  38.22 
 
 		 152 aa  91.3  5e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0721684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0435  endoribonuclease L-PSP  37.58 
 
 		 155 aa  91.3  5e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2118  endoribonuclease L-PSP  38.46 
 
 		 154 aa  91.3  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124484  normal  0.0891562 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0668  endoribonuclease L-PSP  33.75 
 
 		 155 aa  90.9  6e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2736  endoribonuclease L-PSP  41.77 
 
 		 146 aa  90.1  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1705  Endoribonuclease L-PSP  36.2 
 
 		 156 aa  90.1  1e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.182301  hitchhiker  0.0000000000000067862 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2512  endoribonuclease L-PSP  40.48 
 
 		 150 aa  89.4  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.796499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0434  Endoribonuclease L-PSP  40.24 
 
 		 155 aa  89.4  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.51654 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3039  Endoribonuclease L-PSP  40.24 
 
 		 157 aa  89  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0228  Endoribonuclease L-PSP  47.41 
 
 		 152 aa  89  3e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0916  Endoribonuclease L-PSP  38.96 
 
 		 156 aa  88.2  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.139977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0847  Endoribonuclease L-PSP  38.96 
 
 		 156 aa  88.2  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00708228  normal  0.528275 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3397  endoribonuclease L-PSP  36.47 
 
 		 189 aa  88.2  4e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1113  Endoribonuclease L-PSP  39.49 
 
 		 155 aa  88.2  4e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.85817  normal  0.626067 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0986  hypothetical protein  38.06 
 
 		 156 aa  87.4  8e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0698758  normal  0.152684 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0894  hypothetical protein  40.88 
 
 		 152 aa  86.7  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.324074  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2553  endoribonuclease L-PSP  40.88 
 
 		 152 aa  86.7  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8908  Endoribonuclease L-PSP  41.25 
 
 		 152 aa  86.7  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.974502 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0241  Endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 152 aa  86.3  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.206377  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>