199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1027 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1027  Endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 158 aa  322  1e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.190417  normal  0.406014 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1232  Endoribonuclease L-PSP  77.63 
 
 		 158 aa  249  9.000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.118395 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7001  Endoribonuclease L-PSP  77.12 
 
 		 153 aa  246  8e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.29749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0668  endoribonuclease L-PSP  72.26 
 
 		 155 aa  239  7e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2908  Endoribonuclease L-PSP  57.24 
 
 		 164 aa  171  2.9999999999999996e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37922  predicted protein  48.3 
 
 		 185 aa  145  2.0000000000000003e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00476754  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47655  predicted protein  48.3 
 
 		 185 aa  145  2.0000000000000003e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00618585  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3462  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 159 aa  142  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0120904 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6138  endoribonuclease L-PSP  43.23 
 
 		 153 aa  130  6e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5091  hypothetical protein  42.21 
 
 		 163 aa  129  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6426  endoribonuclease L-PSP  42.58 
 
 		 153 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.576265 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2706  Endoribonuclease L-PSP  42.76 
 
 		 153 aa  124  7e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.253512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2803  endoribonuclease L-PSP  43.59 
 
 		 155 aa  121  4e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.117143  normal  0.432336 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5760  Endoribonuclease L-PSP  44.44 
 
 		 165 aa  117  9e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.332069  normal  0.705807 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2988  endoribonuclease L-PSP  42.68 
 
 		 164 aa  117  9e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1504  endoribonuclease L-PSP  43.42 
 
 		 155 aa  116  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.910903  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2153  endoribonuclease L-PSP, putative  40 
 
 		 152 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6667  Endoribonuclease L-PSP  42.31 
 
 		 165 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0416868  normal  0.0241604 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3735  endoribonuclease L-PSP  37.01 
 
 		 170 aa  111  3e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0323381  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1204  endoribonuclease L-PSP  39.04 
 
 		 156 aa  111  5e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.375276 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0904  endoribonuclease L-PSP  40.52 
 
 		 151 aa  111  5e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1554  Endoribonuclease L-PSP  42.11 
 
 		 168 aa  110  6e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.30004 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2477  endoribonuclease L-PSP  40.13 
 
 		 153 aa  110  8.000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.738257  normal  0.0496442 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2609  endoribonuclease L-PSP  38 
 
 		 152 aa  109  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.56142 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1313  L-PSP family endoribonuclease  42.36 
 
 		 164 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.221061  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0708  L-PSP family endoribonuclease  42.36 
 
 		 155 aa  107  5e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2223  L-PSP family endoribonuclease  42.36 
 
 		 152 aa  107  6e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2542  L-PSP family endoribonuclease  42.36 
 
 		 152 aa  107  6e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.455947  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1153  putative endoribonuclease L-PSP  42.36 
 
 		 152 aa  107  6e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1162  putative endoribonuclease L-PSP  42.36 
 
 		 152 aa  107  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2072  putative endoribonuclease L-PSP  42.36 
 
 		 152 aa  107  6e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.110705  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2512  endoribonuclease L-PSP  41.89 
 
 		 150 aa  107  7.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.796499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2457  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 153 aa  106  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0402  endoribonuclease L-PSP  40.69 
 
 		 152 aa  106  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0666223 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4853  Endoribonuclease L-PSP  37.91 
 
 		 154 aa  106  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2118  endoribonuclease L-PSP  40.69 
 
 		 154 aa  105  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124484  normal  0.0891562 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1212  Endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 154 aa  105  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1477  endoribonuclease L-PSP  37.11 
 
 		 174 aa  105  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1346  endoribonuclease L-PSP  40.54 
 
 		 152 aa  105  3e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00288796  normal  0.104373 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3343  Endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 152 aa  105  4e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0721684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2348  endoribonuclease L-PSP  39.86 
 
 		 151 aa  104  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2373  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 152 aa  104  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0938  Endoribonuclease L-PSP  43.7 
 
 		 152 aa  104  5e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4751  putative endoribonuclease L-PSP (protein synthesis inhibitor)  37.58 
 
 		 155 aa  104  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.708532  normal  0.751414 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0927  endoribonuclease L-PSP  39.31 
 
 		 152 aa  103  6e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.553211 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2270  endoribonuclease L-PSP  39.31 
 
 		 152 aa  103  7e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.724419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1740  endoribonuclease L-PSP  39.31 
 
 		 152 aa  103  7e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2388  endoribonuclease L-PSP  39.31 
 
 		 152 aa  103  7e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.921996  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2352  endoribonuclease L-PSP  39.31 
 
 		 152 aa  103  7e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0986  hypothetical protein  39.07 
 
 		 156 aa  103  8e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0698758  normal  0.152684 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0950  L-PSP family endoribonuclease  40.28 
 
 		 164 aa  103  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.449669  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0435  endoribonuclease L-PSP  38.22 
 
 		 155 aa  103  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2555  hypothetical protein  38.62 
 
 		 154 aa  102  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.853817 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5691  endoribonuclease L-PSP  38.62 
 
 		 152 aa  102  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1123  endoribonuclease L-PSP  37.82 
 
 		 155 aa  102  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.321047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3793  endoribonuclease L-PSP  33.55 
 
 		 154 aa  102  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.756407 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0038  Endoribonuclease L-PSP  41.27 
 
 		 161 aa  101  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.491451  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3580  endoribonuclease L-PSP  38.82 
 
 		 153 aa  101  5e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.45612  normal  0.209775 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2736  endoribonuclease L-PSP  42.67 
 
 		 146 aa  100  6e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2506  endoribonuclease L-PSP  40.16 
 
 		 151 aa  100  8e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.101057  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0137  endoribonuclease L-PSP  38.22 
 
 		 155 aa  100  8e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1792  endoribonuclease L-PSP  37.18 
 
 		 156 aa  100  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.282183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3105  endoribonuclease L-PSP  42.48 
 
 		 155 aa  99  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.473778  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0932  Endoribonuclease L-PSP  39.31 
 
 		 152 aa  98.2  4e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.315119  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0250  endoribonuclease L-PSP  41.45 
 
 		 152 aa  98.2  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0200  endoribonuclease L-PSP  35.95 
 
 		 153 aa  97.8  5e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.151399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1018  endoribonuclease L-PSP  39.31 
 
 		 152 aa  97.8  5e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.386479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7184  Endoribonuclease L-PSP  37.97 
 
 		 161 aa  97.8  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2027  endoribonuclease L-PSP  36.13 
 
 		 154 aa  97.8  6e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0633724  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3162  endoribonuclease L-PSP  37.34 
 
 		 155 aa  97.4  7e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.567156  normal  0.207214 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1645  Endoribonuclease L-PSP  35.95 
 
 		 156 aa  97.1  8e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.827325 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0894  hypothetical protein  42.21 
 
 		 152 aa  97.4  8e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.324074  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2553  endoribonuclease L-PSP  42.21 
 
 		 152 aa  97.4  8e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6055  Endoribonuclease L-PSP  38.62 
 
 		 162 aa  97.1  9e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.316335  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2531  hypothetical protein  37.82 
 
 		 156 aa  97.1  9e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3144  endoribonuclease L-PSP  38 
 
 		 152 aa  97.1  9e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.147772 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1427  endoribonuclease L-PSP  37.82 
 
 		 155 aa  96.7  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.426351 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3333  hypothetical protein  42.02 
 
 		 154 aa  95.9  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.440014  normal  0.330579 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0847  Endoribonuclease L-PSP  42.5 
 
 		 156 aa  96.3  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00708228  normal  0.528275 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0916  Endoribonuclease L-PSP  42.5 
 
 		 156 aa  96.3  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.139977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1113  Endoribonuclease L-PSP  33.12 
 
 		 155 aa  95.1  4e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.85817  normal  0.626067 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3408  Endoribonuclease L-PSP  40.34 
 
 		 152 aa  94.7  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1165  hypothetical protein  34.84 
 
 		 154 aa  94.7  5e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5081  endoribonuclease L-PSP  35.57 
 
 		 152 aa  94.7  5e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0190721 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1774  Endoribonuclease L-PSP  36.08 
 
 		 156 aa  94.4  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.98491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1122  hypothetical protein  34.84 
 
 		 154 aa  94.4  6e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.457332  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1272  endoribonuclease L-PSP  38.41 
 
 		 153 aa  94  7e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.103554  hitchhiker  0.00713107 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0336  endoribonuclease L-PSP  39.19 
 
 		 154 aa  94  7e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1577  Endoribonuclease L-PSP  36.08 
 
 		 156 aa  94  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.401191  normal  0.481334 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1944  Endoribonuclease L-PSP  35.33 
 
 		 153 aa  94  8e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1379  endoribonuclease L-PSP  30.57 
 
 		 158 aa  93.2  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0841  endoribonuclease L-PSP  33.77 
 
 		 164 aa  92.4  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3444  endoribonuclease L-PSP  33.99 
 
 		 163 aa  92  3e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.603041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2448  endoribonuclease L-PSP  36.54 
 
 		 155 aa  92  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.514496  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1749  endoribonuclease L-PSP  36.3 
 
 		 151 aa  90.9  6e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.470188  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3546  Endoribonuclease L-PSP  35.26 
 
 		 155 aa  90.9  6e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3313  endoribonuclease L-PSP  36.54 
 
 		 155 aa  90.5  8e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2408  endoribonuclease L-PSP  35.26 
 
 		 155 aa  90.5  9e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.628638  normal  0.167618 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3039  Endoribonuclease L-PSP  36.77 
 
 		 157 aa  90.5  9e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8908  Endoribonuclease L-PSP  40.4 
 
 		 152 aa  90.1  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.974502 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>