200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1477 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1477  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 174 aa  353  6.999999999999999e-97  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5091  hypothetical protein  44.74 
 
 		 163 aa  139  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2706  Endoribonuclease L-PSP  44.59 
 
 		 153 aa  137  6e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.253512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3462  endoribonuclease L-PSP  48.65 
 
 		 159 aa  135  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0120904 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2988  endoribonuclease L-PSP  48.68 
 
 		 164 aa  134  7.000000000000001e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5760  Endoribonuclease L-PSP  47.71 
 
 		 165 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.332069  normal  0.705807 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1554  Endoribonuclease L-PSP  40.36 
 
 		 168 aa  130  9e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.30004 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4751  putative endoribonuclease L-PSP (protein synthesis inhibitor)  46.36 
 
 		 155 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.708532  normal  0.751414 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6667  Endoribonuclease L-PSP  46.41 
 
 		 165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0416868  normal  0.0241604 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3735  endoribonuclease L-PSP  37.8 
 
 		 170 aa  128  3e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0323381  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3793  endoribonuclease L-PSP  42.47 
 
 		 154 aa  122  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.756407 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3313  endoribonuclease L-PSP  46.58 
 
 		 155 aa  122  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6138  endoribonuclease L-PSP  41.78 
 
 		 153 aa  121  6e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6426  endoribonuclease L-PSP  41.78 
 
 		 153 aa  120  9e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.576265 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1944  Endoribonuclease L-PSP  42.07 
 
 		 153 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1232  Endoribonuclease L-PSP  41.18 
 
 		 158 aa  120  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.118395 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2408  endoribonuclease L-PSP  42.86 
 
 		 155 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.628638  normal  0.167618 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3043  endoribonuclease L-PSP  43.15 
 
 		 155 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.574471 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2153  endoribonuclease L-PSP, putative  38 
 
 		 152 aa  118  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1379  endoribonuclease L-PSP  38.96 
 
 		 158 aa  118  3.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1645  Endoribonuclease L-PSP  38.82 
 
 		 156 aa  118  3.9999999999999996e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.827325 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1705  Endoribonuclease L-PSP  42.76 
 
 		 156 aa  118  4.9999999999999996e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.182301  hitchhiker  0.0000000000000067862 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3144  endoribonuclease L-PSP  42.86 
 
 		 152 aa  117  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.147772 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3546  Endoribonuclease L-PSP  42.86 
 
 		 155 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1427  endoribonuclease L-PSP  43.92 
 
 		 155 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.426351 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2027  endoribonuclease L-PSP  40.67 
 
 		 154 aa  114  7.999999999999999e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0633724  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1577  Endoribonuclease L-PSP  41.94 
 
 		 156 aa  114  8.999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.401191  normal  0.481334 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2531  hypothetical protein  42.38 
 
 		 156 aa  113  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0668  endoribonuclease L-PSP  40.67 
 
 		 155 aa  113  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1774  Endoribonuclease L-PSP  41.29 
 
 		 156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.98491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2448  endoribonuclease L-PSP  43.92 
 
 		 155 aa  112  3e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.514496  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6055  Endoribonuclease L-PSP  40.13 
 
 		 162 aa  112  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.316335  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1123  endoribonuclease L-PSP  40.27 
 
 		 155 aa  112  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.321047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1113  Endoribonuclease L-PSP  39.33 
 
 		 155 aa  111  6e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.85817  normal  0.626067 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2908  Endoribonuclease L-PSP  41.33 
 
 		 164 aa  109  2.0000000000000002e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1504  endoribonuclease L-PSP  43.33 
 
 		 155 aa  109  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.910903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2457  endoribonuclease L-PSP  40.54 
 
 		 153 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3343  Endoribonuclease L-PSP  37.75 
 
 		 152 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0721684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1272  endoribonuclease L-PSP  42.07 
 
 		 153 aa  107  8.000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.103554  hitchhiker  0.00713107 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0581  endoribonuclease L-PSP  40.26 
 
 		 154 aa  107  9.000000000000001e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0481259  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7001  Endoribonuclease L-PSP  39.07 
 
 		 153 aa  107  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.29749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0435  endoribonuclease L-PSP  41.61 
 
 		 155 aa  106  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1092  endoribonuclease L-PSP  38.67 
 
 		 151 aa  107  1e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4853  Endoribonuclease L-PSP  40.14 
 
 		 154 aa  107  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1027  Endoribonuclease L-PSP  37.11 
 
 		 158 aa  105  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.190417  normal  0.406014 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0137  endoribonuclease L-PSP  40.94 
 
 		 155 aa  105  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3580  endoribonuclease L-PSP  42.76 
 
 		 153 aa  106  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.45612  normal  0.209775 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1180  Endoribonuclease L-PSP  41.13 
 
 		 153 aa  105  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1792  endoribonuclease L-PSP  37.75 
 
 		 156 aa  105  4e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.282183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47655  predicted protein  37.09 
 
 		 185 aa  105  4e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00618585  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37922  predicted protein  37.09 
 
 		 185 aa  105  4e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00476754  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1165  hypothetical protein  39.33 
 
 		 154 aa  103  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0950  L-PSP family endoribonuclease  40.85 
 
 		 164 aa  103  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.449669  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2477  endoribonuclease L-PSP  39.74 
 
 		 153 aa  103  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.738257  normal  0.0496442 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1122  hypothetical protein  39.33 
 
 		 154 aa  103  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.457332  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4070  endoribonuclease L-PSP  39.61 
 
 		 162 aa  102  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.256894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4437  Endoribonuclease L-PSP  39.47 
 
 		 157 aa  102  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.062411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2118  endoribonuclease L-PSP  41.55 
 
 		 154 aa  102  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124484  normal  0.0891562 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2803  endoribonuclease L-PSP  38.93 
 
 		 155 aa  101  4e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.117143  normal  0.432336 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4551  Endoribonuclease L-PSP  39.47 
 
 		 157 aa  101  5e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0200  endoribonuclease L-PSP  39.07 
 
 		 153 aa  101  5e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.151399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1313  L-PSP family endoribonuclease  40.69 
 
 		 164 aa  100  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.221061  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0708  L-PSP family endoribonuclease  40.69 
 
 		 155 aa  100  8e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2223  L-PSP family endoribonuclease  40.69 
 
 		 152 aa  100  9e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1212  Endoribonuclease L-PSP  40.14 
 
 		 154 aa  100  9e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2542  L-PSP family endoribonuclease  40.69 
 
 		 152 aa  100  9e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.455947  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1153  putative endoribonuclease L-PSP  40.69 
 
 		 152 aa  100  9e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1162  putative endoribonuclease L-PSP  40.69 
 
 		 152 aa  100  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2072  putative endoribonuclease L-PSP  40.69 
 
 		 152 aa  100  9e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.110705  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2736  endoribonuclease L-PSP  42.36 
 
 		 146 aa  99.8  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0927  endoribonuclease L-PSP  39.86 
 
 		 152 aa  99  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.553211 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2373  endoribonuclease L-PSP  40.85 
 
 		 152 aa  99  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8908  Endoribonuclease L-PSP  42.86 
 
 		 152 aa  98.6  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.974502 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2270  endoribonuclease L-PSP  40.14 
 
 		 152 aa  98.2  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.724419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1740  endoribonuclease L-PSP  40.14 
 
 		 152 aa  98.2  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2388  endoribonuclease L-PSP  40.14 
 
 		 152 aa  98.2  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.921996  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2352  endoribonuclease L-PSP  40.14 
 
 		 152 aa  98.2  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0986  hypothetical protein  36.67 
 
 		 156 aa  97.8  6e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0698758  normal  0.152684 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0114  hypothetical protein  42.55 
 
 		 155 aa  97.8  7e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1258  endoribonuclease L-PSP  40.26 
 
 		 156 aa  97.4  9e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13709  hypothetical protein  40.54 
 
 		 151 aa  96.3  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0525391 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5691  endoribonuclease L-PSP  38.73 
 
 		 152 aa  95.5  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2030  Endoribonuclease L-PSP  34.01 
 
 		 156 aa  95.5  3e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00146961  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0168  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 153 aa  95.9  3e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4348  endoribonuclease L-PSP  41.18 
 
 		 153 aa  95.1  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.917733 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0038  Endoribonuclease L-PSP  43.44 
 
 		 161 aa  95.1  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.491451  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4789  endoribonuclease L-PSP  41.91 
 
 		 153 aa  95.1  5e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0118265 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2319  endoribonuclease L-PSP  37.82 
 
 		 157 aa  94  9e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0713  Endoribonuclease L-PSP  39.74 
 
 		 152 aa  93.2  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3105  endoribonuclease L-PSP  38.82 
 
 		 155 aa  94  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.473778  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3333  hypothetical protein  40.85 
 
 		 154 aa  93.6  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.440014  normal  0.330579 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0841  endoribonuclease L-PSP  33.55 
 
 		 164 aa  93.6  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0938  Endoribonuclease L-PSP  38.03 
 
 		 152 aa  94  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2784  endoribonuclease L-PSP  41.67 
 
 		 155 aa  94  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3006  endoribonuclease L-PSP  40.54 
 
 		 154 aa  93.2  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.236246 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1062  Endoribonuclease L-PSP  42.07 
 
 		 151 aa  92  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2111  Endoribonuclease L-PSP  38.1 
 
 		 163 aa  91.7  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1749  endoribonuclease L-PSP  39.13 
 
 		 151 aa  91.7  5e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.470188  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2609  endoribonuclease L-PSP  35.86 
 
 		 152 aa  91.3  6e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.56142 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2204  Endoribonuclease L-PSP  41.06 
 
 		 153 aa  91.3  7e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0449477  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>