216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0137 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0137  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 155 aa  308  2e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0435  endoribonuclease L-PSP  74.84 
 
 		 155 aa  237  4e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0250  endoribonuclease L-PSP  74.17 
 
 		 152 aa  211  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2477  endoribonuclease L-PSP  66.23 
 
 		 153 aa  207  3e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.738257  normal  0.0496442 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0894  hypothetical protein  72.67 
 
 		 152 aa  204  3e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.324074  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2553  endoribonuclease L-PSP  72.67 
 
 		 152 aa  204  3e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2803  endoribonuclease L-PSP  61.04 
 
 		 155 aa  190  6e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.117143  normal  0.432336 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1272  endoribonuclease L-PSP  59.06 
 
 		 153 aa  179  1e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.103554  hitchhiker  0.00713107 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2457  endoribonuclease L-PSP  62.59 
 
 		 153 aa  178  2.9999999999999997e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3793  endoribonuclease L-PSP  57.79 
 
 		 154 aa  174  5e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.756407 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1123  endoribonuclease L-PSP  54.55 
 
 		 155 aa  171  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.321047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2736  endoribonuclease L-PSP  62.67 
 
 		 146 aa  171  5e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1577  Endoribonuclease L-PSP  55.19 
 
 		 156 aa  169  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.401191  normal  0.481334 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1427  endoribonuclease L-PSP  60 
 
 		 155 aa  167  4e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.426351 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4751  putative endoribonuclease L-PSP (protein synthesis inhibitor)  57.05 
 
 		 155 aa  167  5e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.708532  normal  0.751414 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1774  Endoribonuclease L-PSP  54.55 
 
 		 156 aa  167  7e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.98491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2408  endoribonuclease L-PSP  56.77 
 
 		 155 aa  165  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.628638  normal  0.167618 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2531  hypothetical protein  54.55 
 
 		 156 aa  165  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2448  endoribonuclease L-PSP  58.06 
 
 		 155 aa  164  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.514496  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6055  Endoribonuclease L-PSP  53.02 
 
 		 162 aa  162  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.316335  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3546  Endoribonuclease L-PSP  55.48 
 
 		 155 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3043  endoribonuclease L-PSP  55.77 
 
 		 155 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.574471 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2027  endoribonuclease L-PSP  52.6 
 
 		 154 aa  159  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0633724  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3144  endoribonuclease L-PSP  52 
 
 		 152 aa  157  5e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.147772 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3313  endoribonuclease L-PSP  56.13 
 
 		 155 aa  156  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1379  endoribonuclease L-PSP  51.95 
 
 		 158 aa  156  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3105  endoribonuclease L-PSP  55.84 
 
 		 155 aa  154  6e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.473778  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2784  endoribonuclease L-PSP  56.29 
 
 		 155 aa  149  8.999999999999999e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1165  hypothetical protein  50.65 
 
 		 154 aa  147  4e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1504  endoribonuclease L-PSP  49.67 
 
 		 155 aa  147  4e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.910903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1122  hypothetical protein  50.65 
 
 		 154 aa  147  4e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.457332  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0168  endoribonuclease L-PSP  51.66 
 
 		 153 aa  147  7e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2319  endoribonuclease L-PSP  52.56 
 
 		 157 aa  145  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1554  Endoribonuclease L-PSP  48.34 
 
 		 168 aa  144  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.30004 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1792  endoribonuclease L-PSP  51.95 
 
 		 156 aa  145  3e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.282183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4853  Endoribonuclease L-PSP  48.99 
 
 		 154 aa  144  4.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3462  endoribonuclease L-PSP  50.34 
 
 		 159 aa  141  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0120904 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13709  hypothetical protein  51.3 
 
 		 151 aa  140  8e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0525391 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4551  Endoribonuclease L-PSP  50.33 
 
 		 157 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1092  endoribonuclease L-PSP  43.92 
 
 		 151 aa  139  9.999999999999999e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1113  Endoribonuclease L-PSP  49.66 
 
 		 155 aa  139  9.999999999999999e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.85817  normal  0.626067 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2030  Endoribonuclease L-PSP  42.31 
 
 		 156 aa  138  3e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00146961  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37922  predicted protein  49.02 
 
 		 185 aa  138  3e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00476754  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0200  endoribonuclease L-PSP  49.33 
 
 		 153 aa  138  3e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.151399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4070  endoribonuclease L-PSP  49.67 
 
 		 162 aa  138  3e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.256894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47655  predicted protein  49.02 
 
 		 185 aa  138  3e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00618585  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3343  Endoribonuclease L-PSP  48 
 
 		 152 aa  137  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0721684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3006  endoribonuclease L-PSP  54.73 
 
 		 154 aa  137  6e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.236246 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1346  endoribonuclease L-PSP  47.52 
 
 		 152 aa  137  6e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00288796  normal  0.104373 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0402  endoribonuclease L-PSP  48.23 
 
 		 152 aa  137  6e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0666223 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3178  Endoribonuclease L-PSP  51.9 
 
 		 177 aa  137  7e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.738101 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0713  Endoribonuclease L-PSP  48.65 
 
 		 152 aa  137  7e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7458  Endoribonuclease L-PSP  49.37 
 
 		 157 aa  137  7.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4437  Endoribonuclease L-PSP  49.67 
 
 		 157 aa  136  8.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.062411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1705  Endoribonuclease L-PSP  46.36 
 
 		 156 aa  136  1e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.182301  hitchhiker  0.0000000000000067862 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2555  hypothetical protein  48.63 
 
 		 154 aa  136  1e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.853817 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2373  endoribonuclease L-PSP  49.32 
 
 		 152 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6537  endoribonuclease L-PSP  48.73 
 
 		 157 aa  135  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.21507  normal  0.550061 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1018  endoribonuclease L-PSP  46.1 
 
 		 152 aa  135  2e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.386479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2270  endoribonuclease L-PSP  48.63 
 
 		 152 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.724419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1944  Endoribonuclease L-PSP  49.32 
 
 		 153 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1740  endoribonuclease L-PSP  48.63 
 
 		 152 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2388  endoribonuclease L-PSP  48.63 
 
 		 152 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.921996  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0927  endoribonuclease L-PSP  48.63 
 
 		 152 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.553211 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2352  endoribonuclease L-PSP  48.63 
 
 		 152 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0932  Endoribonuclease L-PSP  46.1 
 
 		 152 aa  135  3.0000000000000003e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.315119  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1348  Endoribonuclease L-PSP  50.65 
 
 		 157 aa  134  4e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1645  Endoribonuclease L-PSP  44 
 
 		 156 aa  134  4e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.827325 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5691  endoribonuclease L-PSP  50.35 
 
 		 152 aa  134  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2153  endoribonuclease L-PSP, putative  46.31 
 
 		 152 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1212  Endoribonuclease L-PSP  46.94 
 
 		 154 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3039  Endoribonuclease L-PSP  50.33 
 
 		 157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0986  hypothetical protein  46.53 
 
 		 156 aa  131  3e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0698758  normal  0.152684 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2118  endoribonuclease L-PSP  48.3 
 
 		 154 aa  131  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124484  normal  0.0891562 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4348  endoribonuclease L-PSP  49.65 
 
 		 153 aa  130  7.999999999999999e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.917733 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0950  L-PSP family endoribonuclease  45.89 
 
 		 164 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.449669  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2609  endoribonuclease L-PSP  48.28 
 
 		 152 aa  129  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.56142 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6667  Endoribonuclease L-PSP  48.1 
 
 		 165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0416868  normal  0.0241604 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1313  L-PSP family endoribonuclease  47.52 
 
 		 164 aa  128  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.221061  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1204  endoribonuclease L-PSP  42.86 
 
 		 156 aa  128  3e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.375276 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0708  L-PSP family endoribonuclease  47.52 
 
 		 155 aa  128  3e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2223  L-PSP family endoribonuclease  47.52 
 
 		 152 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0581  endoribonuclease L-PSP  41.33 
 
 		 154 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0481259  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2542  L-PSP family endoribonuclease  47.52 
 
 		 152 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.455947  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1153  putative endoribonuclease L-PSP  47.52 
 
 		 152 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1162  putative endoribonuclease L-PSP  47.52 
 
 		 152 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2072  putative endoribonuclease L-PSP  47.52 
 
 		 152 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.110705  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5081  endoribonuclease L-PSP  46.1 
 
 		 152 aa  127  6e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0190721 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5760  Endoribonuclease L-PSP  48.7 
 
 		 165 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.332069  normal  0.705807 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1369  endoribonuclease L-PSP  46.75 
 
 		 153 aa  126  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.324136 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3735  endoribonuclease L-PSP  42.67 
 
 		 170 aa  125  3e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0323381  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2111  Endoribonuclease L-PSP  43.54 
 
 		 163 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2512  endoribonuclease L-PSP  48.97 
 
 		 150 aa  124  6e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.796499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4820  endoribonuclease L-PSP  49.28 
 
 		 162 aa  124  6e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4906  endoribonuclease L-PSP  49.28 
 
 		 162 aa  124  6e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.374579 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5207  endoribonuclease L-PSP  49.28 
 
 		 162 aa  124  6e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000695376 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6426  endoribonuclease L-PSP  42.38 
 
 		 153 aa  123  9e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.576265 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0336  endoribonuclease L-PSP  50.34 
 
 		 154 aa  122  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2348  endoribonuclease L-PSP  48.28 
 
 		 151 aa  122  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6138  endoribonuclease L-PSP  41.72 
 
 		 153 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>