196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0038 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0038  Endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 161 aa  315  2e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.491451  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7184  Endoribonuclease L-PSP  64.6 
 
 		 161 aa  207  6e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3444  endoribonuclease L-PSP  53.5 
 
 		 163 aa  169  2e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.603041  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2908  Endoribonuclease L-PSP  47.06 
 
 		 164 aa  122  1e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1554  Endoribonuclease L-PSP  45.16 
 
 		 168 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.30004 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2030  Endoribonuclease L-PSP  47.3 
 
 		 156 aa  118  3e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00146961  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2803  endoribonuclease L-PSP  44.94 
 
 		 155 aa  118  3.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.117143  normal  0.432336 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47655  predicted protein  40.99 
 
 		 185 aa  117  6e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00618585  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37922  predicted protein  40.99 
 
 		 185 aa  117  6e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00476754  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1792  endoribonuclease L-PSP  45 
 
 		 156 aa  116  9.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.282183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3462  endoribonuclease L-PSP  46.67 
 
 		 159 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0120904 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2319  endoribonuclease L-PSP  46.88 
 
 		 157 aa  115  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6426  endoribonuclease L-PSP  44.3 
 
 		 153 aa  115  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.576265 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5091  hypothetical protein  45.64 
 
 		 163 aa  114  7.999999999999999e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1027  Endoribonuclease L-PSP  41.94 
 
 		 158 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.190417  normal  0.406014 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1232  Endoribonuclease L-PSP  41.29 
 
 		 158 aa  113  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.118395 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6138  endoribonuclease L-PSP  44.16 
 
 		 153 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1427  endoribonuclease L-PSP  46.45 
 
 		 155 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.426351 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6667  Endoribonuclease L-PSP  45.64 
 
 		 165 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0416868  normal  0.0241604 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7001  Endoribonuclease L-PSP  41.56 
 
 		 153 aa  112  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.29749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3735  endoribonuclease L-PSP  43.23 
 
 		 170 aa  111  3e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0323381  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3546  Endoribonuclease L-PSP  43.23 
 
 		 155 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2408  endoribonuclease L-PSP  42.58 
 
 		 155 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.628638  normal  0.167618 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3043  endoribonuclease L-PSP  42.58 
 
 		 155 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.574471 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1645  Endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 156 aa  109  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.827325 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0668  endoribonuclease L-PSP  38.71 
 
 		 155 aa  109  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4751  putative endoribonuclease L-PSP (protein synthesis inhibitor)  42.31 
 
 		 155 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.708532  normal  0.751414 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1272  endoribonuclease L-PSP  42.77 
 
 		 153 aa  108  3e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.103554  hitchhiker  0.00713107 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2448  endoribonuclease L-PSP  45.81 
 
 		 155 aa  107  8.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.514496  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2609  endoribonuclease L-PSP  44.08 
 
 		 152 aa  107  8.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.56142 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2988  endoribonuclease L-PSP  45.51 
 
 		 164 aa  107  8.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5760  Endoribonuclease L-PSP  44.97 
 
 		 165 aa  106  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.332069  normal  0.705807 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0200  endoribonuclease L-PSP  41.77 
 
 		 153 aa  106  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.151399  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1165  hypothetical protein  42.04 
 
 		 154 aa  105  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4853  Endoribonuclease L-PSP  45.45 
 
 		 154 aa  105  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1477  endoribonuclease L-PSP  40.67 
 
 		 174 aa  105  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1122  hypothetical protein  42.04 
 
 		 154 aa  106  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.457332  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2706  Endoribonuclease L-PSP  40.38 
 
 		 153 aa  105  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.253512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1123  endoribonuclease L-PSP  44.03 
 
 		 155 aa  105  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.321047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3313  endoribonuclease L-PSP  42.58 
 
 		 155 aa  104  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4551  Endoribonuclease L-PSP  41.88 
 
 		 157 aa  104  6e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3793  endoribonuclease L-PSP  41.94 
 
 		 154 aa  104  6e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.756407 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13709  hypothetical protein  46.15 
 
 		 151 aa  103  8e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0525391 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7458  Endoribonuclease L-PSP  42.5 
 
 		 157 aa  103  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2027  endoribonuclease L-PSP  43.23 
 
 		 154 aa  103  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0633724  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3144  endoribonuclease L-PSP  39.24 
 
 		 152 aa  102  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.147772 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4070  endoribonuclease L-PSP  41.25 
 
 		 162 aa  102  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.256894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3343  Endoribonuclease L-PSP  42.67 
 
 		 152 aa  102  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0721684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1348  Endoribonuclease L-PSP  43.12 
 
 		 157 aa  102  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1504  endoribonuclease L-PSP  46.45 
 
 		 155 aa  102  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.910903  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2153  endoribonuclease L-PSP, putative  37.58 
 
 		 152 aa  102  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2457  endoribonuclease L-PSP  46.41 
 
 		 153 aa  102  3e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3178  Endoribonuclease L-PSP  42.26 
 
 		 177 aa  101  4e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.738101 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4437  Endoribonuclease L-PSP  41.25 
 
 		 157 aa  101  5e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.062411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2555  hypothetical protein  42.11 
 
 		 154 aa  100  6e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.853817 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6537  endoribonuclease L-PSP  41.88 
 
 		 157 aa  100  7e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.21507  normal  0.550061 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0904  endoribonuclease L-PSP  41.56 
 
 		 151 aa  100  9e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0927  endoribonuclease L-PSP  39.24 
 
 		 152 aa  99  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.553211 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1379  endoribonuclease L-PSP  41.94 
 
 		 158 aa  99.4  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0137  endoribonuclease L-PSP  45.45 
 
 		 155 aa  99  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0228  Endoribonuclease L-PSP  45.27 
 
 		 152 aa  98.6  3e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0435  endoribonuclease L-PSP  40.91 
 
 		 155 aa  98.2  4e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1613  endoribonuclease L-PSP  44.59 
 
 		 154 aa  97.8  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.578745  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4883  endoribonuclease L-PSP  43.62 
 
 		 157 aa  97.4  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000371063  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2270  endoribonuclease L-PSP  38.31 
 
 		 152 aa  96.7  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.724419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1705  Endoribonuclease L-PSP  39.13 
 
 		 156 aa  97.1  1e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.182301  hitchhiker  0.0000000000000067862 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1740  endoribonuclease L-PSP  38.31 
 
 		 152 aa  96.7  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2388  endoribonuclease L-PSP  38.31 
 
 		 152 aa  96.7  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.921996  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2352  endoribonuclease L-PSP  38.31 
 
 		 152 aa  96.7  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0713  Endoribonuclease L-PSP  44.3 
 
 		 152 aa  96.7  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2373  endoribonuclease L-PSP  38.31 
 
 		 152 aa  96.7  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1636  endoribonuclease L-PSP  43.92 
 
 		 154 aa  96.7  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.564581 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2531  hypothetical protein  42.04 
 
 		 156 aa  96.3  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2118  endoribonuclease L-PSP  38.56 
 
 		 154 aa  95.9  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124484  normal  0.0891562 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5691  endoribonuclease L-PSP  38.31 
 
 		 152 aa  96.3  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0950  L-PSP family endoribonuclease  38.96 
 
 		 164 aa  95.9  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.449669  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6055  Endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 162 aa  96.3  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.316335  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0581  endoribonuclease L-PSP  35.44 
 
 		 154 aa  95.9  2e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0481259  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3408  Endoribonuclease L-PSP  40.76 
 
 		 152 aa  95.1  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2204  Endoribonuclease L-PSP  48 
 
 		 153 aa  95.1  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0449477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1944  Endoribonuclease L-PSP  42.67 
 
 		 153 aa  94.7  4e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1313  L-PSP family endoribonuclease  38.31 
 
 		 164 aa  94.4  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.221061  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2223  L-PSP family endoribonuclease  38.31 
 
 		 152 aa  94.4  6e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0708  L-PSP family endoribonuclease  38.31 
 
 		 155 aa  94.4  6e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2542  L-PSP family endoribonuclease  38.31 
 
 		 152 aa  94.4  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.455947  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1153  putative endoribonuclease L-PSP  38.31 
 
 		 152 aa  94.4  6e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1162  putative endoribonuclease L-PSP  38.31 
 
 		 152 aa  94.4  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2072  putative endoribonuclease L-PSP  38.31 
 
 		 152 aa  94.4  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.110705  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1204  endoribonuclease L-PSP  38.85 
 
 		 156 aa  94  7e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.375276 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1577  Endoribonuclease L-PSP  41.88 
 
 		 156 aa  93.2  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.401191  normal  0.481334 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1113  Endoribonuclease L-PSP  38.06 
 
 		 155 aa  93.6  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.85817  normal  0.626067 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1212  Endoribonuclease L-PSP  39.24 
 
 		 154 aa  93.2  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5125  endoribonuclease L-PSP  42.57 
 
 		 154 aa  92.4  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4282  endoribonuclease L-PSP  45.57 
 
 		 154 aa  92.4  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.667627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0250  endoribonuclease L-PSP  43.95 
 
 		 152 aa  92.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0168  endoribonuclease L-PSP  42.48 
 
 		 153 aa  92.8  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0938  Endoribonuclease L-PSP  39.22 
 
 		 152 aa  92  3e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3397  endoribonuclease L-PSP  39.16 
 
 		 189 aa  90.9  6e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2348  endoribonuclease L-PSP  42.28 
 
 		 151 aa  90.5  9e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0121  peptidase C26  37.75 
 
 		 407 aa  89.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.808568 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>