205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1258 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1258  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 156 aa  306  6.999999999999999e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2457  endoribonuclease L-PSP  51.66 
 
 		 153 aa  155  2e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1379  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 158 aa  154  6e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1577  Endoribonuclease L-PSP  48.7 
 
 		 156 aa  153  9e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.401191  normal  0.481334 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1774  Endoribonuclease L-PSP  48.05 
 
 		 156 aa  149  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.98491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1123  endoribonuclease L-PSP  48.7 
 
 		 155 aa  149  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.321047  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6055  Endoribonuclease L-PSP  51.7 
 
 		 162 aa  147  5e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.316335  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2408  endoribonuclease L-PSP  50.32 
 
 		 155 aa  145  3e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.628638  normal  0.167618 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3043  endoribonuclease L-PSP  50.32 
 
 		 155 aa  143  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.574471 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0581  endoribonuclease L-PSP  47.1 
 
 		 154 aa  143  9e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0481259  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4751  putative endoribonuclease L-PSP (protein synthesis inhibitor)  50 
 
 		 155 aa  143  9e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.708532  normal  0.751414 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2477  endoribonuclease L-PSP  51.97 
 
 		 153 aa  143  1e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.738257  normal  0.0496442 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2027  endoribonuclease L-PSP  49.35 
 
 		 154 aa  142  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0633724  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2531  hypothetical protein  46.1 
 
 		 156 aa  141  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3546  Endoribonuclease L-PSP  50.97 
 
 		 155 aa  141  4e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3793  endoribonuclease L-PSP  47.4 
 
 		 154 aa  140  6e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.756407 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3313  endoribonuclease L-PSP  48.39 
 
 		 155 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1113  Endoribonuclease L-PSP  45.16 
 
 		 155 aa  135  3.0000000000000003e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.85817  normal  0.626067 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2803  endoribonuclease L-PSP  47.4 
 
 		 155 aa  135  3.0000000000000003e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.117143  normal  0.432336 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0435  endoribonuclease L-PSP  45.51 
 
 		 155 aa  134  3.0000000000000003e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4070  endoribonuclease L-PSP  45.81 
 
 		 162 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.256894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2448  endoribonuclease L-PSP  48.39 
 
 		 155 aa  134  4e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.514496  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1792  endoribonuclease L-PSP  47.1 
 
 		 156 aa  134  5e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.282183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4437  Endoribonuclease L-PSP  45.81 
 
 		 157 aa  134  5e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.062411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1122  hypothetical protein  46.1 
 
 		 154 aa  134  6.0000000000000005e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.457332  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1165  hypothetical protein  46.1 
 
 		 154 aa  133  8e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4551  Endoribonuclease L-PSP  45.81 
 
 		 157 aa  133  8e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0137  endoribonuclease L-PSP  44.87 
 
 		 155 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1427  endoribonuclease L-PSP  47.1 
 
 		 155 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.426351 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1272  endoribonuclease L-PSP  46.71 
 
 		 153 aa  128  3e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.103554  hitchhiker  0.00713107 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1944  Endoribonuclease L-PSP  46.71 
 
 		 153 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2319  endoribonuclease L-PSP  45.51 
 
 		 157 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4853  Endoribonuclease L-PSP  43.92 
 
 		 154 aa  124  6e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3105  endoribonuclease L-PSP  47.1 
 
 		 155 aa  122  1e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.473778  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2030  Endoribonuclease L-PSP  38.46 
 
 		 156 aa  122  2e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00146961  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0986  hypothetical protein  42.48 
 
 		 156 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0698758  normal  0.152684 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1645  Endoribonuclease L-PSP  40.94 
 
 		 156 aa  119  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.827325 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0250  endoribonuclease L-PSP  47.37 
 
 		 152 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0200  endoribonuclease L-PSP  44.3 
 
 		 153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.151399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1504  endoribonuclease L-PSP  41.67 
 
 		 155 aa  119  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.910903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2736  endoribonuclease L-PSP  48.34 
 
 		 146 aa  118  3e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1346  endoribonuclease L-PSP  42.38 
 
 		 152 aa  117  3.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00288796  normal  0.104373 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2784  endoribonuclease L-PSP  47.37 
 
 		 155 aa  117  3.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3343  Endoribonuclease L-PSP  41.45 
 
 		 152 aa  117  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0721684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0402  endoribonuclease L-PSP  44.37 
 
 		 152 aa  117  4.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0666223 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0168  endoribonuclease L-PSP  39.74 
 
 		 153 aa  117  6e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2706  Endoribonuclease L-PSP  41.45 
 
 		 153 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.253512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5081  endoribonuclease L-PSP  42.38 
 
 		 152 aa  116  9e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0190721 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1636  endoribonuclease L-PSP  43.14 
 
 		 154 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.564581 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1613  endoribonuclease L-PSP  43.14 
 
 		 154 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.578745  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0932  Endoribonuclease L-PSP  42.38 
 
 		 152 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.315119  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0927  endoribonuclease L-PSP  43.54 
 
 		 152 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.553211 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2118  endoribonuclease L-PSP  43.24 
 
 		 154 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124484  normal  0.0891562 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1018  endoribonuclease L-PSP  42.38 
 
 		 152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.386479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1212  Endoribonuclease L-PSP  41.89 
 
 		 154 aa  114  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5691  endoribonuclease L-PSP  44.22 
 
 		 152 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3006  endoribonuclease L-PSP  45.75 
 
 		 154 aa  114  3.9999999999999997e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.236246 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1740  endoribonuclease L-PSP  44.22 
 
 		 152 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2388  endoribonuclease L-PSP  44.22 
 
 		 152 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.921996  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2352  endoribonuclease L-PSP  44.22 
 
 		 152 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2270  endoribonuclease L-PSP  44.22 
 
 		 152 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.724419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4883  endoribonuclease L-PSP  42.86 
 
 		 157 aa  114  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000371063  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2373  endoribonuclease L-PSP  43.54 
 
 		 152 aa  114  6e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1348  Endoribonuclease L-PSP  45.03 
 
 		 157 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3178  Endoribonuclease L-PSP  40.37 
 
 		 177 aa  112  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.738101 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2111  Endoribonuclease L-PSP  44.22 
 
 		 163 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0894  hypothetical protein  46.41 
 
 		 152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.324074  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0950  L-PSP family endoribonuclease  41.06 
 
 		 164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.449669  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0121  peptidase C26  43.92 
 
 		 407 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.808568 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1092  endoribonuclease L-PSP  42.67 
 
 		 151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2553  endoribonuclease L-PSP  46.41 
 
 		 152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3144  endoribonuclease L-PSP  41.72 
 
 		 152 aa  111  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.147772 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2223  L-PSP family endoribonuclease  42.86 
 
 		 152 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1313  L-PSP family endoribonuclease  42.86 
 
 		 164 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.221061  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0708  L-PSP family endoribonuclease  42.86 
 
 		 155 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2542  L-PSP family endoribonuclease  42.86 
 
 		 152 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.455947  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1153  putative endoribonuclease L-PSP  42.86 
 
 		 152 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1162  putative endoribonuclease L-PSP  42.86 
 
 		 152 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2072  putative endoribonuclease L-PSP  42.86 
 
 		 152 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.110705  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13709  hypothetical protein  42.38 
 
 		 151 aa  110  7.000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0525391 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3462  endoribonuclease L-PSP  46.15 
 
 		 159 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0120904 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7458  Endoribonuclease L-PSP  39.61 
 
 		 157 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2555  hypothetical protein  42.11 
 
 		 154 aa  110  9e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.853817 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3735  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 170 aa  110  9e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0323381  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1477  endoribonuclease L-PSP  40.26 
 
 		 174 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6537  endoribonuclease L-PSP  40.52 
 
 		 157 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.21507  normal  0.550061 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5091  hypothetical protein  38.93 
 
 		 163 aa  108  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6426  endoribonuclease L-PSP  40.94 
 
 		 153 aa  108  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.576265 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0916  Endoribonuclease L-PSP  42.86 
 
 		 156 aa  108  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.139977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0847  Endoribonuclease L-PSP  42.86 
 
 		 156 aa  108  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00708228  normal  0.528275 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2153  endoribonuclease L-PSP, putative  41.67 
 
 		 152 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2699  Endoribonuclease L-PSP  38.67 
 
 		 162 aa  107  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.396345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1180  Endoribonuclease L-PSP  39.58 
 
 		 153 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0713  Endoribonuclease L-PSP  38.16 
 
 		 152 aa  107  7.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0841  endoribonuclease L-PSP  40.94 
 
 		 164 aa  107  9.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5760  Endoribonuclease L-PSP  42.48 
 
 		 165 aa  105  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.332069  normal  0.705807 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2512  endoribonuclease L-PSP  41.72 
 
 		 150 aa  105  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.796499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1705  Endoribonuclease L-PSP  41.83 
 
 		 156 aa  105  2e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.182301  hitchhiker  0.0000000000000067862 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3333  hypothetical protein  42.18 
 
 		 154 aa  105  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.440014  normal  0.330579 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1530  endoribonuclease L-PSP  39.35 
 
 		 160 aa  105  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>