253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2699 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_2699  Endoribonuclease L-PSP  100 
 
 
162 aa  316  7e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.396345  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2368  Endoribonuclease L-PSP  86.96 
 
 
162 aa  243  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0738806 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5536  endoribonuclease L-PSP  63.76 
 
 
156 aa  197  3.9999999999999996e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.044824 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6842  Endoribonuclease L-PSP  60.93 
 
 
168 aa  183  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.173433 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0841  endoribonuclease L-PSP  58 
 
 
164 aa  181  4.0000000000000006e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1944  Endoribonuclease L-PSP  50 
 
 
153 aa  137  7.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1645  Endoribonuclease L-PSP  39.6 
 
 
156 aa  135  2e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.827325 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3343  Endoribonuclease L-PSP  37.84 
 
 
152 aa  128  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0721684  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4853  Endoribonuclease L-PSP  44 
 
 
154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1705  Endoribonuclease L-PSP  42.86 
 
 
156 aa  122  2e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.182301  hitchhiker  0.0000000000000067862 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0581  endoribonuclease L-PSP  35.81 
 
 
154 aa  120  8e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0481259  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4751  putative endoribonuclease L-PSP (protein synthesis inhibitor)  43.05 
 
 
155 aa  120  9e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.708532  normal  0.751414 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3793  endoribonuclease L-PSP  40.54 
 
 
154 aa  120  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.756407 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1379  endoribonuclease L-PSP  39.19 
 
 
158 aa  117  4.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0121  peptidase C26  44.14 
 
 
407 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.808568 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2408  endoribonuclease L-PSP  42.67 
 
 
155 aa  115  3e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.628638  normal  0.167618 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0200  endoribonuclease L-PSP  42.57 
 
 
153 aa  114  5e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.151399  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3735  endoribonuclease L-PSP  36.6 
 
 
170 aa  113  7.999999999999999e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0323381  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13709  hypothetical protein  42.95 
 
 
151 aa  114  7.999999999999999e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0525391 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1122  hypothetical protein  39.19 
 
 
154 aa  113  8.999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.457332  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1165  hypothetical protein  39.19 
 
 
154 aa  113  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3580  endoribonuclease L-PSP  39.6 
 
 
153 aa  113  1.0000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.45612  normal  0.209775 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2448  endoribonuclease L-PSP  43.33 
 
 
155 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.514496  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1092  endoribonuclease L-PSP  36.91 
 
 
151 aa  112  1.0000000000000001e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0332  endoribonuclease L-PSP  47.97 
 
 
163 aa  112  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0921694 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2027  endoribonuclease L-PSP  39.19 
 
 
154 aa  112  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0633724  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3105  endoribonuclease L-PSP  47.3 
 
 
155 aa  112  3e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.473778  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3043  endoribonuclease L-PSP  42 
 
 
155 aa  112  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.574471 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6138  endoribonuclease L-PSP  41.1 
 
 
153 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1530  endoribonuclease L-PSP  41.56 
 
 
160 aa  111  4.0000000000000004e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2153  endoribonuclease L-PSP, putative  38.93 
 
 
152 aa  111  5e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2457  endoribonuclease L-PSP  40.82 
 
 
153 aa  110  5e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6055  Endoribonuclease L-PSP  37.09 
 
 
162 aa  111  5e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.316335  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6426  endoribonuclease L-PSP  41.1 
 
 
153 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.576265 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1427  endoribonuclease L-PSP  41.33 
 
 
155 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.426351 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3546  Endoribonuclease L-PSP  40.94 
 
 
155 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0713  Endoribonuclease L-PSP  43.84 
 
 
152 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1062  Endoribonuclease L-PSP  44.22 
 
 
151 aa  107  5e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3039  Endoribonuclease L-PSP  43.42 
 
 
157 aa  107  5e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36190  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  47.95 
 
 
151 aa  107  6e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0168  endoribonuclease L-PSP  41.55 
 
 
153 aa  107  8.000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0434  Endoribonuclease L-PSP  45.27 
 
 
155 aa  107  8.000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.51654 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4282  endoribonuclease L-PSP  45.7 
 
 
154 aa  107  9.000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.667627  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0986  hypothetical protein  40.27 
 
 
156 aa  106  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0698758  normal  0.152684 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1636  endoribonuclease L-PSP  37.84 
 
 
154 aa  106  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.564581 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1613  endoribonuclease L-PSP  37.84 
 
 
154 aa  106  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.578745  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26250  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  47.3 
 
 
167 aa  105  2e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.738846  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3178  Endoribonuclease L-PSP  36.2 
 
 
177 aa  105  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.738101 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1212  Endoribonuclease L-PSP  38.1 
 
 
154 aa  105  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0336  endoribonuclease L-PSP  41.89 
 
 
154 aa  105  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8908  Endoribonuclease L-PSP  43.92 
 
 
152 aa  105  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.974502 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2118  endoribonuclease L-PSP  39.46 
 
 
154 aa  105  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124484  normal  0.0891562 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1232  Endoribonuclease L-PSP  36.54 
 
 
158 aa  105  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.118395 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0241  Endoribonuclease L-PSP  46.58 
 
 
152 aa  105  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.206377  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0465  hypothetical protein  44.3 
 
 
152 aa  104  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.346493 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5091  hypothetical protein  36.73 
 
 
163 aa  105  4e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3313  endoribonuclease L-PSP  38.82 
 
 
155 aa  104  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129795  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1285  Endoribonuclease L-PSP  43.75 
 
 
156 aa  104  6e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.770765 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1554  Endoribonuclease L-PSP  36.91 
 
 
168 aa  104  6e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.30004 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4883  endoribonuclease L-PSP  35.57 
 
 
157 aa  103  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000371063  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5691  endoribonuclease L-PSP  38.36 
 
 
152 aa  103  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2609  endoribonuclease L-PSP  38.93 
 
 
152 aa  103  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.56142 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0515  Endoribonuclease L-PSP  45.75 
 
 
157 aa  103  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1258  endoribonuclease L-PSP  38.67 
 
 
156 aa  102  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1470  endoribonuclease L-PSP  42.95 
 
 
157 aa  102  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2803  endoribonuclease L-PSP  39.22 
 
 
155 aa  102  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.117143  normal  0.432336 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3144  endoribonuclease L-PSP  39.86 
 
 
152 aa  102  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.147772 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1346  endoribonuclease L-PSP  38.78 
 
 
152 aa  102  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00288796  normal  0.104373 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0927  endoribonuclease L-PSP  37.67 
 
 
152 aa  102  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.553211 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5312  Endoribonuclease L-PSP  41.89 
 
 
153 aa  102  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.688432 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2030  Endoribonuclease L-PSP  33.11 
 
 
156 aa  102  3e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00146961  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1504  endoribonuclease L-PSP  41.18 
 
 
155 aa  102  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.910903  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2450  peptidase C26  37.66 
 
 
409 aa  101  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210353  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0668  endoribonuclease L-PSP  36.24 
 
 
155 aa  101  5e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2373  endoribonuclease L-PSP  37.67 
 
 
152 aa  100  6e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2706  Endoribonuclease L-PSP  34.69 
 
 
153 aa  100  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.253512  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1740  endoribonuclease L-PSP  36.99 
 
 
152 aa  100  7e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2388  endoribonuclease L-PSP  36.99 
 
 
152 aa  100  7e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.921996  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2352  endoribonuclease L-PSP  36.99 
 
 
152 aa  100  7e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2270  endoribonuclease L-PSP  36.99 
 
 
152 aa  100  7e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.724419  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1008  Endoribonuclease L-PSP  42.86 
 
 
162 aa  100  9e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1369  endoribonuclease L-PSP  40.79 
 
 
153 aa  100  9e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.324136 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7001  Endoribonuclease L-PSP  36.24 
 
 
153 aa  100  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.29749  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1252  endoribonuclease L-PSP  41.1 
 
 
156 aa  100  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.476616  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2736  endoribonuclease L-PSP  42.86 
 
 
146 aa  100  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.947  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1018  endoribonuclease L-PSP  40.27 
 
 
152 aa  100  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.386479  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1113  Endoribonuclease L-PSP  37.16 
 
 
155 aa  99.8  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.85817  normal  0.626067 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0932  Endoribonuclease L-PSP  39.6 
 
 
152 aa  99.4  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.315119  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47655  predicted protein  35.33 
 
 
185 aa  99.4  2e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00618585  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37922  predicted protein  35.33 
 
 
185 aa  99.4  2e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00476754  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2555  hypothetical protein  38 
 
 
154 aa  99.8  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.853817 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1749  endoribonuclease L-PSP  40.74 
 
 
151 aa  98.6  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.470188  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1577  Endoribonuclease L-PSP  35.81 
 
 
156 aa  98.6  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.401191  normal  0.481334 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0960  hypothetical protein  41.22 
 
 
162 aa  98.2  4e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.304597  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2908  Endoribonuclease L-PSP  35 
 
 
164 aa  98.2  4e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1498  Endoribonuclease L-PSP  37.33 
 
 
160 aa  97.8  5e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1180  Endoribonuclease L-PSP  37.16 
 
 
153 aa  97.8  6e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4820  endoribonuclease L-PSP  43.07 
 
 
162 aa  97.4  6e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5207  endoribonuclease L-PSP  43.07 
 
 
162 aa  97.4  6e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000695376 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4906  endoribonuclease L-PSP  43.07 
 
 
162 aa  97.4  6e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.374579 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>