239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5536 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5536  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 156 aa  303  6e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.044824 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6842  Endoribonuclease L-PSP  77.27 
 
 		 168 aa  236  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.173433 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2699  Endoribonuclease L-PSP  63.33 
 
 		 162 aa  181  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.396345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0841  endoribonuclease L-PSP  50.68 
 
 		 164 aa  158  3e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2368  Endoribonuclease L-PSP  59.73 
 
 		 162 aa  151  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0738806 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1944  Endoribonuclease L-PSP  44.08 
 
 		 153 aa  124  7e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1645  Endoribonuclease L-PSP  34.67 
 
 		 156 aa  117  6e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.827325 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3343  Endoribonuclease L-PSP  38.41 
 
 		 152 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0721684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4853  Endoribonuclease L-PSP  39.6 
 
 		 154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1379  endoribonuclease L-PSP  37.33 
 
 		 158 aa  111  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3735  endoribonuclease L-PSP  35.33 
 
 		 170 aa  111  4.0000000000000004e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0323381  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1749  endoribonuclease L-PSP  45.19 
 
 		 151 aa  111  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.470188  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0121  peptidase C26  41.26 
 
 		 407 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.808568 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2027  endoribonuclease L-PSP  37.66 
 
 		 154 aa  107  6e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0633724  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1165  hypothetical protein  38.31 
 
 		 154 aa  107  7.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1705  Endoribonuclease L-PSP  38.36 
 
 		 156 aa  106  1e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.182301  hitchhiker  0.0000000000000067862 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0581  endoribonuclease L-PSP  34.42 
 
 		 154 aa  106  1e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0481259  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3105  endoribonuclease L-PSP  44.59 
 
 		 155 aa  105  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.473778  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1122  hypothetical protein  37.66 
 
 		 154 aa  105  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.457332  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3580  endoribonuclease L-PSP  37.84 
 
 		 153 aa  105  3e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.45612  normal  0.209775 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6426  endoribonuclease L-PSP  38.1 
 
 		 153 aa  103  6e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.576265 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2153  endoribonuclease L-PSP, putative  33.78 
 
 		 152 aa  103  7e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4883  endoribonuclease L-PSP  39.01 
 
 		 157 aa  102  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000371063  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1113  Endoribonuclease L-PSP  37.42 
 
 		 155 aa  102  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.85817  normal  0.626067 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6138  endoribonuclease L-PSP  37.41 
 
 		 153 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37922  predicted protein  36 
 
 		 185 aa  102  3e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00476754  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47655  predicted protein  36 
 
 		 185 aa  102  3e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00618585  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1092  endoribonuclease L-PSP  33.11 
 
 		 151 aa  100  7e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0986  hypothetical protein  36.67 
 
 		 156 aa  100  8e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0698758  normal  0.152684 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2457  endoribonuclease L-PSP  37.91 
 
 		 153 aa  99.4  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3462  endoribonuclease L-PSP  40.85 
 
 		 159 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0120904 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0168  endoribonuclease L-PSP  38.46 
 
 		 153 aa  98.6  3e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6055  Endoribonuclease L-PSP  33.55 
 
 		 162 aa  98.6  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.316335  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4751  putative endoribonuclease L-PSP (protein synthesis inhibitor)  37.33 
 
 		 155 aa  97.8  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.708532  normal  0.751414 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1180  Endoribonuclease L-PSP  34.9 
 
 		 153 aa  97.8  5e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0814  hypothetical protein  38.51 
 
 		 170 aa  97.1  8e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.565462  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1470  endoribonuclease L-PSP  41.94 
 
 		 157 aa  96.3  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1232  Endoribonuclease L-PSP  35.1 
 
 		 158 aa  96.7  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.118395 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3793  endoribonuclease L-PSP  31.76 
 
 		 154 aa  95.5  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.756407 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1062  Endoribonuclease L-PSP  39.19 
 
 		 151 aa  95.5  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1504  endoribonuclease L-PSP  38.67 
 
 		 155 aa  94.4  5e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.910903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2408  endoribonuclease L-PSP  35.33 
 
 		 155 aa  94.4  5e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.628638  normal  0.167618 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1636  endoribonuclease L-PSP  37.04 
 
 		 154 aa  94  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.564581 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3144  endoribonuclease L-PSP  35.14 
 
 		 152 aa  94  7e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.147772 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3313  endoribonuclease L-PSP  35.29 
 
 		 155 aa  94  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1613  endoribonuclease L-PSP  37.04 
 
 		 154 aa  94  7e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.578745  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3891  putative endoribonuclease L-PSP  41.13 
 
 		 152 aa  94  8e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0241  Endoribonuclease L-PSP  43.84 
 
 		 152 aa  93.6  9e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.206377  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0332  endoribonuclease L-PSP  43.54 
 
 		 163 aa  93.2  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0921694 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2908  Endoribonuclease L-PSP  36.73 
 
 		 164 aa  93.2  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3043  endoribonuclease L-PSP  34.67 
 
 		 155 aa  93.2  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.574471 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1123  endoribonuclease L-PSP  36.67 
 
 		 155 aa  93.6  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.321047  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1774  Endoribonuclease L-PSP  36.67 
 
 		 156 aa  93.2  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.98491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1530  endoribonuclease L-PSP  35.95 
 
 		 160 aa  93.6  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3546  Endoribonuclease L-PSP  34.67 
 
 		 155 aa  93.6  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0200  endoribonuclease L-PSP  36.49 
 
 		 153 aa  92.8  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.151399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2118  endoribonuclease L-PSP  36.3 
 
 		 154 aa  92.4  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124484  normal  0.0891562 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5125  endoribonuclease L-PSP  38.52 
 
 		 154 aa  92.8  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2609  endoribonuclease L-PSP  35.76 
 
 		 152 aa  92.8  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.56142 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2450  peptidase C26  37.76 
 
 		 409 aa  92  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5091  hypothetical protein  33.33 
 
 		 163 aa  91.3  5e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2706  Endoribonuclease L-PSP  36.73 
 
 		 153 aa  90.5  7e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.253512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1577  Endoribonuclease L-PSP  36.24 
 
 		 156 aa  90.5  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.401191  normal  0.481334 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7001  Endoribonuclease L-PSP  37.32 
 
 		 153 aa  90.1  9e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.29749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1346  endoribonuclease L-PSP  35.66 
 
 		 152 aa  90.1  9e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00288796  normal  0.104373 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0713  Endoribonuclease L-PSP  36 
 
 		 152 aa  89.7  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2803  endoribonuclease L-PSP  34.21 
 
 		 155 aa  90.1  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.117143  normal  0.432336 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1427  endoribonuclease L-PSP  32.68 
 
 		 155 aa  89.4  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.426351 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5691  endoribonuclease L-PSP  35.25 
 
 		 152 aa  89.4  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4282  endoribonuclease L-PSP  43.84 
 
 		 154 aa  89.4  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.667627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2665  endoribonuclease L-PSP  37.01 
 
 		 158 aa  89.4  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0119908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5081  endoribonuclease L-PSP  37.06 
 
 		 152 aa  89.4  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0190721 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13709  hypothetical protein  35.76 
 
 		 151 aa  89.4  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0525391 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0938  Endoribonuclease L-PSP  34.38 
 
 		 152 aa  88.6  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1272  endoribonuclease L-PSP  36 
 
 		 153 aa  88.6  3e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.103554  hitchhiker  0.00713107 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1258  endoribonuclease L-PSP  37.66 
 
 		 156 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1018  endoribonuclease L-PSP  35.14 
 
 		 152 aa  88.2  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.386479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1477  endoribonuclease L-PSP  34.46 
 
 		 174 aa  87.8  5e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0927  endoribonuclease L-PSP  34.53 
 
 		 152 aa  87.4  6e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.553211 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0950  L-PSP family endoribonuclease  31.97 
 
 		 164 aa  87.4  6e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.449669  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0932  Endoribonuclease L-PSP  34.46 
 
 		 152 aa  87.4  7e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.315119  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1498  Endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 160 aa  87.4  7e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2373  endoribonuclease L-PSP  35.25 
 
 		 152 aa  87.4  7e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1212  Endoribonuclease L-PSP  32.88 
 
 		 154 aa  87.4  7e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2270  endoribonuclease L-PSP  34.53 
 
 		 152 aa  87  9e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.724419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1740  endoribonuclease L-PSP  34.53 
 
 		 152 aa  87  9e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2388  endoribonuclease L-PSP  34.53 
 
 		 152 aa  87  9e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.921996  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2352  endoribonuclease L-PSP  34.53 
 
 		 152 aa  87  9e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0336  endoribonuclease L-PSP  38.41 
 
 		 154 aa  87  9e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0668  endoribonuclease L-PSP  35.46 
 
 		 155 aa  87  9e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2030  Endoribonuclease L-PSP  30.82 
 
 		 156 aa  86.3  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00146961  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1554  Endoribonuclease L-PSP  32.21 
 
 		 168 aa  86.7  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.30004 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0434  Endoribonuclease L-PSP  37.33 
 
 		 155 aa  85.5  2e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.51654 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1204  endoribonuclease L-PSP  34.75 
 
 		 156 aa  85.9  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.375276 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3039  Endoribonuclease L-PSP  37.25 
 
 		 157 aa  85.9  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1008  Endoribonuclease L-PSP  35.48 
 
 		 162 aa  85.1  3e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0402  endoribonuclease L-PSP  33.11 
 
 		 152 aa  85.1  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0666223 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5312  Endoribonuclease L-PSP  35.14 
 
 		 153 aa  85.1  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.688432 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5670  endoribonuclease L-PSP  34.09 
 
 		 162 aa  84.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6034  endoribonuclease L-PSP  34.09 
 
 		 162 aa  84.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.641404 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>