202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_5670 on replicon NC_008062
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008062  Bcen_5670  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 162 aa  322  9e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6034  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 162 aa  322  9e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6524  endoribonuclease L-PSP  98.77 
 
 		 162 aa  319  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.372376 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7448  endoribonuclease L-PSP  87.26 
 
 		 162 aa  283  5e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5806  endoribonuclease L-PSP  55.26 
 
 		 156 aa  171  3.9999999999999995e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.295199 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2665  endoribonuclease L-PSP  52.98 
 
 		 158 aa  156  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0119908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0287  endoribonuclease L-PSP  46.98 
 
 		 162 aa  140  6e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2788  Endoribonuclease L-PSP  46.15 
 
 		 163 aa  136  8.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4643  endoribonuclease L-PSP  44.74 
 
 		 163 aa  134  5e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.183681  normal  0.137047 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5025  endoribonuclease L-PSP  39.47 
 
 		 177 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1801  hypothetical protein  42.48 
 
 		 168 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0113627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1944  Endoribonuclease L-PSP  39.87 
 
 		 153 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2111  endoribonuclease L-PSP  40.6 
 
 		 141 aa  102  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.459106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3343  Endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 152 aa  99  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0721684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1645  Endoribonuclease L-PSP  32.48 
 
 		 156 aa  96.3  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.827325 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4704  hypothetical protein  37.14 
 
 		 144 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.723705  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3735  endoribonuclease L-PSP  36.64 
 
 		 170 aa  95.9  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0323381  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6055  Endoribonuclease L-PSP  36.62 
 
 		 162 aa  95.5  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.316335  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1636  endoribonuclease L-PSP  41.13 
 
 		 154 aa  94.7  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.564581 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1613  endoribonuclease L-PSP  41.13 
 
 		 154 aa  94.7  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.578745  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0168  endoribonuclease L-PSP  37.67 
 
 		 153 aa  93.6  9e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1165  hypothetical protein  37.33 
 
 		 154 aa  93.2  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0841  endoribonuclease L-PSP  34.67 
 
 		 164 aa  93.2  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1122  hypothetical protein  37.33 
 
 		 154 aa  93.2  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.457332  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1180  Endoribonuclease L-PSP  41.94 
 
 		 153 aa  92.4  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0960  hypothetical protein  41.18 
 
 		 162 aa  92.8  2e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.304597  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2030  Endoribonuclease L-PSP  37.25 
 
 		 156 aa  92.4  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00146961  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0581  endoribonuclease L-PSP  37.59 
 
 		 154 aa  92.8  2e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0481259  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1470  endoribonuclease L-PSP  41.8 
 
 		 157 aa  92  3e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3793  endoribonuclease L-PSP  41.27 
 
 		 154 aa  91.7  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.756407 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53740  hypothetical protein  36.43 
 
 		 144 aa  91.3  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00018421  hitchhiker  0.00710422 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3105  endoribonuclease L-PSP  37.91 
 
 		 155 aa  90.5  8e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.473778  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4853  Endoribonuclease L-PSP  36.88 
 
 		 154 aa  90.5  8e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4883  endoribonuclease L-PSP  37.76 
 
 		 157 aa  90.5  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000371063  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4278  endoribonuclease L-PSP  41.03 
 
 		 165 aa  89.7  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.17728  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2027  endoribonuclease L-PSP  38 
 
 		 154 aa  90.1  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0633724  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0200  endoribonuclease L-PSP  36.55 
 
 		 153 aa  89.7  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.151399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1577  Endoribonuclease L-PSP  34.44 
 
 		 156 aa  87.8  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.401191  normal  0.481334 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2153  endoribonuclease L-PSP, putative  34.09 
 
 		 152 aa  87.8  6e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8908  Endoribonuclease L-PSP  39.29 
 
 		 152 aa  87  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.974502 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1774  Endoribonuclease L-PSP  35.1 
 
 		 156 aa  86.7  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.98491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2477  endoribonuclease L-PSP  35.03 
 
 		 153 aa  86.7  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.738257  normal  0.0496442 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0228  Endoribonuclease L-PSP  39.6 
 
 		 152 aa  86.3  1e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0435  endoribonuclease L-PSP  38.17 
 
 		 155 aa  85.5  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1379  endoribonuclease L-PSP  33.56 
 
 		 158 aa  86.3  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4348  endoribonuclease L-PSP  40.3 
 
 		 153 aa  85.9  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.917733 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2803  endoribonuclease L-PSP  34.97 
 
 		 155 aa  85.1  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.117143  normal  0.432336 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1258  endoribonuclease L-PSP  37.91 
 
 		 156 aa  85.1  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5536  endoribonuclease L-PSP  34.09 
 
 		 156 aa  84.7  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.044824 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3178  Endoribonuclease L-PSP  34.84 
 
 		 177 aa  84.7  5e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.738101 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1498  Endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 160 aa  84.7  5e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2531  hypothetical protein  34 
 
 		 156 aa  84.3  6e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0814  hypothetical protein  34.81 
 
 		 170 aa  83.2  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.565462  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5125  endoribonuclease L-PSP  38.03 
 
 		 154 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2457  endoribonuclease L-PSP  34.62 
 
 		 153 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3580  endoribonuclease L-PSP  37.88 
 
 		 153 aa  82.8  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.45612  normal  0.209775 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5312  Endoribonuclease L-PSP  35.17 
 
 		 153 aa  82.4  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.688432 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0434  Endoribonuclease L-PSP  36.77 
 
 		 155 aa  82  0.000000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.51654 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1123  endoribonuclease L-PSP  35.92 
 
 		 155 aa  82  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.321047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1252  endoribonuclease L-PSP  36.81 
 
 		 156 aa  81.6  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.476616  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0241  Endoribonuclease L-PSP  36.31 
 
 		 152 aa  81.6  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.206377  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0713  Endoribonuclease L-PSP  35.86 
 
 		 152 aa  81.3  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0114  hypothetical protein  35.82 
 
 		 155 aa  80.9  0.000000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6842  Endoribonuclease L-PSP  34.38 
 
 		 168 aa  80.5  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.173433 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13709  hypothetical protein  41.27 
 
 		 151 aa  80.5  0.000000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0525391 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0515  Endoribonuclease L-PSP  42.62 
 
 		 157 aa  80.5  0.000000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3462  endoribonuclease L-PSP  32.82 
 
 		 159 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0120904 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4789  endoribonuclease L-PSP  38.93 
 
 		 153 aa  80.1  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0118265 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4820  endoribonuclease L-PSP  37.31 
 
 		 162 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2373  endoribonuclease L-PSP  37.82 
 
 		 152 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4906  endoribonuclease L-PSP  37.31 
 
 		 162 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.374579 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0927  endoribonuclease L-PSP  36.97 
 
 		 152 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.553211 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5207  endoribonuclease L-PSP  37.31 
 
 		 162 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000695376 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1092  endoribonuclease L-PSP  30.77 
 
 		 151 aa  80.1  0.00000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4751  putative endoribonuclease L-PSP (protein synthesis inhibitor)  36.43 
 
 		 155 aa  80.1  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.708532  normal  0.751414 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26250  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  38.02 
 
 		 167 aa  80.1  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.738846  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2270  endoribonuclease L-PSP  36.97 
 
 		 152 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.724419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2951  Endoribonuclease L-PSP  41.38 
 
 		 165 aa  79.3  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.686705  normal  0.0892214 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1740  endoribonuclease L-PSP  36.97 
 
 		 152 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2388  endoribonuclease L-PSP  36.97 
 
 		 152 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.921996  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2352  endoribonuclease L-PSP  36.97 
 
 		 152 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0250  endoribonuclease L-PSP  35.67 
 
 		 152 aa  79  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2784  endoribonuclease L-PSP  38.66 
 
 		 155 aa  79.7  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0332  endoribonuclease L-PSP  36.88 
 
 		 163 aa  79  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0921694 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1272  endoribonuclease L-PSP  34.97 
 
 		 153 aa  78.6  0.00000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.103554  hitchhiker  0.00713107 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3039  Endoribonuclease L-PSP  37.16 
 
 		 157 aa  79  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0336  endoribonuclease L-PSP  40.34 
 
 		 154 aa  79  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0950  L-PSP family endoribonuclease  34.21 
 
 		 164 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.449669  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3934  Endoribonuclease L-PSP  39.31 
 
 		 156 aa  78.6  0.00000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5691  endoribonuclease L-PSP  36.13 
 
 		 152 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1404  Endoribonuclease L-PSP  40.71 
 
 		 161 aa  77.8  0.00000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1749  endoribonuclease L-PSP  37.8 
 
 		 151 aa  77.8  0.00000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.470188  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2699  Endoribonuclease L-PSP  32.81 
 
 		 162 aa  77.4  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.396345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2706  Endoribonuclease L-PSP  33.59 
 
 		 153 aa  77.4  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.253512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0499  Endoribonuclease L-PSP  37.82 
 
 		 162 aa  77.4  0.00000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.389355  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2118  endoribonuclease L-PSP  36.13 
 
 		 154 aa  77.4  0.00000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124484  normal  0.0891562 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0708  L-PSP family endoribonuclease  33.55 
 
 		 155 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2223  L-PSP family endoribonuclease  33.55 
 
 		 152 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1313  L-PSP family endoribonuclease  33.55 
 
 		 164 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.221061  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4282  endoribonuclease L-PSP  39.69 
 
 		 154 aa  76.6  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.667627  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>