199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4278 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4278  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 165 aa  319  8e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.17728  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3421  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 140 aa  112  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1749  endoribonuclease L-PSP  48.55 
 
 		 151 aa  110  8.000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.470188  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6524  endoribonuclease L-PSP  42.31 
 
 		 162 aa  107  6e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.372376 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7448  endoribonuclease L-PSP  42.28 
 
 		 162 aa  106  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1645  Endoribonuclease L-PSP  37.78 
 
 		 156 aa  105  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.827325 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5670  endoribonuclease L-PSP  41.03 
 
 		 162 aa  105  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6034  endoribonuclease L-PSP  41.03 
 
 		 162 aa  105  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1252  endoribonuclease L-PSP  47.89 
 
 		 156 aa  103  9e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.476616  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3343  Endoribonuclease L-PSP  41.79 
 
 		 152 aa  103  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0721684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2059  endoribonuclease L-PSP  47.37 
 
 		 140 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.398481  normal  0.153486 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3438  translation initiation inhibitor  46.67 
 
 		 141 aa  102  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1285  Endoribonuclease L-PSP  46.04 
 
 		 156 aa  100  7e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.770765 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3083  endoribonuclease L-PSP  45.93 
 
 		 141 aa  99  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.214935  normal  0.51996 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5536  endoribonuclease L-PSP  42.07 
 
 		 156 aa  96.3  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.044824 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1530  endoribonuclease L-PSP  41.91 
 
 		 160 aa  95.1  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1404  Endoribonuclease L-PSP  42.14 
 
 		 161 aa  94.7  5e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0960  hypothetical protein  43.88 
 
 		 162 aa  94.7  5e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.304597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0814  hypothetical protein  41.61 
 
 		 170 aa  93.2  1e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.565462  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2788  Endoribonuclease L-PSP  38.46 
 
 		 163 aa  93.2  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2699  Endoribonuclease L-PSP  39.38 
 
 		 162 aa  92  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.396345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4643  endoribonuclease L-PSP  38.76 
 
 		 163 aa  92  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.183681  normal  0.137047 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1092  endoribonuclease L-PSP  34.33 
 
 		 151 aa  92  3e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1801  hypothetical protein  38.31 
 
 		 168 aa  92  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0113627  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0200  endoribonuclease L-PSP  41.13 
 
 		 153 aa  90.9  8e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.151399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1944  Endoribonuclease L-PSP  39.71 
 
 		 153 aa  90.1  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5806  endoribonuclease L-PSP  38.93 
 
 		 156 aa  90.1  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.295199 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2450  peptidase C26  41.48 
 
 		 409 aa  90.5  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2111  endoribonuclease L-PSP  41.22 
 
 		 141 aa  89.7  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.459106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2665  endoribonuclease L-PSP  40.31 
 
 		 158 aa  89.7  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0119908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2368  Endoribonuclease L-PSP  40.62 
 
 		 162 aa  89  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0738806 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1008  Endoribonuclease L-PSP  43.8 
 
 		 162 aa  89  3e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1498  Endoribonuclease L-PSP  38.3 
 
 		 160 aa  89  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2706  Endoribonuclease L-PSP  37.24 
 
 		 153 aa  89  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.253512  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1165  hypothetical protein  39.85 
 
 		 154 aa  87.8  5e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3580  endoribonuclease L-PSP  37.31 
 
 		 153 aa  88.2  5e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.45612  normal  0.209775 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6842  Endoribonuclease L-PSP  39.26 
 
 		 168 aa  88.2  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.173433 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1122  hypothetical protein  39.85 
 
 		 154 aa  88.2  5e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.457332  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2153  endoribonuclease L-PSP, putative  34.13 
 
 		 152 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4704  hypothetical protein  40.6 
 
 		 144 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.723705  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6055  Endoribonuclease L-PSP  38.06 
 
 		 162 aa  85.9  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.316335  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3934  Endoribonuclease L-PSP  41.78 
 
 		 156 aa  86.3  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2457  endoribonuclease L-PSP  38.06 
 
 		 153 aa  85.5  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4853  Endoribonuclease L-PSP  40.71 
 
 		 154 aa  84.7  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1180  Endoribonuclease L-PSP  36.09 
 
 		 153 aa  84.3  6e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4282  endoribonuclease L-PSP  44.93 
 
 		 154 aa  84.3  6e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.667627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1204  endoribonuclease L-PSP  32.48 
 
 		 156 aa  84.7  6e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.375276 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2027  endoribonuclease L-PSP  38.35 
 
 		 154 aa  84.3  6e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0633724  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0841  endoribonuclease L-PSP  36.57 
 
 		 164 aa  84  9e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53740  hypothetical protein  40.6 
 
 		 144 aa  84  9e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00018421  hitchhiker  0.00710422 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0287  endoribonuclease L-PSP  37.59 
 
 		 162 aa  83.6  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0713  Endoribonuclease L-PSP  40.29 
 
 		 152 aa  83.6  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0434  Endoribonuclease L-PSP  42.38 
 
 		 155 aa  83.6  0.000000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.51654 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0515  Endoribonuclease L-PSP  44.44 
 
 		 157 aa  81.6  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1346  endoribonuclease L-PSP  36.5 
 
 		 152 aa  82  0.000000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00288796  normal  0.104373 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3735  endoribonuclease L-PSP  35.25 
 
 		 170 aa  82  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0323381  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0121  peptidase C26  35.56 
 
 		 407 aa  81.6  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.808568 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5025  endoribonuclease L-PSP  37.8 
 
 		 177 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1504  endoribonuclease L-PSP  37.32 
 
 		 155 aa  80.9  0.000000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.910903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0228  Endoribonuclease L-PSP  39.06 
 
 		 152 aa  80.5  0.00000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0932  Endoribonuclease L-PSP  35.71 
 
 		 152 aa  80.5  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.315119  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3039  Endoribonuclease L-PSP  41.26 
 
 		 157 aa  80.1  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2030  Endoribonuclease L-PSP  33.83 
 
 		 156 aa  79.7  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00146961  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1018  endoribonuclease L-PSP  35.71 
 
 		 152 aa  79.7  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.386479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1554  Endoribonuclease L-PSP  33.58 
 
 		 168 aa  80.1  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.30004 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0332  endoribonuclease L-PSP  42.96 
 
 		 163 aa  79.7  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0921694 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1792  endoribonuclease L-PSP  35.29 
 
 		 156 aa  79.7  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.282183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0336  endoribonuclease L-PSP  39.66 
 
 		 154 aa  79  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0402  endoribonuclease L-PSP  35.77 
 
 		 152 aa  79  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0666223 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5091  hypothetical protein  34.06 
 
 		 163 aa  78.6  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8908  Endoribonuclease L-PSP  39.71 
 
 		 152 aa  78.6  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.974502 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25430  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  41.78 
 
 		 157 aa  78.6  0.00000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18300  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  39.24 
 
 		 166 aa  78.2  0.00000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.614303  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1379  endoribonuclease L-PSP  34.59 
 
 		 158 aa  78.2  0.00000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1705  Endoribonuclease L-PSP  36.5 
 
 		 156 aa  78.2  0.00000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.182301  hitchhiker  0.0000000000000067862 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0581  endoribonuclease L-PSP  34.59 
 
 		 154 aa  77.8  0.00000000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0481259  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1113  Endoribonuclease L-PSP  35.34 
 
 		 155 aa  77.8  0.00000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.85817  normal  0.626067 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13709  hypothetical protein  38.81 
 
 		 151 aa  77.4  0.00000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0525391 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2506  endoribonuclease L-PSP  34.78 
 
 		 151 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.101057  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4820  endoribonuclease L-PSP  37.24 
 
 		 162 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4906  endoribonuclease L-PSP  37.24 
 
 		 162 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.374579 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1212  Endoribonuclease L-PSP  31.85 
 
 		 154 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3178  Endoribonuclease L-PSP  36.24 
 
 		 177 aa  77  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.738101 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5207  endoribonuclease L-PSP  37.24 
 
 		 162 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000695376 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0465  hypothetical protein  44.68 
 
 		 152 aa  77  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.346493 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4751  putative endoribonuclease L-PSP (protein synthesis inhibitor)  35.82 
 
 		 155 aa  77  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.708532  normal  0.751414 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36190  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  44.83 
 
 		 151 aa  76.3  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3333  hypothetical protein  33.87 
 
 		 154 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.440014  normal  0.330579 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3793  endoribonuclease L-PSP  32.86 
 
 		 154 aa  76.6  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.756407 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0168  endoribonuclease L-PSP  35 
 
 		 153 aa  76.3  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5081  endoribonuclease L-PSP  34.78 
 
 		 152 aa  75.9  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0190721 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0950  L-PSP family endoribonuclease  31.58 
 
 		 164 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.449669  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6667  Endoribonuclease L-PSP  35.16 
 
 		 165 aa  75.5  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0416868  normal  0.0241604 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0241  Endoribonuclease L-PSP  42.61 
 
 		 152 aa  75.5  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.206377  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0927  endoribonuclease L-PSP  30.61 
 
 		 152 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.553211 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5691  endoribonuclease L-PSP  30.61 
 
 		 152 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2118  endoribonuclease L-PSP  32.59 
 
 		 154 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124484  normal  0.0891562 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1062  Endoribonuclease L-PSP  39.55 
 
 		 151 aa  75.1  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1313  L-PSP family endoribonuclease  30.92 
 
 		 164 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.221061  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1636  endoribonuclease L-PSP  34.51 
 
 		 154 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.564581 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>