202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3083 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3083  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 141 aa  275  1e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.214935  normal  0.51996 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3438  translation initiation inhibitor  97.87 
 
 		 141 aa  250  4.0000000000000004e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2059  endoribonuclease L-PSP  91.91 
 
 		 140 aa  229  1e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.398481  normal  0.153486 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3421  endoribonuclease L-PSP  74.82 
 
 		 140 aa  209  1e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0200  endoribonuclease L-PSP  40.91 
 
 		 153 aa  92.8  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.151399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1645  Endoribonuclease L-PSP  35.07 
 
 		 156 aa  92  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.827325 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1944  Endoribonuclease L-PSP  43.94 
 
 		 153 aa  90.9  5e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1252  endoribonuclease L-PSP  42.54 
 
 		 156 aa  90.5  6e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.476616  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4278  endoribonuclease L-PSP  45.93 
 
 		 165 aa  90.5  8e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.17728  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3343  Endoribonuclease L-PSP  36.57 
 
 		 152 aa  85.1  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0721684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1530  endoribonuclease L-PSP  39.69 
 
 		 160 aa  84.3  6e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1122  hypothetical protein  38.64 
 
 		 154 aa  84  6e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.457332  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1165  hypothetical protein  38.64 
 
 		 154 aa  83.6  9e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1379  endoribonuclease L-PSP  37.88 
 
 		 158 aa  83.6  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2665  endoribonuclease L-PSP  39.53 
 
 		 158 aa  82.4  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0119908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4853  Endoribonuclease L-PSP  38.64 
 
 		 154 aa  82  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6842  Endoribonuclease L-PSP  35.82 
 
 		 168 aa  82  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.173433 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2027  endoribonuclease L-PSP  41.35 
 
 		 154 aa  81.6  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0633724  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0814  hypothetical protein  36.09 
 
 		 170 aa  81.3  0.000000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.565462  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1285  Endoribonuclease L-PSP  39.42 
 
 		 156 aa  80.5  0.000000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.770765 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3039  Endoribonuclease L-PSP  37.88 
 
 		 157 aa  78.6  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2111  endoribonuclease L-PSP  34.75 
 
 		 141 aa  79.3  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.459106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13709  hypothetical protein  37.12 
 
 		 151 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0525391 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6055  Endoribonuclease L-PSP  35.34 
 
 		 162 aa  78.6  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.316335  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1062  Endoribonuclease L-PSP  41.67 
 
 		 151 aa  78.2  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1008  Endoribonuclease L-PSP  39.57 
 
 		 162 aa  77.8  0.00000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5536  endoribonuclease L-PSP  35.07 
 
 		 156 aa  78.2  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.044824 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2788  Endoribonuclease L-PSP  38.1 
 
 		 163 aa  77  0.00000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1498  Endoribonuclease L-PSP  38.93 
 
 		 160 aa  76.6  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0465  hypothetical protein  40.91 
 
 		 152 aa  76.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.346493 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3934  Endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 156 aa  75.9  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0960  hypothetical protein  40.16 
 
 		 162 aa  75.5  0.0000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.304597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2111  Endoribonuclease L-PSP  38.24 
 
 		 163 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1092  endoribonuclease L-PSP  33.58 
 
 		 151 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4704  hypothetical protein  39.23 
 
 		 144 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.723705  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3178  Endoribonuclease L-PSP  35.97 
 
 		 177 aa  74.3  0.0000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.738101 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2450  peptidase C26  37.88 
 
 		 409 aa  73.6  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1749  endoribonuclease L-PSP  36.84 
 
 		 151 aa  73.6  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.470188  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3462  endoribonuclease L-PSP  34.33 
 
 		 159 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0120904 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1369  endoribonuclease L-PSP  38.64 
 
 		 153 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.324136 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4643  endoribonuclease L-PSP  34.62 
 
 		 163 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.183681  normal  0.137047 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53740  hypothetical protein  39.23 
 
 		 144 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00018421  hitchhiker  0.00710422 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0228  Endoribonuclease L-PSP  39.52 
 
 		 152 aa  72  0.000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0713  Endoribonuclease L-PSP  37.78 
 
 		 152 aa  71.2  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7448  endoribonuclease L-PSP  35.43 
 
 		 162 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5312  Endoribonuclease L-PSP  37.12 
 
 		 153 aa  70.5  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.688432 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4820  endoribonuclease L-PSP  37.4 
 
 		 162 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4906  endoribonuclease L-PSP  37.4 
 
 		 162 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.374579 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8908  Endoribonuclease L-PSP  39.1 
 
 		 152 aa  70.5  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.974502 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36190  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  40.65 
 
 		 151 aa  70.5  0.000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5207  endoribonuclease L-PSP  37.4 
 
 		 162 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000695376 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18300  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  38.64 
 
 		 166 aa  70.5  0.000000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.614303  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0332  endoribonuclease L-PSP  39.55 
 
 		 163 aa  70.5  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0921694 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26250  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  38.66 
 
 		 167 aa  70.1  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.738846  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5091  hypothetical protein  34.07 
 
 		 163 aa  69.7  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0336  endoribonuclease L-PSP  35.77 
 
 		 154 aa  70.1  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2531  hypothetical protein  36.64 
 
 		 156 aa  69.7  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1404  Endoribonuclease L-PSP  38.06 
 
 		 161 aa  70.1  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2457  endoribonuclease L-PSP  34.59 
 
 		 153 aa  69.3  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4282  endoribonuclease L-PSP  39.42 
 
 		 154 aa  68.9  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.667627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0241  Endoribonuclease L-PSP  38.21 
 
 		 152 aa  69.3  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.206377  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3397  endoribonuclease L-PSP  35.66 
 
 		 189 aa  68.9  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1801  hypothetical protein  40.16 
 
 		 168 aa  69.3  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0113627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1123  endoribonuclease L-PSP  34.33 
 
 		 155 aa  68.9  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.321047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6524  endoribonuclease L-PSP  34.65 
 
 		 162 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.372376 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0841  endoribonuclease L-PSP  35.07 
 
 		 164 aa  68.6  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5125  endoribonuclease L-PSP  35.82 
 
 		 154 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5806  endoribonuclease L-PSP  35.38 
 
 		 156 aa  67.8  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.295199 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2368  Endoribonuclease L-PSP  36.92 
 
 		 162 aa  67.8  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0738806 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3793  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 154 aa  67.8  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.756407 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5670  endoribonuclease L-PSP  34.65 
 
 		 162 aa  67  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6034  endoribonuclease L-PSP  34.65 
 
 		 162 aa  67  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3096  Endoribonuclease L-PSP  38.52 
 
 		 168 aa  67  0.00000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000584514 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2153  endoribonuclease L-PSP, putative  29.23 
 
 		 152 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2699  Endoribonuclease L-PSP  36.57 
 
 		 162 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.396345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5437  endoribonuclease L-PSP  37.4 
 
 		 152 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491285 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2030  Endoribonuclease L-PSP  32.09 
 
 		 156 aa  65.1  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00146961  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0114  hypothetical protein  34.96 
 
 		 155 aa  64.7  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1705  Endoribonuclease L-PSP  33.81 
 
 		 156 aa  64.7  0.0000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.182301  hitchhiker  0.0000000000000067862 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0499  Endoribonuclease L-PSP  38.69 
 
 		 162 aa  64.7  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.389355  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1554  Endoribonuclease L-PSP  30.22 
 
 		 168 aa  64.7  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.30004 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4348  endoribonuclease L-PSP  37.4 
 
 		 153 aa  64.7  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.917733 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1180  Endoribonuclease L-PSP  32.58 
 
 		 153 aa  64.3  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0515  Endoribonuclease L-PSP  37.82 
 
 		 157 aa  64.3  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2706  Endoribonuclease L-PSP  34.81 
 
 		 153 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.253512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2518  Endoribonuclease L-PSP  38.06 
 
 		 151 aa  63.5  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0151498  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0287  endoribonuclease L-PSP  34.88 
 
 		 162 aa  63.5  0.0000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1470  endoribonuclease L-PSP  35.77 
 
 		 157 aa  63.5  0.0000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4789  endoribonuclease L-PSP  35.77 
 
 		 153 aa  63.2  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0118265 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1999  endoribonuclease L-PSP  38.58 
 
 		 161 aa  62.8  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0434  Endoribonuclease L-PSP  37.21 
 
 		 155 aa  62.8  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.51654 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3580  endoribonuclease L-PSP  29.01 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.45612  normal  0.209775 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6426  endoribonuclease L-PSP  35.25 
 
 		 153 aa  62  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.576265 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0121  peptidase C26  34.85 
 
 		 407 aa  61.6  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.808568 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6138  endoribonuclease L-PSP  32.86 
 
 		 153 aa  62  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2988  endoribonuclease L-PSP  31.78 
 
 		 164 aa  61.6  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2803  endoribonuclease L-PSP  32.33 
 
 		 155 aa  61.6  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.117143  normal  0.432336 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0581  endoribonuclease L-PSP  31.01 
 
 		 154 aa  61.2  0.000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0481259  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5025  endoribonuclease L-PSP  29.23 
 
 		 177 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2951  Endoribonuclease L-PSP  35 
 
 		 165 aa  60.8  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.686705  normal  0.0892214 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>