208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5806 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5806  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 156 aa  305  1.0000000000000001e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.295199 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2665  endoribonuclease L-PSP  62.67 
 
 		 158 aa  186  1e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0119908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7448  endoribonuclease L-PSP  57.89 
 
 		 162 aa  177  4e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4643  endoribonuclease L-PSP  53.55 
 
 		 163 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.183681  normal  0.137047 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0287  endoribonuclease L-PSP  58.67 
 
 		 162 aa  171  2.9999999999999996e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5670  endoribonuclease L-PSP  55.26 
 
 		 162 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6034  endoribonuclease L-PSP  55.26 
 
 		 162 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6524  endoribonuclease L-PSP  54.61 
 
 		 162 aa  168  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.372376 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2788  Endoribonuclease L-PSP  53.33 
 
 		 163 aa  161  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1801  hypothetical protein  50.33 
 
 		 168 aa  134  4e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0113627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5025  endoribonuclease L-PSP  45.16 
 
 		 177 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2111  endoribonuclease L-PSP  49.62 
 
 		 141 aa  122  3e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.459106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4704  hypothetical protein  47.76 
 
 		 144 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.723705  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3793  endoribonuclease L-PSP  44.06 
 
 		 154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.756407 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1944  Endoribonuclease L-PSP  46.88 
 
 		 153 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1645  Endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 156 aa  110  8.000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.827325 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0581  endoribonuclease L-PSP  40.31 
 
 		 154 aa  110  8.000000000000001e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0481259  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1470  endoribonuclease L-PSP  46.4 
 
 		 157 aa  109  1.0000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3343  Endoribonuclease L-PSP  42.19 
 
 		 152 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0721684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53740  hypothetical protein  46.27 
 
 		 144 aa  107  6e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00018421  hitchhiker  0.00710422 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4853  Endoribonuclease L-PSP  38.71 
 
 		 154 aa  105  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1092  endoribonuclease L-PSP  41.54 
 
 		 151 aa  105  3e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1123  endoribonuclease L-PSP  40.97 
 
 		 155 aa  102  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.321047  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1774  Endoribonuclease L-PSP  43.08 
 
 		 156 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.98491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1577  Endoribonuclease L-PSP  43.08 
 
 		 156 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.401191  normal  0.481334 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2027  endoribonuclease L-PSP  41.09 
 
 		 154 aa  102  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0633724  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1122  hypothetical protein  41.09 
 
 		 154 aa  102  3e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.457332  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1165  hypothetical protein  41.09 
 
 		 154 aa  101  5e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2030  Endoribonuclease L-PSP  41.46 
 
 		 156 aa  100  6e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00146961  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2531  hypothetical protein  43.85 
 
 		 156 aa  100  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4789  endoribonuclease L-PSP  42.31 
 
 		 153 aa  99.4  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0118265 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0114  hypothetical protein  40.28 
 
 		 155 aa  97.8  5e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0200  endoribonuclease L-PSP  42.19 
 
 		 153 aa  96.7  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.151399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13709  hypothetical protein  42.97 
 
 		 151 aa  96.7  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0525391 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5312  Endoribonuclease L-PSP  40.26 
 
 		 153 aa  96.3  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.688432 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4348  endoribonuclease L-PSP  40.6 
 
 		 153 aa  95.9  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.917733 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0332  endoribonuclease L-PSP  41.96 
 
 		 163 aa  94.7  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0921694 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0336  endoribonuclease L-PSP  42.15 
 
 		 154 aa  95.1  4e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4751  putative endoribonuclease L-PSP (protein synthesis inhibitor)  41.98 
 
 		 155 aa  94.7  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.708532  normal  0.751414 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0121  peptidase C26  40 
 
 		 407 aa  94  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.808568 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1379  endoribonuclease L-PSP  36.11 
 
 		 158 aa  94  8e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6055  Endoribonuclease L-PSP  35.29 
 
 		 162 aa  93.6  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.316335  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1272  endoribonuclease L-PSP  37.84 
 
 		 153 aa  93.6  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.103554  hitchhiker  0.00713107 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2457  endoribonuclease L-PSP  41.6 
 
 		 153 aa  92.4  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0841  endoribonuclease L-PSP  37.25 
 
 		 164 aa  92.8  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26250  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  43.44 
 
 		 167 aa  92.4  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.738846  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1498  Endoribonuclease L-PSP  36.03 
 
 		 160 aa  92  3e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2477  endoribonuclease L-PSP  39.69 
 
 		 153 aa  92  3e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.738257  normal  0.0496442 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1062  Endoribonuclease L-PSP  38.46 
 
 		 151 aa  91.3  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0499  Endoribonuclease L-PSP  38.99 
 
 		 162 aa  91.3  5e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.389355  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1252  endoribonuclease L-PSP  38.51 
 
 		 156 aa  91.3  5e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.476616  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3178  Endoribonuclease L-PSP  37.96 
 
 		 177 aa  91.3  5e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.738101 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2408  endoribonuclease L-PSP  42.4 
 
 		 155 aa  90.9  6e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.628638  normal  0.167618 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3735  endoribonuclease L-PSP  39.37 
 
 		 170 aa  90.9  6e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0323381  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0713  Endoribonuclease L-PSP  39.86 
 
 		 152 aa  90.1  9e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2111  Endoribonuclease L-PSP  41.98 
 
 		 163 aa  90.1  9e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3580  endoribonuclease L-PSP  37.69 
 
 		 153 aa  89.7  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.45612  normal  0.209775 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3105  endoribonuclease L-PSP  44.63 
 
 		 155 aa  90.1  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.473778  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1180  Endoribonuclease L-PSP  36.92 
 
 		 153 aa  89.7  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0515  Endoribonuclease L-PSP  42.14 
 
 		 157 aa  90.1  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4883  endoribonuclease L-PSP  41.22 
 
 		 157 aa  89  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000371063  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4820  endoribonuclease L-PSP  42.37 
 
 		 162 aa  89  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4906  endoribonuclease L-PSP  42.37 
 
 		 162 aa  89  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.374579 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5207  endoribonuclease L-PSP  42.37 
 
 		 162 aa  89  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000695376 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0241  Endoribonuclease L-PSP  41.46 
 
 		 152 aa  89.4  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.206377  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3144  endoribonuclease L-PSP  37.98 
 
 		 152 aa  88.6  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.147772 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2448  endoribonuclease L-PSP  43.31 
 
 		 155 aa  89  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.514496  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6138  endoribonuclease L-PSP  38.46 
 
 		 153 aa  88.6  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1554  Endoribonuclease L-PSP  34.35 
 
 		 168 aa  88.2  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.30004 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1427  endoribonuclease L-PSP  42.52 
 
 		 155 aa  87.8  5e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.426351 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3043  endoribonuclease L-PSP  41.6 
 
 		 155 aa  87.8  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.574471 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6426  endoribonuclease L-PSP  38.46 
 
 		 153 aa  87.8  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.576265 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0434  Endoribonuclease L-PSP  41.09 
 
 		 155 aa  87.8  5e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.51654 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2518  Endoribonuclease L-PSP  46.83 
 
 		 151 aa  87.4  7e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0151498  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0465  hypothetical protein  40.65 
 
 		 152 aa  87.4  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.346493 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1204  endoribonuclease L-PSP  34.11 
 
 		 156 aa  87  8e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.375276 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3546  Endoribonuclease L-PSP  41.6 
 
 		 155 aa  87  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0228  Endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 152 aa  86.3  1e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3039  Endoribonuclease L-PSP  39.39 
 
 		 157 aa  86.7  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8908  Endoribonuclease L-PSP  41.41 
 
 		 152 aa  85.9  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.974502 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2506  endoribonuclease L-PSP  35.2 
 
 		 151 aa  85.5  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.101057  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6667  Endoribonuclease L-PSP  35.71 
 
 		 165 aa  85.5  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0416868  normal  0.0241604 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2319  endoribonuclease L-PSP  38.35 
 
 		 157 aa  85.5  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0960  hypothetical protein  40.16 
 
 		 162 aa  85.1  3e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.304597  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6842  Endoribonuclease L-PSP  36.15 
 
 		 168 aa  85.5  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.173433 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0168  endoribonuclease L-PSP  38.4 
 
 		 153 aa  85.5  3e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5691  endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 152 aa  84.7  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1613  endoribonuclease L-PSP  36.77 
 
 		 154 aa  84.7  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.578745  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1636  endoribonuclease L-PSP  36.77 
 
 		 154 aa  84.7  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.564581 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5125  endoribonuclease L-PSP  36.13 
 
 		 154 aa  84.3  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2512  endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 150 aa  84.7  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.796499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5081  endoribonuclease L-PSP  37.21 
 
 		 152 aa  84.3  5e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0190721 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2609  endoribonuclease L-PSP  40.31 
 
 		 152 aa  84  7e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.56142 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2373  endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 152 aa  84  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1530  endoribonuclease L-PSP  37.98 
 
 		 160 aa  84  7e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3408  Endoribonuclease L-PSP  39.2 
 
 		 152 aa  84  8e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3891  putative endoribonuclease L-PSP  38.46 
 
 		 152 aa  83.6  8e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1740  endoribonuclease L-PSP  36.72 
 
 		 152 aa  84  8e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2388  endoribonuclease L-PSP  36.72 
 
 		 152 aa  84  8e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.921996  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2352  endoribonuclease L-PSP  36.72 
 
 		 152 aa  84  8e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>