207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2518 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2518  Endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 151 aa  291  2e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0151498  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3934  Endoribonuclease L-PSP  58.39 
 
 		 156 aa  156  1e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0200  endoribonuclease L-PSP  59.59 
 
 		 153 aa  155  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.151399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4820  endoribonuclease L-PSP  61.31 
 
 		 162 aa  153  6e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4906  endoribonuclease L-PSP  61.31 
 
 		 162 aa  153  6e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.374579 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5207  endoribonuclease L-PSP  61.31 
 
 		 162 aa  153  6e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000695376 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4348  endoribonuclease L-PSP  55.07 
 
 		 153 aa  153  8e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.917733 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4853  Endoribonuclease L-PSP  57.43 
 
 		 154 aa  152  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13709  hypothetical protein  57.64 
 
 		 151 aa  153  1e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0525391 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4789  endoribonuclease L-PSP  56.62 
 
 		 153 aa  152  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0118265 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0713  Endoribonuclease L-PSP  55.56 
 
 		 152 aa  151  4e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1661  Endoribonuclease L-PSP  54.79 
 
 		 162 aa  147  4e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.228688 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1369  endoribonuclease L-PSP  59.59 
 
 		 153 aa  145  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.324136 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5437  endoribonuclease L-PSP  61.31 
 
 		 152 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491285 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0336  endoribonuclease L-PSP  60.14 
 
 		 154 aa  144  3e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0332  endoribonuclease L-PSP  59.86 
 
 		 163 aa  144  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0921694 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8908  Endoribonuclease L-PSP  57.53 
 
 		 152 aa  142  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.974502 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3178  Endoribonuclease L-PSP  51.59 
 
 		 177 aa  141  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.738101 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2531  hypothetical protein  48 
 
 		 156 aa  140  5e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0515  Endoribonuclease L-PSP  61.98 
 
 		 157 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3343  Endoribonuclease L-PSP  48.3 
 
 		 152 aa  138  3e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0721684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1062  Endoribonuclease L-PSP  52.05 
 
 		 151 aa  137  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0241  Endoribonuclease L-PSP  59.59 
 
 		 152 aa  137  3.9999999999999997e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.206377  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1165  hypothetical protein  46 
 
 		 154 aa  134  4e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4282  endoribonuclease L-PSP  56.55 
 
 		 154 aa  134  4e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.667627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1122  hypothetical protein  46 
 
 		 154 aa  134  4e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.457332  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3039  Endoribonuclease L-PSP  53.69 
 
 		 157 aa  134  5e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36190  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  57.53 
 
 		 151 aa  133  7.000000000000001e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0499  Endoribonuclease L-PSP  58.94 
 
 		 162 aa  133  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.389355  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0114  hypothetical protein  58.39 
 
 		 155 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0465  hypothetical protein  55.48 
 
 		 152 aa  130  6.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.346493 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0434  Endoribonuclease L-PSP  57.05 
 
 		 155 aa  130  6.999999999999999e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.51654 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1577  Endoribonuclease L-PSP  43.42 
 
 		 156 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.401191  normal  0.481334 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26250  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  56.56 
 
 		 167 aa  128  3e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.738846  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1774  Endoribonuclease L-PSP  44.08 
 
 		 156 aa  128  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.98491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1944  Endoribonuclease L-PSP  48.68 
 
 		 153 aa  127  4.0000000000000003e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2030  Endoribonuclease L-PSP  45.64 
 
 		 156 aa  127  6e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00146961  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1123  endoribonuclease L-PSP  44.37 
 
 		 155 aa  127  7.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.321047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1645  Endoribonuclease L-PSP  41.22 
 
 		 156 aa  126  9.000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.827325 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5312  Endoribonuclease L-PSP  55.48 
 
 		 153 aa  125  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.688432 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3580  endoribonuclease L-PSP  47.97 
 
 		 153 aa  125  2.0000000000000002e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.45612  normal  0.209775 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18300  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  56.94 
 
 		 166 aa  125  2.0000000000000002e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.614303  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2027  endoribonuclease L-PSP  44 
 
 		 154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0633724  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3397  endoribonuclease L-PSP  51.57 
 
 		 189 aa  125  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3793  endoribonuclease L-PSP  46.9 
 
 		 154 aa  124  3e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.756407 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1113  Endoribonuclease L-PSP  48.98 
 
 		 155 aa  124  5e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.85817  normal  0.626067 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1252  endoribonuclease L-PSP  53.74 
 
 		 156 aa  124  5e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.476616  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3105  endoribonuclease L-PSP  52.48 
 
 		 155 aa  123  8.000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.473778  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6055  Endoribonuclease L-PSP  45.27 
 
 		 162 aa  122  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.316335  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25430  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  52.7 
 
 		 157 aa  121  3e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4751  putative endoribonuclease L-PSP (protein synthesis inhibitor)  46.26 
 
 		 155 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.708532  normal  0.751414 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1999  endoribonuclease L-PSP  54.93 
 
 		 161 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3144  endoribonuclease L-PSP  47.26 
 
 		 152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.147772 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1498  Endoribonuclease L-PSP  40.79 
 
 		 160 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1379  endoribonuclease L-PSP  40.4 
 
 		 158 aa  114  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2319  endoribonuclease L-PSP  49.34 
 
 		 157 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0168  endoribonuclease L-PSP  45.07 
 
 		 153 aa  114  3.9999999999999997e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1092  endoribonuclease L-PSP  39.19 
 
 		 151 aa  114  5e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0137  endoribonuclease L-PSP  45.07 
 
 		 155 aa  114  5e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0228  Endoribonuclease L-PSP  47.92 
 
 		 152 aa  113  8.999999999999998e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04880  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  53.15 
 
 		 159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.826759 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2803  endoribonuclease L-PSP  43.24 
 
 		 155 aa  111  4.0000000000000004e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.117143  normal  0.432336 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2118  endoribonuclease L-PSP  41.89 
 
 		 154 aa  110  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124484  normal  0.0891562 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6537  endoribonuclease L-PSP  47.68 
 
 		 157 aa  110  6e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.21507  normal  0.550061 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2153  endoribonuclease L-PSP, putative  38.78 
 
 		 152 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1427  endoribonuclease L-PSP  44.08 
 
 		 155 aa  110  8.000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.426351 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2223  L-PSP family endoribonuclease  40.67 
 
 		 152 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1313  L-PSP family endoribonuclease  40.67 
 
 		 164 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.221061  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0960  hypothetical protein  45.03 
 
 		 162 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.304597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0950  L-PSP family endoribonuclease  40 
 
 		 164 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.449669  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2408  endoribonuclease L-PSP  42.76 
 
 		 155 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.628638  normal  0.167618 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2450  peptidase C26  43.15 
 
 		 409 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0708  L-PSP family endoribonuclease  40.67 
 
 		 155 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2542  L-PSP family endoribonuclease  40.67 
 
 		 152 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.455947  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1153  putative endoribonuclease L-PSP  40.67 
 
 		 152 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1162  putative endoribonuclease L-PSP  40.67 
 
 		 152 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2072  putative endoribonuclease L-PSP  40.67 
 
 		 152 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.110705  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2111  endoribonuclease L-PSP  46.62 
 
 		 141 aa  109  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.459106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3735  endoribonuclease L-PSP  39.86 
 
 		 170 aa  109  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0323381  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2111  Endoribonuclease L-PSP  45.21 
 
 		 163 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2706  Endoribonuclease L-PSP  43.15 
 
 		 153 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.253512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1272  endoribonuclease L-PSP  46.31 
 
 		 153 aa  108  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.103554  hitchhiker  0.00713107 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1530  endoribonuclease L-PSP  41.33 
 
 		 160 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0121  peptidase C26  43.15 
 
 		 407 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.808568 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1346  endoribonuclease L-PSP  40.4 
 
 		 152 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00288796  normal  0.104373 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3546  Endoribonuclease L-PSP  43.42 
 
 		 155 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2270  endoribonuclease L-PSP  39.33 
 
 		 152 aa  108  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.724419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1740  endoribonuclease L-PSP  39.33 
 
 		 152 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2388  endoribonuclease L-PSP  39.33 
 
 		 152 aa  108  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.921996  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2352  endoribonuclease L-PSP  39.33 
 
 		 152 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1018  endoribonuclease L-PSP  40.4 
 
 		 152 aa  108  3e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.386479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2373  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 152 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1212  Endoribonuclease L-PSP  40.54 
 
 		 154 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0927  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 152 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.553211 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0581  endoribonuclease L-PSP  36.91 
 
 		 154 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0481259  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0426  Endoribonuclease L-PSP  50.71 
 
 		 158 aa  108  4.0000000000000004e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.235874 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2448  endoribonuclease L-PSP  44.3 
 
 		 155 aa  107  5e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.514496  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0932  Endoribonuclease L-PSP  39.74 
 
 		 152 aa  107  5e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.315119  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2457  endoribonuclease L-PSP  43.66 
 
 		 153 aa  107  6e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3162  endoribonuclease L-PSP  40.14 
 
 		 155 aa  107  6e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.567156  normal  0.207214 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>