234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1999 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_1999  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 
161 aa  310  7.999999999999999e-84  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0200  endoribonuclease L-PSP  70.32 
 
 
153 aa  205  2e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.151399  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3039  Endoribonuclease L-PSP  71.05 
 
 
157 aa  201  4e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4853  Endoribonuclease L-PSP  66.67 
 
 
154 aa  199  1.9999999999999998e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8908  Endoribonuclease L-PSP  72.9 
 
 
152 aa  197  7e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.974502 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3178  Endoribonuclease L-PSP  63.29 
 
 
177 aa  193  7e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.738101 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13709  hypothetical protein  68.67 
 
 
151 aa  191  5e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0525391 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5312  Endoribonuclease L-PSP  68.39 
 
 
153 aa  182  1.0000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.688432 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0465  hypothetical protein  71.05 
 
 
152 aa  182  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.346493 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3343  Endoribonuclease L-PSP  56.49 
 
 
152 aa  182  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0721684  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0114  hypothetical protein  68.46 
 
 
155 aa  181  5.0000000000000004e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0336  endoribonuclease L-PSP  66.67 
 
 
154 aa  180  9.000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4820  endoribonuclease L-PSP  66.9 
 
 
162 aa  176  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0713  Endoribonuclease L-PSP  61.29 
 
 
152 aa  176  1e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4906  endoribonuclease L-PSP  66.9 
 
 
162 aa  176  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.374579 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5207  endoribonuclease L-PSP  66.9 
 
 
162 aa  176  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000695376 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1645  Endoribonuclease L-PSP  50 
 
 
156 aa  174  4e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.827325 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0434  Endoribonuclease L-PSP  67.32 
 
 
155 aa  174  5e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.51654 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36190  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  72.85 
 
 
151 aa  174  6e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3397  endoribonuclease L-PSP  63.92 
 
 
189 aa  173  8e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0241  Endoribonuclease L-PSP  70.13 
 
 
152 aa  173  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.206377  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0499  Endoribonuclease L-PSP  66.67 
 
 
162 aa  172  1.9999999999999998e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.389355  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04880  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  69.5 
 
 
159 aa  168  4e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.826759 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3934  Endoribonuclease L-PSP  57.69 
 
 
156 aa  167  5e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1369  endoribonuclease L-PSP  64.33 
 
 
153 aa  167  7e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.324136 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4789  endoribonuclease L-PSP  61.81 
 
 
153 aa  165  2.9999999999999998e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0118265 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0515  Endoribonuclease L-PSP  69.03 
 
 
157 aa  163  6.9999999999999995e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4348  endoribonuclease L-PSP  60.42 
 
 
153 aa  163  9e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.917733 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18300  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  64.67 
 
 
166 aa  162  2.0000000000000002e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.614303  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1062  Endoribonuclease L-PSP  60.93 
 
 
151 aa  162  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1944  Endoribonuclease L-PSP  58.17 
 
 
153 aa  161  4.0000000000000004e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25430  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  61.04 
 
 
157 aa  161  4.0000000000000004e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0332  endoribonuclease L-PSP  60.51 
 
 
163 aa  158  3e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0921694 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0426  Endoribonuclease L-PSP  63.95 
 
 
158 aa  156  1e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.235874 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5437  endoribonuclease L-PSP  65.07 
 
 
152 aa  155  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.491285 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4282  endoribonuclease L-PSP  60.26 
 
 
154 aa  154  6e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.667627  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26250  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  63.49 
 
 
167 aa  151  2.9999999999999998e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.738846  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2027  endoribonuclease L-PSP  50.97 
 
 
154 aa  151  4e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0633724  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0581  endoribonuclease L-PSP  46.2 
 
 
154 aa  149  2e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0481259  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0607  Endoribonuclease L-PSP  66.45 
 
 
155 aa  148  3e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.322518  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1113  Endoribonuclease L-PSP  51.57 
 
 
155 aa  148  3e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.85817  normal  0.626067 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2531  hypothetical protein  50.97 
 
 
156 aa  145  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3793  endoribonuclease L-PSP  52.63 
 
 
154 aa  145  3e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.756407 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1122  hypothetical protein  50.32 
 
 
154 aa  144  4.0000000000000006e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.457332  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1165  hypothetical protein  50.32 
 
 
154 aa  144  6e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1252  endoribonuclease L-PSP  56.86 
 
 
156 aa  144  6e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.476616  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1470  endoribonuclease L-PSP  55.48 
 
 
157 aa  144  6e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2030  Endoribonuclease L-PSP  47.02 
 
 
156 aa  142  2e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00146961  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1123  endoribonuclease L-PSP  51.3 
 
 
155 aa  142  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.321047  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1498  Endoribonuclease L-PSP  47.68 
 
 
160 aa  141  3e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1530  endoribonuclease L-PSP  49.67 
 
 
160 aa  141  3e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3144  endoribonuclease L-PSP  51.61 
 
 
152 aa  141  4e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.147772 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1661  Endoribonuclease L-PSP  49.69 
 
 
162 aa  139  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.228688 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2457  endoribonuclease L-PSP  51.97 
 
 
153 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4751  putative endoribonuclease L-PSP (protein synthesis inhibitor)  49.04 
 
 
155 aa  138  3.9999999999999997e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.708532  normal  0.751414 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0950  L-PSP family endoribonuclease  50.66 
 
 
164 aa  137  6e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.449669  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0927  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 
152 aa  137  7e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.553211 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0814  hypothetical protein  47.5 
 
 
170 aa  136  8.999999999999999e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.565462  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5091  hypothetical protein  46.79 
 
 
163 aa  136  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2609  endoribonuclease L-PSP  52.6 
 
 
152 aa  136  1e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.56142 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2803  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 
155 aa  135  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.117143  normal  0.432336 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2408  endoribonuclease L-PSP  51.3 
 
 
155 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.628638  normal  0.167618 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2319  endoribonuclease L-PSP  52.2 
 
 
157 aa  135  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1313  L-PSP family endoribonuclease  49.34 
 
 
164 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.221061  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1204  endoribonuclease L-PSP  47.68 
 
 
156 aa  135  3.0000000000000003e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.375276 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2153  endoribonuclease L-PSP, putative  42.04 
 
 
152 aa  134  4e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1092  endoribonuclease L-PSP  43.51 
 
 
151 aa  134  4e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0708  L-PSP family endoribonuclease  49.34 
 
 
155 aa  134  4e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2373  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 
152 aa  134  5e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5691  endoribonuclease L-PSP  49.34 
 
 
152 aa  134  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2223  L-PSP family endoribonuclease  49.34 
 
 
152 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4070  endoribonuclease L-PSP  50.62 
 
 
162 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.256894  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2270  endoribonuclease L-PSP  49.34 
 
 
152 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.724419  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1740  endoribonuclease L-PSP  49.34 
 
 
152 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2388  endoribonuclease L-PSP  49.34 
 
 
152 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.921996  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2352  endoribonuclease L-PSP  49.34 
 
 
152 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2542  L-PSP family endoribonuclease  49.34 
 
 
152 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.455947  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1153  putative endoribonuclease L-PSP  49.34 
 
 
152 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1162  putative endoribonuclease L-PSP  49.34 
 
 
152 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2072  putative endoribonuclease L-PSP  49.34 
 
 
152 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.110705  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2448  endoribonuclease L-PSP  50.32 
 
 
155 aa  134  7.000000000000001e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.514496  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3580  endoribonuclease L-PSP  47.4 
 
 
153 aa  132  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.45612  normal  0.209775 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4551  Endoribonuclease L-PSP  51.25 
 
 
157 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1285  Endoribonuclease L-PSP  50.96 
 
 
156 aa  132  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.770765 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6055  Endoribonuclease L-PSP  47.17 
 
 
162 aa  132  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.316335  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1379  endoribonuclease L-PSP  44.52 
 
 
158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3735  endoribonuclease L-PSP  42.14 
 
 
170 aa  132  1.9999999999999998e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0323381  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4437  Endoribonuclease L-PSP  50.62 
 
 
157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.062411  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1577  Endoribonuclease L-PSP  46.1 
 
 
156 aa  132  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.401191  normal  0.481334 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3313  endoribonuclease L-PSP  49.37 
 
 
155 aa  131  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129795  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3105  endoribonuclease L-PSP  55.26 
 
 
155 aa  130  6.999999999999999e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.473778  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2118  endoribonuclease L-PSP  46.84 
 
 
154 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124484  normal  0.0891562 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3546  Endoribonuclease L-PSP  50 
 
 
155 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1504  endoribonuclease L-PSP  50.68 
 
 
155 aa  130  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.910903  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1427  endoribonuclease L-PSP  48.7 
 
 
155 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.426351 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3043  endoribonuclease L-PSP  48.7 
 
 
155 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.574471 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1272  endoribonuclease L-PSP  49.68 
 
 
153 aa  129  2.0000000000000002e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.103554  hitchhiker  0.00713107 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2518  Endoribonuclease L-PSP  58.55 
 
 
151 aa  128  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0151498  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1774  Endoribonuclease L-PSP  45.75 
 
 
156 aa  128  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.98491  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4883  endoribonuclease L-PSP  43.67 
 
 
157 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000371063  normal  0.434406 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>