291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0607 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0607  Endoribonuclease L-PSP  100 
 
 
155 aa  298  2e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.322518  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3039  Endoribonuclease L-PSP  65.1 
 
 
157 aa  187  5e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0200  endoribonuclease L-PSP  66.45 
 
 
153 aa  180  6e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.151399  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3178  Endoribonuclease L-PSP  59.87 
 
 
177 aa  180  8.000000000000001e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.738101 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04880  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  71.43 
 
 
159 aa  178  2e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.826759 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0465  hypothetical protein  68.18 
 
 
152 aa  172  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.346493 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4853  Endoribonuclease L-PSP  59.74 
 
 
154 aa  171  2.9999999999999996e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0336  endoribonuclease L-PSP  64.94 
 
 
154 aa  171  3.9999999999999995e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0332  endoribonuclease L-PSP  64.29 
 
 
163 aa  167  7e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0921694 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8908  Endoribonuclease L-PSP  63.82 
 
 
152 aa  166  8e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.974502 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13709  hypothetical protein  57.79 
 
 
151 aa  165  2e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0525391 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4789  endoribonuclease L-PSP  63.64 
 
 
153 aa  165  2.9999999999999998e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0118265 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3343  Endoribonuclease L-PSP  51.3 
 
 
152 aa  163  8e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0721684  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0713  Endoribonuclease L-PSP  58.82 
 
 
152 aa  162  1.0000000000000001e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5207  endoribonuclease L-PSP  64.08 
 
 
162 aa  162  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000695376 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4820  endoribonuclease L-PSP  64.08 
 
 
162 aa  162  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3397  endoribonuclease L-PSP  61.15 
 
 
189 aa  162  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4906  endoribonuclease L-PSP  64.08 
 
 
162 aa  162  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.374579 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0434  Endoribonuclease L-PSP  62.5 
 
 
155 aa  160  5.0000000000000005e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.51654 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1944  Endoribonuclease L-PSP  56.13 
 
 
153 aa  160  5.0000000000000005e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4348  endoribonuclease L-PSP  62.24 
 
 
153 aa  159  1e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.917733 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25430  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  63.27 
 
 
157 aa  159  2e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1369  endoribonuclease L-PSP  64 
 
 
153 aa  157  4e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.324136 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18300  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  62.42 
 
 
166 aa  155  1e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.614303  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1999  endoribonuclease L-PSP  66.9 
 
 
161 aa  156  1e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5312  Endoribonuclease L-PSP  60.13 
 
 
153 aa  155  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.688432 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0114  hypothetical protein  64.58 
 
 
155 aa  153  7e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3934  Endoribonuclease L-PSP  55.84 
 
 
156 aa  152  1e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4282  endoribonuclease L-PSP  63.09 
 
 
154 aa  152  2e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.667627  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0426  Endoribonuclease L-PSP  62.5 
 
 
158 aa  152  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.235874 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0241  Endoribonuclease L-PSP  64.29 
 
 
152 aa  151  2.9999999999999998e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.206377  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0499  Endoribonuclease L-PSP  60.26 
 
 
162 aa  149  1e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.389355  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1645  Endoribonuclease L-PSP  45.75 
 
 
156 aa  149  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.827325 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5437  endoribonuclease L-PSP  64.79 
 
 
152 aa  149  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.491285 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36190  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  60.65 
 
 
151 aa  148  3e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1252  endoribonuclease L-PSP  59.21 
 
 
156 aa  147  4e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.476616  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1062  Endoribonuclease L-PSP  54 
 
 
151 aa  142  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0515  Endoribonuclease L-PSP  62.42 
 
 
157 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26250  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  60.4 
 
 
167 aa  137  3.9999999999999997e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.738846  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2030  Endoribonuclease L-PSP  47.62 
 
 
156 aa  133  9e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00146961  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1092  endoribonuclease L-PSP  42 
 
 
151 aa  131  3.9999999999999996e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0960  hypothetical protein  49.33 
 
 
162 aa  130  6e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.304597  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3793  endoribonuclease L-PSP  46.31 
 
 
154 aa  127  5.0000000000000004e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.756407 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1470  endoribonuclease L-PSP  51.95 
 
 
157 aa  127  6e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1530  endoribonuclease L-PSP  44.67 
 
 
160 aa  127  6e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1636  endoribonuclease L-PSP  44.81 
 
 
154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.564581 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0814  hypothetical protein  45.45 
 
 
170 aa  125  3e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.565462  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1613  endoribonuclease L-PSP  44.81 
 
 
154 aa  124  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.578745  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1122  hypothetical protein  46.1 
 
 
154 aa  124  4.0000000000000003e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.457332  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1165  hypothetical protein  46.1 
 
 
154 aa  124  5e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2027  endoribonuclease L-PSP  45.45 
 
 
154 aa  124  6e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0633724  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2531  hypothetical protein  46.75 
 
 
156 aa  123  7e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2118  endoribonuclease L-PSP  46.98 
 
 
154 aa  123  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124484  normal  0.0891562 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1212  Endoribonuclease L-PSP  44.97 
 
 
154 aa  122  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1661  Endoribonuclease L-PSP  46.75 
 
 
162 aa  120  5e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.228688 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2803  endoribonuclease L-PSP  47.37 
 
 
155 aa  120  6e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.117143  normal  0.432336 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0228  Endoribonuclease L-PSP  44.16 
 
 
152 aa  120  6e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1123  endoribonuclease L-PSP  47.02 
 
 
155 aa  120  6e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.321047  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3096  Endoribonuclease L-PSP  64.1 
 
 
168 aa  120  9e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000584514 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5091  hypothetical protein  42.67 
 
 
163 aa  120  9e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6055  Endoribonuclease L-PSP  45.33 
 
 
162 aa  119  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.316335  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1504  endoribonuclease L-PSP  48.37 
 
 
155 aa  119  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.910903  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4883  endoribonuclease L-PSP  44.67 
 
 
157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000371063  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1577  Endoribonuclease L-PSP  44.44 
 
 
156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.401191  normal  0.481334 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0950  L-PSP family endoribonuclease  44.67 
 
 
164 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.449669  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1008  Endoribonuclease L-PSP  47.02 
 
 
162 aa  118  1.9999999999999998e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0581  endoribonuclease L-PSP  44.59 
 
 
154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0481259  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0168  endoribonuclease L-PSP  48 
 
 
153 aa  117  4.9999999999999996e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2319  endoribonuclease L-PSP  49.33 
 
 
157 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4751  putative endoribonuclease L-PSP (protein synthesis inhibitor)  46.1 
 
 
155 aa  117  7e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.708532  normal  0.751414 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2555  hypothetical protein  45.22 
 
 
154 aa  116  9e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.853817 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2153  endoribonuclease L-PSP, putative  39.87 
 
 
152 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1498  Endoribonuclease L-PSP  40.67 
 
 
160 aa  116  9.999999999999999e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2408  endoribonuclease L-PSP  46.05 
 
 
155 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.628638  normal  0.167618 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1774  Endoribonuclease L-PSP  45.03 
 
 
156 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.98491  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1113  Endoribonuclease L-PSP  46.1 
 
 
155 aa  116  9.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.85817  normal  0.626067 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1313  L-PSP family endoribonuclease  44.67 
 
 
164 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.221061  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2450  peptidase C26  43.24 
 
 
409 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210353  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2373  endoribonuclease L-PSP  43.71 
 
 
152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2223  L-PSP family endoribonuclease  44.67 
 
 
152 aa  114  3e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2072  putative endoribonuclease L-PSP  44.67 
 
 
152 aa  114  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.110705  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2270  endoribonuclease L-PSP  43.05 
 
 
152 aa  114  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.724419  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1740  endoribonuclease L-PSP  43.05 
 
 
152 aa  114  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2388  endoribonuclease L-PSP  43.05 
 
 
152 aa  114  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.921996  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2706  Endoribonuclease L-PSP  39.61 
 
 
153 aa  115  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.253512  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2352  endoribonuclease L-PSP  43.05 
 
 
152 aa  114  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1153  putative endoribonuclease L-PSP  44.67 
 
 
152 aa  114  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0708  L-PSP family endoribonuclease  44.67 
 
 
155 aa  115  3e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1162  putative endoribonuclease L-PSP  44.67 
 
 
152 aa  114  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2542  L-PSP family endoribonuclease  44.67 
 
 
152 aa  114  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.455947  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0927  endoribonuclease L-PSP  42.38 
 
 
152 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.553211 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2518  Endoribonuclease L-PSP  56.29 
 
 
151 aa  114  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0151498  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1285  Endoribonuclease L-PSP  48.32 
 
 
156 aa  114  5e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.770765 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1379  endoribonuclease L-PSP  40.13 
 
 
158 aa  114  6e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3735  endoribonuclease L-PSP  38.67 
 
 
170 aa  113  7.999999999999999e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0323381  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5691  endoribonuclease L-PSP  42.38 
 
 
152 aa  113  8.999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7001  Endoribonuclease L-PSP  38.71 
 
 
153 aa  113  8.999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.29749  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0121  peptidase C26  42.95 
 
 
407 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.808568 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3333  hypothetical protein  45.64 
 
 
154 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.440014  normal  0.330579 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2448  endoribonuclease L-PSP  45.64 
 
 
155 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.514496  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>