216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3096 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_3096  Endoribonuclease L-PSP  100 
 
 
168 aa  314  4e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000584514 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3039  Endoribonuclease L-PSP  66.46 
 
 
157 aa  190  7e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0200  endoribonuclease L-PSP  67.74 
 
 
153 aa  181  4.0000000000000006e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.151399  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0434  Endoribonuclease L-PSP  64.38 
 
 
155 aa  178  2e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.51654 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3178  Endoribonuclease L-PSP  59.65 
 
 
177 aa  177  4.999999999999999e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.738101 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13709  hypothetical protein  62.18 
 
 
151 aa  169  1e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0525391 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0465  hypothetical protein  65.81 
 
 
152 aa  168  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.346493 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5312  Endoribonuclease L-PSP  66.45 
 
 
153 aa  167  8e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.688432 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4853  Endoribonuclease L-PSP  59.87 
 
 
154 aa  166  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0713  Endoribonuclease L-PSP  57.96 
 
 
152 aa  164  4e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04880  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  67.32 
 
 
159 aa  164  4e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.826759 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4820  endoribonuclease L-PSP  62.99 
 
 
162 aa  160  8.000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4906  endoribonuclease L-PSP  62.99 
 
 
162 aa  160  8.000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.374579 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5207  endoribonuclease L-PSP  62.99 
 
 
162 aa  160  8.000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000695376 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18300  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  65 
 
 
166 aa  160  1e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.614303  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8908  Endoribonuclease L-PSP  64.52 
 
 
152 aa  159  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.974502 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0241  Endoribonuclease L-PSP  67.74 
 
 
152 aa  155  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.206377  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26250  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  65.84 
 
 
167 aa  154  7e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.738846  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3397  endoribonuclease L-PSP  58.62 
 
 
189 aa  152  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0114  hypothetical protein  63.95 
 
 
155 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36190  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  61.64 
 
 
151 aa  148  3e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0426  Endoribonuclease L-PSP  63.82 
 
 
158 aa  146  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.235874 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0336  endoribonuclease L-PSP  61.69 
 
 
154 aa  146  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4789  endoribonuclease L-PSP  55.41 
 
 
153 aa  142  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0118265 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4348  endoribonuclease L-PSP  54.73 
 
 
153 aa  142  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.917733 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1369  endoribonuclease L-PSP  57.69 
 
 
153 aa  142  3e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.324136 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0332  endoribonuclease L-PSP  60.78 
 
 
163 aa  141  4e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0921694 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3343  Endoribonuclease L-PSP  45.81 
 
 
152 aa  140  6e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0721684  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0515  Endoribonuclease L-PSP  62.82 
 
 
157 aa  140  6e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3934  Endoribonuclease L-PSP  53.66 
 
 
156 aa  140  6e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1062  Endoribonuclease L-PSP  51.92 
 
 
151 aa  139  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1999  endoribonuclease L-PSP  64.9 
 
 
161 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1123  endoribonuclease L-PSP  49.06 
 
 
155 aa  136  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.321047  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1645  Endoribonuclease L-PSP  43.04 
 
 
156 aa  136  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.827325 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5437  endoribonuclease L-PSP  58.5 
 
 
152 aa  135  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.491285 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25430  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  56.17 
 
 
157 aa  135  3.0000000000000003e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1944  Endoribonuclease L-PSP  50 
 
 
153 aa  134  6.0000000000000005e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4282  endoribonuclease L-PSP  56.49 
 
 
154 aa  133  9.999999999999999e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.667627  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0499  Endoribonuclease L-PSP  59.75 
 
 
162 aa  131  3e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.389355  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2531  hypothetical protein  49.37 
 
 
156 aa  130  6e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1774  Endoribonuclease L-PSP  47.8 
 
 
156 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.98491  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1530  endoribonuclease L-PSP  46.3 
 
 
160 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3793  endoribonuclease L-PSP  51.57 
 
 
154 aa  128  4.0000000000000003e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.756407 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1252  endoribonuclease L-PSP  53.21 
 
 
156 aa  128  4.0000000000000003e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.476616  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0607  Endoribonuclease L-PSP  58.86 
 
 
155 aa  128  4.0000000000000003e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.322518  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1577  Endoribonuclease L-PSP  47.17 
 
 
156 aa  127  9.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.401191  normal  0.481334 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2027  endoribonuclease L-PSP  48.1 
 
 
154 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0633724  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2803  endoribonuclease L-PSP  48.75 
 
 
155 aa  124  5e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.117143  normal  0.432336 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2457  endoribonuclease L-PSP  49.35 
 
 
153 aa  123  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3105  endoribonuclease L-PSP  55.06 
 
 
155 aa  123  1e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.473778  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0137  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 
155 aa  122  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1661  Endoribonuclease L-PSP  47.44 
 
 
162 aa  122  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.228688 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1122  hypothetical protein  46.84 
 
 
154 aa  122  3e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.457332  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1165  hypothetical protein  46.84 
 
 
154 aa  121  4e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1285  Endoribonuclease L-PSP  47.5 
 
 
156 aa  120  8e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.770765 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1498  Endoribonuclease L-PSP  40.85 
 
 
160 aa  120  9.999999999999999e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2030  Endoribonuclease L-PSP  43.51 
 
 
156 aa  118  3.9999999999999996e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00146961  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0581  endoribonuclease L-PSP  41.77 
 
 
154 aa  118  3.9999999999999996e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0481259  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0435  endoribonuclease L-PSP  42.86 
 
 
155 aa  117  7.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3144  endoribonuclease L-PSP  47.17 
 
 
152 aa  116  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.147772 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0250  endoribonuclease L-PSP  48.1 
 
 
152 aa  115  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1092  endoribonuclease L-PSP  39.74 
 
 
151 aa  115  3e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1272  endoribonuclease L-PSP  49.68 
 
 
153 aa  114  5e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.103554  hitchhiker  0.00713107 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2518  Endoribonuclease L-PSP  54.19 
 
 
151 aa  114  6e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0151498  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4751  putative endoribonuclease L-PSP (protein synthesis inhibitor)  45.4 
 
 
155 aa  114  6e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.708532  normal  0.751414 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6055  Endoribonuclease L-PSP  42.58 
 
 
162 aa  114  7.999999999999999e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.316335  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0894  hypothetical protein  46.84 
 
 
152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.324074  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1113  Endoribonuclease L-PSP  48.08 
 
 
155 aa  112  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.85817  normal  0.626067 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2553  endoribonuclease L-PSP  46.84 
 
 
152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5091  hypothetical protein  43.51 
 
 
163 aa  112  4.0000000000000004e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2477  endoribonuclease L-PSP  46.25 
 
 
153 aa  110  6e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.738257  normal  0.0496442 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4551  Endoribonuclease L-PSP  47.53 
 
 
157 aa  110  9e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2319  endoribonuclease L-PSP  48.15 
 
 
157 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2153  endoribonuclease L-PSP, putative  39.49 
 
 
152 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2555  hypothetical protein  45.28 
 
 
154 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.853817 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2223  L-PSP family endoribonuclease  43.4 
 
 
152 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1313  L-PSP family endoribonuclease  43.4 
 
 
164 aa  108  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.221061  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0950  L-PSP family endoribonuclease  42.77 
 
 
164 aa  108  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.449669  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3313  endoribonuclease L-PSP  47.2 
 
 
155 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129795  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1379  endoribonuclease L-PSP  41.14 
 
 
158 aa  108  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0708  L-PSP family endoribonuclease  43.4 
 
 
155 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2542  L-PSP family endoribonuclease  43.4 
 
 
152 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.455947  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1153  putative endoribonuclease L-PSP  43.4 
 
 
152 aa  108  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1162  putative endoribonuclease L-PSP  43.4 
 
 
152 aa  108  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2072  putative endoribonuclease L-PSP  43.4 
 
 
152 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.110705  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4070  endoribonuclease L-PSP  46.3 
 
 
162 aa  107  6e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.256894  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1346  endoribonuclease L-PSP  43.87 
 
 
152 aa  107  6e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00288796  normal  0.104373 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1212  Endoribonuclease L-PSP  42.24 
 
 
154 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0986  hypothetical protein  41.77 
 
 
156 aa  106  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0698758  normal  0.152684 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2373  endoribonuclease L-PSP  42.77 
 
 
152 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0932  Endoribonuclease L-PSP  43.04 
 
 
152 aa  106  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.315119  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2448  endoribonuclease L-PSP  45.34 
 
 
155 aa  107  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.514496  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0927  endoribonuclease L-PSP  42.77 
 
 
152 aa  107  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.553211 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1018  endoribonuclease L-PSP  43.67 
 
 
152 aa  107  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.386479  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2609  endoribonuclease L-PSP  44.38 
 
 
152 aa  106  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.56142 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0168  endoribonuclease L-PSP  46.1 
 
 
153 aa  106  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0938  Endoribonuclease L-PSP  40.88 
 
 
152 aa  106  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2408  endoribonuclease L-PSP  44.1 
 
 
155 aa  106  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.628638  normal  0.167618 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1740  endoribonuclease L-PSP  42.14 
 
 
152 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2388  endoribonuclease L-PSP  42.14 
 
 
152 aa  106  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.921996  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>