294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1285 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1285  Endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 156 aa  310  5.999999999999999e-84  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.770765 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1530  endoribonuclease L-PSP  64.94 
 
 		 160 aa  207  3e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1008  Endoribonuclease L-PSP  66.67 
 
 		 162 aa  205  2e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1404  Endoribonuclease L-PSP  65.81 
 
 		 161 aa  200  6e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1498  Endoribonuclease L-PSP  59.21 
 
 		 160 aa  191  4e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0814  hypothetical protein  58.33 
 
 		 170 aa  177  4.999999999999999e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.565462  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0960  hypothetical protein  54.25 
 
 		 162 aa  169  1e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.304597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3039  Endoribonuclease L-PSP  54.9 
 
 		 157 aa  150  7e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0200  endoribonuclease L-PSP  52.32 
 
 		 153 aa  139  9.999999999999999e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.151399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0713  Endoribonuclease L-PSP  50.65 
 
 		 152 aa  137  4.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1122  hypothetical protein  48.99 
 
 		 154 aa  137  7e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.457332  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1645  Endoribonuclease L-PSP  44.08 
 
 		 156 aa  137  7.999999999999999e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.827325 
 
 
-
 
NC_004310  BR1165  hypothetical protein  48.99 
 
 		 154 aa  136  1e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2027  endoribonuclease L-PSP  48.32 
 
 		 154 aa  135  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0633724  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4853  Endoribonuclease L-PSP  50.64 
 
 		 154 aa  135  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3934  Endoribonuclease L-PSP  53.64 
 
 		 156 aa  132  9.999999999999999e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3343  Endoribonuclease L-PSP  47.3 
 
 		 152 aa  133  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0721684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13709  hypothetical protein  50 
 
 		 151 aa  132  3e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0525391 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25430  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  50.96 
 
 		 157 aa  131  5e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0434  Endoribonuclease L-PSP  55.13 
 
 		 155 aa  130  5e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.51654 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1944  Endoribonuclease L-PSP  47.37 
 
 		 153 aa  130  9e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4282  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 154 aa  126  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.667627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0332  endoribonuclease L-PSP  54.48 
 
 		 163 aa  125  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0921694 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0499  Endoribonuclease L-PSP  54.97 
 
 		 162 aa  125  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.389355  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3178  Endoribonuclease L-PSP  43.83 
 
 		 177 aa  125  3e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.738101 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1092  endoribonuclease L-PSP  40.79 
 
 		 151 aa  122  2e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2030  Endoribonuclease L-PSP  44.08 
 
 		 156 aa  122  2e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00146961  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8908  Endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 152 aa  122  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.974502 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1379  endoribonuclease L-PSP  39.74 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1062  Endoribonuclease L-PSP  43.87 
 
 		 151 aa  120  5e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0336  endoribonuclease L-PSP  48.68 
 
 		 154 aa  120  5e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1252  endoribonuclease L-PSP  50.33 
 
 		 156 aa  120  7e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.476616  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2609  endoribonuclease L-PSP  44 
 
 		 152 aa  118  3e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.56142 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0581  endoribonuclease L-PSP  41.72 
 
 		 154 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0481259  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0241  Endoribonuclease L-PSP  52 
 
 		 152 aa  118  3.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.206377  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04880  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  52.38 
 
 		 159 aa  116  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.826759 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0515  Endoribonuclease L-PSP  52.98 
 
 		 157 aa  116  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26250  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  55.74 
 
 		 167 aa  115  1.9999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.738846  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0465  hypothetical protein  51.7 
 
 		 152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.346493 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5207  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 162 aa  115  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000695376 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4820  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 162 aa  115  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4906  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 162 aa  115  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.374579 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5312  Endoribonuclease L-PSP  49.67 
 
 		 153 aa  114  3.9999999999999997e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.688432 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2531  hypothetical protein  43.51 
 
 		 156 aa  114  3.9999999999999997e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1577  Endoribonuclease L-PSP  42.31 
 
 		 156 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.401191  normal  0.481334 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36190  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  53.02 
 
 		 151 aa  114  5e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1123  endoribonuclease L-PSP  41.29 
 
 		 155 aa  114  6e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.321047  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1774  Endoribonuclease L-PSP  42.31 
 
 		 156 aa  113  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.98491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3105  endoribonuclease L-PSP  44.44 
 
 		 155 aa  113  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.473778  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18300  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  51.01 
 
 		 166 aa  112  1.0000000000000001e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.614303  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1113  Endoribonuclease L-PSP  43.24 
 
 		 155 aa  112  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.85817  normal  0.626067 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1999  endoribonuclease L-PSP  51.72 
 
 		 161 aa  111  4.0000000000000004e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1313  L-PSP family endoribonuclease  40.79 
 
 		 164 aa  110  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.221061  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2072  putative endoribonuclease L-PSP  40.79 
 
 		 152 aa  110  6e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.110705  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2223  L-PSP family endoribonuclease  40.79 
 
 		 152 aa  110  6e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1162  putative endoribonuclease L-PSP  40.79 
 
 		 152 aa  110  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1153  putative endoribonuclease L-PSP  40.79 
 
 		 152 aa  110  6e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2542  L-PSP family endoribonuclease  40.79 
 
 		 152 aa  110  6e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.455947  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3793  endoribonuclease L-PSP  41.72 
 
 		 154 aa  110  7.000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.756407 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1792  endoribonuclease L-PSP  42.67 
 
 		 156 aa  110  7.000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.282183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0708  L-PSP family endoribonuclease  40.79 
 
 		 155 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0114  hypothetical protein  50 
 
 		 155 aa  110  8.000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0986  hypothetical protein  41.06 
 
 		 156 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0698758  normal  0.152684 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0927  endoribonuclease L-PSP  41.18 
 
 		 152 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.553211 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2118  endoribonuclease L-PSP  43.05 
 
 		 154 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124484  normal  0.0891562 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3397  endoribonuclease L-PSP  43.21 
 
 		 189 aa  110  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2408  endoribonuclease L-PSP  44.22 
 
 		 155 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.628638  normal  0.167618 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4551  Endoribonuclease L-PSP  40.4 
 
 		 157 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0950  L-PSP family endoribonuclease  40.13 
 
 		 164 aa  108  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.449669  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6537  endoribonuclease L-PSP  44.37 
 
 		 157 aa  108  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.21507  normal  0.550061 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1204  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 156 aa  108  4.0000000000000004e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.375276 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1369  endoribonuclease L-PSP  47.33 
 
 		 153 aa  107  5e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.324136 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2373  endoribonuclease L-PSP  40.79 
 
 		 152 aa  107  6e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4789  endoribonuclease L-PSP  48.61 
 
 		 153 aa  107  6e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0118265 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4070  endoribonuclease L-PSP  39.74 
 
 		 162 aa  107  6e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.256894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2270  endoribonuclease L-PSP  40.13 
 
 		 152 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.724419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1740  endoribonuclease L-PSP  40.13 
 
 		 152 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2388  endoribonuclease L-PSP  40.13 
 
 		 152 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.921996  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2352  endoribonuclease L-PSP  40.13 
 
 		 152 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2665  endoribonuclease L-PSP  44.19 
 
 		 158 aa  106  9.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0119908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4437  Endoribonuclease L-PSP  39.74 
 
 		 157 aa  106  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.062411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3043  endoribonuclease L-PSP  43.54 
 
 		 155 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.574471 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3144  endoribonuclease L-PSP  40.91 
 
 		 152 aa  105  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.147772 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5437  endoribonuclease L-PSP  48.61 
 
 		 152 aa  105  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491285 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1212  Endoribonuclease L-PSP  40.67 
 
 		 154 aa  104  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5691  endoribonuclease L-PSP  38.82 
 
 		 152 aa  104  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1018  endoribonuclease L-PSP  43.84 
 
 		 152 aa  104  4e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.386479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2319  endoribonuclease L-PSP  44.08 
 
 		 157 aa  104  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1346  endoribonuclease L-PSP  42.28 
 
 		 152 aa  104  4e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00288796  normal  0.104373 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4348  endoribonuclease L-PSP  46.53 
 
 		 153 aa  104  5e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.917733 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2555  hypothetical protein  42.67 
 
 		 154 aa  104  6e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.853817 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0932  Endoribonuclease L-PSP  43.15 
 
 		 152 aa  103  6e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.315119  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1470  endoribonuclease L-PSP  43.51 
 
 		 157 aa  103  8e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7458  Endoribonuclease L-PSP  43.71 
 
 		 157 aa  103  9e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3313  endoribonuclease L-PSP  42.95 
 
 		 155 aa  103  9e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129795  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2788  Endoribonuclease L-PSP  41.04 
 
 		 163 aa  102  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1705  Endoribonuclease L-PSP  39.74 
 
 		 156 aa  103  1e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.182301  hitchhiker  0.0000000000000067862 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37922  predicted protein  40.13 
 
 		 185 aa  102  1e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00476754  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2448  endoribonuclease L-PSP  43.54 
 
 		 155 aa  102  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.514496  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47655  predicted protein  40.13 
 
 		 185 aa  102  1e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00618585  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>