244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0960 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0960  hypothetical protein  100 
 
 
162 aa  319  9.000000000000001e-87  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.304597  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1498  Endoribonuclease L-PSP  56.77 
 
 
160 aa  186  8e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1530  endoribonuclease L-PSP  53.85 
 
 
160 aa  168  3e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1404  Endoribonuclease L-PSP  55 
 
 
161 aa  167  6e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0814  hypothetical protein  55.26 
 
 
170 aa  167  7e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.565462  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1285  Endoribonuclease L-PSP  54.25 
 
 
156 aa  157  4e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.770765 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1008  Endoribonuclease L-PSP  52.94 
 
 
162 aa  152  2e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0200  endoribonuclease L-PSP  49.02 
 
 
153 aa  136  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.151399  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3343  Endoribonuclease L-PSP  48.67 
 
 
152 aa  135  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0721684  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3039  Endoribonuclease L-PSP  48.37 
 
 
157 aa  134  5e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3178  Endoribonuclease L-PSP  43.83 
 
 
177 aa  132  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.738101 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0336  endoribonuclease L-PSP  46.71 
 
 
154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1944  Endoribonuclease L-PSP  44.97 
 
 
153 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4853  Endoribonuclease L-PSP  45.1 
 
 
154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3397  endoribonuclease L-PSP  43.21 
 
 
189 aa  124  7e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8908  Endoribonuclease L-PSP  52.6 
 
 
152 aa  122  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.974502 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1645  Endoribonuclease L-PSP  40.54 
 
 
156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.827325 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1379  endoribonuclease L-PSP  38.41 
 
 
158 aa  118  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4282  endoribonuclease L-PSP  46.71 
 
 
154 aa  117  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.667627  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0713  Endoribonuclease L-PSP  45.39 
 
 
152 aa  116  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0434  Endoribonuclease L-PSP  46.71 
 
 
155 aa  116  9.999999999999999e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.51654 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1092  endoribonuclease L-PSP  39.86 
 
 
151 aa  114  3.9999999999999997e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0499  Endoribonuclease L-PSP  49.36 
 
 
162 aa  114  7.999999999999999e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.389355  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13709  hypothetical protein  44.74 
 
 
151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0525391 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5312  Endoribonuclease L-PSP  47.06 
 
 
153 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.688432 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0465  hypothetical protein  46.98 
 
 
152 aa  112  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.346493 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2030  Endoribonuclease L-PSP  39.74 
 
 
156 aa  110  6e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00146961  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25430  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  45.86 
 
 
157 aa  110  6e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2531  hypothetical protein  41.45 
 
 
156 aa  110  6e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1165  hypothetical protein  39.74 
 
 
154 aa  110  7.000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1122  hypothetical protein  39.74 
 
 
154 aa  110  7.000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.457332  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3793  endoribonuclease L-PSP  39.33 
 
 
154 aa  110  7.000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.756407 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0168  endoribonuclease L-PSP  42.86 
 
 
153 aa  110  9e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4789  endoribonuclease L-PSP  52.48 
 
 
153 aa  110  9e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0118265 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2408  endoribonuclease L-PSP  40.82 
 
 
155 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.628638  normal  0.167618 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1123  endoribonuclease L-PSP  40.4 
 
 
155 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.321047  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4751  putative endoribonuclease L-PSP (protein synthesis inhibitor)  39.19 
 
 
155 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.708532  normal  0.751414 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26250  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  48 
 
 
167 aa  108  3e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.738846  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2027  endoribonuclease L-PSP  39.07 
 
 
154 aa  108  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0633724  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3934  Endoribonuclease L-PSP  44.22 
 
 
156 aa  108  3e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1470  endoribonuclease L-PSP  43.05 
 
 
157 aa  107  6e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04880  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  49.31 
 
 
159 aa  107  8.000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.826759 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0332  endoribonuclease L-PSP  46.21 
 
 
163 aa  106  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0921694 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1427  endoribonuclease L-PSP  40.82 
 
 
155 aa  106  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.426351 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2803  endoribonuclease L-PSP  37.84 
 
 
155 aa  105  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.117143  normal  0.432336 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1577  Endoribonuclease L-PSP  36.84 
 
 
156 aa  105  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.401191  normal  0.481334 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0515  Endoribonuclease L-PSP  50.82 
 
 
157 aa  105  4e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1999  endoribonuclease L-PSP  49.3 
 
 
161 aa  104  5e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1113  Endoribonuclease L-PSP  42.07 
 
 
155 aa  104  6e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.85817  normal  0.626067 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18300  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  46.53 
 
 
166 aa  103  7e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.614303  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3105  endoribonuclease L-PSP  39.22 
 
 
155 aa  103  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.473778  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0241  Endoribonuclease L-PSP  43.84 
 
 
152 aa  102  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.206377  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0927  endoribonuclease L-PSP  38.56 
 
 
152 aa  102  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.553211 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3043  endoribonuclease L-PSP  38.1 
 
 
155 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.574471 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4820  endoribonuclease L-PSP  42.25 
 
 
162 aa  102  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1062  Endoribonuclease L-PSP  42.76 
 
 
151 aa  102  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36190  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  47.54 
 
 
151 aa  102  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4906  endoribonuclease L-PSP  42.25 
 
 
162 aa  102  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.374579 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5207  endoribonuclease L-PSP  42.25 
 
 
162 aa  102  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000695376 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1774  Endoribonuclease L-PSP  36.18 
 
 
156 aa  102  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.98491  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0581  endoribonuclease L-PSP  35.33 
 
 
154 aa  101  5e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0481259  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3313  endoribonuclease L-PSP  38.67 
 
 
155 aa  100  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129795  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2153  endoribonuclease L-PSP, putative  35.81 
 
 
152 aa  100  8e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1180  Endoribonuclease L-PSP  41.83 
 
 
153 aa  100  8e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4348  endoribonuclease L-PSP  49.29 
 
 
153 aa  100  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.917733 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1252  endoribonuclease L-PSP  44.37 
 
 
156 aa  100  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.476616  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2373  endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 
152 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2270  endoribonuclease L-PSP  36.84 
 
 
152 aa  99.8  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.724419  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1212  Endoribonuclease L-PSP  36.67 
 
 
154 aa  99.4  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2319  endoribonuclease L-PSP  40.91 
 
 
157 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2448  endoribonuclease L-PSP  38.51 
 
 
155 aa  99.8  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.514496  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3144  endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 
152 aa  99.4  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.147772 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1740  endoribonuclease L-PSP  36.84 
 
 
152 aa  99.8  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2388  endoribonuclease L-PSP  36.84 
 
 
152 aa  99.8  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.921996  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2352  endoribonuclease L-PSP  36.84 
 
 
152 aa  99.8  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0426  Endoribonuclease L-PSP  49.26 
 
 
158 aa  98.6  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.235874 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3580  endoribonuclease L-PSP  36.49 
 
 
153 aa  99  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.45612  normal  0.209775 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0607  Endoribonuclease L-PSP  49.33 
 
 
155 aa  98.6  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.322518  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4551  Endoribonuclease L-PSP  40.26 
 
 
157 aa  98.2  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1801  hypothetical protein  37.93 
 
 
168 aa  98.2  4e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0113627  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1369  endoribonuclease L-PSP  46.72 
 
 
153 aa  98.2  4e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.324136 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0121  peptidase C26  35.57 
 
 
407 aa  97.8  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.808568 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3546  Endoribonuclease L-PSP  37.41 
 
 
155 aa  97.8  6e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5691  endoribonuclease L-PSP  35.53 
 
 
152 aa  97.1  9e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4070  endoribonuclease L-PSP  40.26 
 
 
162 aa  97.1  9e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.256894  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4883  endoribonuclease L-PSP  36.94 
 
 
157 aa  96.7  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000371063  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3333  hypothetical protein  37.33 
 
 
154 aa  96.7  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.440014  normal  0.330579 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1792  endoribonuclease L-PSP  36.84 
 
 
156 aa  96.7  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.282183  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1346  endoribonuclease L-PSP  38 
 
 
152 aa  96.3  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00288796  normal  0.104373 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0114  hypothetical protein  42.14 
 
 
155 aa  96.3  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4437  Endoribonuclease L-PSP  40.26 
 
 
157 aa  96.3  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.062411  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2457  endoribonuclease L-PSP  36.84 
 
 
153 aa  95.9  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2665  endoribonuclease L-PSP  41.09 
 
 
158 aa  95.9  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0119908  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2118  endoribonuclease L-PSP  36.77 
 
 
154 aa  95.9  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124484  normal  0.0891562 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5437  endoribonuclease L-PSP  42.76 
 
 
152 aa  95.1  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.491285 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2223  L-PSP family endoribonuclease  35.53 
 
 
152 aa  94.7  4e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6055  Endoribonuclease L-PSP  36.55 
 
 
162 aa  95.1  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.316335  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2542  L-PSP family endoribonuclease  35.53 
 
 
152 aa  94.7  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.455947  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1153  putative endoribonuclease L-PSP  35.53 
 
 
152 aa  94.7  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1162  putative endoribonuclease L-PSP  35.53 
 
 
152 aa  94.7  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>