More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1404 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1404  Endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 161 aa  323  4.0000000000000003e-88  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1530  endoribonuclease L-PSP  69.23 
 
 		 160 aa  222  2e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1285  Endoribonuclease L-PSP  65.81 
 
 		 156 aa  202  2e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.770765 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1498  Endoribonuclease L-PSP  61.39 
 
 		 160 aa  197  6e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1008  Endoribonuclease L-PSP  62.5 
 
 		 162 aa  181  5.0000000000000004e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0814  hypothetical protein  59.6 
 
 		 170 aa  175  2e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.565462  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0960  hypothetical protein  55 
 
 		 162 aa  174  4e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.304597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4853  Endoribonuclease L-PSP  52.94 
 
 		 154 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3039  Endoribonuclease L-PSP  51.97 
 
 		 157 aa  133  9.999999999999999e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1944  Endoribonuclease L-PSP  51.66 
 
 		 153 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0200  endoribonuclease L-PSP  51.61 
 
 		 153 aa  128  3e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.151399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0713  Endoribonuclease L-PSP  50.33 
 
 		 152 aa  127  5.0000000000000004e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3343  Endoribonuclease L-PSP  48.3 
 
 		 152 aa  127  5.0000000000000004e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0721684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13709  hypothetical protein  53.57 
 
 		 151 aa  127  8.000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0525391 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0434  Endoribonuclease L-PSP  52.63 
 
 		 155 aa  125  4.0000000000000003e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.51654 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1122  hypothetical protein  47.97 
 
 		 154 aa  124  6e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.457332  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1165  hypothetical protein  47.97 
 
 		 154 aa  124  8.000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1379  endoribonuclease L-PSP  42.57 
 
 		 158 aa  123  9e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3934  Endoribonuclease L-PSP  51.33 
 
 		 156 aa  123  1e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4282  endoribonuclease L-PSP  49.67 
 
 		 154 aa  120  6e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.667627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2027  endoribonuclease L-PSP  47.3 
 
 		 154 aa  120  8e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0633724  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8908  Endoribonuclease L-PSP  49.33 
 
 		 152 aa  119  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.974502 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1645  Endoribonuclease L-PSP  42.86 
 
 		 156 aa  117  6e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.827325 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3178  Endoribonuclease L-PSP  44.03 
 
 		 177 aa  117  6e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.738101 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0499  Endoribonuclease L-PSP  49.68 
 
 		 162 aa  115  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.389355  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5312  Endoribonuclease L-PSP  49.01 
 
 		 153 aa  114  5e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.688432 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1092  endoribonuclease L-PSP  41.5 
 
 		 151 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1252  endoribonuclease L-PSP  50.66 
 
 		 156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.476616  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0336  endoribonuclease L-PSP  44.37 
 
 		 154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25430  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  45.51 
 
 		 157 aa  112  3e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1062  Endoribonuclease L-PSP  46.05 
 
 		 151 aa  111  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0465  hypothetical protein  50.68 
 
 		 152 aa  111  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.346493 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2609  endoribonuclease L-PSP  43.42 
 
 		 152 aa  111  5e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.56142 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2542  L-PSP family endoribonuclease  42.86 
 
 		 152 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.455947  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1153  putative endoribonuclease L-PSP  42.86 
 
 		 152 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2223  L-PSP family endoribonuclease  42.86 
 
 		 152 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0708  L-PSP family endoribonuclease  42.86 
 
 		 155 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1162  putative endoribonuclease L-PSP  42.86 
 
 		 152 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1313  L-PSP family endoribonuclease  42.86 
 
 		 164 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.221061  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0332  endoribonuclease L-PSP  53.19 
 
 		 163 aa  110  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0921694 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2072  putative endoribonuclease L-PSP  42.86 
 
 		 152 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.110705  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2030  Endoribonuclease L-PSP  41.38 
 
 		 156 aa  109  2.0000000000000002e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00146961  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2373  endoribonuclease L-PSP  41.45 
 
 		 152 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1346  endoribonuclease L-PSP  44.67 
 
 		 152 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00288796  normal  0.104373 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1740  endoribonuclease L-PSP  42.11 
 
 		 152 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2388  endoribonuclease L-PSP  42.11 
 
 		 152 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.921996  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2352  endoribonuclease L-PSP  42.11 
 
 		 152 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2270  endoribonuclease L-PSP  42.11 
 
 		 152 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.724419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1018  endoribonuclease L-PSP  42.67 
 
 		 152 aa  108  3e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.386479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04880  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  49.66 
 
 		 159 aa  108  3e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.826759 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0950  L-PSP family endoribonuclease  39.87 
 
 		 164 aa  108  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.449669  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4789  endoribonuclease L-PSP  50.38 
 
 		 153 aa  108  4.0000000000000004e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0118265 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5691  endoribonuclease L-PSP  41.45 
 
 		 152 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0927  endoribonuclease L-PSP  41.72 
 
 		 152 aa  107  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.553211 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0932  Endoribonuclease L-PSP  42 
 
 		 152 aa  107  5e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.315119  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3793  endoribonuclease L-PSP  42 
 
 		 154 aa  107  6e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.756407 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1999  endoribonuclease L-PSP  51.72 
 
 		 161 aa  107  8.000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1212  Endoribonuclease L-PSP  41.72 
 
 		 154 aa  107  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2118  endoribonuclease L-PSP  41.06 
 
 		 154 aa  105  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124484  normal  0.0891562 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0426  Endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 158 aa  105  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.235874 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1123  endoribonuclease L-PSP  41.72 
 
 		 155 aa  105  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.321047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2531  hypothetical protein  40.94 
 
 		 156 aa  105  4e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1749  endoribonuclease L-PSP  47.14 
 
 		 151 aa  105  4e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.470188  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6537  endoribonuclease L-PSP  45.39 
 
 		 157 aa  104  5e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.21507  normal  0.550061 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0402  endoribonuclease L-PSP  47.48 
 
 		 152 aa  104  6e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0666223 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0241  Endoribonuclease L-PSP  47.95 
 
 		 152 aa  103  7e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.206377  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36190  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  52.89 
 
 		 151 aa  103  9e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1774  Endoribonuclease L-PSP  41.83 
 
 		 156 aa  103  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.98491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4348  endoribonuclease L-PSP  49.62 
 
 		 153 aa  103  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.917733 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2348  endoribonuclease L-PSP  42.11 
 
 		 151 aa  103  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4751  putative endoribonuclease L-PSP (protein synthesis inhibitor)  41.89 
 
 		 155 aa  103  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.708532  normal  0.751414 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7458  Endoribonuclease L-PSP  44.08 
 
 		 157 aa  103  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26250  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  51.67 
 
 		 167 aa  103  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.738846  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1204  endoribonuclease L-PSP  43.48 
 
 		 156 aa  102  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.375276 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5081  endoribonuclease L-PSP  43.17 
 
 		 152 aa  102  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0190721 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1577  Endoribonuclease L-PSP  40.4 
 
 		 156 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.401191  normal  0.481334 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0114  hypothetical protein  46.43 
 
 		 155 aa  102  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0515  Endoribonuclease L-PSP  48.99 
 
 		 157 aa  102  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1369  endoribonuclease L-PSP  47.14 
 
 		 153 aa  102  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.324136 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4820  endoribonuclease L-PSP  47.37 
 
 		 162 aa  102  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5207  endoribonuclease L-PSP  47.37 
 
 		 162 aa  102  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000695376 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4070  endoribonuclease L-PSP  37.75 
 
 		 162 aa  102  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.256894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47655  predicted protein  42.76 
 
 		 185 aa  102  2e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00618585  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37922  predicted protein  42.76 
 
 		 185 aa  102  2e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00476754  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3397  endoribonuclease L-PSP  44.03 
 
 		 189 aa  102  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1113  Endoribonuclease L-PSP  39.31 
 
 		 155 aa  102  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.85817  normal  0.626067 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4906  endoribonuclease L-PSP  47.37 
 
 		 162 aa  102  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.374579 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0904  endoribonuclease L-PSP  44.44 
 
 		 151 aa  102  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4551  Endoribonuclease L-PSP  38.41 
 
 		 157 aa  102  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0581  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 154 aa  102  3e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0481259  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18300  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  47.48 
 
 		 166 aa  102  3e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.614303  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4437  Endoribonuclease L-PSP  37.75 
 
 		 157 aa  100  6e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.062411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2512  endoribonuclease L-PSP  41.89 
 
 		 150 aa  100  7e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.796499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0168  endoribonuclease L-PSP  42.18 
 
 		 153 aa  100  8e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0986  hypothetical protein  41.72 
 
 		 156 aa  100  8e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0698758  normal  0.152684 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1180  Endoribonuclease L-PSP  38.93 
 
 		 153 aa  100  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3333  hypothetical protein  42.38 
 
 		 154 aa  100  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.440014  normal  0.330579 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2319  endoribonuclease L-PSP  41.06 
 
 		 157 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2803  endoribonuclease L-PSP  43.97 
 
 		 155 aa  100  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.117143  normal  0.432336 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2555  hypothetical protein  44 
 
 		 154 aa  99.4  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.853817 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>