223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1749 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_1749  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 151 aa  303  8.000000000000001e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.470188  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3343  Endoribonuclease L-PSP  44.6 
 
 		 152 aa  124  6e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0721684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1705  Endoribonuclease L-PSP  43.79 
 
 		 156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.182301  hitchhiker  0.0000000000000067862 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1180  Endoribonuclease L-PSP  45.99 
 
 		 153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1944  Endoribonuclease L-PSP  46.38 
 
 		 153 aa  117  3.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5536  endoribonuclease L-PSP  45.19 
 
 		 156 aa  111  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.044824 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1645  Endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 156 aa  111  4.0000000000000004e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.827325 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2027  endoribonuclease L-PSP  45.19 
 
 		 154 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0633724  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1165  hypothetical protein  43.7 
 
 		 154 aa  106  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0168  endoribonuclease L-PSP  42.86 
 
 		 153 aa  106  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2153  endoribonuclease L-PSP, putative  38.52 
 
 		 152 aa  105  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1122  hypothetical protein  43.7 
 
 		 154 aa  105  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.457332  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0200  endoribonuclease L-PSP  43.17 
 
 		 153 aa  105  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.151399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4853  Endoribonuclease L-PSP  42.65 
 
 		 154 aa  105  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3580  endoribonuclease L-PSP  37.86 
 
 		 153 aa  105  3e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.45612  normal  0.209775 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4282  endoribonuclease L-PSP  48.18 
 
 		 154 aa  103  7e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.667627  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6055  Endoribonuclease L-PSP  41.18 
 
 		 162 aa  102  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.316335  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0713  Endoribonuclease L-PSP  40.29 
 
 		 152 aa  101  5e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3462  endoribonuclease L-PSP  42.22 
 
 		 159 aa  100  6e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0120904 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2118  endoribonuclease L-PSP  38.69 
 
 		 154 aa  100  8e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124484  normal  0.0891562 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4751  putative endoribonuclease L-PSP (protein synthesis inhibitor)  39.85 
 
 		 155 aa  99.8  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.708532  normal  0.751414 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1062  Endoribonuclease L-PSP  46.72 
 
 		 151 aa  99.4  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0435  endoribonuclease L-PSP  42.31 
 
 		 155 aa  99.8  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0986  hypothetical protein  40.88 
 
 		 156 aa  99  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0698758  normal  0.152684 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1470  endoribonuclease L-PSP  40.98 
 
 		 157 aa  98.6  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1212  Endoribonuclease L-PSP  39.42 
 
 		 154 aa  99.4  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1379  endoribonuclease L-PSP  40.74 
 
 		 158 aa  98.2  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1092  endoribonuclease L-PSP  35.56 
 
 		 151 aa  97.8  5e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0581  endoribonuclease L-PSP  37.78 
 
 		 154 aa  97.4  6e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0481259  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0332  endoribonuclease L-PSP  45.59 
 
 		 163 aa  97.1  7e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0921694 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8908  Endoribonuclease L-PSP  41.04 
 
 		 152 aa  97.1  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.974502 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1427  endoribonuclease L-PSP  39.57 
 
 		 155 aa  95.9  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.426351 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2531  hypothetical protein  41.18 
 
 		 156 aa  96.3  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6842  Endoribonuclease L-PSP  42.65 
 
 		 168 aa  96.3  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.173433 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4643  endoribonuclease L-PSP  36.43 
 
 		 163 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.183681  normal  0.137047 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1204  endoribonuclease L-PSP  38.24 
 
 		 156 aa  95.5  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.375276 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0228  Endoribonuclease L-PSP  43.38 
 
 		 152 aa  94.7  3e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1636  endoribonuclease L-PSP  38.13 
 
 		 154 aa  95.1  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.564581 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0927  endoribonuclease L-PSP  37.78 
 
 		 152 aa  95.1  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.553211 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1613  endoribonuclease L-PSP  38.13 
 
 		 154 aa  95.1  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.578745  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1740  endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 152 aa  94.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2388  endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 152 aa  94.7  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.921996  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53740  hypothetical protein  39.42 
 
 		 144 aa  94.4  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00018421  hitchhiker  0.00710422 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2352  endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 152 aa  94.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2270  endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 152 aa  94.7  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.724419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1404  Endoribonuclease L-PSP  46.43 
 
 		 161 aa  94.4  5e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1232  Endoribonuclease L-PSP  38.35 
 
 		 158 aa  94.4  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.118395 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5691  endoribonuclease L-PSP  36.76 
 
 		 152 aa  94  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1252  endoribonuclease L-PSP  45.32 
 
 		 156 aa  94  6e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.476616  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0402  endoribonuclease L-PSP  40.15 
 
 		 152 aa  94.4  6e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0666223 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1285  Endoribonuclease L-PSP  43.57 
 
 		 156 aa  94  7e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.770765 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6426  endoribonuclease L-PSP  38.52 
 
 		 153 aa  94  7e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.576265 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1530  endoribonuclease L-PSP  39.86 
 
 		 160 aa  94  7e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25430  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  42.25 
 
 		 157 aa  93.6  8e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2373  endoribonuclease L-PSP  36.76 
 
 		 152 aa  93.6  8e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0932  Endoribonuclease L-PSP  39.13 
 
 		 152 aa  93.6  8e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.315119  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3333  hypothetical protein  40.48 
 
 		 154 aa  93.6  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.440014  normal  0.330579 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6138  endoribonuclease L-PSP  38.24 
 
 		 153 aa  93.6  9e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4704  hypothetical protein  39.42 
 
 		 144 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.723705  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0950  L-PSP family endoribonuclease  37.23 
 
 		 164 aa  92.8  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.449669  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2408  endoribonuclease L-PSP  37.41 
 
 		 155 aa  92.8  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.628638  normal  0.167618 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2448  endoribonuclease L-PSP  40.16 
 
 		 155 aa  92.8  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.514496  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1018  endoribonuclease L-PSP  39.13 
 
 		 152 aa  93.2  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.386479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1577  Endoribonuclease L-PSP  39.71 
 
 		 156 aa  93.2  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.401191  normal  0.481334 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7001  Endoribonuclease L-PSP  38.35 
 
 		 153 aa  92.8  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.29749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1123  endoribonuclease L-PSP  41.91 
 
 		 155 aa  92  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.321047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4883  endoribonuclease L-PSP  37.96 
 
 		 157 aa  92  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000371063  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2030  Endoribonuclease L-PSP  34.75 
 
 		 156 aa  92  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00146961  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0121  peptidase C26  38.24 
 
 		 407 aa  92.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.808568 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4278  endoribonuclease L-PSP  48.55 
 
 		 165 aa  92.4  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.17728  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3313  endoribonuclease L-PSP  38.46 
 
 		 155 aa  92  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3043  endoribonuclease L-PSP  36.69 
 
 		 155 aa  91.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.574471 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1774  Endoribonuclease L-PSP  39.71 
 
 		 156 aa  92  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.98491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1313  L-PSP family endoribonuclease  36.5 
 
 		 164 aa  91.3  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.221061  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2457  endoribonuclease L-PSP  38.81 
 
 		 153 aa  91.7  4e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1477  endoribonuclease L-PSP  39.13 
 
 		 174 aa  91.7  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1346  endoribonuclease L-PSP  37.96 
 
 		 152 aa  91.7  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00288796  normal  0.104373 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0668  endoribonuclease L-PSP  36.57 
 
 		 155 aa  91.3  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2223  L-PSP family endoribonuclease  36.76 
 
 		 152 aa  90.9  6e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1027  Endoribonuclease L-PSP  36.3 
 
 		 158 aa  90.9  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.190417  normal  0.406014 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2111  endoribonuclease L-PSP  38.06 
 
 		 141 aa  90.9  6e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.459106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2803  endoribonuclease L-PSP  39.71 
 
 		 155 aa  90.9  6e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.117143  normal  0.432336 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0708  L-PSP family endoribonuclease  36.76 
 
 		 155 aa  90.9  6e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2542  L-PSP family endoribonuclease  36.76 
 
 		 152 aa  90.9  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.455947  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1153  putative endoribonuclease L-PSP  36.76 
 
 		 152 aa  90.9  6e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1162  putative endoribonuclease L-PSP  36.76 
 
 		 152 aa  90.9  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2072  putative endoribonuclease L-PSP  36.76 
 
 		 152 aa  90.9  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.110705  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3144  endoribonuclease L-PSP  36.57 
 
 		 152 aa  90.5  7e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.147772 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3546  Endoribonuclease L-PSP  37.8 
 
 		 155 aa  90.5  8e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2477  endoribonuclease L-PSP  41.35 
 
 		 153 aa  90.5  8e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.738257  normal  0.0496442 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2736  endoribonuclease L-PSP  41.48 
 
 		 146 aa  90.1  8e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3178  Endoribonuclease L-PSP  38.62 
 
 		 177 aa  90.1  8e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.738101 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3793  endoribonuclease L-PSP  36.96 
 
 		 154 aa  90.1  9e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.756407 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0434  Endoribonuclease L-PSP  42.96 
 
 		 155 aa  89.7  1e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.51654 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0894  hypothetical protein  41.43 
 
 		 152 aa  89.7  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.324074  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36190  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  46.49 
 
 		 151 aa  89.7  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26250  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  44.35 
 
 		 167 aa  89.7  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.738846  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2609  endoribonuclease L-PSP  39.13 
 
 		 152 aa  90.1  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.56142 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2553  endoribonuclease L-PSP  41.43 
 
 		 152 aa  89.7  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2908  Endoribonuclease L-PSP  40.6 
 
 		 164 aa  89  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>